MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_014974	TCC	2	6	1863174	1863179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451029
42502	NC_014974	GCAG	2	8	1863187	1863194	25 %	0 %	50 %	25 %	320451029
42503	NC_014974	GGC	2	6	1863221	1863226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451029
42504	NC_014974	ACC	2	6	1863258	1863263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451029
42505	NC_014974	TCA	2	6	1863271	1863276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451029
42506	NC_014974	TGG	2	6	1863328	1863333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451029
42507	NC_014974	CGGT	2	8	1863348	1863355	0 %	25 %	50 %	25 %	320451029
42508	NC_014974	GAT	2	6	1863356	1863361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451029
42509	NC_014974	CCA	2	6	1863364	1863369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451029
42510	NC_014974	CTC	2	6	1863377	1863382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451029
42511	NC_014974	AGG	2	6	1863417	1863422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451029
42512	NC_014974	CCT	2	6	1863430	1863435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451029
42513	NC_014974	A	6	6	1863498	1863503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42514	NC_014974	CGG	2	6	1863512	1863517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42515	NC_014974	CCG	2	6	1863521	1863526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42516	NC_014974	GTC	2	6	1863554	1863559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451030
42517	NC_014974	CCT	2	6	1863592	1863597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451030
42518	NC_014974	CAC	2	6	1863608	1863613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451030
42519	NC_014974	CCG	2	6	1863745	1863750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451030
42520	NC_014974	GAG	2	6	1863801	1863806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451030
42521	NC_014974	CCA	2	6	1863862	1863867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451030
42522	NC_014974	AGG	2	6	1863891	1863896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451030
42523	NC_014974	CTC	2	6	1863908	1863913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451030
42524	NC_014974	CAC	2	6	1863935	1863940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451030
42525	NC_014974	TGGA	2	8	1863948	1863955	25 %	25 %	50 %	0 %	320451030
42526	NC_014974	GCC	2	6	1864043	1864048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451030
42527	NC_014974	GCG	2	6	1864067	1864072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451030
42528	NC_014974	CCA	2	6	1864093	1864098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451030
42529	NC_014974	AAG	2	6	1864103	1864108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451030
42530	NC_014974	G	6	6	1864135	1864140	0 %	0 %	100 %	0 %	320451030
42531	NC_014974	GAT	2	6	1864157	1864162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451030
42532	NC_014974	GAT	2	6	1864175	1864180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451030
42533	NC_014974	GAT	2	6	1864229	1864234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451030
42534	NC_014974	CGG	3	9	1864242	1864250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451030
42535	NC_014974	TGTCC	2	10	1864285	1864294	0 %	40 %	20 %	40 %	320451030
42536	NC_014974	C	7	7	1864310	1864316	0 %	0 %	0 %	100 %	320451030
42537	NC_014974	CCA	2	6	1864378	1864383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451030
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42542	NC_014974	AGG	2	6	1864506	1864511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451030
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42544	NC_014974	GGC	2	6	1864572	1864577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451031
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42546	NC_014974	CTCC	2	8	1864714	1864721	0 %	25 %	0 %	75 %	320451031
42547	NC_014974	CCG	2	6	1864725	1864730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451031
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42550	NC_014974	CCGC	2	8	1864821	1864828	0 %	0 %	25 %	75 %	320451031
42551	NC_014974	CAC	3	9	1864840	1864848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451031
42552	NC_014974	CCA	2	6	1864866	1864871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451031
42553	NC_014974	TGA	2	6	1864887	1864892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451031
42554	NC_014974	TCC	2	6	1864913	1864918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451031
42555	NC_014974	CTT	2	6	1864924	1864929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451031
42556	NC_014974	GTG	2	6	1864973	1864978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451031
42557	NC_014974	TCG	2	6	1864982	1864987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451031
42558	NC_014974	GAG	2	6	1864993	1864998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451031
