MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014974	AAGG	2	8	1799435	1799442	50 %	0 %	50 %	0 %	320450961
41002	NC_014974	GC	3	6	1799489	1799494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41003	NC_014974	CCT	2	6	1799539	1799544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450962
41004	NC_014974	GGC	2	6	1799702	1799707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450962
41005	NC_014974	AGA	2	6	1799734	1799739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450962
41006	NC_014974	TGG	2	6	1799749	1799754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450962
41007	NC_014974	CGGG	3	12	1799829	1799840	0 %	0 %	75 %	25 %	320450962
41008	NC_014974	TCG	2	6	1799844	1799849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450962
41009	NC_014974	TGA	2	6	1799851	1799856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450962
41010	NC_014974	GGC	2	6	1799879	1799884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450962
41011	NC_014974	GAA	2	6	1799885	1799890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450962
41012	NC_014974	CAGGC	2	10	1799985	1799994	20 %	0 %	40 %	40 %	320450962
41013	NC_014974	TGA	2	6	1800007	1800012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450962
41014	NC_014974	CGG	2	6	1800051	1800056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450962
41015	NC_014974	GGA	2	6	1800094	1800099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450962
41016	NC_014974	CCT	2	6	1800210	1800215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450963
41017	NC_014974	GAG	2	6	1800415	1800420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450963
41018	NC_014974	CCA	2	6	1800441	1800446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450963
41019	NC_014974	GTC	2	6	1800472	1800477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450963
41020	NC_014974	CAT	2	6	1800571	1800576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450963
41021	NC_014974	GCC	2	6	1800602	1800607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450963
41022	NC_014974	CTC	2	6	1800670	1800675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450963
41023	NC_014974	GC	3	6	1800728	1800733	0 %	0 %	50 %	50 %	320450963
41024	NC_014974	ACC	2	6	1800743	1800748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450963
41025	NC_014974	CGG	2	6	1800813	1800818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450963
41026	NC_014974	CAC	2	6	1800832	1800837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450963
41027	NC_014974	GTT	2	6	1800841	1800846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320450963
41028	NC_014974	GTG	2	6	1800875	1800880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450963
41029	NC_014974	C	7	7	1800886	1800892	0 %	0 %	0 %	100 %	320450963
41030	NC_014974	CACCGG	2	12	1800916	1800927	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320450963
41031	NC_014974	CTT	2	6	1800985	1800990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450963
41032	NC_014974	GGTG	2	8	1801011	1801018	0 %	25 %	75 %	0 %	320450963
41033	NC_014974	CTT	2	6	1801039	1801044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450963
41034	NC_014974	C	6	6	1801053	1801058	0 %	0 %	0 %	100 %	320450963
41035	NC_014974	TGG	2	6	1801122	1801127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450963
41036	NC_014974	C	6	6	1801175	1801180	0 %	0 %	0 %	100 %	320450963
41037	NC_014974	C	6	6	1801182	1801187	0 %	0 %	0 %	100 %	320450963
41038	NC_014974	GAG	2	6	1801201	1801206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450963
41039	NC_014974	C	6	6	1801349	1801354	0 %	0 %	0 %	100 %	320450963
41040	NC_014974	TGGCCT	2	12	1801368	1801379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450963
41041	NC_014974	CCA	2	6	1801416	1801421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450963
41042	NC_014974	TGT	2	6	1801485	1801490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320450963
41043	NC_014974	CTG	2	6	1801501	1801506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450963
41044	NC_014974	GGA	2	6	1801518	1801523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450963
41045	NC_014974	CGG	2	6	1801542	1801547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450963
41046	NC_014974	GCC	2	6	1801594	1801599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450963
41047	NC_014974	GCG	2	6	1801603	1801608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450963
41048	NC_014974	GCTCCA	2	12	1801656	1801667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320450963
41049	NC_014974	CCT	2	6	1801683	1801688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450963
41050	NC_014974	CGG	2	6	1801701	1801706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450963
41051	NC_014974	CCCT	2	8	1801729	1801736	0 %	25 %	0 %	75 %	320450963
41052	NC_014974	TCC	3	9	1801769	1801777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450963
41053	NC_014974	GCC	2	6	1801790	1801795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450963
41054	NC_014974	TCCC	2	8	1801800	1801807	0 %	25 %	0 %	75 %	320450963
41055	NC_014974	GCC	2	6	1801811	1801816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450963
41056	NC_014974	ACC	2	6	1801850	1801855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450963
41057	NC_014974	GAA	2	6	1801994	1801999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450964
41058	NC_014974	CAC	2	6	1802024	1802029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450964
41059	NC_014974	GTC	2	6	1802066	1802071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450964
41060	NC_014974	GGT	2	6	1802144	1802149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450964
41061	NC_014974	TGA	2	6	1802200	1802205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450964
41062	NC_014974	ACC	2	6	1802247	1802252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450964
