MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_014974	CCT	2	6	1560823	1560828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
35503	NC_014974	GAAA	2	8	1560840	1560847	75 %	0 %	25 %	0 %	320450701
35504	NC_014974	CCTCC	2	10	1560878	1560887	0 %	20 %	0 %	80 %	320450701
35505	NC_014974	GTG	2	6	1560990	1560995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450701
35506	NC_014974	CTCG	2	8	1561010	1561017	0 %	25 %	25 %	50 %	320450701
35507	NC_014974	CCA	2	6	1561039	1561044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450701
35508	NC_014974	GAA	2	6	1561069	1561074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450701
35509	NC_014974	GAGTA	2	10	1561159	1561168	40 %	20 %	40 %	0 %	320450701
35510	NC_014974	G	6	6	1561232	1561237	0 %	0 %	100 %	0 %	320450701
35511	NC_014974	GGA	2	6	1561248	1561253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450701
35512	NC_014974	GTC	2	6	1561316	1561321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320450701
35513	NC_014974	CTC	2	6	1561347	1561352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
35514	NC_014974	CTC	2	6	1561367	1561372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
35515	NC_014974	CCT	2	6	1561399	1561404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
35516	NC_014974	GAG	2	6	1561447	1561452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450701
35517	NC_014974	GTA	2	6	1561469	1561474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450701
35518	NC_014974	CGG	2	6	1561497	1561502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450701
35519	NC_014974	AGA	2	6	1561537	1561542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450701
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35521	NC_014974	CCT	2	6	1561606	1561611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
35522	NC_014974	CT	3	6	1561638	1561643	0 %	50 %	0 %	50 %	320450701
35523	NC_014974	GAA	2	6	1561663	1561668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450701
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35525	NC_014974	TCC	2	6	1561781	1561786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450701
35526	NC_014974	CCT	2	6	1561910	1561915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320450702
35527	NC_014974	AGG	2	6	1561920	1561925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450702
35528	NC_014974	GAA	2	6	1561961	1561966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450702
35529	NC_014974	CAC	2	6	1562124	1562129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450702
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35531	NC_014974	CTC	2	6	1562225	1562230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35532	NC_014974	AAG	2	6	1562292	1562297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320450703
35533	NC_014974	GAT	2	6	1562352	1562357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450703
35534	NC_014974	ATG	2	6	1562383	1562388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450703
35535	NC_014974	GAT	2	6	1562439	1562444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450703
35536	NC_014974	ACC	2	6	1562484	1562489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320450703
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35538	NC_014974	CCT	2	6	1562595	1562600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35539	NC_014974	GGC	2	6	1562675	1562680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450704
35540	NC_014974	TGA	3	9	1562710	1562718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450704
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35542	NC_014974	ATG	2	6	1562772	1562777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450704
35543	NC_014974	GAT	2	6	1562828	1562833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450704
35544	NC_014974	GCC	2	6	1562907	1562912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450704
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35549	NC_014974	GGC	2	6	1563067	1563072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320450705
35550	NC_014974	TGA	3	9	1563102	1563110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450705
35551	NC_014974	CCCCAG	2	12	1563151	1563162	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320450705
35552	NC_014974	ATG	2	6	1563164	1563169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450705
35553	NC_014974	GAT	2	6	1563220	1563225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320450705
35554	NC_014974	GCC	2	6	1563299	1563304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450705
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35556	NC_014974	GCC	2	6	1563320	1563325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320450705
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35560	NC_014974	C	7	7	1563421	1563427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35561	NC_014974	AGG	2	6	1563565	1563570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320450706
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35572	NC_014974	ACCGGA	2	12	1564062	1564073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320450706
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35589	NC_014974	TCAACC	2	12	1564618	1564629	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	320450707
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35601	NC_014974	GC	4	8	1565171	1565178	0 %	0 %	50 %	50 %	320450707
35602	NC_014974	TGG	2	6	1565187	1565192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320450707
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35604	NC_014974	GGTCTT	2	12	1565251	1565262	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	320450707
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35608	NC_014974	TCT	2	6	1565432	1565437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35609	NC_014974	ACC	2	6	1565472	1565477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35610	NC_014974	CAC	2	6	1565501	1565506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35611	NC_014974	G	6	6	1565536	1565541	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35612	NC_014974	ACT	2	6	1565569	1565574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35613	NC_014974	CTA	2	6	1565703	1565708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320450708
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35846	NC_014974	CG	3	6	1576624	1576629	0 %	0 %	50 %	50 %	320450721
35847	NC_014974	CGTCCA	2	12	1576652	1576663	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320450721
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