MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014974	CCA	2	6	662757	662762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449801
15502	NC_014974	CCG	2	6	662815	662820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449801
15503	NC_014974	GCCCC	2	10	662894	662903	0 %	0 %	20 %	80 %	320449801
15504	NC_014974	GCC	2	6	662912	662917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449801
15505	NC_014974	GGC	2	6	662938	662943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449801
15506	NC_014974	TGG	2	6	663036	663041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449801
15507	NC_014974	CCA	2	6	663165	663170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449801
15508	NC_014974	GGT	2	6	663172	663177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449801
15509	NC_014974	C	6	6	663183	663188	0 %	0 %	0 %	100 %	320449801
15510	NC_014974	GT	3	6	663254	663259	0 %	50 %	50 %	0 %	320449801
15511	NC_014974	TCA	2	6	663267	663272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449801
15512	NC_014974	CCT	2	6	663288	663293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15513	NC_014974	CGG	2	6	663366	663371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_014974	ATA	2	6	663373	663378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_014974	AGG	2	6	663538	663543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449802
15516	NC_014974	G	7	7	663571	663577	0 %	0 %	100 %	0 %	320449802
15517	NC_014974	GTG	3	9	663612	663620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449802
15518	NC_014974	GAA	2	6	663636	663641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449802
15519	NC_014974	GGCTTC	2	12	663699	663710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449802
15520	NC_014974	AAG	2	6	663789	663794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449802
15521	NC_014974	CCG	2	6	663926	663931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449802
15522	NC_014974	GAG	3	9	663999	664007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449802
15523	NC_014974	GGA	2	6	664064	664069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449802
15524	NC_014974	CCCCTC	2	12	664083	664094	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320449802
15525	NC_014974	GGGT	2	8	664113	664120	0 %	25 %	75 %	0 %	320449802
15526	NC_014974	GGC	2	6	664164	664169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449802
15527	NC_014974	GCC	2	6	664205	664210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449802
15528	NC_014974	CCT	2	6	664237	664242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449803
15529	NC_014974	CCT	2	6	664279	664284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449803
15530	NC_014974	CCA	2	6	664288	664293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449803
15531	NC_014974	GGC	2	6	664367	664372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449803
15532	NC_014974	AAAGG	2	10	664424	664433	60 %	0 %	40 %	0 %	320449803
15533	NC_014974	TCCC	2	8	664481	664488	0 %	25 %	0 %	75 %	320449803
15534	NC_014974	G	6	6	664492	664497	0 %	0 %	100 %	0 %	320449803
15535	NC_014974	GGT	2	6	664564	664569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449803
15536	NC_014974	TCG	2	6	664644	664649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449803
15537	NC_014974	ATC	2	6	664698	664703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449803
15538	NC_014974	CCT	2	6	664767	664772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15539	NC_014974	GTA	2	6	664834	664839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449804
15540	NC_014974	CTC	2	6	664900	664905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449804
15541	NC_014974	GGT	2	6	664908	664913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449804
15542	NC_014974	GCC	2	6	664962	664967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449804
15543	NC_014974	GCCTCG	2	12	664970	664981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449804
15544	NC_014974	GCC	2	6	664995	665000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449804
15545	NC_014974	CCT	2	6	665020	665025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449804
15546	NC_014974	G	7	7	665046	665052	0 %	0 %	100 %	0 %	320449804
15547	NC_014974	GAAGG	2	10	665089	665098	40 %	0 %	60 %	0 %	320449804
15548	NC_014974	CCA	2	6	665130	665135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449804
15549	NC_014974	G	6	6	665169	665174	0 %	0 %	100 %	0 %	320449804
15550	NC_014974	GGT	2	6	665184	665189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449804
15551	NC_014974	CAG	2	6	665230	665235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449804
15552	NC_014974	CGT	2	6	665241	665246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449804
15553	NC_014974	GAG	2	6	665254	665259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449804
15554	NC_014974	CCT	2	6	665267	665272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449804
15555	NC_014974	C	6	6	665298	665303	0 %	0 %	0 %	100 %	320449804
15556	NC_014974	TGG	2	6	665337	665342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449804
15557	NC_014974	GTG	2	6	665351	665356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449804
15558	NC_014974	CTC	2	6	665458	665463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449804
15559	NC_014974	G	6	6	665592	665597	0 %	0 %	100 %	0 %	320449804
15560	NC_014974	ATC	2	6	665633	665638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449804
15561	NC_014974	CCTC	2	8	665653	665660	0 %	25 %	0 %	75 %	320449805
15562	NC_014974	GCC	2	6	665671	665676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449805
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15565	NC_014974	C	6	6	665846	665851	0 %	0 %	0 %	100 %	320449805