41063	NC_014974	CCA	2	6	1802273	1802278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450964
41064	NC_014974	GGAAG	2	10	1802381	1802390	40 %	0 %	60 %	0 %	320450965
41065	NC_014974	AGA	2	6	1802393	1802398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450965
41066	NC_014974	C	6	6	1802447	1802452	0 %	0 %	0 %	100 %	320450965
41067	NC_014974	GAT	2	6	1802472	1802477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450965
41068	NC_014974	GAA	3	9	1802519	1802527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450965
41069	NC_014974	TGG	2	6	1802548	1802553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450965
41070	NC_014974	CCT	2	6	1802704	1802709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41071	NC_014974	ACC	2	6	1802725	1802730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450966
41072	NC_014974	ACC	2	6	1802743	1802748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450966
41073	NC_014974	TCC	2	6	1802763	1802768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450966
41074	NC_014974	CCAT	2	8	1802769	1802776	25 %	25 %	0 %	50 %	320450966
41075	NC_014974	C	6	6	1802831	1802836	0 %	0 %	0 %	100 %	320450966
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41077	NC_014974	G	8	8	1802911	1802918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41078	NC_014974	G	6	6	1802925	1802930	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_014974	G	6	6	1802939	1802944	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41080	NC_014974	G	6	6	1802952	1802957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41081	NC_014974	AGG	2	6	1802965	1802970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41082	NC_014974	TGG	2	6	1803010	1803015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450967
41083	NC_014974	ACG	2	6	1803022	1803027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450967
41084	NC_014974	GAG	2	6	1803087	1803092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450967
41085	NC_014974	C	6	6	1803114	1803119	0 %	0 %	0 %	100 %	320450967
41086	NC_014974	GGA	2	6	1803146	1803151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450967
41087	NC_014974	GTG	2	6	1803165	1803170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450967
41088	NC_014974	ATC	2	6	1803171	1803176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450967
41089	NC_014974	TCT	2	6	1803235	1803240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450967
41090	NC_014974	C	6	6	1803422	1803427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41091	NC_014974	TCCT	2	8	1803466	1803473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41092	NC_014974	CT	3	6	1803472	1803477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41093	NC_014974	AGG	3	9	1803485	1803493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41094	NC_014974	TTC	2	6	1803526	1803531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450968
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41097	NC_014974	ACCCTC	2	12	1803636	1803647	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320450968
41098	NC_014974	C	6	6	1803663	1803668	0 %	0 %	0 %	100 %	320450968
41099	NC_014974	GTG	2	6	1803672	1803677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450968
41100	NC_014974	GGCA	2	8	1803709	1803716	25 %	0 %	50 %	25 %	320450968
41101	NC_014974	CGG	2	6	1803725	1803730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450968
41102	NC_014974	GCGG	2	8	1803743	1803750	0 %	0 %	75 %	25 %	320450968
41103	NC_014974	ACCCTC	2	12	1803777	1803788	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320450968
41104	NC_014974	AGG	2	6	1803805	1803810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450968
41105	NC_014974	TGG	3	9	1803883	1803891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450968
41106	NC_014974	TCC	2	6	1803947	1803952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450968
41107	NC_014974	CCAG	2	8	1804069	1804076	25 %	0 %	25 %	50 %	320450968
41108	NC_014974	GCC	2	6	1804185	1804190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450968
41109	NC_014974	GGCC	2	8	1804233	1804240	0 %	0 %	50 %	50 %	320450968
41110	NC_014974	CAC	2	6	1804253	1804258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450968
41111	NC_014974	AGG	2	6	1804261	1804266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450968
41112	NC_014974	GGC	2	6	1804267	1804272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450968
41113	NC_014974	GGT	2	6	1804283	1804288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450968
41114	NC_014974	GAA	2	6	1804322	1804327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450968
41115	NC_014974	CAGGAG	2	12	1804431	1804442	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320450968
41116	NC_014974	CCGC	2	8	1804447	1804454	0 %	0 %	25 %	75 %	320450968
41117	NC_014974	GTG	2	6	1804554	1804559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450968
41118	NC_014974	TGG	2	6	1804579	1804584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450968
41119	NC_014974	CAT	2	6	1804592	1804597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450968
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41230	NC_014974	ATC	2	6	1809020	1809025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450973
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41240	NC_014974	GTG	2	6	1809401	1809406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450974
41241	NC_014974	AGG	2	6	1809429	1809434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450974
41242	NC_014974	AGG	2	6	1809467	1809472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450974
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41341	NC_014974	CTG	2	6	1813589	1813594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450978
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