MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014974	GGT	2	6	106868	106873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449226
2503	NC_014974	TGG	2	6	106918	106923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449226
2504	NC_014974	AGG	2	6	106924	106929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449226
2505	NC_014974	ACG	2	6	106972	106977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449226
2506	NC_014974	CACCTG	2	12	106992	107003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320449226
2507	NC_014974	CCT	2	6	107054	107059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449226
2508	NC_014974	AGG	2	6	107071	107076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449226
2509	NC_014974	GGAGGT	2	12	107099	107110	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449226
2510	NC_014974	AGG	2	6	107276	107281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449227
2511	NC_014974	GGC	2	6	107340	107345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449227
2512	NC_014974	GGA	2	6	107352	107357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449227
2513	NC_014974	TGG	2	6	107396	107401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449227
2514	NC_014974	AGG	2	6	107444	107449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449227
2515	NC_014974	GGA	2	6	107466	107471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449227
2516	NC_014974	CTT	2	6	107505	107510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449227
2517	NC_014974	CGCCCT	2	12	107523	107534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449227
2518	NC_014974	GGGA	2	8	107549	107556	25 %	0 %	75 %	0 %	320449227
2519	NC_014974	GGGC	2	8	107586	107593	0 %	0 %	75 %	25 %	320449227
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2521	NC_014974	CGC	2	6	107610	107615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449227
2522	NC_014974	GTG	2	6	107632	107637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449227
2523	NC_014974	ACC	2	6	107654	107659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449227
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2530	NC_014974	GGCCT	2	10	107854	107863	0 %	20 %	40 %	40 %	320449227
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2536	NC_014974	CCTT	2	8	108033	108040	0 %	50 %	0 %	50 %	320449227
2537	NC_014974	G	6	6	108046	108051	0 %	0 %	100 %	0 %	320449227
2538	NC_014974	AAG	2	6	108052	108057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449227
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2542	NC_014974	ACC	2	6	108170	108175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449227
2543	NC_014974	GGT	2	6	108210	108215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449227
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2545	NC_014974	TGG	2	6	108284	108289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449227
2546	NC_014974	GAA	2	6	108292	108297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449227
2547	NC_014974	GTG	3	9	108340	108348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449227
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2549	NC_014974	ACC	2	6	108426	108431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_014974	GGT	2	6	108444	108449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_014974	GCGG	2	8	108475	108482	0 %	0 %	75 %	25 %	320449228
2552	NC_014974	GCCACG	2	12	108563	108574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449228
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2555	NC_014974	G	6	6	108655	108660	0 %	0 %	100 %	0 %	320449228
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2558	NC_014974	CCA	2	6	108912	108917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449228
2559	NC_014974	G	6	6	108945	108950	0 %	0 %	100 %	0 %	320449228
2560	NC_014974	CCT	2	6	109035	109040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449228
2561	NC_014974	GTT	2	6	109075	109080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449228
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2564	NC_014974	GA	3	6	109136	109141	50 %	0 %	50 %	0 %	320449228
2565	NC_014974	AGG	4	12	109235	109246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449228
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2569	NC_014974	AAGGG	2	10	109379	109388	40 %	0 %	60 %	0 %	320449228
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2579	NC_014974	GGTG	2	8	109999	110006	0 %	25 %	75 %	0 %	320449229
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2582	NC_014974	CCTTCC	2	12	110352	110363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449230
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2593	NC_014974	CAAGG	2	10	110927	110936	40 %	0 %	40 %	20 %	320449230
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2596	NC_014974	AAGG	2	8	110986	110993	50 %	0 %	50 %	0 %	320449230
2597	NC_014974	GCG	2	6	111035	111040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449230
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2599	NC_014974	GGA	2	6	111088	111093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449230
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2603	NC_014974	GGGAG	2	10	111346	111355	20 %	0 %	80 %	0 %	320449231
2604	NC_014974	CTGG	2	8	111356	111363	0 %	25 %	50 %	25 %	320449231
2605	NC_014974	CAA	2	6	111451	111456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449231
2606	NC_014974	CCT	3	9	111469	111477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449231
2607	NC_014974	CTC	2	6	111497	111502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449231
