MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_014974	CTT	3	9	1884253	1884261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451050
43003	NC_014974	TGG	2	6	1884329	1884334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451050
43004	NC_014974	TGG	2	6	1884386	1884391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451050
43005	NC_014974	G	6	6	1884411	1884416	0 %	0 %	100 %	0 %	320451050
43006	NC_014974	TGG	2	6	1884419	1884424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451050
43007	NC_014974	CCTT	2	8	1884432	1884439	0 %	50 %	0 %	50 %	320451050
43008	NC_014974	GTT	2	6	1884457	1884462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451050
43009	NC_014974	TGGGGG	2	12	1884470	1884481	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	320451050
43010	NC_014974	CTT	2	6	1884487	1884492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451050
43011	NC_014974	TGC	2	6	1884500	1884505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451050
43012	NC_014974	CCCG	2	8	1884544	1884551	0 %	0 %	25 %	75 %	320451050
43013	NC_014974	TGG	2	6	1884632	1884637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451050
43014	NC_014974	GGTG	2	8	1884669	1884676	0 %	25 %	75 %	0 %	320451050
43015	NC_014974	TC	3	6	1884678	1884683	0 %	50 %	0 %	50 %	320451050
43016	NC_014974	CCT	2	6	1884729	1884734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451050
43017	NC_014974	TGG	2	6	1884803	1884808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451050
43018	NC_014974	CTC	2	6	1884823	1884828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451050
43019	NC_014974	CCTGG	2	10	1884888	1884897	0 %	20 %	40 %	40 %	320451050
43020	NC_014974	CTGG	2	8	1884978	1884985	0 %	25 %	50 %	25 %	320451050
43021	NC_014974	CCTGGG	2	12	1884987	1884998	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320451050
43022	NC_014974	CTG	2	6	1885015	1885020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451050
43023	NC_014974	GCC	2	6	1885030	1885035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451050
43024	NC_014974	GCCTGG	2	12	1885037	1885048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320451050
43025	NC_014974	TCC	2	6	1885073	1885078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451050
43026	NC_014974	C	6	6	1885146	1885151	0 %	0 %	0 %	100 %	320451051
43027	NC_014974	C	6	6	1885155	1885160	0 %	0 %	0 %	100 %	320451051
43028	NC_014974	CCAGG	2	10	1885198	1885207	20 %	0 %	40 %	40 %	320451051
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43032	NC_014974	AAG	2	6	1885352	1885357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451051
43033	NC_014974	GAG	2	6	1885387	1885392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451051
43034	NC_014974	A	6	6	1885395	1885400	100 %	0 %	0 %	0 %	320451051
43035	NC_014974	CCA	2	6	1885428	1885433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451051
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43037	NC_014974	CTC	2	6	1885648	1885653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451051
43038	NC_014974	CGG	2	6	1885661	1885666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451051
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43041	NC_014974	C	6	6	1885717	1885722	0 %	0 %	0 %	100 %	320451051
43042	NC_014974	CCT	2	6	1885734	1885739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451051
43043	NC_014974	CGG	2	6	1885742	1885747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451051
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43046	NC_014974	TCT	2	6	1885845	1885850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451051
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43050	NC_014974	GTC	2	6	1885948	1885953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451051
43051	NC_014974	AGG	2	6	1885979	1885984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451051
43052	NC_014974	AGG	2	6	1885997	1886002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451051
43053	NC_014974	AGA	2	6	1886022	1886027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451051
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43055	NC_014974	CCGC	2	8	1886130	1886137	0 %	0 %	25 %	75 %	320451051
43056	NC_014974	TGG	2	6	1886145	1886150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451051
43057	NC_014974	CGG	2	6	1886159	1886164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451051
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43060	NC_014974	GGTCC	2	10	1886215	1886224	0 %	20 %	40 %	40 %	320451051
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43070	NC_014974	TCA	2	6	1886606	1886611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451052
43071	NC_014974	CCG	3	9	1886624	1886632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451052
43072	NC_014974	AAGG	2	8	1886647	1886654	50 %	0 %	50 %	0 %	320451052
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43075	NC_014974	TGGG	2	8	1886786	1886793	0 %	25 %	75 %	0 %	320451052
43076	NC_014974	GC	3	6	1886812	1886817	0 %	0 %	50 %	50 %	320451052
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43087	NC_014974	GCC	2	6	1887091	1887096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451052
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43089	NC_014974	AGA	2	6	1887226	1887231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451052
43090	NC_014974	CGGG	2	8	1887330	1887337	0 %	0 %	75 %	25 %	320451052
43091	NC_014974	GAG	2	6	1887344	1887349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451052
43092	NC_014974	CTC	2	6	1887360	1887365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451052
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43098	NC_014974	ACC	2	6	1887616	1887621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451052
43099	NC_014974	AGG	2	6	1887622	1887627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451052
43100	NC_014974	CGC	2	6	1887646	1887651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451052
43101	NC_014974	GGGCCT	2	12	1887723	1887734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320451053
43102	NC_014974	CGCTC	2	10	1887741	1887750	0 %	20 %	20 %	60 %	320451053
43103	NC_014974	GCC	2	6	1887832	1887837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451053
