MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014974	CCA	2	6	555104	555109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449687
13002	NC_014974	TTC	2	6	555214	555219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449687
13003	NC_014974	CAC	3	9	555285	555293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449687
13004	NC_014974	GCA	2	6	555296	555301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449687
13005	NC_014974	GTGG	2	8	555306	555313	0 %	25 %	75 %	0 %	320449687
13006	NC_014974	CTC	2	6	555369	555374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449687
13007	NC_014974	GTCCAG	2	12	555387	555398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449687
13008	NC_014974	CCT	2	6	555415	555420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449688
13009	NC_014974	TTC	2	6	555495	555500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449688
13010	NC_014974	TCC	2	6	555609	555614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449688
13011	NC_014974	CCTC	2	8	555676	555683	0 %	25 %	0 %	75 %	320449688
13012	NC_014974	GAA	2	6	555761	555766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449688
13013	NC_014974	CCGTCC	2	12	555774	555785	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449688
13014	NC_014974	CGGG	2	8	555833	555840	0 %	0 %	75 %	25 %	320449688
13015	NC_014974	TCC	2	6	555918	555923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449688
13016	NC_014974	CAC	2	6	555944	555949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449688
13017	NC_014974	CTT	2	6	556000	556005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449688
13018	NC_014974	GC	3	6	556041	556046	0 %	0 %	50 %	50 %	320449689
13019	NC_014974	GGC	2	6	556052	556057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449689
13020	NC_014974	G	6	6	556061	556066	0 %	0 %	100 %	0 %	320449689
13021	NC_014974	CTT	2	6	556106	556111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449689
13022	NC_014974	G	6	6	556152	556157	0 %	0 %	100 %	0 %	320449689
13023	NC_014974	GTAC	2	8	556165	556172	25 %	25 %	25 %	25 %	320449689
13024	NC_014974	CAC	2	6	556184	556189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449689
13025	NC_014974	GTT	2	6	556217	556222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449689
13026	NC_014974	C	7	7	556229	556235	0 %	0 %	0 %	100 %	320449689
13027	NC_014974	CGC	2	6	556296	556301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449689
13028	NC_014974	TCT	2	6	556315	556320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449689
13029	NC_014974	GCC	2	6	556327	556332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449689
13030	NC_014974	ATC	2	6	556341	556346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449689
13031	NC_014974	CAT	2	6	556424	556429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449689
13032	NC_014974	GCA	2	6	556439	556444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449689
13033	NC_014974	CCA	2	6	556492	556497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449689
13034	NC_014974	GGT	2	6	556508	556513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449689
13035	NC_014974	CCA	2	6	556591	556596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449690
13036	NC_014974	CCA	2	6	556734	556739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449690
13037	NC_014974	CCG	2	6	556773	556778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449690
13038	NC_014974	AGG	2	6	556835	556840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449690
13039	NC_014974	CAC	2	6	556846	556851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449690
13040	NC_014974	GCC	2	6	556856	556861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449690
13041	NC_014974	AGAT	2	8	556886	556893	50 %	25 %	25 %	0 %	320449690
13042	NC_014974	CTG	2	6	556911	556916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449690
13043	NC_014974	CCT	2	6	556932	556937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_014974	GAG	2	6	556955	556960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_014974	CTC	2	6	556984	556989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_014974	GGGT	2	8	557030	557037	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_014974	CCT	2	6	557192	557197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449691
13048	NC_014974	CCT	3	9	557201	557209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449691
13049	NC_014974	CGG	3	9	557219	557227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449691
13050	NC_014974	GGC	2	6	557265	557270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449691
13051	NC_014974	GAG	2	6	557274	557279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449691
13052	NC_014974	GTC	2	6	557295	557300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449691
13053	NC_014974	CAC	2	6	557337	557342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449691
13054	NC_014974	AAG	2	6	557356	557361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449691
13055	NC_014974	GAG	2	6	557421	557426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449691
13056	NC_014974	GGGCC	2	10	557445	557454	0 %	0 %	60 %	40 %	320449691
13057	NC_014974	CCT	2	6	557471	557476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449691
13058	NC_014974	GAG	2	6	557517	557522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449691
13059	NC_014974	G	6	6	557534	557539	0 %	0 %	100 %	0 %	320449691
13060	NC_014974	CCA	2	6	557564	557569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449691
13061	NC_014974	CCT	2	6	557588	557593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449691
13062	NC_014974	ACGG	2	8	557628	557635	25 %	0 %	50 %	25 %	320449691
13063	NC_014974	TCC	2	6	557653	557658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449691
13064	NC_014974	AGGCC	2	10	557740	557749	20 %	0 %	40 %	40 %	320449691
13065	NC_014974	GCC	2	6	557782	557787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449691
13066	NC_014974	GAGGT	2	10	557893	557902	20 %	20 %	60 %	0 %	320449691
13067	NC_014974	TCC	2	6	557948	557953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449692
13068	NC_014974	CCT	2	6	558024	558029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449692
13069	NC_014974	ACC	2	6	558096	558101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449692
13070	NC_014974	AGA	2	6	558126	558131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449692
13071	NC_014974	TCG	2	6	558134	558139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449692
13072	NC_014974	ACC	2	6	558194	558199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449692
13073	NC_014974	GCC	2	6	558320	558325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449692
