MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47003	NC_014974	GGA	3	9	2055688	2055696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451235
47004	NC_014974	CCA	2	6	2055714	2055719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451235
47005	NC_014974	CTT	2	6	2055748	2055753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451235
47006	NC_014974	CGA	2	6	2055826	2055831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451235
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47011	NC_014974	CCT	2	6	2056122	2056127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451236
47012	NC_014974	GGA	2	6	2056134	2056139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451236
47013	NC_014974	ATC	2	6	2056230	2056235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451237
47014	NC_014974	CGA	2	6	2056256	2056261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451237
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47018	NC_014974	GGA	2	6	2056421	2056426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451237
47019	NC_014974	GGC	2	6	2056450	2056455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451237
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47027	NC_014974	C	6	6	2056717	2056722	0 %	0 %	0 %	100 %	320451237
47028	NC_014974	ATG	2	6	2056806	2056811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451237
47029	NC_014974	GCGG	2	8	2056823	2056830	0 %	0 %	75 %	25 %	320451237
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47117	NC_014974	CTCC	2	8	2060257	2060264	0 %	25 %	0 %	75 %	320451240
47118	NC_014974	GGC	2	6	2060269	2060274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451240
47119	NC_014974	AGG	2	6	2060299	2060304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451240
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47121	NC_014974	GTG	2	6	2060336	2060341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451240
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47123	NC_014974	GGA	2	6	2060485	2060490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451240
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47129	NC_014974	CGG	2	6	2060829	2060834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451240
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47131	NC_014974	CGA	2	6	2060860	2060865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451240
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47142	NC_014974	GCCTG	2	10	2061117	2061126	0 %	20 %	40 %	40 %	320451240
47143	NC_014974	CCGG	2	8	2061143	2061150	0 %	0 %	50 %	50 %	320451240
47144	NC_014974	C	6	6	2061243	2061248	0 %	0 %	0 %	100 %	320451241
47145	NC_014974	CAG	2	6	2061292	2061297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451241
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47147	NC_014974	TGA	2	6	2061420	2061425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451241
47148	NC_014974	AAT	2	6	2061427	2061432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320451241
47149	NC_014974	CCT	3	9	2061546	2061554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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47180	NC_014974	TCGCCC	2	12	2062816	2062827	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320451242
47181	NC_014974	GAA	2	6	2062857	2062862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47182	NC_014974	CGGGG	2	10	2062956	2062965	0 %	0 %	80 %	20 %	320451243
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47222	NC_014974	GCC	2	6	2064391	2064396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451243
47223	NC_014974	CGCC	2	8	2064405	2064412	0 %	0 %	25 %	75 %	320451243
47224	NC_014974	GGAA	2	8	2064420	2064427	50 %	0 %	50 %	0 %	320451243
47225	NC_014974	GAAT	2	8	2064463	2064470	50 %	25 %	25 %	0 %	320451243
47226	NC_014974	GGT	2	6	2064515	2064520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451244
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47230	NC_014974	ACCT	2	8	2064621	2064628	25 %	25 %	0 %	50 %	320451244
47231	NC_014974	CCT	2	6	2064680	2064685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451244
47232	NC_014974	GCA	2	6	2064707	2064712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451244
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47235	NC_014974	GCA	2	6	2064784	2064789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451244
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47313	NC_014974	GGA	2	6	2067856	2067861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451247
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47315	NC_014974	GCC	2	6	2067879	2067884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451247
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47336	NC_014974	TCC	2	6	2068669	2068674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451249
47337	NC_014974	AGT	3	9	2068709	2068717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451249
47338	NC_014974	ATGGAG	2	12	2068759	2068770	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320451249
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47340	NC_014974	GGC	2	6	2068850	2068855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451249
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47343	NC_014974	GGA	2	6	2068896	2068901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47344	NC_014974	AC	3	6	2068925	2068930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47345	NC_014974	TCT	2	6	2068977	2068982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451250
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47347	NC_014974	C	6	6	2069066	2069071	0 %	0 %	0 %	100 %	320451250
47348	NC_014974	G	6	6	2069089	2069094	0 %	0 %	100 %	0 %	320451250
47349	NC_014974	ACC	2	6	2069187	2069192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451250
47350	NC_014974	ACCAC	2	10	2069196	2069205	40 %	0 %	0 %	60 %	320451250
47351	NC_014974	G	7	7	2069233	2069239	0 %	0 %	100 %	0 %	320451250
47352	NC_014974	CCT	2	6	2069257	2069262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451250
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47463	NC_014974	G	6	6	2073980	2073985	0 %	0 %	100 %	0 %	320451254
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47471	NC_014974	CCG	2	6	2074341	2074346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451255
47472	NC_014974	AAGGG	2	10	2074363	2074372	40 %	0 %	60 %	0 %	320451255
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47474	NC_014974	GAT	2	6	2074458	2074463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451255
47475	NC_014974	CCA	2	6	2074490	2074495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451255
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47481	NC_014974	CCA	3	9	2074631	2074639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451255
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47483	NC_014974	GGC	2	6	2074710	2074715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451255
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47490	NC_014974	CCT	2	6	2075125	2075130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451256
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47492	NC_014974	GCCC	2	8	2075221	2075228	0 %	0 %	25 %	75 %	320451256
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47499	NC_014974	AGGTCC	2	12	2075424	2075435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320451256
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