MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

< Previous12...2627282930313233343536...107108Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014974	CCT	2	6	641320	641325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15002	NC_014974	CCCG	2	8	641338	641345	0 %	0 %	25 %	75 %	320449783
15003	NC_014974	CTC	2	6	641417	641422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15004	NC_014974	AGG	2	6	641427	641432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449783
15005	NC_014974	GCG	3	9	641439	641447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449783
15006	NC_014974	GGGA	2	8	641455	641462	25 %	0 %	75 %	0 %	320449783
15007	NC_014974	TCG	2	6	641469	641474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449783
15008	NC_014974	TCC	2	6	641559	641564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15009	NC_014974	CTG	2	6	641636	641641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449783
15010	NC_014974	GCGG	2	8	641648	641655	0 %	0 %	75 %	25 %	320449783
15011	NC_014974	TTG	2	6	641667	641672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449783
15012	NC_014974	CCA	2	6	641680	641685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449783
15013	NC_014974	CCA	2	6	641750	641755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449783
15014	NC_014974	CCT	2	6	641830	641835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15015	NC_014974	AGGA	2	8	641847	641854	50 %	0 %	50 %	0 %	320449783
15016	NC_014974	CTT	2	6	641873	641878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449783
15017	NC_014974	ACC	2	6	641889	641894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449783
15018	NC_014974	TGC	2	6	641919	641924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449783
15019	NC_014974	GGC	2	6	641927	641932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449783
15020	NC_014974	CAC	2	6	642083	642088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449783
15021	NC_014974	CTC	2	6	642152	642157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15022	NC_014974	TCC	3	9	642180	642188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15023	NC_014974	GAG	2	6	642194	642199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449783
15024	NC_014974	GGGCA	2	10	642257	642266	20 %	0 %	60 %	20 %	320449783
15025	NC_014974	CTC	3	9	642269	642277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15026	NC_014974	CTC	2	6	642290	642295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15027	NC_014974	AGG	3	9	642330	642338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449783
15028	NC_014974	TCG	2	6	642339	642344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449783
15029	NC_014974	CTC	2	6	642416	642421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449783
15030	NC_014974	G	7	7	642430	642436	0 %	0 %	100 %	0 %	320449783
15031	NC_014974	TTC	2	6	642437	642442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449783
15032	NC_014974	TCG	2	6	642498	642503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449783
15033	NC_014974	G	6	6	642529	642534	0 %	0 %	100 %	0 %	320449783
15034	NC_014974	CTT	2	6	642545	642550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449783
15035	NC_014974	GGT	2	6	642563	642568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449783
15036	NC_014974	TCT	2	6	642679	642684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449783
15037	NC_014974	CCTC	2	8	642695	642702	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15038	NC_014974	CCA	2	6	642826	642831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449784
15039	NC_014974	GCC	3	9	642861	642869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449784
15040	NC_014974	C	6	6	642909	642914	0 %	0 %	0 %	100 %	320449784
15041	NC_014974	G	6	6	642923	642928	0 %	0 %	100 %	0 %	320449784
15042	NC_014974	ATG	2	6	642939	642944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449784
15043	NC_014974	CTT	2	6	642952	642957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449784
15044	NC_014974	GGC	2	6	643055	643060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449784
15045	NC_014974	GTC	2	6	643109	643114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449784
15046	NC_014974	C	8	8	643132	643139	0 %	0 %	0 %	100 %	320449784
15047	NC_014974	CCA	2	6	643228	643233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449784
15048	NC_014974	GAAGGT	2	12	643301	643312	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320449784
15049	NC_014974	AGGG	2	8	643347	643354	25 %	0 %	75 %	0 %	320449784
15050	NC_014974	C	6	6	643503	643508	0 %	0 %	0 %	100 %	320449784
15051	NC_014974	GCG	2	6	643524	643529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449784
15052	NC_014974	ACC	2	6	643584	643589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449784
15053	NC_014974	TCC	2	6	643605	643610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449784
15054	NC_014974	AGG	2	6	643619	643624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449784
15055	NC_014974	GGC	2	6	643667	643672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449784
15056	NC_014974	ACCC	2	8	643730	643737	25 %	0 %	0 %	75 %	320449784
15057	NC_014974	C	7	7	643843	643849	0 %	0 %	0 %	100 %	320449784
15058	NC_014974	G	6	6	643861	643866	0 %	0 %	100 %	0 %	320449784
15059	NC_014974	GGT	2	6	643873	643878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449784
15060	NC_014974	ATA	2	6	643941	643946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_014974	GCC	2	6	643958	643963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15062	NC_014974	AGG	2	6	643976	643981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_014974	GGC	2	6	644011	644016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449785
15064	NC_014974	GGT	3	9	644097	644105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449785
