MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014974	TCC	3	9	702716	702724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449843
16503	NC_014974	GAA	2	6	702799	702804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449843
16504	NC_014974	GAT	2	6	702826	702831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449843
16505	NC_014974	CCCG	2	8	702842	702849	0 %	0 %	25 %	75 %	320449843
16506	NC_014974	G	6	6	702861	702866	0 %	0 %	100 %	0 %	320449843
16507	NC_014974	GCT	2	6	702877	702882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449843
16508	NC_014974	CCA	2	6	702903	702908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449843
16509	NC_014974	GGA	2	6	702909	702914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449843
16510	NC_014974	TCG	2	6	702983	702988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449843
16511	NC_014974	AGA	2	6	702990	702995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449843
16512	NC_014974	GCGG	2	8	703036	703043	0 %	0 %	75 %	25 %	320449843
16513	NC_014974	GAT	2	6	703045	703050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449843
16514	NC_014974	TGG	2	6	703101	703106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449843
16515	NC_014974	CGCC	2	8	703167	703174	0 %	0 %	25 %	75 %	320449844
16516	NC_014974	CCG	4	12	703176	703187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449844
16517	NC_014974	CCA	2	6	703188	703193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449844
16518	NC_014974	GGA	2	6	703258	703263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449844
16519	NC_014974	GGC	2	6	703267	703272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449844
16520	NC_014974	TCC	3	9	703376	703384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449844
16521	NC_014974	CCAC	2	8	703395	703402	25 %	0 %	0 %	75 %	320449844
16522	NC_014974	ACC	2	6	703415	703420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449844
16523	NC_014974	CTT	2	6	703435	703440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449844
16524	NC_014974	GGCG	2	8	703488	703495	0 %	0 %	75 %	25 %	320449844
16525	NC_014974	CTC	2	6	703597	703602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449844
16526	NC_014974	CTC	2	6	703612	703617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449844
16527	NC_014974	TCC	2	6	703629	703634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449844
16528	NC_014974	G	6	6	703681	703686	0 %	0 %	100 %	0 %	320449844
16529	NC_014974	CGT	2	6	703713	703718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449844
16530	NC_014974	CCT	2	6	703767	703772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449844
16531	NC_014974	GGC	2	6	703800	703805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449844
16532	NC_014974	GGT	2	6	703822	703827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449844
16533	NC_014974	TCG	2	6	703829	703834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449844
16534	NC_014974	TCCATG	2	12	703898	703909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320449844
16535	NC_014974	CCCT	2	8	703951	703958	0 %	25 %	0 %	75 %	320449844
16536	NC_014974	GAT	2	6	703975	703980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449844
16537	NC_014974	GGA	2	6	703983	703988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449844
16538	NC_014974	GCC	2	6	704060	704065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449844
16539	NC_014974	CTGG	2	8	704095	704102	0 %	25 %	50 %	25 %	320449844
16540	NC_014974	TGCCGA	2	12	704103	704114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449844
16541	NC_014974	GTGG	2	8	704137	704144	0 %	25 %	75 %	0 %	320449844
16542	NC_014974	AAG	2	6	704246	704251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449844
16543	NC_014974	GTGG	2	8	704335	704342	0 %	25 %	75 %	0 %	320449844
16544	NC_014974	AGG	2	6	704444	704449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449844
16545	NC_014974	CTCC	2	8	704540	704547	0 %	25 %	0 %	75 %	320449845
16546	NC_014974	GCCC	2	8	704608	704615	0 %	0 %	25 %	75 %	320449845
16547	NC_014974	CGC	2	6	704639	704644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16548	NC_014974	TGCCTT	2	12	704664	704675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16553	NC_014974	GGC	2	6	704901	704906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449846
16554	NC_014974	GGC	2	6	704967	704972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449846
16555	NC_014974	GGAGG	2	10	705042	705051	20 %	0 %	80 %	0 %	320449846
16556	NC_014974	CCT	2	6	705068	705073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449846
16557	NC_014974	GT	3	6	705297	705302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_014974	GTGG	2	8	705458	705465	0 %	25 %	75 %	0 %	320449847
16559	NC_014974	CTT	2	6	705494	705499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449847
16560	NC_014974	GCT	2	6	705576	705581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449847
16561	NC_014974	GGC	2	6	705593	705598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449847
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16564	NC_014974	GCC	2	6	705729	705734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449847
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16570	NC_014974	CTT	2	6	705918	705923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449847
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16590	NC_014974	C	6	6	706757	706762	0 %	0 %	0 %	100 %	320449848
