MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_014974	CCTGGT	2	12	1948573	1948584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451111
44502	NC_014974	GGA	2	6	1948585	1948590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451111
44503	NC_014974	CCT	2	6	1948609	1948614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451111
44504	NC_014974	TGG	3	9	1948731	1948739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451111
44505	NC_014974	G	6	6	1948765	1948770	0 %	0 %	100 %	0 %	320451112
44506	NC_014974	CCT	2	6	1948780	1948785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451112
44507	NC_014974	CTC	2	6	1948807	1948812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451112
44508	NC_014974	CCA	2	6	1948828	1948833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451112
44509	NC_014974	C	6	6	1948901	1948906	0 %	0 %	0 %	100 %	320451112
44510	NC_014974	AGT	2	6	1948932	1948937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451112
44511	NC_014974	CTT	2	6	1948942	1948947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451112
44512	NC_014974	GGC	2	6	1948983	1948988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451112
44513	NC_014974	CCT	2	6	1949001	1949006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451112
44514	NC_014974	GAA	2	6	1949052	1949057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451112
44515	NC_014974	CGGT	2	8	1949153	1949160	0 %	25 %	50 %	25 %	320451112
44516	NC_014974	TGA	2	6	1949250	1949255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451112
44517	NC_014974	GCGG	2	8	1949290	1949297	0 %	0 %	75 %	25 %	320451112
44518	NC_014974	C	6	6	1949340	1949345	0 %	0 %	0 %	100 %	320451112
44519	NC_014974	ACCA	2	8	1949372	1949379	50 %	0 %	0 %	50 %	320451112
44520	NC_014974	CAC	2	6	1949443	1949448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451112
44521	NC_014974	GGT	2	6	1949455	1949460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451112
44522	NC_014974	GGT	2	6	1949470	1949475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451112
44523	NC_014974	CCA	2	6	1949487	1949492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451112
44524	NC_014974	CTTGC	2	10	1949579	1949588	0 %	40 %	20 %	40 %	320451113
44525	NC_014974	TCC	2	6	1949614	1949619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451113
44526	NC_014974	CGG	2	6	1949623	1949628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451113
44527	NC_014974	ACCC	2	8	1949640	1949647	25 %	0 %	0 %	75 %	320451113
44528	NC_014974	GAGGT	2	10	1949701	1949710	20 %	20 %	60 %	0 %	320451113
44529	NC_014974	CCGC	2	8	1949729	1949736	0 %	0 %	25 %	75 %	320451113
44530	NC_014974	GGGCCA	2	12	1949738	1949749	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320451113
44531	NC_014974	GGCG	2	8	1949825	1949832	0 %	0 %	75 %	25 %	320451113
44532	NC_014974	C	7	7	1949858	1949864	0 %	0 %	0 %	100 %	320451113
44533	NC_014974	AAG	2	6	1949901	1949906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451113
44534	NC_014974	GCG	2	6	1949917	1949922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451113
44535	NC_014974	AAG	2	6	1949964	1949969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451113
44536	NC_014974	CGG	2	6	1949990	1949995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451113
44537	NC_014974	CTT	2	6	1950009	1950014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451113
44538	NC_014974	CGG	2	6	1950124	1950129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451113
44539	NC_014974	TCC	2	6	1950145	1950150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451113
44540	NC_014974	CCA	2	6	1950206	1950211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451113
44541	NC_014974	C	7	7	1950275	1950281	0 %	0 %	0 %	100 %	320451113
44542	NC_014974	GTG	2	6	1950403	1950408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451114
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44545	NC_014974	GAG	2	6	1950625	1950630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451114
44546	NC_014974	GCC	2	6	1950650	1950655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451114
44547	NC_014974	CTC	2	6	1950691	1950696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451114
44548	NC_014974	CTGGCC	2	12	1950697	1950708	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451114
44549	NC_014974	CAT	2	6	1950756	1950761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451114
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44551	NC_014974	GGGT	2	8	1950842	1950849	0 %	25 %	75 %	0 %	320451114
44552	NC_014974	CGC	2	6	1950915	1950920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451114
44553	NC_014974	CAT	2	6	1950924	1950929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451114
44554	NC_014974	TGGG	2	8	1950965	1950972	0 %	25 %	75 %	0 %	320451114
44555	NC_014974	GGA	2	6	1950975	1950980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451114
44556	NC_014974	TCC	2	6	1950983	1950988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451114
44557	NC_014974	CTC	2	6	1951031	1951036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451114
44558	NC_014974	GCA	2	6	1951038	1951043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451114
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44562	NC_014974	CTG	2	6	1951141	1951146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451115
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44566	NC_014974	CCA	2	6	1951228	1951233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451115
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44572	NC_014974	TGG	2	6	1951575	1951580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451115
44573	NC_014974	GGA	2	6	1951598	1951603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451115
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44575	NC_014974	GCCC	2	8	1951634	1951641	0 %	0 %	25 %	75 %	320451115
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44578	NC_014974	G	6	6	1951740	1951745	0 %	0 %	100 %	0 %	320451115
44579	NC_014974	CTGG	2	8	1951768	1951775	0 %	25 %	50 %	25 %	320451115
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44583	NC_014974	GC	3	6	1951942	1951947	0 %	0 %	50 %	50 %	320451115
44584	NC_014974	TCC	2	6	1951954	1951959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451115
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44586	NC_014974	CCCT	2	8	1952210	1952217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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44592	NC_014974	TCC	2	6	1952444	1952449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451116
44593	NC_014974	GCTG	2	8	1952468	1952475	0 %	25 %	50 %	25 %	320451116
44594	NC_014974	C	7	7	1952561	1952567	0 %	0 %	0 %	100 %	320451116
44595	NC_014974	TGGA	2	8	1952671	1952678	25 %	25 %	50 %	0 %	320451116
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44598	NC_014974	ATCCCG	2	12	1952760	1952771	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320451116
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44601	NC_014974	CCA	2	6	1952861	1952866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451116
44602	NC_014974	C	6	6	1952880	1952885	0 %	0 %	0 %	100 %	320451116
44603	NC_014974	AGG	2	6	1952899	1952904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451116
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44605	NC_014974	GCGGG	2	10	1952937	1952946	0 %	0 %	80 %	20 %	320451116
44606	NC_014974	CCT	2	6	1952984	1952989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451116
44607	NC_014974	CCA	3	9	1953005	1953013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451116
44608	NC_014974	GCG	2	6	1953033	1953038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451116
44609	NC_014974	CAC	3	9	1953069	1953077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451116
44610	NC_014974	CTC	2	6	1953090	1953095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451116
44611	NC_014974	CAC	2	6	1953132	1953137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451116
44612	NC_014974	TCAGGA	2	12	1953167	1953178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320451116
44613	NC_014974	CTT	2	6	1953215	1953220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451116
44614	NC_014974	AGG	2	6	1953313	1953318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451116
44615	NC_014974	GAA	2	6	1953383	1953388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44617	NC_014974	TGA	2	6	1953451	1953456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451117
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