MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40003	NC_014974	CGC	2	6	1755484	1755489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450918
40004	NC_014974	AGG	2	6	1755507	1755512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450918
40005	NC_014974	CAT	2	6	1755547	1755552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450918
40006	NC_014974	GGC	2	6	1755629	1755634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450918
40007	NC_014974	CCGG	2	8	1755663	1755670	0 %	0 %	50 %	50 %	320450918
40008	NC_014974	TCA	2	6	1755678	1755683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450918
40009	NC_014974	GCA	2	6	1755709	1755714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450918
40010	NC_014974	TCC	3	9	1755717	1755725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450918
40011	NC_014974	CGA	2	6	1755730	1755735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450918
40012	NC_014974	GCC	2	6	1755791	1755796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450918
40013	NC_014974	GGTG	2	8	1755799	1755806	0 %	25 %	75 %	0 %	320450918
40014	NC_014974	CCAC	2	8	1755867	1755874	25 %	0 %	0 %	75 %	320450918
40015	NC_014974	GAT	2	6	1755940	1755945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450918
40016	NC_014974	GCA	2	6	1755971	1755976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450918
40017	NC_014974	TCA	2	6	1755981	1755986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450918
40018	NC_014974	CCT	2	6	1756042	1756047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450918
40019	NC_014974	CCT	2	6	1756072	1756077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450918
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40029	NC_014974	CCCCT	2	10	1756638	1756647	0 %	20 %	0 %	80 %	320450919
40030	NC_014974	CCT	2	6	1756667	1756672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450919
40031	NC_014974	GAAGGG	2	12	1756680	1756691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450919
40032	NC_014974	TCCC	2	8	1756695	1756702	0 %	25 %	0 %	75 %	320450919
40033	NC_014974	GCG	2	6	1756717	1756722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450919
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40117	NC_014974	CCAG	2	8	1760545	1760552	25 %	0 %	25 %	50 %	320450922
40118	NC_014974	GCC	2	6	1760598	1760603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450922
40119	NC_014974	ACCTC	2	10	1760639	1760648	20 %	20 %	0 %	60 %	320450923
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40121	NC_014974	CTA	2	6	1760827	1760832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450923
40122	NC_014974	ATC	2	6	1760849	1760854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450923
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40132	NC_014974	CCCT	2	8	1761344	1761351	0 %	25 %	0 %	75 %	320450923
40133	NC_014974	TGC	2	6	1761432	1761437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450923
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40138	NC_014974	TCC	2	6	1761658	1761663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450923
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40142	NC_014974	CTTC	2	8	1761740	1761747	0 %	50 %	0 %	50 %	320450923
40143	NC_014974	TCA	2	6	1761748	1761753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450923
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40145	NC_014974	CCG	2	6	1761821	1761826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40148	NC_014974	CCAG	2	8	1762049	1762056	25 %	0 %	25 %	50 %	320450924
40149	NC_014974	GAG	2	6	1762249	1762254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450924
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40151	NC_014974	GAG	3	9	1762351	1762359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450924
40152	NC_014974	TGG	2	6	1762379	1762384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450924
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40188	NC_014974	TCC	2	6	1763812	1763817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450925
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40207	NC_014974	G	6	6	1764541	1764546	0 %	0 %	100 %	0 %	320450925
40208	NC_014974	AGG	2	6	1764549	1764554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450925
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40210	NC_014974	CTT	2	6	1764617	1764622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450925
40211	NC_014974	CCA	2	6	1764643	1764648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450925
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40214	NC_014974	AGGTGG	2	12	1764670	1764681	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320450925
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40216	NC_014974	GCC	2	6	1764773	1764778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450926
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40218	NC_014974	GCG	2	6	1764819	1764824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450926
40219	NC_014974	ACC	2	6	1764905	1764910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450926
40220	NC_014974	C	6	6	1764923	1764928	0 %	0 %	0 %	100 %	320450926
40221	NC_014974	GCCG	2	8	1765013	1765020	0 %	0 %	50 %	50 %	320450926
40222	NC_014974	AGG	2	6	1765059	1765064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450926
40223	NC_014974	C	6	6	1765088	1765093	0 %	0 %	0 %	100 %	320450926
40224	NC_014974	CCG	2	6	1765095	1765100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450926
40225	NC_014974	AGGG	2	8	1765103	1765110	25 %	0 %	75 %	0 %	320450926
40226	NC_014974	CCA	2	6	1765155	1765160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450926
40227	NC_014974	TCC	2	6	1765176	1765181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450926
40228	NC_014974	CATACC	2	12	1765183	1765194	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	320450926
40229	NC_014974	TAC	2	6	1765206	1765211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450927
40230	NC_014974	CACC	2	8	1765291	1765298	25 %	0 %	0 %	75 %	320450927
40231	NC_014974	GAG	2	6	1765327	1765332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450927
40232	NC_014974	CAC	2	6	1765361	1765366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450927
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40497	NC_014974	GTG	2	6	1776357	1776362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450938
40498	NC_014974	GCC	2	6	1776411	1776416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450938
40499	NC_014974	ACG	2	6	1776424	1776429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450938
40500	NC_014974	CGA	2	6	1776440	1776445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450938

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