MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_014974	TCTCCT	2	12	1970370	1970381	0 %	50 %	0 %	50 %	320451136
45003	NC_014974	CCA	2	6	1970406	1970411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451136
45004	NC_014974	GTT	2	6	1970413	1970418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451136
45005	NC_014974	CGG	2	6	1970420	1970425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451136
45006	NC_014974	AAG	2	6	1970449	1970454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451136
45007	NC_014974	AGCC	2	8	1970462	1970469	25 %	0 %	25 %	50 %	320451136
45008	NC_014974	G	6	6	1970473	1970478	0 %	0 %	100 %	0 %	320451136
45009	NC_014974	CTT	2	6	1970491	1970496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451136
45010	NC_014974	ACC	2	6	1970502	1970507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451136
45011	NC_014974	AGG	2	6	1970537	1970542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451136
45012	NC_014974	GAG	2	6	1970604	1970609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451136
45013	NC_014974	CCCCA	2	10	1970722	1970731	20 %	0 %	0 %	80 %	320451136
45014	NC_014974	CCT	2	6	1970807	1970812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451137
45015	NC_014974	GGT	2	6	1970828	1970833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
45016	NC_014974	AGG	2	6	1970866	1970871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451137
45017	NC_014974	GTG	2	6	1970874	1970879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
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45019	NC_014974	TGG	2	6	1970905	1970910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451137
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45021	NC_014974	AGA	2	6	1970947	1970952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451137
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45042	NC_014974	TCT	2	6	1971913	1971918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451137
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45050	NC_014974	GAA	2	6	1972132	1972137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451138
45051	NC_014974	GTA	2	6	1972196	1972201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451138
45052	NC_014974	GCCCC	2	10	1972318	1972327	0 %	0 %	20 %	80 %	320451138
45053	NC_014974	GCCC	2	8	1972343	1972350	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45054	NC_014974	GGC	2	6	1972382	1972387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451139
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45061	NC_014974	G	6	6	1972652	1972657	0 %	0 %	100 %	0 %	320451140
45062	NC_014974	CAC	2	6	1972749	1972754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451140
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45064	NC_014974	CA	3	6	1972856	1972861	50 %	0 %	0 %	50 %	320451140
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45071	NC_014974	GCCC	2	8	1973241	1973248	0 %	0 %	25 %	75 %	320451140
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45100	NC_014974	CCCG	2	8	1974883	1974890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45101	NC_014974	TGGAGG	2	12	1975027	1975038	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320451142
45102	NC_014974	GCCC	2	8	1975043	1975050	0 %	0 %	25 %	75 %	320451142
45103	NC_014974	CCA	2	6	1975109	1975114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451142
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45105	NC_014974	G	6	6	1975259	1975264	0 %	0 %	100 %	0 %	320451142
45106	NC_014974	G	6	6	1975344	1975349	0 %	0 %	100 %	0 %	320451142
45107	NC_014974	GCC	2	6	1975356	1975361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451142
45108	NC_014974	C	7	7	1975371	1975377	0 %	0 %	0 %	100 %	320451142
45109	NC_014974	C	6	6	1975447	1975452	0 %	0 %	0 %	100 %	320451142
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45114	NC_014974	GCC	2	6	1975695	1975700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451142
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45116	NC_014974	GGA	2	6	1975721	1975726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451142
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45237	NC_014974	CCT	2	6	1980311	1980316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451149
45238	NC_014974	GGC	2	6	1980328	1980333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451149
45239	NC_014974	GAA	2	6	1980471	1980476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451149
45240	NC_014974	TCC	3	9	1980487	1980495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451149
45241	NC_014974	CTT	2	6	1980503	1980508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451149
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45243	NC_014974	GA	3	6	1980628	1980633	50 %	0 %	50 %	0 %	320451149
45244	NC_014974	GAA	2	6	1980684	1980689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451149
45245	NC_014974	CCT	2	6	1980718	1980723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451150
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45249	NC_014974	CCT	2	6	1980910	1980915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451150
45250	NC_014974	CCT	2	6	1980988	1980993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451150