16591	NC_014974	GGC	2	6	706777	706782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449848
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16594	NC_014974	CCTTC	2	10	706876	706885	0 %	40 %	0 %	60 %	320449848
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16601	NC_014974	GGGA	2	8	707238	707245	25 %	0 %	75 %	0 %	320449849
16602	NC_014974	CGTGGA	2	12	707341	707352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449849
16603	NC_014974	AGG	2	6	707412	707417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449849
16604	NC_014974	GCA	2	6	707525	707530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16605	NC_014974	CTG	2	6	707554	707559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16606	NC_014974	TGG	2	6	707592	707597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16607	NC_014974	TCA	2	6	707666	707671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16608	NC_014974	CCG	2	6	707787	707792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16609	NC_014974	GAT	2	6	707803	707808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_014974	CTT	2	6	707861	707866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_014974	CCT	2	6	707870	707875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16612	NC_014974	TGCC	2	8	707930	707937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16613	NC_014974	CTTC	2	8	707948	707955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16614	NC_014974	CTC	2	6	707963	707968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16615	NC_014974	CCT	2	6	707972	707977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16616	NC_014974	C	7	7	708017	708023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16617	NC_014974	G	7	7	708028	708034	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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16620	NC_014974	CTGGT	2	10	708205	708214	0 %	40 %	40 %	20 %	320449850
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16622	NC_014974	GTT	2	6	708339	708344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449850
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16867	NC_014974	TGG	2	6	720109	720114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449861
16868	NC_014974	GGA	2	6	720128	720133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449861
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16870	NC_014974	TGG	2	6	720346	720351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449861
16871	NC_014974	GAG	2	6	720495	720500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449861
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16895	NC_014974	CCCTT	2	10	721285	721294	0 %	40 %	0 %	60 %	320449862
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16898	NC_014974	CCT	2	6	721332	721337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16899	NC_014974	GCG	2	6	721380	721385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449863
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16919	NC_014974	TC	3	6	722334	722339	0 %	50 %	0 %	50 %	320449863
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16932	NC_014974	TCC	2	6	723419	723424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449863
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16970	NC_014974	ACG	2	6	725132	725137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449863
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16972	NC_014974	GGGGA	2	10	725266	725275	20 %	0 %	80 %	0 %	320449863
16973	NC_014974	GGC	2	6	725325	725330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449863
16974	NC_014974	GGA	2	6	725343	725348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449863
16975	NC_014974	TTTCC	2	10	725352	725361	0 %	60 %	0 %	40 %	320449863
16976	NC_014974	CTACCG	2	12	725523	725534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320449863
16977	NC_014974	GGGC	2	8	725535	725542	0 %	0 %	75 %	25 %	320449863
16978	NC_014974	TGG	2	6	725567	725572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449863
16979	NC_014974	AGGCGG	2	12	725669	725680	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320449863
16980	NC_014974	AGG	2	6	725693	725698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449863
16981	NC_014974	GGT	2	6	725826	725831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449863
16982	NC_014974	CCT	2	6	725892	725897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449863
16983	NC_014974	G	7	7	725922	725928	0 %	0 %	100 %	0 %	320449863
16984	NC_014974	GGGC	2	8	725951	725958	0 %	0 %	75 %	25 %	320449863
16985	NC_014974	GAGGGG	2	12	725971	725982	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	320449863
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16987	NC_014974	CTGC	2	8	726012	726019	0 %	25 %	25 %	50 %	320449863
16988	NC_014974	GGC	2	6	726239	726244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449863
16989	NC_014974	CCTGG	2	10	726549	726558	0 %	20 %	40 %	40 %	320449863
16990	NC_014974	AGG	2	6	726647	726652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449863
16991	NC_014974	AAGG	2	8	726676	726683	50 %	0 %	50 %	0 %	320449863
16992	NC_014974	GCCTG	2	10	726749	726758	0 %	20 %	40 %	40 %	320449863
16993	NC_014974	G	6	6	726774	726779	0 %	0 %	100 %	0 %	320449863
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17000	NC_014974	TGGAGG	2	12	727193	727204	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449863

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