MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014974	CCA	2	6	682354	682359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449822
16002	NC_014974	GGA	2	6	682360	682365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449822
16003	NC_014974	CTCC	2	8	682459	682466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16004	NC_014974	T	6	6	682495	682500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_014974	CCTC	2	8	682502	682509	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16006	NC_014974	G	7	7	682582	682588	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_014974	AAGGT	2	10	682631	682640	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_014974	CTC	2	6	682648	682653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16009	NC_014974	GA	3	6	682661	682666	50 %	0 %	50 %	0 %	320449823
16010	NC_014974	GAG	2	6	682699	682704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16011	NC_014974	GCG	2	6	682705	682710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449823
16012	NC_014974	CTC	2	6	682822	682827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16013	NC_014974	CAC	2	6	682852	682857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16014	NC_014974	CCG	2	6	682905	682910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449823
16015	NC_014974	CGG	2	6	682953	682958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449823
16016	NC_014974	CGT	2	6	682989	682994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449823
16017	NC_014974	CTC	2	6	683023	683028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16018	NC_014974	CAT	2	6	683122	683127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449823
16019	NC_014974	CCT	2	6	683159	683164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16020	NC_014974	G	6	6	683171	683176	0 %	0 %	100 %	0 %	320449823
16021	NC_014974	CTC	2	6	683188	683193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16022	NC_014974	CCA	2	6	683196	683201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16023	NC_014974	GGA	2	6	683253	683258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16024	NC_014974	G	6	6	683262	683267	0 %	0 %	100 %	0 %	320449823
16025	NC_014974	GCCC	2	8	683280	683287	0 %	0 %	25 %	75 %	320449823
16026	NC_014974	CCA	2	6	683299	683304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16027	NC_014974	CCG	2	6	683323	683328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449823
16028	NC_014974	CCA	2	6	683337	683342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16029	NC_014974	GGA	2	6	683410	683415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16030	NC_014974	CCA	2	6	683508	683513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16031	NC_014974	CGGGGT	2	12	683529	683540	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449823
16032	NC_014974	GGA	2	6	683559	683564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16033	NC_014974	CTCC	2	8	683574	683581	0 %	25 %	0 %	75 %	320449823
16034	NC_014974	AGG	2	6	683582	683587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16035	NC_014974	G	6	6	683586	683591	0 %	0 %	100 %	0 %	320449823
16036	NC_014974	TGG	2	6	683634	683639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
16037	NC_014974	AGA	2	6	683643	683648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449823
16038	NC_014974	CGT	3	9	683649	683657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449823
16039	NC_014974	AAG	2	6	683669	683674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449823
16040	NC_014974	GGT	2	6	683682	683687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
16041	NC_014974	GGT	2	6	683689	683694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
16042	NC_014974	CAC	2	6	683698	683703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16043	NC_014974	C	6	6	683707	683712	0 %	0 %	0 %	100 %	320449823
16044	NC_014974	GTGGAC	2	12	683713	683724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449823
16045	NC_014974	CCA	2	6	683787	683792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16046	NC_014974	ACC	2	6	683888	683893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449823
16047	NC_014974	CCT	2	6	683916	683921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16048	NC_014974	GAG	2	6	683980	683985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16049	NC_014974	GGC	2	6	684171	684176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449823
16050	NC_014974	TCC	2	6	684212	684217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16051	NC_014974	AGG	2	6	684239	684244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449823
16052	NC_014974	TGG	2	6	684303	684308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449823
16053	NC_014974	CCT	2	6	684474	684479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449823
16054	NC_014974	AAG	2	6	684508	684513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449823
16055	NC_014974	CTC	3	9	684530	684538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16056	NC_014974	GCC	2	6	684589	684594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449824
16057	NC_014974	CGGGG	2	10	684645	684654	0 %	0 %	80 %	20 %	320449824
16058	NC_014974	AGG	2	6	684675	684680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
16059	NC_014974	TCT	2	6	684691	684696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449824
16060	NC_014974	AGG	2	6	684702	684707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
16061	NC_014974	CTC	2	6	684716	684721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16062	NC_014974	CCT	2	6	684727	684732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16063	NC_014974	TCC	2	6	684768	684773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16064	NC_014974	GGC	2	6	684788	684793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16065	NC_014974	GGGT	2	8	684810	684817	0 %	25 %	75 %	0 %	320449824
16066	NC_014974	GCC	2	6	684825	684830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449824
16067	NC_014974	CGG	2	6	684838	684843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16068	NC_014974	TGA	2	6	684868	684873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449824
16069	NC_014974	CCT	2	6	684874	684879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16070	NC_014974	C	7	7	684967	684973	0 %	0 %	0 %	100 %	320449824
16071	NC_014974	CCA	2	6	684982	684987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16072	NC_014974	GCCCT	2	10	684997	685006	0 %	20 %	20 %	60 %	320449824
16073	NC_014974	AGG	2	6	685008	685013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
16074	NC_014974	AGG	2	6	685034	685039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
16075	NC_014974	CCA	2	6	685060	685065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16076	NC_014974	CAGGG	2	10	685136	685145	20 %	0 %	60 %	20 %	320449824