15065	NC_014974	CAC	2	6	644121	644126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449785
15066	NC_014974	CGA	2	6	644127	644132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449785
15067	NC_014974	CCT	2	6	644187	644192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449785
15068	NC_014974	CAC	3	9	644193	644201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449785
15069	NC_014974	CCT	2	6	644223	644228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449785
15070	NC_014974	AGG	2	6	644351	644356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449785
15071	NC_014974	CAC	2	6	644400	644405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449785
15072	NC_014974	CAC	2	6	644421	644426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449785
15073	NC_014974	G	8	8	644435	644442	0 %	0 %	100 %	0 %	320449785
15074	NC_014974	ACC	2	6	644449	644454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449785
15075	NC_014974	CGC	3	9	644466	644474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449785
15076	NC_014974	ACACGG	2	12	644501	644512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449785
15077	NC_014974	GCC	2	6	644596	644601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449785
15078	NC_014974	TCC	2	6	644615	644620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449785
15079	NC_014974	GTG	2	6	644656	644661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449785
15080	NC_014974	AGG	2	6	644708	644713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449785
15081	NC_014974	GGT	2	6	644733	644738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449785
15082	NC_014974	CGC	2	6	644808	644813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449785
15083	NC_014974	ATC	2	6	644860	644865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449785
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15085	NC_014974	GCA	2	6	644895	644900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449785
15086	NC_014974	GAA	2	6	644916	644921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449785
15087	NC_014974	AGG	2	6	644933	644938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449785
15088	NC_014974	GTGGGG	2	12	645019	645030	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	320449785
15089	NC_014974	GAT	2	6	645099	645104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449785
15090	NC_014974	CCA	2	6	645107	645112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449785
15091	NC_014974	TCA	2	6	645131	645136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449785
15092	NC_014974	GCC	2	6	645157	645162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449785
15093	NC_014974	GAG	2	6	645228	645233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449786
15094	NC_014974	GAG	2	6	645276	645281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449786
15095	NC_014974	GC	3	6	645349	645354	0 %	0 %	50 %	50 %	320449786
15096	NC_014974	CGG	3	9	645367	645375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449786
15097	NC_014974	GGA	2	6	645392	645397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449786
15098	NC_014974	TCT	2	6	645415	645420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449786
15099	NC_014974	C	6	6	645428	645433	0 %	0 %	0 %	100 %	320449786
15100	NC_014974	TGG	3	9	645463	645471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449786
15101	NC_014974	TGG	2	6	645544	645549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449786
15102	NC_014974	GGT	2	6	645626	645631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449786
15103	NC_014974	GGC	2	6	645960	645965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449787
15104	NC_014974	GGC	2	6	645969	645974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449787
15105	NC_014974	GGC	2	6	645978	645983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449787
15106	NC_014974	GAT	2	6	646005	646010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449787
15107	NC_014974	CCA	2	6	646067	646072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449787
15108	NC_014974	TGG	2	6	646124	646129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449787
15109	NC_014974	GCG	2	6	646155	646160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449787
15110	NC_014974	TCT	2	6	646184	646189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449787
15111	NC_014974	CAC	2	6	646308	646313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449787
15112	NC_014974	GGCCC	2	10	646350	646359	0 %	0 %	40 %	60 %	320449787
15113	NC_014974	AGG	2	6	646390	646395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449787
15114	NC_014974	GCC	2	6	646426	646431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449787
15115	NC_014974	CCA	2	6	646433	646438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449787
15116	NC_014974	GTC	2	6	646476	646481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449787
15117	NC_014974	ATG	2	6	646531	646536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449787
15118	NC_014974	GGA	2	6	646580	646585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449787
15119	NC_014974	GCG	2	6	646618	646623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449787
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15121	NC_014974	CCT	2	6	646701	646706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15232	NC_014974	G	7	7	651340	651346	0 %	0 %	100 %	0 %	320449790
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15243	NC_014974	TGG	2	6	651797	651802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449791
15244	NC_014974	AGGG	2	8	651816	651823	25 %	0 %	75 %	0 %	320449791
15245	NC_014974	AGG	2	6	651833	651838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449791
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15247	NC_014974	CTG	2	6	651936	651941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449791