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42566	NC_014974	C	6	6	1865336	1865341	0 %	0 %	0 %	100 %	320451031
42567	NC_014974	CCGG	2	8	1865347	1865354	0 %	0 %	50 %	50 %	320451031
42568	NC_014974	ATG	2	6	1865375	1865380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451031
42569	NC_014974	CAC	2	6	1865419	1865424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451031
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42571	NC_014974	CAC	2	6	1865476	1865481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451031
42572	NC_014974	GAA	2	6	1865494	1865499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451031
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42574	NC_014974	CCG	2	6	1865562	1865567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42575	NC_014974	AGGCCT	2	12	1865612	1865623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320451032
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42579	NC_014974	C	7	7	1865742	1865748	0 %	0 %	0 %	100 %	320451032
42580	NC_014974	AGGA	2	8	1865809	1865816	50 %	0 %	50 %	0 %	320451032
42581	NC_014974	TGGCAG	2	12	1865879	1865890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451032
42582	NC_014974	GGCG	2	8	1865900	1865907	0 %	0 %	75 %	25 %	320451032
42583	NC_014974	ATG	2	6	1865908	1865913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451032
42584	NC_014974	GCC	2	6	1865941	1865946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451032
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42586	NC_014974	C	7	7	1866004	1866010	0 %	0 %	0 %	100 %	320451032
42587	NC_014974	CAC	2	6	1866033	1866038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451032
42588	NC_014974	TGA	2	6	1866050	1866055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451032
42589	NC_014974	TGG	2	6	1866068	1866073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451032
42590	NC_014974	CCGC	2	8	1866080	1866087	0 %	0 %	25 %	75 %	320451032
42591	NC_014974	GAG	2	6	1866096	1866101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451032
42592	NC_014974	GGC	2	6	1866117	1866122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451032
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42595	NC_014974	GTC	2	6	1866150	1866155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451032
42596	NC_014974	AAG	2	6	1866198	1866203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451032
42597	NC_014974	GAC	2	6	1866228	1866233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451032
42598	NC_014974	AAGAA	2	10	1866295	1866304	80 %	0 %	20 %	0 %	320451032
42599	NC_014974	GCCA	2	8	1866319	1866326	25 %	0 %	25 %	50 %	320451032
42600	NC_014974	GAA	2	6	1866329	1866334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451032
42601	NC_014974	G	6	6	1866379	1866384	0 %	0 %	100 %	0 %	320451032
42602	NC_014974	GCC	2	6	1866401	1866406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451032
42603	NC_014974	C	6	6	1866427	1866432	0 %	0 %	0 %	100 %	320451032
42604	NC_014974	C	6	6	1866495	1866500	0 %	0 %	0 %	100 %	320451032
42605	NC_014974	TCC	2	6	1866676	1866681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451032
42606	NC_014974	TGC	2	6	1866713	1866718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451032
42607	NC_014974	TGG	2	6	1866722	1866727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451032
42608	NC_014974	GGT	2	6	1866791	1866796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451032
42609	NC_014974	G	6	6	1866804	1866809	0 %	0 %	100 %	0 %	320451032
42610	NC_014974	TAG	2	6	1866820	1866825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451032
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42612	NC_014974	AGA	2	6	1866880	1866885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451032
42613	NC_014974	GCCC	2	8	1866890	1866897	0 %	0 %	25 %	75 %	320451032
42614	NC_014974	GCGG	2	8	1866945	1866952	0 %	0 %	75 %	25 %	320451032
42615	NC_014974	AGA	2	6	1866954	1866959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451032
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42617	NC_014974	ATC	2	6	1867045	1867050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451033
42618	NC_014974	GGCCA	2	10	1867138	1867147	20 %	0 %	40 %	40 %	320451033
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42674	NC_014974	TCC	2	6	1869886	1869891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42675	NC_014974	AGG	2	6	1869895	1869900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42836	NC_014974	GA	3	6	1877008	1877013	50 %	0 %	50 %	0 %	320451044
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42920	NC_014974	TAC	2	6	1880799	1880804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42921	NC_014974	C	7	7	1880868	1880874	0 %	0 %	0 %	100 %	320451047
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42923	NC_014974	GGAA	2	8	1880903	1880910	50 %	0 %	50 %	0 %	320451047
42924	NC_014974	GCC	2	6	1880965	1880970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451047
