MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_014974	GAAGA	2	10	1820100	1820109	60 %	0 %	40 %	0 %	320450983
41503	NC_014974	GTG	2	6	1820142	1820147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450983
41504	NC_014974	ACC	2	6	1820260	1820265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450983
41505	NC_014974	GGA	2	6	1820306	1820311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450983
41506	NC_014974	ACC	2	6	1820331	1820336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450983
41507	NC_014974	GAC	2	6	1820346	1820351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450983
41508	NC_014974	GAG	2	6	1820460	1820465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450983
41509	NC_014974	AAG	3	9	1820472	1820480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450983
41510	NC_014974	CCGC	2	8	1820497	1820504	0 %	0 %	25 %	75 %	320450983
41511	NC_014974	GGA	2	6	1820615	1820620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450983
41512	NC_014974	GAG	2	6	1820732	1820737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41513	NC_014974	ATC	2	6	1820753	1820758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450984
41514	NC_014974	AGG	2	6	1820766	1820771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41515	NC_014974	G	6	6	1820770	1820775	0 %	0 %	100 %	0 %	320450984
41516	NC_014974	CCT	2	6	1820803	1820808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450984
41517	NC_014974	CCGC	2	8	1820809	1820816	0 %	0 %	25 %	75 %	320450984
41518	NC_014974	CTC	2	6	1820879	1820884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450984
41519	NC_014974	CAC	2	6	1820897	1820902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450984
41520	NC_014974	GCC	2	6	1820952	1820957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450984
41521	NC_014974	GGCAGG	2	12	1821012	1821023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320450984
41522	NC_014974	AGG	2	6	1821045	1821050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41523	NC_014974	G	6	6	1821049	1821054	0 %	0 %	100 %	0 %	320450984
41524	NC_014974	AGG	2	6	1821071	1821076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41525	NC_014974	AGG	2	6	1821111	1821116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
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41527	NC_014974	TCC	2	6	1821177	1821182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450984
41528	NC_014974	GGT	2	6	1821190	1821195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450984
41529	NC_014974	CCA	2	6	1821226	1821231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450984
41530	NC_014974	GCCC	2	8	1821242	1821249	0 %	0 %	25 %	75 %	320450984
41531	NC_014974	GGC	2	6	1821251	1821256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450984
41532	NC_014974	TCC	2	6	1821297	1821302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450984
41533	NC_014974	AGG	2	6	1821303	1821308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41534	NC_014974	CCT	3	9	1821316	1821324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450984
41535	NC_014974	CGG	2	6	1821352	1821357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450984
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41537	NC_014974	GGCCC	2	10	1821380	1821389	0 %	0 %	40 %	60 %	320450984
41538	NC_014974	AGG	2	6	1821399	1821404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41539	NC_014974	AGG	3	9	1821435	1821443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41540	NC_014974	GAG	2	6	1821494	1821499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41541	NC_014974	G	7	7	1821499	1821505	0 %	0 %	100 %	0 %	320450984
41542	NC_014974	GCG	2	6	1821552	1821557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450984
41543	NC_014974	CAC	2	6	1821560	1821565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450984
41544	NC_014974	ACCTCC	2	12	1821579	1821590	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320450984
41545	NC_014974	ACC	2	6	1821612	1821617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450984
41546	NC_014974	C	6	6	1821619	1821624	0 %	0 %	0 %	100 %	320450984
41547	NC_014974	C	6	6	1821633	1821638	0 %	0 %	0 %	100 %	320450984
41548	NC_014974	GGA	2	6	1821643	1821648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
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41550	NC_014974	C	6	6	1821759	1821764	0 %	0 %	0 %	100 %	320450984
41551	NC_014974	G	6	6	1821770	1821775	0 %	0 %	100 %	0 %	320450984
41552	NC_014974	GAG	2	6	1821808	1821813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
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41555	NC_014974	G	6	6	1821907	1821912	0 %	0 %	100 %	0 %	320450984
41556	NC_014974	GAG	2	6	1821914	1821919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41557	NC_014974	G	6	6	1821940	1821945	0 %	0 %	100 %	0 %	320450984
41558	NC_014974	CAC	2	6	1821956	1821961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450984
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41560	NC_014974	C	7	7	1822042	1822048	0 %	0 %	0 %	100 %	320450984
41561	NC_014974	GGA	2	6	1822051	1822056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450984
41562	NC_014974	TGG	2	6	1822060	1822065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450984
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41588	NC_014974	GCC	2	6	1822985	1822990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450985
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41591	NC_014974	GCA	2	6	1823085	1823090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450985
41592	NC_014974	G	6	6	1823096	1823101	0 %	0 %	100 %	0 %	320450985
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41596	NC_014974	CCCG	2	8	1823261	1823268	0 %	0 %	25 %	75 %	320450985
41597	NC_014974	GCCAG	2	10	1823298	1823307	20 %	0 %	40 %	40 %	320450985
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41600	NC_014974	TGGT	2	8	1823483	1823490	0 %	50 %	50 %	0 %	320450985
41601	NC_014974	CCA	2	6	1823502	1823507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450985
41602	NC_014974	CCTG	2	8	1823508	1823515	0 %	25 %	25 %	50 %	320450985
41603	NC_014974	CCT	2	6	1823541	1823546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450985
41604	NC_014974	CCTCC	2	10	1823650	1823659	0 %	20 %	0 %	80 %	320450985
41605	NC_014974	GCT	2	6	1823680	1823685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450985
41606	NC_014974	GGT	2	6	1823686	1823691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450985
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41608	NC_014974	CCA	2	6	1823765	1823770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450986
41609	NC_014974	GCCC	2	8	1823778	1823785	0 %	0 %	25 %	75 %	320450986
41610	NC_014974	G	7	7	1823832	1823838	0 %	0 %	100 %	0 %	320450986
41611	NC_014974	TCC	2	6	1823869	1823874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450986
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41618	NC_014974	G	6	6	1824174	1824179	0 %	0 %	100 %	0 %	320450986
41619	NC_014974	TGG	2	6	1824214	1824219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450986
41620	NC_014974	C	6	6	1824239	1824244	0 %	0 %	0 %	100 %	320450986
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41625	NC_014974	GGA	3	9	1824436	1824444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450986
41626	NC_014974	AGGG	2	8	1824460	1824467	25 %	0 %	75 %	0 %	320450986
41627	NC_014974	C	6	6	1824526	1824531	0 %	0 %	0 %	100 %	320450986
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41638	NC_014974	CCT	2	6	1824798	1824803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450987
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41642	NC_014974	CCT	2	6	1824945	1824950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450987
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41651	NC_014974	AGCC	2	8	1825507	1825514	25 %	0 %	25 %	50 %	320450987
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41666	NC_014974	GGC	2	6	1826181	1826186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450987
41667	NC_014974	TCC	2	6	1826227	1826232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41724	NC_014974	GAG	2	6	1828659	1828664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450989
41725	NC_014974	TGGG	2	8	1828711	1828718	0 %	25 %	75 %	0 %	320450989
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41733	NC_014974	GCC	2	6	1829054	1829059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450989
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