15248	NC_014974	CCT	2	6	652016	652021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449791
15249	NC_014974	GAA	2	6	652038	652043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449791
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15252	NC_014974	CCCA	2	8	652090	652097	25 %	0 %	0 %	75 %	320449791
15253	NC_014974	C	7	7	652235	652241	0 %	0 %	0 %	100 %	320449791
15254	NC_014974	AGGTC	2	10	652355	652364	20 %	20 %	40 %	20 %	320449791
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15257	NC_014974	CTT	2	6	652478	652483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449791
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15263	NC_014974	ACC	2	6	652642	652647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449791
15264	NC_014974	TCCCC	2	10	652662	652671	0 %	20 %	0 %	80 %	320449791
15265	NC_014974	CCCG	2	8	652678	652685	0 %	0 %	25 %	75 %	320449791
15266	NC_014974	TGG	2	6	652772	652777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449791
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15275	NC_014974	CCT	2	6	653060	653065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449791
15276	NC_014974	TGG	2	6	653126	653131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449791
15277	NC_014974	GGC	2	6	653136	653141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449791
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15280	NC_014974	AGG	2	6	653302	653307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449791
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15288	NC_014974	TGG	2	6	653614	653619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449791
15289	NC_014974	G	6	6	653685	653690	0 %	0 %	100 %	0 %	320449791
15290	NC_014974	GCA	2	6	653789	653794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449791
15291	NC_014974	GCG	2	6	653942	653947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449792
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15294	NC_014974	CCT	2	6	654091	654096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449792
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15300	NC_014974	GCA	2	6	654289	654294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449792
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15303	NC_014974	AGG	3	9	654377	654385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449792
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15310	NC_014974	GGC	2	6	654599	654604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449793
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15312	NC_014974	CTA	2	6	654647	654652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449793
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15331	NC_014974	CCT	2	6	655427	655432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449793
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15335	NC_014974	GGCC	2	8	655612	655619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15336	NC_014974	CTTC	2	8	655625	655632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15337	NC_014974	CAC	2	6	655638	655643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15338	NC_014974	TTCC	2	8	655679	655686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15339	NC_014974	TGG	2	6	655732	655737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15340	NC_014974	GCC	2	6	655765	655770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15341	NC_014974	GGGCT	2	10	655786	655795	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15342	NC_014974	GCC	2	6	655841	655846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15343	NC_014974	C	6	6	655848	655853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15344	NC_014974	CCT	2	6	655886	655891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15345	NC_014974	AGG	2	6	655924	655929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15347	NC_014974	CCT	2	6	656049	656054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449794
15348	NC_014974	CTCC	2	8	656064	656071	0 %	25 %	0 %	75 %	320449794
15349	NC_014974	CCA	2	6	656097	656102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449794
15350	NC_014974	CCT	2	6	656163	656168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449794
15351	NC_014974	CGC	2	6	656190	656195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449794
15352	NC_014974	TGG	2	6	656208	656213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449794
15353	NC_014974	CGG	2	6	656214	656219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449794
15354	NC_014974	C	6	6	656224	656229	0 %	0 %	0 %	100 %	320449794
15355	NC_014974	CGG	2	6	656234	656239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449794
15356	NC_014974	G	7	7	656305	656311	0 %	0 %	100 %	0 %	320449794
15357	NC_014974	ACC	2	6	656327	656332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449794
15358	NC_014974	TCTCC	2	10	656451	656460	0 %	40 %	0 %	60 %	320449794
15359	NC_014974	GGC	2	6	656491	656496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449794
15360	NC_014974	CCA	2	6	656547	656552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449794
15361	NC_014974	GCT	2	6	656576	656581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449794
15362	NC_014974	TGCCA	2	10	656608	656617	20 %	20 %	20 %	40 %	320449794
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15364	NC_014974	TGG	2	6	656655	656660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449795
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15487	NC_014974	CCA	2	6	662014	662019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449800
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15489	NC_014974	CCA	2	6	662289	662294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449801
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