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45252	NC_014974	C	7	7	1981199	1981205	0 %	0 %	0 %	100 %	320451150
45253	NC_014974	CTC	2	6	1981236	1981241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451150
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45256	NC_014974	C	7	7	1981342	1981348	0 %	0 %	0 %	100 %	320451151
45257	NC_014974	CCAC	2	8	1981350	1981357	25 %	0 %	0 %	75 %	320451151
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45260	NC_014974	GAG	2	6	1981429	1981434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451151
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45267	NC_014974	GAG	3	9	1981990	1981998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451151
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45282	NC_014974	CCA	2	6	1982515	1982520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451151
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45286	NC_014974	CAC	2	6	1982608	1982613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451151
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45289	NC_014974	AG	3	6	1982709	1982714	50 %	0 %	50 %	0 %	320451151
45290	NC_014974	TGG	2	6	1982772	1982777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451151
45291	NC_014974	GAA	3	9	1982788	1982796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451151
45292	NC_014974	GCA	2	6	1982886	1982891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451151
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45300	NC_014974	CAG	2	6	1983178	1983183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451151
45301	NC_014974	CCT	2	6	1983200	1983205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451152
45302	NC_014974	TCC	2	6	1983223	1983228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451152
45303	NC_014974	AGG	2	6	1983277	1983282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451152
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45305	NC_014974	CCT	2	6	1983338	1983343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451152
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45307	NC_014974	C	6	6	1983463	1983468	0 %	0 %	0 %	100 %	320451152
45308	NC_014974	GCC	2	6	1983552	1983557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451152
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45310	NC_014974	AGGT	2	8	1983672	1983679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45311	NC_014974	CCT	3	9	1983717	1983725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451153
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45322	NC_014974	C	6	6	1984065	1984070	0 %	0 %	0 %	100 %	320451153
45323	NC_014974	GGGCC	2	10	1984075	1984084	0 %	0 %	60 %	40 %	320451153
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45329	NC_014974	GAG	2	6	1984324	1984329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451153
45330	NC_014974	AGCCCC	2	12	1984334	1984345	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320451153
45331	NC_014974	AAGGG	2	10	1984429	1984438	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45332	NC_014974	AACCT	2	10	1984467	1984476	40 %	20 %	0 %	40 %	320451154
45333	NC_014974	ACC	2	6	1984483	1984488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451154
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45335	NC_014974	AAG	2	6	1984536	1984541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451154
45336	NC_014974	CCA	2	6	1984545	1984550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451154
45337	NC_014974	GTG	2	6	1984591	1984596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451154
45338	NC_014974	ACC	2	6	1984624	1984629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451154
45339	NC_014974	AGA	2	6	1984681	1984686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451154
45340	NC_014974	AGA	2	6	1984775	1984780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451154
45341	NC_014974	CGC	2	6	1984785	1984790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451154
45342	NC_014974	AGGGCA	2	12	1984798	1984809	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320451154
45343	NC_014974	AAG	2	6	1984839	1984844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451154
45344	NC_014974	AGG	3	9	1984882	1984890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451154
45345	NC_014974	CTC	2	6	1984905	1984910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451154
45346	NC_014974	AAGGCC	2	12	1984954	1984965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451154
45347	NC_014974	CTC	3	9	1985001	1985009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451154
45348	NC_014974	CAAGGC	2	12	1985016	1985027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451154
45349	NC_014974	ATG	2	6	1985029	1985034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451154
45350	NC_014974	A	6	6	1985049	1985054	100 %	0 %	0 %	0 %	320451154
45351	NC_014974	AAG	2	6	1985067	1985072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451154
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45353	NC_014974	CAC	2	6	1985133	1985138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451154
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