16077	NC_014974	CCA	2	6	685163	685168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16078	NC_014974	GCCAG	2	10	685180	685189	20 %	0 %	40 %	40 %	320449824
16079	NC_014974	CCA	2	6	685243	685248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16080	NC_014974	AGG	2	6	685255	685260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
16081	NC_014974	GGGCC	2	10	685262	685271	0 %	0 %	60 %	40 %	320449824
16082	NC_014974	GGC	2	6	685279	685284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16083	NC_014974	GAG	2	6	685313	685318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
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16085	NC_014974	TCC	2	6	685383	685388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
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16087	NC_014974	C	6	6	685404	685409	0 %	0 %	0 %	100 %	320449824
16088	NC_014974	CAC	2	6	685445	685450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16089	NC_014974	AGA	2	6	685453	685458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449824
16090	NC_014974	CGG	2	6	685462	685467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16091	NC_014974	CCA	2	6	685528	685533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16092	NC_014974	GCCGTG	2	12	685541	685552	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320449824
16093	NC_014974	GGA	2	6	685591	685596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
16094	NC_014974	GTG	2	6	685671	685676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449824
16095	NC_014974	CCA	2	6	685726	685731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
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16098	NC_014974	CCA	2	6	685780	685785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16099	NC_014974	GGCCCA	2	12	685831	685842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449824
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16101	NC_014974	GGC	2	6	685975	685980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16102	NC_014974	CCCATC	2	12	686024	686035	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449824
16103	NC_014974	TGA	2	6	686041	686046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449824
16104	NC_014974	CTG	2	6	686054	686059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449824
16105	NC_014974	GGC	2	6	686096	686101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16106	NC_014974	TCC	2	6	686111	686116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16107	NC_014974	GTGG	2	8	686129	686136	0 %	25 %	75 %	0 %	320449824
16108	NC_014974	CCA	2	6	686284	686289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16109	NC_014974	G	6	6	686330	686335	0 %	0 %	100 %	0 %	320449824
16110	NC_014974	GGC	2	6	686392	686397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449824
16111	NC_014974	CGAAGG	2	12	686398	686409	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320449824
16112	NC_014974	CAC	3	9	686426	686434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449824
16113	NC_014974	CTCCC	2	10	686453	686462	0 %	20 %	0 %	80 %	320449824
16114	NC_014974	CTC	2	6	686507	686512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
16115	NC_014974	CCG	2	6	686518	686523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449824
16116	NC_014974	G	7	7	686605	686611	0 %	0 %	100 %	0 %	320449824
16117	NC_014974	AGG	2	6	686634	686639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449824
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16119	NC_014974	CCT	2	6	686665	686670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
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16121	NC_014974	TCC	2	6	686787	686792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449824
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16243	NC_014974	GGT	2	6	691790	691795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449830
16244	NC_014974	GGACGT	2	12	691796	691807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449830
16245	NC_014974	GGT	2	6	691850	691855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449830
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16341	NC_014974	ATT	2	6	695917	695922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320449835
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16345	NC_014974	GTG	3	9	696054	696062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449835
16346	NC_014974	TCC	2	6	696091	696096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449835
16347	NC_014974	TGG	2	6	696193	696198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449835
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16349	NC_014974	GCC	2	6	696240	696245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449835
16350	NC_014974	CTGGC	2	10	696297	696306	0 %	20 %	40 %	40 %	320449835
16351	NC_014974	GGC	2	6	696314	696319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449835
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16353	NC_014974	GAC	2	6	696351	696356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449835
16354	NC_014974	CTT	2	6	696368	696373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449835
16355	NC_014974	CCG	2	6	696376	696381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449835
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16357	NC_014974	ATC	2	6	696468	696473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449835
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16359	NC_014974	GGA	2	6	696517	696522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449835
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16482	NC_014974	CATGGC	2	12	701858	701869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449842
16483	NC_014974	CCT	2	6	701917	701922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449842
16484	NC_014974	GCC	2	6	702003	702008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449842
16485	NC_014974	GCCTCC	2	12	702069	702080	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449842
16486	NC_014974	C	6	6	702145	702150	0 %	0 %	0 %	100 %	320449842
16487	NC_014974	TCC	2	6	702159	702164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449842
16488	NC_014974	G	6	6	702169	702174	0 %	0 %	100 %	0 %	320449842
16489	NC_014974	GCCC	2	8	702298	702305	0 %	0 %	25 %	75 %	320449842
16490	NC_014974	GCC	2	6	702330	702335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449842
16491	NC_014974	C	6	6	702340	702345	0 %	0 %	0 %	100 %	320449842
16492	NC_014974	GCC	2	6	702387	702392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449842
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16499	NC_014974	G	6	6	702648	702653	0 %	0 %	100 %	0 %	320449843
16500	NC_014974	CCT	2	6	702675	702680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449843

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