43104	NC_014974	ACC	2	6	1887857	1887862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451053
43105	NC_014974	CGT	2	6	1887972	1887977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451053
43106	NC_014974	ACC	2	6	1887983	1887988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451053
43107	NC_014974	GACGGA	2	12	1888096	1888107	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320451054
43108	NC_014974	CTC	2	6	1888109	1888114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451054
43109	NC_014974	CCT	2	6	1888132	1888137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451054
43110	NC_014974	CAA	2	6	1888154	1888159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320451054
43111	NC_014974	AAG	2	6	1888192	1888197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451054
43112	NC_014974	GCCC	2	8	1888242	1888249	0 %	0 %	25 %	75 %	320451054
43113	NC_014974	ACC	2	6	1888260	1888265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451054
43114	NC_014974	GCCTCC	2	12	1888329	1888340	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320451054
43115	NC_014974	AAG	2	6	1888361	1888366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451054
43116	NC_014974	AGG	2	6	1888401	1888406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451054
43117	NC_014974	GGC	2	6	1888444	1888449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451054
43118	NC_014974	AAG	2	6	1888524	1888529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451054
43119	NC_014974	ACC	2	6	1888722	1888727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451054
43120	NC_014974	AGG	2	6	1888779	1888784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451054
43121	NC_014974	ACC	2	6	1888791	1888796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451054
43122	NC_014974	CAC	2	6	1888823	1888828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451054
43123	NC_014974	AGC	2	6	1888832	1888837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451054
43124	NC_014974	AAG	2	6	1888838	1888843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451054
43125	NC_014974	CAGGGG	2	12	1889009	1889020	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320451054
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43128	NC_014974	CAC	2	6	1889156	1889161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451054
43129	NC_014974	CCG	2	6	1889167	1889172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451054
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43134	NC_014974	GAAG	2	8	1889308	1889315	50 %	0 %	50 %	0 %	320451054
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43137	NC_014974	CTC	2	6	1889462	1889467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451054
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43139	NC_014974	C	6	6	1889546	1889551	0 %	0 %	0 %	100 %	320451054
43140	NC_014974	GTT	2	6	1889573	1889578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451054
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43142	NC_014974	TCC	2	6	1889694	1889699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451054
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43145	NC_014974	TTG	2	6	1889784	1889789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451054
43146	NC_014974	AGG	2	6	1889790	1889795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451054
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43153	NC_014974	AGG	2	6	1889967	1889972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451054
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43155	NC_014974	CTC	2	6	1890089	1890094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451054
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43157	NC_014974	C	6	6	1890136	1890141	0 %	0 %	0 %	100 %	320451054
43158	NC_014974	GCG	2	6	1890164	1890169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451054
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43166	NC_014974	GGC	2	6	1890605	1890610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43170	NC_014974	GGGTG	2	10	1890787	1890796	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43171	NC_014974	GGCCC	2	10	1890802	1890811	0 %	0 %	40 %	60 %	320451056
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43204	NC_014974	TAG	2	6	1892436	1892441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451058
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43209	NC_014974	GGCCTG	2	12	1892567	1892578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320451058
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43219	NC_014974	CTC	2	6	1893023	1893028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451058
43220	NC_014974	G	6	6	1893040	1893045	0 %	0 %	100 %	0 %	320451058
43221	NC_014974	CGG	2	6	1893059	1893064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451058
43222	NC_014974	AAG	2	6	1893122	1893127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451058
43223	NC_014974	TGC	2	6	1893135	1893140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451058
43224	NC_014974	ATG	2	6	1893144	1893149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451058
43225	NC_014974	GCT	2	6	1893199	1893204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451058
43226	NC_014974	TTG	2	6	1893216	1893221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451058
43227	NC_014974	CGG	2	6	1893244	1893249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451058
43228	NC_014974	TTC	2	6	1893284	1893289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451059
43229	NC_014974	CAC	2	6	1893377	1893382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451059
43230	NC_014974	CCCAG	2	10	1893400	1893409	20 %	0 %	20 %	60 %	320451059
43231	NC_014974	GGA	2	6	1893447	1893452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451059
43232	NC_014974	CTC	2	6	1893470	1893475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451059
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43234	NC_014974	AGGC	2	8	1893503	1893510	25 %	0 %	50 %	25 %	320451059
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43468	NC_014974	TGCGTA	2	12	1904418	1904429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320451069
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