MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014974	GCC	2	6	576713	576718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449714
13502	NC_014974	GGC	2	6	576722	576727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449714
13503	NC_014974	CCA	2	6	576745	576750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449714
13504	NC_014974	TCC	2	6	576858	576863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449714
13505	NC_014974	GAG	2	6	576884	576889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449714
13506	NC_014974	TGC	2	6	576916	576921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449714
13507	NC_014974	CCA	2	6	576922	576927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449714
13508	NC_014974	AGG	2	6	576933	576938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449714
13509	NC_014974	CAC	2	6	577022	577027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449714
13510	NC_014974	GCCA	2	8	577059	577066	25 %	0 %	25 %	50 %	320449714
13511	NC_014974	GTG	2	6	577124	577129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449715
13512	NC_014974	GAA	2	6	577147	577152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449715
13513	NC_014974	GGA	2	6	577192	577197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449715
13514	NC_014974	GCAG	2	8	577207	577214	25 %	0 %	50 %	25 %	320449715
13515	NC_014974	GCC	2	6	577232	577237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449715
13516	NC_014974	T	6	6	577246	577251	0 %	100 %	0 %	0 %	320449715
13517	NC_014974	T	7	7	577330	577336	0 %	100 %	0 %	0 %	320449715
13518	NC_014974	AGGG	2	8	577367	577374	25 %	0 %	75 %	0 %	320449715
13519	NC_014974	TGG	3	9	577428	577436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449715
13520	NC_014974	GGTTCT	2	12	577450	577461	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	320449715
13521	NC_014974	CCT	2	6	577513	577518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449715
13522	NC_014974	GAGCG	2	10	577547	577556	20 %	0 %	60 %	20 %	320449715
13523	NC_014974	AGG	2	6	577568	577573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449715
13524	NC_014974	GGA	3	9	577636	577644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449715
13525	NC_014974	TGGCCC	2	12	577668	577679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449715
13526	NC_014974	AGA	2	6	577680	577685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449715
13527	NC_014974	CCG	2	6	577714	577719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449715
13528	NC_014974	G	6	6	577777	577782	0 %	0 %	100 %	0 %	320449715
13529	NC_014974	TCC	2	6	577953	577958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449715
13530	NC_014974	CCT	2	6	577964	577969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449715
13531	NC_014974	C	6	6	577997	578002	0 %	0 %	0 %	100 %	320449715
13532	NC_014974	TGG	2	6	578016	578021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449715
13533	NC_014974	CTT	2	6	578045	578050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449715
13534	NC_014974	GGA	2	6	578101	578106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449715
13535	NC_014974	CGG	2	6	578123	578128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449715
13536	NC_014974	GCC	2	6	578132	578137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449715
13537	NC_014974	AGG	2	6	578244	578249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449715
13538	NC_014974	AGC	2	6	578259	578264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449715
13539	NC_014974	CAG	2	6	578272	578277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_014974	ATG	2	6	578295	578300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_014974	A	6	6	578326	578331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_014974	GGA	2	6	578332	578337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_014974	GCC	2	6	578415	578420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449716
13544	NC_014974	CTA	3	9	578422	578430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449716
13545	NC_014974	ACC	2	6	578477	578482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449716
13546	NC_014974	GAG	2	6	578516	578521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449716
13547	NC_014974	CCG	2	6	578587	578592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449716
13548	NC_014974	CCCAT	2	10	578607	578616	20 %	20 %	0 %	60 %	320449716
13549	NC_014974	CGG	2	6	578631	578636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449716
13550	NC_014974	CCA	2	6	578727	578732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449716
13551	NC_014974	GCC	2	6	578738	578743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449716
13552	NC_014974	AGGGA	2	10	578756	578765	40 %	0 %	60 %	0 %	320449716
13553	NC_014974	TC	3	6	578791	578796	0 %	50 %	0 %	50 %	320449716
13554	NC_014974	CGC	2	6	578800	578805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449716
13555	NC_014974	CTT	2	6	578809	578814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449716
13556	NC_014974	AGGAGC	2	12	578844	578855	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320449716
13557	NC_014974	CGC	2	6	578923	578928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449716
13558	NC_014974	CCG	3	9	578964	578972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449716
13559	NC_014974	TGA	2	6	579018	579023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449716
13560	NC_014974	GAT	2	6	579025	579030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449716
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13562	NC_014974	CAT	2	6	579097	579102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449716
13563	NC_014974	GGA	3	9	579223	579231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449716
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13565	NC_014974	TTC	2	6	579323	579328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449716
13566	NC_014974	TGGG	2	8	579362	579369	0 %	25 %	75 %	0 %	320449716
13567	NC_014974	CT	4	8	579577	579584	0 %	50 %	0 %	50 %	320449717
13568	NC_014974	GAT	2	6	579591	579596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449717
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13572	NC_014974	CAC	2	6	579742	579747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449717
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13575	NC_014974	TGG	2	6	579863	579868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449717
13576	NC_014974	CGT	2	6	579939	579944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449717
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13579	NC_014974	TCC	2	6	580118	580123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449717
13580	NC_014974	GTG	2	6	580124	580129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449717
13581	NC_014974	CGG	2	6	580200	580205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449717
13582	NC_014974	CCA	2	6	580206	580211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449717
13583	NC_014974	CAC	4	12	580249	580260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449717
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13585	NC_014974	ATC	2	6	580310	580315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449717
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13587	NC_014974	CTC	2	6	580336	580341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449717
13588	NC_014974	G	6	6	580381	580386	0 %	0 %	100 %	0 %	320449718
13589	NC_014974	GGGGT	2	10	580446	580455	0 %	20 %	80 %	0 %	320449718
13590	NC_014974	CCA	2	6	580571	580576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449718
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13593	NC_014974	GAT	2	6	580644	580649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449718
13594	NC_014974	GTG	2	6	580686	580691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449718
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13599	NC_014974	CGG	2	6	580891	580896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449718
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13601	NC_014974	GGC	2	6	580998	581003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449718
13602	NC_014974	GTA	2	6	581004	581009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449718
13603	NC_014974	GGC	2	6	581049	581054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449718
13604	NC_014974	GCCG	2	8	581087	581094	0 %	0 %	50 %	50 %	320449718
13605	NC_014974	AGG	2	6	581098	581103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449718
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13607	NC_014974	TC	3	6	581116	581121	0 %	50 %	0 %	50 %	320449718
13608	NC_014974	CCA	2	6	581162	581167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449718
13609	NC_014974	G	6	6	581204	581209	0 %	0 %	100 %	0 %	320449718
13610	NC_014974	AGGA	2	8	581220	581227	50 %	0 %	50 %	0 %	320449718
13611	NC_014974	GGA	2	6	581291	581296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449719
13612	NC_014974	GGC	2	6	581408	581413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449719
13613	NC_014974	C	6	6	581439	581444	0 %	0 %	0 %	100 %	320449719
13614	NC_014974	CCT	2	6	581530	581535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449719
13615	NC_014974	CACCGC	2	12	581543	581554	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449719
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13989	NC_014974	TCC	2	6	597658	597663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449736
13990	NC_014974	AGG	2	6	597676	597681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449736
13991	NC_014974	GA	3	6	597706	597711	50 %	0 %	50 %	0 %	320449736
13992	NC_014974	AGG	2	6	597736	597741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449736
13993	NC_014974	GCG	2	6	597814	597819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449736
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13997	NC_014974	GGC	2	6	597891	597896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449736
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13999	NC_014974	CAC	2	6	597915	597920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449736
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