MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014974	GGA	2	6	468948	468953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449600
11003	NC_014974	G	6	6	469015	469020	0 %	0 %	100 %	0 %	320449600
11004	NC_014974	TGG	2	6	469034	469039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449600
11005	NC_014974	GGA	2	6	469044	469049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449600
11006	NC_014974	GA	3	6	469078	469083	50 %	0 %	50 %	0 %	320449600
11007	NC_014974	CCG	2	6	469148	469153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449600
11008	NC_014974	ACT	2	6	469202	469207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449600
11009	NC_014974	CCCTGC	2	12	469220	469231	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449600
11010	NC_014974	GCC	2	6	469255	469260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449600
11011	NC_014974	AGG	3	9	469262	469270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449600
11012	NC_014974	AGG	2	6	469272	469277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449600
11013	NC_014974	ACC	2	6	469289	469294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449600
11014	NC_014974	TGC	2	6	469298	469303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449600
11015	NC_014974	AGG	2	6	469361	469366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449600
11016	NC_014974	TGG	2	6	469367	469372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449600
11017	NC_014974	CTC	2	6	469387	469392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449600
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11019	NC_014974	AGGG	2	8	469411	469418	25 %	0 %	75 %	0 %	320449600
11020	NC_014974	GCG	2	6	469420	469425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449600
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11022	NC_014974	CCGC	2	8	469553	469560	0 %	0 %	25 %	75 %	320449601
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11033	NC_014974	G	6	6	469974	469979	0 %	0 %	100 %	0 %	320449601
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11036	NC_014974	GCCC	2	8	470021	470028	0 %	0 %	25 %	75 %	320449601
11037	NC_014974	C	7	7	470026	470032	0 %	0 %	0 %	100 %	320449601
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11092	NC_014974	GCCCT	2	10	471839	471848	0 %	20 %	20 %	60 %	320449602
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11108	NC_014974	G	6	6	472292	472297	0 %	0 %	100 %	0 %	320449602
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11115	NC_014974	TGG	2	6	472625	472630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449603
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11120	NC_014974	T	6	6	472805	472810	0 %	100 %	0 %	0 %	320449603
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11242	NC_014974	A	6	6	478488	478493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11280	NC_014974	TGC	2	6	480563	480568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449611
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11283	NC_014974	GTCA	2	8	480713	480720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11284	NC_014974	CGG	2	6	480825	480830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449612
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11366	NC_014974	CAC	2	6	483628	483633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449614
11367	NC_014974	G	6	6	483672	483677	0 %	0 %	100 %	0 %	320449614
11368	NC_014974	GGC	2	6	483685	483690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449614
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11370	NC_014974	GGC	2	6	483724	483729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449614
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11378	NC_014974	GCCCA	2	10	483971	483980	20 %	0 %	20 %	60 %	320449614
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11384	NC_014974	TCT	2	6	484095	484100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449614
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11397	NC_014974	GGT	2	6	484581	484586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449615
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11405	NC_014974	GAG	2	6	484996	485001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449616
11406	NC_014974	CGGG	2	8	485012	485019	0 %	0 %	75 %	25 %	320449616
11407	NC_014974	TCG	2	6	485021	485026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449616
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11412	NC_014974	GGAG	2	8	485286	485293	25 %	0 %	75 %	0 %	320449616
11413	NC_014974	GCG	2	6	485312	485317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449616
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11418	NC_014974	GAG	2	6	485572	485577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449616
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11421	NC_014974	GGCC	2	8	485774	485781	0 %	0 %	50 %	50 %	320449617
11422	NC_014974	ACT	2	6	485787	485792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449617
11423	NC_014974	GAG	3	9	485860	485868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449617
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11425	NC_014974	GAG	2	6	485957	485962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449617
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11430	NC_014974	G	6	6	486216	486221	0 %	0 %	100 %	0 %	320449617
11431	NC_014974	CTT	2	6	486263	486268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449617
11432	NC_014974	CGG	2	6	486287	486292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449617
11433	NC_014974	GAA	2	6	486343	486348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449617
11434	NC_014974	GGC	2	6	486352	486357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449617
11435	NC_014974	TGG	2	6	486359	486364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449617
11436	NC_014974	TCC	2	6	486421	486426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449617
11437	NC_014974	TTGC	2	8	486428	486435	0 %	50 %	25 %	25 %	320449617
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11440	NC_014974	TGG	2	6	486525	486530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449617
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11448	NC_014974	AGG	2	6	486912	486917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449618
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11452	NC_014974	CATC	2	8	487084	487091	25 %	25 %	0 %	50 %	320449618
11453	NC_014974	CTT	2	6	487156	487161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449618
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11457	NC_014974	CAC	2	6	487303	487308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449619
11458	NC_014974	GGCGG	2	10	487339	487348	0 %	0 %	80 %	20 %	320449619
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11461	NC_014974	CTCC	2	8	487506	487513	0 %	25 %	0 %	75 %	320449619
11462	NC_014974	AAG	2	6	487525	487530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449619
11463	NC_014974	TCC	2	6	487604	487609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11464	NC_014974	ACC	2	6	487679	487684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449620
11465	NC_014974	GGA	2	6	487689	487694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449620
11466	NC_014974	CGG	2	6	487706	487711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449620
11467	NC_014974	TAGGC	2	10	487780	487789	20 %	20 %	40 %	20 %	320449620
11468	NC_014974	TCTCC	2	10	487807	487816	0 %	40 %	0 %	60 %	320449620
11469	NC_014974	CCT	2	6	487836	487841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449620
11470	NC_014974	CCT	3	9	487896	487904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449620
11471	NC_014974	CGG	2	6	487949	487954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449620
11472	NC_014974	GCCA	2	8	488009	488016	25 %	0 %	25 %	50 %	320449620
11473	NC_014974	CCT	2	6	488052	488057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449620
11474	NC_014974	TCC	2	6	488117	488122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449620
11475	NC_014974	TCC	2	6	488156	488161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449620
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11478	NC_014974	GGCCC	2	10	488362	488371	0 %	0 %	40 %	60 %	320449620
11479	NC_014974	GCA	2	6	488379	488384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449620
11480	NC_014974	TCCCGG	2	12	488546	488557	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449620
11481	NC_014974	TCC	2	6	488633	488638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449620
11482	NC_014974	CAG	2	6	488800	488805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449621
11483	NC_014974	TCT	2	6	488894	488899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449621
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11485	NC_014974	CTG	2	6	489019	489024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449621
11486	NC_014974	TCC	2	6	489041	489046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449621
11487	NC_014974	CCT	2	6	489157	489162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449622
11488	NC_014974	TCC	2	6	489213	489218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449622
11489	NC_014974	CAC	2	6	489317	489322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449622
11490	NC_014974	GAG	2	6	489326	489331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449622
11491	NC_014974	GAT	2	6	489383	489388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449622
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11496	NC_014974	GCT	2	6	489619	489624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449623
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