MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014974	TCA	2	6	512258	512263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449646
12003	NC_014974	CTG	3	9	512310	512318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449646
12004	NC_014974	GCT	2	6	512450	512455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449646
12005	NC_014974	ACA	2	6	512477	512482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449646
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12007	NC_014974	GCT	2	6	512625	512630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449646
12008	NC_014974	CT	3	6	512650	512655	0 %	50 %	0 %	50 %	320449646
12009	NC_014974	CTT	2	6	512707	512712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449646
12010	NC_014974	T	6	6	512722	512727	0 %	100 %	0 %	0 %	320449646
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12012	NC_014974	CT	3	6	512820	512825	0 %	50 %	0 %	50 %	320449646
12013	NC_014974	GAA	2	6	512827	512832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449646
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12018	NC_014974	GA	3	6	513219	513224	50 %	0 %	50 %	0 %	320449646
12019	NC_014974	GAC	2	6	513238	513243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449646
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12021	NC_014974	CCCG	2	8	513387	513394	0 %	0 %	25 %	75 %	320449646
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12028	NC_014974	CAG	2	6	514009	514014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_014974	GCTG	2	8	514050	514057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12030	NC_014974	CCATC	2	10	514136	514145	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12031	NC_014974	GCCA	2	8	514185	514192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12041	NC_014974	GCG	2	6	514676	514681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_014974	CTT	2	6	514690	514695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12055	NC_014974	G	7	7	515325	515331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12058	NC_014974	C	6	6	515429	515434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12061	NC_014974	G	6	6	515513	515518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12103	NC_014974	GCCCC	2	10	517319	517328	0 %	0 %	20 %	80 %	320449648
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12108	NC_014974	GGA	2	6	517680	517685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449649
12109	NC_014974	TCT	2	6	517725	517730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449649
12110	NC_014974	CCGC	2	8	517830	517837	0 %	0 %	25 %	75 %	320449649
12111	NC_014974	GCC	2	6	517871	517876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449649
12112	NC_014974	CCT	2	6	517905	517910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449649
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12120	NC_014974	GAG	2	6	518347	518352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449649
12121	NC_014974	ACC	3	9	518384	518392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449649
12122	NC_014974	C	6	6	518391	518396	0 %	0 %	0 %	100 %	320449649
12123	NC_014974	GGT	2	6	518416	518421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449649
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12125	NC_014974	CGT	2	6	518514	518519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449649
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12248	NC_014974	TCT	2	6	523573	523578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449653
12249	NC_014974	CCCCGT	2	12	523585	523596	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449653
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12252	NC_014974	C	6	6	523741	523746	0 %	0 %	0 %	100 %	320449654
12253	NC_014974	GA	3	6	523881	523886	50 %	0 %	50 %	0 %	320449654
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12265	NC_014974	G	8	8	524263	524270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12272	NC_014974	AG	3	6	524517	524522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_014974	C	6	6	524556	524561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12274	NC_014974	GAG	2	6	524576	524581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12275	NC_014974	TGG	2	6	524599	524604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449657
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12278	NC_014974	TCG	2	6	524643	524648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449657
12279	NC_014974	GGA	2	6	524663	524668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449657
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12281	NC_014974	CACC	2	8	524897	524904	25 %	0 %	0 %	75 %	320449657
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12351	NC_014974	GGT	2	6	527997	528002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449659
12352	NC_014974	GGA	2	6	528067	528072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449659
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12354	NC_014974	CCAC	2	8	528232	528239	25 %	0 %	0 %	75 %	320449660
12355	NC_014974	CTT	2	6	528255	528260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449660
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12362	NC_014974	C	6	6	528448	528453	0 %	0 %	0 %	100 %	320449660
12363	NC_014974	TGG	2	6	528493	528498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449660
12364	NC_014974	TGG	2	6	528517	528522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449660
12365	NC_014974	CCTGGC	2	12	528554	528565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449660
12366	NC_014974	GGT	2	6	528581	528586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449660
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12381	NC_014974	C	6	6	529237	529242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12475	NC_014974	CCGGGA	2	12	533141	533152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449664
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12481	NC_014974	ACT	2	6	533375	533380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449665
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12484	NC_014974	CGG	2	6	533505	533510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449665
12485	NC_014974	GCCTC	2	10	533544	533553	0 %	20 %	20 %	60 %	320449665
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12487	NC_014974	TCC	2	6	533573	533578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449665
12488	NC_014974	TCCC	2	8	533593	533600	0 %	25 %	0 %	75 %	320449665
12489	NC_014974	GAC	2	6	533611	533616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449665
12490	NC_014974	CTC	2	6	533617	533622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449665
12491	NC_014974	GGT	2	6	533658	533663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449665
12492	NC_014974	G	7	7	533712	533718	0 %	0 %	100 %	0 %	320449665
12493	NC_014974	GCC	2	6	533722	533727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449665
12494	NC_014974	AGG	2	6	533733	533738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449665
12495	NC_014974	GCG	2	6	533796	533801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449665
12496	NC_014974	CCTGGA	2	12	533877	533888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449665
12497	NC_014974	CTT	2	6	533913	533918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449665
12498	NC_014974	CTC	2	6	533956	533961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449665
12499	NC_014974	TC	3	6	534025	534030	0 %	50 %	0 %	50 %	320449666
12500	NC_014974	TGG	2	6	534039	534044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449666

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