MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_014974	GTG	2	6	1690838	1690843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450853
38502	NC_014974	GGA	2	6	1691020	1691025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450853
38503	NC_014974	AAG	2	6	1691069	1691074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450853
38504	NC_014974	CCT	2	6	1691107	1691112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450853
38505	NC_014974	GAAG	2	8	1691146	1691153	50 %	0 %	50 %	0 %	320450853
38506	NC_014974	TGG	2	6	1691235	1691240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450853
38507	NC_014974	CAA	2	6	1691431	1691436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320450853
38508	NC_014974	TGAGG	2	10	1691458	1691467	20 %	20 %	60 %	0 %	320450853
38509	NC_014974	GGGGCC	2	12	1691501	1691512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450853
38510	NC_014974	CCG	2	6	1691513	1691518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450853
38511	NC_014974	GTGAAG	2	12	1691555	1691566	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320450853
38512	NC_014974	CCAGCG	2	12	1691602	1691613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320450853
38513	NC_014974	AGGC	2	8	1691714	1691721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38514	NC_014974	ACC	2	6	1691753	1691758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38515	NC_014974	TGG	2	6	1691776	1691781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38516	NC_014974	CAC	2	6	1691828	1691833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38517	NC_014974	G	6	6	1691841	1691846	0 %	0 %	100 %	0 %	320450854
38518	NC_014974	GCC	2	6	1691892	1691897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450854
38519	NC_014974	CCA	2	6	1691950	1691955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38520	NC_014974	CAC	2	6	1691957	1691962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38521	NC_014974	CTT	2	6	1691963	1691968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320450854
38522	NC_014974	CTC	2	6	1691978	1691983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38523	NC_014974	CTC	2	6	1692023	1692028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38524	NC_014974	CCG	2	6	1692082	1692087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450854
38525	NC_014974	CCA	2	6	1692088	1692093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38526	NC_014974	TCC	2	6	1692159	1692164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38527	NC_014974	CCT	2	6	1692190	1692195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38528	NC_014974	CCT	2	6	1692205	1692210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38529	NC_014974	CCT	2	6	1692229	1692234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38530	NC_014974	GGGGAA	2	12	1692235	1692246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450854
38531	NC_014974	CCT	2	6	1692274	1692279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38532	NC_014974	CCT	2	6	1692289	1692294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38533	NC_014974	AGG	2	6	1692351	1692356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450854
38534	NC_014974	CCA	2	6	1692379	1692384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38535	NC_014974	CCTC	2	8	1692406	1692413	0 %	25 %	0 %	75 %	320450854
38536	NC_014974	TCC	2	6	1692417	1692422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38537	NC_014974	CTC	2	6	1692557	1692562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38538	NC_014974	CTC	2	6	1692566	1692571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38539	NC_014974	CCT	2	6	1692688	1692693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38540	NC_014974	GTA	2	6	1692737	1692742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450854
38541	NC_014974	CCGCA	2	10	1692743	1692752	20 %	0 %	20 %	60 %	320450854
38542	NC_014974	GAA	2	6	1692775	1692780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450854
38543	NC_014974	CCA	2	6	1692787	1692792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38544	NC_014974	CAG	2	6	1692833	1692838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450854
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38546	NC_014974	TGG	2	6	1692892	1692897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450854
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38549	NC_014974	GGGT	2	8	1693173	1693180	0 %	25 %	75 %	0 %	320450854
38550	NC_014974	GAA	2	6	1693223	1693228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450854
38551	NC_014974	CCT	2	6	1693244	1693249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38552	NC_014974	GCCG	2	8	1693258	1693265	0 %	0 %	50 %	50 %	320450854
38553	NC_014974	GTA	2	6	1693349	1693354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450854
38554	NC_014974	CAC	2	6	1693394	1693399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
38555	NC_014974	CTC	2	6	1693412	1693417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38556	NC_014974	GGT	2	6	1693418	1693423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450854
38557	NC_014974	TCG	2	6	1693434	1693439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450854
38558	NC_014974	TCC	2	6	1693509	1693514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450854
38559	NC_014974	GAA	2	6	1693571	1693576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450854
38560	NC_014974	CCA	2	6	1693621	1693626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450854
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38562	NC_014974	GTA	2	6	1693667	1693672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450854
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38564	NC_014974	CTC	2	6	1693708	1693713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38565	NC_014974	CGGG	2	8	1693738	1693745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38566	NC_014974	TCC	2	6	1693815	1693820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450855
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38570	NC_014974	C	7	7	1694014	1694020	0 %	0 %	0 %	100 %	320450855
38571	NC_014974	CAC	2	6	1694078	1694083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450855
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38578	NC_014974	TGG	2	6	1694299	1694304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450855
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38583	NC_014974	GATC	2	8	1694583	1694590	25 %	25 %	25 %	25 %	320450856
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38586	NC_014974	CAC	2	6	1694764	1694769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450856
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38588	NC_014974	GTC	2	6	1694839	1694844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450856
38589	NC_014974	ACC	2	6	1694864	1694869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450856
38590	NC_014974	GCA	2	6	1694936	1694941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450856
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38594	NC_014974	CCAT	2	8	1695082	1695089	25 %	25 %	0 %	50 %	320450857
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38598	NC_014974	TGGCGG	2	12	1695146	1695157	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320450857
38599	NC_014974	CAC	2	6	1695168	1695173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450857
38600	NC_014974	CCCCT	2	10	1695219	1695228	0 %	20 %	0 %	80 %	320450857
38601	NC_014974	CGC	2	6	1695252	1695257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450857
38602	NC_014974	GAG	2	6	1695264	1695269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450857
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38604	NC_014974	CGG	2	6	1695374	1695379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450857
38605	NC_014974	TCC	2	6	1695400	1695405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450857
38606	NC_014974	TGA	2	6	1695413	1695418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450857
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38611	NC_014974	GGA	2	6	1695819	1695824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450858
38612	NC_014974	G	6	6	1695837	1695842	0 %	0 %	100 %	0 %	320450858
38613	NC_014974	AGG	2	6	1695861	1695866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450858
38614	NC_014974	CCT	2	6	1695903	1695908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450858
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