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42942	NC_014974	C	6	6	1881689	1881694	0 %	0 %	0 %	100 %	320451048
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42944	NC_014974	GCCACC	2	12	1881808	1881819	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320451048
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42950	NC_014974	AGG	2	6	1881910	1881915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451048
42951	NC_014974	C	7	7	1882026	1882032	0 %	0 %	0 %	100 %	320451048
42952	NC_014974	AGG	2	6	1882063	1882068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451048
42953	NC_014974	TCA	2	6	1882072	1882077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451048
42954	NC_014974	GGC	2	6	1882106	1882111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451048
42955	NC_014974	GGCG	2	8	1882148	1882155	0 %	0 %	75 %	25 %	320451048
42956	NC_014974	AGG	2	6	1882165	1882170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451048
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42959	NC_014974	CGT	2	6	1882301	1882306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451048
42960	NC_014974	GGAGG	2	10	1882353	1882362	20 %	0 %	80 %	0 %	320451048
42961	NC_014974	CTC	2	6	1882396	1882401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451048
42962	NC_014974	GCCCCC	2	12	1882408	1882419	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	320451048
42963	NC_014974	GCC	2	6	1882501	1882506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451048
42964	NC_014974	TCC	2	6	1882531	1882536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451048
42965	NC_014974	CCA	2	6	1882634	1882639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451048
42966	NC_014974	GGC	2	6	1882646	1882651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451048
42967	NC_014974	CCTCCA	2	12	1882655	1882666	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320451048
42968	NC_014974	TCC	2	6	1882732	1882737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451048
42969	NC_014974	CCT	2	6	1882760	1882765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451048
42970	NC_014974	CGG	2	6	1882774	1882779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451048
42971	NC_014974	CCCT	2	8	1882797	1882804	0 %	25 %	0 %	75 %	320451048
42972	NC_014974	GCCA	2	8	1882843	1882850	25 %	0 %	25 %	50 %	320451048
42973	NC_014974	C	6	6	1882874	1882879	0 %	0 %	0 %	100 %	320451048
42974	NC_014974	CCT	2	6	1882910	1882915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451048
42975	NC_014974	G	6	6	1882946	1882951	0 %	0 %	100 %	0 %	320451048
42976	NC_014974	ACC	2	6	1882963	1882968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451048
42977	NC_014974	AGA	2	6	1883015	1883020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451048
42978	NC_014974	CCA	2	6	1883100	1883105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451049
42979	NC_014974	CCA	2	6	1883112	1883117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451049
42980	NC_014974	CCT	2	6	1883118	1883123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451049
42981	NC_014974	CGG	2	6	1883163	1883168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451049
42982	NC_014974	CTTC	2	8	1883175	1883182	0 %	50 %	0 %	50 %	320451049
42983	NC_014974	GGA	2	6	1883226	1883231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451049
42984	NC_014974	GGC	2	6	1883380	1883385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451049
42985	NC_014974	GAG	2	6	1883386	1883391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451049
42986	NC_014974	TCC	2	6	1883441	1883446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451049
42987	NC_014974	C	6	6	1883491	1883496	0 %	0 %	0 %	100 %	320451049
42988	NC_014974	GCCACC	2	12	1883507	1883518	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320451049
42989	NC_014974	CAC	2	6	1883566	1883571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451049
42990	NC_014974	CGC	2	6	1883586	1883591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451049
42991	NC_014974	CCA	2	6	1883610	1883615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451049
42992	NC_014974	AGG	2	6	1883634	1883639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451049
42993	NC_014974	ACC	2	6	1883642	1883647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451049
42994	NC_014974	TCC	2	6	1883681	1883686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451049
42995	NC_014974	GGC	2	6	1883866	1883871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451049
42996	NC_014974	TGA	2	6	1883904	1883909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451049
42997	NC_014974	GCCCTG	2	12	1884052	1884063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451050
42998	NC_014974	C	6	6	1884071	1884076	0 %	0 %	0 %	100 %	320451050
42999	NC_014974	CCCTT	2	10	1884098	1884107	0 %	40 %	0 %	60 %	320451050
43000	NC_014974	C	6	6	1884125	1884130	0 %	0 %	0 %	100 %	320451050

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