15566	NC_014974	TGT	2	6	665915	665920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449805
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15568	NC_014974	GGT	2	6	665967	665972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449805
15569	NC_014974	CAG	2	6	666000	666005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449805
15570	NC_014974	C	6	6	666048	666053	0 %	0 %	0 %	100 %	320449805
15571	NC_014974	CGG	2	6	666070	666075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449805
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15573	NC_014974	TGG	2	6	666131	666136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449805
15574	NC_014974	TGG	2	6	666140	666145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449805
15575	NC_014974	CGG	2	6	666191	666196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449805
15576	NC_014974	CCGCC	2	10	666245	666254	0 %	0 %	20 %	80 %	320449805
15577	NC_014974	C	6	6	666253	666258	0 %	0 %	0 %	100 %	320449805
15578	NC_014974	CCT	2	6	666278	666283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449805
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15580	NC_014974	GTG	2	6	666333	666338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449805
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15582	NC_014974	GTG	2	6	666435	666440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449805
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15585	NC_014974	CCT	2	6	666503	666508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449805
15586	NC_014974	TCCCAG	2	12	666514	666525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320449805
15587	NC_014974	CTC	2	6	666531	666536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449805
15588	NC_014974	CGCC	2	8	666728	666735	0 %	0 %	25 %	75 %	320449805
15589	NC_014974	GAG	3	9	666786	666794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449806
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15591	NC_014974	GAG	3	9	666893	666901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449806
15592	NC_014974	GGC	2	6	666923	666928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449806
15593	NC_014974	GAG	2	6	666992	666997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449806
15594	NC_014974	CCT	2	6	667024	667029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449806
15595	NC_014974	CGG	2	6	667132	667137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449806
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15597	NC_014974	CCT	2	6	667207	667212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449806
15598	NC_014974	GCCT	2	8	667280	667287	0 %	25 %	25 %	50 %	320449806
15599	NC_014974	GCCA	2	8	667484	667491	25 %	0 %	25 %	50 %	320449807
15600	NC_014974	AGG	2	6	667505	667510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449807
15601	NC_014974	CCG	2	6	667517	667522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449807
15602	NC_014974	AGG	2	6	667529	667534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449807
15603	NC_014974	AGG	2	6	667542	667547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449807
15604	NC_014974	CAC	2	6	667585	667590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449807
15605	NC_014974	CACC	2	8	667752	667759	25 %	0 %	0 %	75 %	320449807
15606	NC_014974	AGG	2	6	667799	667804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449807
15607	NC_014974	GAG	2	6	667843	667848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449807
15608	NC_014974	CAC	2	6	667855	667860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449807
15609	NC_014974	AGG	2	6	667973	667978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449808
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15611	NC_014974	TGG	2	6	668079	668084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449808
15612	NC_014974	CCT	2	6	668094	668099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449808
15613	NC_014974	CCT	2	6	668136	668141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449808
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15617	NC_014974	GCC	2	6	668321	668326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449808
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15619	NC_014974	TCC	3	9	668393	668401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449808
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15621	NC_014974	C	6	6	668459	668464	0 %	0 %	0 %	100 %	320449808
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15985	NC_014974	GAT	2	6	681727	681732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15986	NC_014974	TGG	2	6	681825	681830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449821
15987	NC_014974	GGC	2	6	681835	681840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
15988	NC_014974	GCGG	2	8	681847	681854	0 %	0 %	75 %	25 %	320449821
15989	NC_014974	AGT	2	6	681861	681866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
15990	NC_014974	C	6	6	681950	681955	0 %	0 %	0 %	100 %	320449821
15991	NC_014974	GGC	2	6	682027	682032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
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15993	NC_014974	GGC	2	6	682054	682059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449821
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15995	NC_014974	GGCC	2	8	682086	682093	0 %	0 %	50 %	50 %	320449821
15996	NC_014974	GATGTA	2	12	682135	682146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449821
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15999	NC_014974	GTA	2	6	682256	682261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449822
16000	NC_014974	CTG	2	6	682295	682300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449822

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