2608	NC_014974	GCG	2	6	111592	111597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449231
2609	NC_014974	TC	3	6	111607	111612	0 %	50 %	0 %	50 %	320449231
2610	NC_014974	CGA	2	6	111628	111633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449231
2611	NC_014974	GAG	2	6	111656	111661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449231
2612	NC_014974	GGA	2	6	111685	111690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449231
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2614	NC_014974	CTC	3	9	111744	111752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2615	NC_014974	ACCT	2	8	111753	111760	25 %	25 %	0 %	50 %	320449232
2616	NC_014974	CGGG	2	8	111801	111808	0 %	0 %	75 %	25 %	320449232
2617	NC_014974	TGG	2	6	111817	111822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
2618	NC_014974	CTC	2	6	111840	111845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2619	NC_014974	CAT	2	6	111911	111916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449232
2620	NC_014974	CTT	2	6	111947	111952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449232
2621	NC_014974	GCG	2	6	111960	111965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449232
2622	NC_014974	TCC	2	6	112006	112011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2623	NC_014974	CCT	2	6	112130	112135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
2624	NC_014974	GGC	2	6	112145	112150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449232
2625	NC_014974	GTG	2	6	112200	112205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
2626	NC_014974	GTTT	2	8	112235	112242	0 %	75 %	25 %	0 %	320449232
2627	NC_014974	CTG	2	6	112263	112268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449232
2628	NC_014974	GGT	2	6	112283	112288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449232
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2631	NC_014974	C	7	7	112343	112349	0 %	0 %	0 %	100 %	320449232
2632	NC_014974	TCC	2	6	112420	112425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449232
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2644	NC_014974	GGGAA	2	10	112802	112811	40 %	0 %	60 %	0 %	320449232
2645	NC_014974	AGCC	2	8	112909	112916	25 %	0 %	25 %	50 %	320449233
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2653	NC_014974	G	7	7	113110	113116	0 %	0 %	100 %	0 %	320449233
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2656	NC_014974	GA	3	6	113267	113272	50 %	0 %	50 %	0 %	320449233
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2662	NC_014974	GCCACG	2	12	113728	113739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449233
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2727	NC_014974	CTC	2	6	116349	116354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449236
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2731	NC_014974	GGGT	2	8	116441	116448	0 %	25 %	75 %	0 %	320449236
2732	NC_014974	CCT	2	6	116463	116468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449236
2733	NC_014974	GGCCT	2	10	116497	116506	0 %	20 %	40 %	40 %	320449236
2734	NC_014974	GTA	2	6	116544	116549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449236
2735	NC_014974	AAG	2	6	116587	116592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449236
2736	NC_014974	GAG	2	6	116601	116606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449236
2737	NC_014974	GAG	2	6	116658	116663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449236
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2739	NC_014974	CCTT	2	8	116680	116687	0 %	50 %	0 %	50 %	320449236
2740	NC_014974	CCA	3	9	116708	116716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449236
2741	NC_014974	G	8	8	116751	116758	0 %	0 %	100 %	0 %	320449236
2742	NC_014974	AGA	2	6	116854	116859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449236
2743	NC_014974	TTG	2	6	116881	116886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449236
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2745	NC_014974	AGA	2	6	116911	116916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449236
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2867	NC_014974	TGATG	2	10	121623	121632	20 %	40 %	40 %	0 %	320449240
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2982	NC_014974	CTC	2	6	126665	126670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2989	NC_014974	GAG	2	6	126960	126965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449245
2990	NC_014974	CAC	2	6	126993	126998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449245
2991	NC_014974	CGG	2	6	127067	127072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449245
2992	NC_014974	CTT	2	6	127115	127120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449245
2993	NC_014974	GCC	2	6	127159	127164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449245
2994	NC_014974	GGCCTT	2	12	127173	127184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449245
2995	NC_014974	ACC	2	6	127201	127206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449245
2996	NC_014974	CCT	3	9	127271	127279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449245
2997	NC_014974	GGC	2	6	127368	127373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449245
2998	NC_014974	CCA	2	6	127376	127381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449245
2999	NC_014974	GAA	2	6	127422	127427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449245
3000	NC_014974	CTG	2	6	127452	127457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449245

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