MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_014974	CCT	2	6	2140001	2140006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451335
49003	NC_014974	GCAG	2	8	2140009	2140016	25 %	0 %	50 %	25 %	320451335
49004	NC_014974	CAC	2	6	2140052	2140057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451335
49005	NC_014974	AGG	3	9	2140138	2140146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451335
49006	NC_014974	GGA	2	6	2140157	2140162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451335
49007	NC_014974	AGG	2	6	2140175	2140180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451335
49008	NC_014974	AGG	2	6	2140336	2140341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451335
49009	NC_014974	CCA	2	6	2140384	2140389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451335
49010	NC_014974	CTA	2	6	2140391	2140396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451335
49011	NC_014974	CCG	2	6	2140397	2140402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451335
49012	NC_014974	CGG	2	6	2140414	2140419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451335
49013	NC_014974	CCT	2	6	2140463	2140468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451335
49014	NC_014974	G	6	6	2140470	2140475	0 %	0 %	100 %	0 %	320451335
49015	NC_014974	CTT	2	6	2140514	2140519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451335
49016	NC_014974	CTA	2	6	2140520	2140525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451335
49017	NC_014974	GCC	2	6	2140584	2140589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451335
49018	NC_014974	CCT	3	9	2140622	2140630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451335
49019	NC_014974	CCTGG	2	10	2140659	2140668	0 %	20 %	40 %	40 %	320451336
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49021	NC_014974	CCCTGG	2	12	2140719	2140730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451336
49022	NC_014974	AGGA	2	8	2140782	2140789	50 %	0 %	50 %	0 %	320451336
49023	NC_014974	GAG	2	6	2140793	2140798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451336
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49031	NC_014974	TCC	3	9	2141223	2141231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451336
49032	NC_014974	CTC	2	6	2141339	2141344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451336
49033	NC_014974	CTA	2	6	2141347	2141352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451336
49034	NC_014974	CGGCTT	2	12	2141368	2141379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451336
49035	NC_014974	TCC	2	6	2141421	2141426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451336
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49037	NC_014974	GTG	2	6	2141498	2141503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451336
49038	NC_014974	CCACC	2	10	2141628	2141637	20 %	0 %	0 %	80 %	320451336
49039	NC_014974	C	7	7	2141636	2141642	0 %	0 %	0 %	100 %	320451336
49040	NC_014974	GCAG	2	8	2141710	2141717	25 %	0 %	50 %	25 %	320451336
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49042	NC_014974	TAC	2	6	2141888	2141893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451336
49043	NC_014974	TGGAC	2	10	2141931	2141940	20 %	20 %	40 %	20 %	320451336
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49049	NC_014974	ACC	2	6	2142300	2142305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451336
49050	NC_014974	CCT	2	6	2142325	2142330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451336
49051	NC_014974	GGA	2	6	2142356	2142361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451336
49052	NC_014974	CACC	2	8	2142373	2142380	25 %	0 %	0 %	75 %	320451336
49053	NC_014974	CAC	2	6	2142409	2142414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451336
49054	NC_014974	GGGA	2	8	2142435	2142442	25 %	0 %	75 %	0 %	320451336
49055	NC_014974	GCT	2	6	2142443	2142448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451336
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49099	NC_014974	CTCC	2	8	2144643	2144650	0 %	25 %	0 %	75 %	320451338
49100	NC_014974	TCC	2	6	2144675	2144680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451338
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49104	NC_014974	CCA	2	6	2144932	2144937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49105	NC_014974	AGG	3	9	2144955	2144963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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49107	NC_014974	CCA	2	6	2145086	2145091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49108	NC_014974	GAG	2	6	2145116	2145121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49109	NC_014974	CCA	2	6	2145164	2145169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451339
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49117	NC_014974	GGC	2	6	2145444	2145449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451339
49118	NC_014974	CCA	2	6	2145464	2145469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451339
49119	NC_014974	CCT	2	6	2145503	2145508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451339
49120	NC_014974	TCC	2	6	2145514	2145519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451339
49121	NC_014974	GTG	2	6	2145534	2145539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451339
49122	NC_014974	GCT	2	6	2145562	2145567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451340
49123	NC_014974	GGC	2	6	2145581	2145586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451340
49124	NC_014974	C	6	6	2145609	2145614	0 %	0 %	0 %	100 %	320451340
49125	NC_014974	GCCC	2	8	2145723	2145730	0 %	0 %	25 %	75 %	320451340
49126	NC_014974	CCA	2	6	2145790	2145795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451340
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49133	NC_014974	TCC	2	6	2146108	2146113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451340
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49150	NC_014974	CGG	2	6	2146900	2146905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451340
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49152	NC_014974	TCC	2	6	2146983	2146988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451340
49153	NC_014974	CGAG	2	8	2146989	2146996	25 %	0 %	50 %	25 %	320451340
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49157	NC_014974	C	6	6	2147266	2147271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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49190	NC_014974	CGG	2	6	2148630	2148635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451342
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49200	NC_014974	GAG	2	6	2149003	2149008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451342
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49217	NC_014974	GGA	2	6	2149579	2149584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451343
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49219	NC_014974	CAT	3	9	2149651	2149659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451343
49220	NC_014974	TGA	2	6	2149701	2149706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451343
49221	NC_014974	AGG	2	6	2149724	2149729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451343
49222	NC_014974	GTA	2	6	2149756	2149761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451343
49223	NC_014974	AAG	2	6	2149805	2149810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451343
49224	NC_014974	AGGGC	2	10	2149881	2149890	20 %	0 %	60 %	20 %	320451343
49225	NC_014974	C	6	6	2149900	2149905	0 %	0 %	0 %	100 %	320451343
49226	NC_014974	GCC	2	6	2149910	2149915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451343
49227	NC_014974	AAG	2	6	2149931	2149936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451343
49228	NC_014974	CTG	2	6	2149981	2149986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451343
49229	NC_014974	GCC	2	6	2149988	2149993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451343
49230	NC_014974	CAC	2	6	2150059	2150064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451343
49231	NC_014974	CCA	2	6	2150070	2150075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451343
49232	NC_014974	CTC	2	6	2150101	2150106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451343
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49234	NC_014974	CTC	2	6	2150145	2150150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451344
49235	NC_014974	GGA	2	6	2150178	2150183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451344
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49237	NC_014974	CTC	2	6	2150265	2150270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451344
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49242	NC_014974	ACC	2	6	2150421	2150426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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49323	NC_014974	AGCCC	2	10	2153974	2153983	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49324	NC_014974	GGT	2	6	2154040	2154045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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49347	NC_014974	C	8	8	2155237	2155244	0 %	0 %	0 %	100 %	320451348
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49349	NC_014974	GGC	2	6	2155300	2155305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451348
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49351	NC_014974	C	8	8	2155592	2155599	0 %	0 %	0 %	100 %	320451348
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