MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_014974	CTT	2	6	446793	446798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449583
10503	NC_014974	TCT	2	6	446803	446808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449583
10504	NC_014974	CTT	2	6	446895	446900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449583
10505	NC_014974	CCG	2	6	446902	446907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449583
10506	NC_014974	TC	3	6	446921	446926	0 %	50 %	0 %	50 %	320449583
10507	NC_014974	CTT	2	6	446927	446932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449583
10508	NC_014974	GGT	2	6	446948	446953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449583
10509	NC_014974	GCC	2	6	446959	446964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449583
10510	NC_014974	TGG	2	6	446965	446970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449583
10511	NC_014974	AGGA	2	8	446982	446989	50 %	0 %	50 %	0 %	320449583
10512	NC_014974	CCA	2	6	446996	447001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449583
10513	NC_014974	TGA	2	6	447052	447057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449583
10514	NC_014974	TC	3	6	447074	447079	0 %	50 %	0 %	50 %	320449583
10515	NC_014974	TGG	2	6	447094	447099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449583
10516	NC_014974	ATG	2	6	447111	447116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449583
10517	NC_014974	GCC	2	6	447121	447126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449583
10518	NC_014974	TCCT	2	8	447129	447136	0 %	50 %	0 %	50 %	320449583
10519	NC_014974	TCC	2	6	447139	447144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449583
10520	NC_014974	CTT	2	6	447149	447154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449583
10521	NC_014974	TTC	2	6	447202	447207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449583
10522	NC_014974	CCT	2	6	447233	447238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449583
10523	NC_014974	CCG	2	6	447251	447256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449583
10524	NC_014974	AGG	2	6	447271	447276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449583
10525	NC_014974	AGG	2	6	447304	447309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449583
10526	NC_014974	GTG	2	6	447327	447332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449583
10527	NC_014974	CCTGGC	2	12	447404	447415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449583
10528	NC_014974	CTG	2	6	447441	447446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449583
10529	NC_014974	TGGG	2	8	447483	447490	0 %	25 %	75 %	0 %	320449583
10530	NC_014974	G	6	6	447492	447497	0 %	0 %	100 %	0 %	320449583
10531	NC_014974	TGG	2	6	447499	447504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449583
10532	NC_014974	G	6	6	447508	447513	0 %	0 %	100 %	0 %	320449583
10533	NC_014974	CCG	2	6	447658	447663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449583
10534	NC_014974	CGA	2	6	447668	447673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449583
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10536	NC_014974	CCTCAC	2	12	447767	447778	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449583
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10539	NC_014974	G	7	7	447890	447896	0 %	0 %	100 %	0 %	320449583
10540	NC_014974	GGA	2	6	447907	447912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449583
10541	NC_014974	GGT	2	6	447944	447949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449583
10542	NC_014974	GCG	2	6	448038	448043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449583
10543	NC_014974	GAG	2	6	448062	448067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449583
10544	NC_014974	G	6	6	448111	448116	0 %	0 %	100 %	0 %	320449583
10545	NC_014974	CAGCGG	2	12	448134	448145	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449583
10546	NC_014974	TGGCCC	2	12	448147	448158	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449583
10547	NC_014974	GCC	2	6	448264	448269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449583
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10552	NC_014974	CCT	2	6	448373	448378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449583
10553	NC_014974	AGG	2	6	448476	448481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
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10555	NC_014974	TCC	3	9	448575	448583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
10556	NC_014974	CAC	2	6	448585	448590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449584
10557	NC_014974	CCG	2	6	448596	448601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449584
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10559	NC_014974	TCT	2	6	448614	448619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449584
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10563	NC_014974	CGC	2	6	448735	448740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449584
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10565	NC_014974	GTGG	2	8	448768	448775	0 %	25 %	75 %	0 %	320449584
10566	NC_014974	GCC	2	6	448863	448868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449584
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10569	NC_014974	CTT	2	6	448945	448950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449584
10570	NC_014974	ATG	2	6	448976	448981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449584
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10572	NC_014974	TCC	2	6	449010	449015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
10573	NC_014974	TGG	2	6	449016	449021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
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10581	NC_014974	TGGCGG	2	12	449280	449291	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449584
10582	NC_014974	CCT	2	6	449293	449298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449584
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10586	NC_014974	TGG	2	6	449349	449354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
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10588	NC_014974	G	6	6	449520	449525	0 %	0 %	100 %	0 %	320449584
10589	NC_014974	CTGG	2	8	449545	449552	0 %	25 %	50 %	25 %	320449584
10590	NC_014974	TTCC	2	8	449608	449615	0 %	50 %	0 %	50 %	320449584
10591	NC_014974	GA	3	6	449628	449633	50 %	0 %	50 %	0 %	320449584
10592	NC_014974	TGG	2	6	449643	449648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
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10594	NC_014974	GTG	2	6	449675	449680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
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10600	NC_014974	G	6	6	449949	449954	0 %	0 %	100 %	0 %	320449584
10601	NC_014974	AGC	2	6	449976	449981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449584
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10604	NC_014974	AGG	2	6	450081	450086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
10605	NC_014974	GGAGG	2	10	450103	450112	20 %	0 %	80 %	0 %	320449584
10606	NC_014974	ATC	2	6	450122	450127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449584
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10609	NC_014974	A	6	6	450176	450181	100 %	0 %	0 %	0 %	320449584
10610	NC_014974	TGG	2	6	450189	450194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449584
10611	NC_014974	AGG	2	6	450195	450200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449584
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10616	NC_014974	CCT	2	6	450355	450360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449585
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10619	NC_014974	GGC	2	6	450448	450453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449585
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10621	NC_014974	CACC	2	8	450526	450533	25 %	0 %	0 %	75 %	320449585
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10743	NC_014974	TCC	2	6	456546	456551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449590
10744	NC_014974	TGG	2	6	456615	456620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449590
10745	NC_014974	GCCC	2	8	456713	456720	0 %	0 %	25 %	75 %	320449590
10746	NC_014974	CTC	2	6	456752	456757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449590
10747	NC_014974	GTA	2	6	456797	456802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449590
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10751	NC_014974	TAGGGC	2	12	457108	457119	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449591
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10822	NC_014974	CAC	2	6	459740	459745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449593
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10825	NC_014974	CCT	2	6	459906	459911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10826	NC_014974	TTG	2	6	460010	460015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449594
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10833	NC_014974	GGCCTT	2	12	460285	460296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449594
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10847	NC_014974	CAC	2	6	460852	460857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449594
10848	NC_014974	TGA	2	6	460878	460883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449594
10849	NC_014974	GTTGGC	2	12	460888	460899	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	320449594
10850	NC_014974	GTC	2	6	460924	460929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449594
10851	NC_014974	TGA	2	6	461067	461072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449594
10852	NC_014974	TGGCC	2	10	461076	461085	0 %	20 %	40 %	40 %	320449594
10853	NC_014974	GGC	2	6	461101	461106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449594
10854	NC_014974	CCT	2	6	461145	461150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10855	NC_014974	G	7	7	461185	461191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10856	NC_014974	TCCC	2	8	461245	461252	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10857	NC_014974	C	6	6	461250	461255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10858	NC_014974	GGAGGG	2	12	461256	461267	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
10859	NC_014974	TGG	2	6	461317	461322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449595
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