13074	NC_014974	TCG	2	6	558326	558331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449692
13075	NC_014974	AGG	2	6	558341	558346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449692
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13077	NC_014974	GCC	2	6	558416	558421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449692
13078	NC_014974	GGT	2	6	558429	558434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449692
13079	NC_014974	AGG	2	6	558515	558520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449692
13080	NC_014974	CTC	2	6	558547	558552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449692
13081	NC_014974	CGA	2	6	558639	558644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449692
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13085	NC_014974	CTC	3	9	558828	558836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449693
13086	NC_014974	TGGG	2	8	558860	558867	0 %	25 %	75 %	0 %	320449693
13087	NC_014974	CCAC	2	8	558896	558903	25 %	0 %	0 %	75 %	320449693
13088	NC_014974	GCC	2	6	558976	558981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449693
13089	NC_014974	TCC	2	6	559006	559011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449693
13090	NC_014974	GGC	2	6	559034	559039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449693
13091	NC_014974	CCA	2	6	559049	559054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449693
13092	NC_014974	CGC	2	6	559063	559068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449693
13093	NC_014974	C	6	6	559070	559075	0 %	0 %	0 %	100 %	320449693
13094	NC_014974	CAC	2	6	559143	559148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449693
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13096	NC_014974	T	6	6	559206	559211	0 %	100 %	0 %	0 %	320449693
13097	NC_014974	G	7	7	559251	559257	0 %	0 %	100 %	0 %	320449693
13098	NC_014974	GGT	3	9	559477	559485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449694
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13100	NC_014974	ACG	2	6	559560	559565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449694
13101	NC_014974	CCG	3	9	559573	559581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449694
13102	NC_014974	GAA	2	6	559609	559614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449694
13103	NC_014974	AAG	2	6	559637	559642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449694
13104	NC_014974	AAGGCC	2	12	559646	559657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449694
13105	NC_014974	AAG	2	6	559676	559681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449694
13106	NC_014974	AAGG	2	8	559703	559710	50 %	0 %	50 %	0 %	320449694
13107	NC_014974	C	6	6	559730	559735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13108	NC_014974	GC	3	6	559776	559781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13109	NC_014974	AGG	2	6	559795	559800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_014974	CCA	2	6	559825	559830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13111	NC_014974	TAG	2	6	559875	559880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449695
13112	NC_014974	G	6	6	559921	559926	0 %	0 %	100 %	0 %	320449695
13113	NC_014974	CGGG	2	8	559938	559945	0 %	0 %	75 %	25 %	320449695
13114	NC_014974	TGG	2	6	559981	559986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449695
13115	NC_014974	CGG	2	6	559990	559995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449695
13116	NC_014974	GTA	2	6	560021	560026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449695
13117	NC_014974	GAG	2	6	560061	560066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449695
13118	NC_014974	TGG	2	6	560103	560108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449695
13119	NC_014974	AGG	2	6	560116	560121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449695
13120	NC_014974	TCA	2	6	560170	560175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449695
13121	NC_014974	CGT	2	6	560218	560223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449695
13122	NC_014974	ACC	2	6	560250	560255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449695
13123	NC_014974	CGCC	2	8	560256	560263	0 %	0 %	25 %	75 %	320449695
13124	NC_014974	GTG	2	6	560358	560363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449695
13125	NC_014974	GAT	2	6	560414	560419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449695
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13132	NC_014974	ACG	2	6	560664	560669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449695
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13161	NC_014974	GTA	2	6	562220	562225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449696
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13350	NC_014974	CTGG	2	8	570334	570341	0 %	25 %	50 %	25 %	320449704
13351	NC_014974	G	6	6	570384	570389	0 %	0 %	100 %	0 %	320449704
13352	NC_014974	ACG	2	6	570440	570445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449704
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13354	NC_014974	G	7	7	570508	570514	0 %	0 %	100 %	0 %	320449704
13355	NC_014974	CGGGGC	2	12	570520	570531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449704
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13359	NC_014974	TCCCCC	2	12	570664	570675	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320449704
13360	NC_014974	CCT	2	6	570699	570704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449704
13361	NC_014974	CGT	2	6	570735	570740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449704
13362	NC_014974	CGG	2	6	570749	570754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449704
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13490	NC_014974	AGG	2	6	576076	576081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449713
13491	NC_014974	CTC	2	6	576160	576165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449714
13492	NC_014974	GCT	2	6	576217	576222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449714
13493	NC_014974	CAG	2	6	576272	576277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449714
13494	NC_014974	CTC	2	6	576311	576316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449714
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13496	NC_014974	GC	3	6	576336	576341	0 %	0 %	50 %	50 %	320449714
13497	NC_014974	GCG	2	6	576345	576350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449714
13498	NC_014974	CTC	2	6	576524	576529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449714
13499	NC_014974	CCTT	2	8	576573	576580	0 %	50 %	0 %	50 %	320449714
13500	NC_014974	GTA	2	6	576707	576712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449714

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