MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014974	TAA	2	6	425927	425932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_014974	CTG	2	6	425945	425950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_014974	CGT	2	6	426029	426034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_014974	CTT	2	6	426071	426076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_014974	GCC	2	6	426087	426092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_014974	TA	3	6	426231	426236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_014974	GTA	2	6	426259	426264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_014974	AAAC	2	8	426266	426273	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_014974	CAC	2	6	426293	426298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_014974	CA	3	6	426381	426386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_014974	TCTGCA	2	12	426409	426420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_014974	C	6	6	426457	426462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10013	NC_014974	AAG	2	6	426526	426531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_014974	CAA	2	6	426579	426584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_014974	CTGC	2	8	426618	426625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_014974	TCA	2	6	426686	426691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_014974	CT	3	6	426695	426700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_014974	GAC	2	6	426784	426789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_014974	GCT	2	6	426966	426971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_014974	TTC	2	6	426977	426982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_014974	CACT	2	8	427047	427054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_014974	AGG	2	6	427105	427110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014974	ATG	2	6	427118	427123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449563
10024	NC_014974	TCC	2	6	427126	427131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
10025	NC_014974	TA	3	6	427260	427265	50 %	50 %	0 %	0 %	320449563
10026	NC_014974	TTG	2	6	427276	427281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449563
10027	NC_014974	TCCGC	2	10	427321	427330	0 %	20 %	20 %	60 %	320449563
10028	NC_014974	AGC	2	6	427476	427481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449563
10029	NC_014974	CAG	2	6	427542	427547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449563
10030	NC_014974	CAC	3	9	427557	427565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449563
10031	NC_014974	ACCC	2	8	427568	427575	25 %	0 %	0 %	75 %	320449563
10032	NC_014974	CTT	2	6	427632	427637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449563
10033	NC_014974	AGC	2	6	427644	427649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449563
10034	NC_014974	GGT	2	6	427739	427744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449563
10035	NC_014974	TCT	2	6	427793	427798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449563
10036	NC_014974	CGT	2	6	427816	427821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449563
10037	NC_014974	CCT	2	6	427826	427831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
10038	NC_014974	CAC	2	6	427845	427850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449563
10039	NC_014974	CCG	2	6	427875	427880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449563
10040	NC_014974	CGTG	2	8	427889	427896	0 %	25 %	50 %	25 %	320449563
10041	NC_014974	CCAC	2	8	427899	427906	25 %	0 %	0 %	75 %	320449563
10042	NC_014974	CCGG	2	8	427910	427917	0 %	0 %	50 %	50 %	320449563
10043	NC_014974	GAG	2	6	427973	427978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449563
10044	NC_014974	GGCG	2	8	427991	427998	0 %	0 %	75 %	25 %	320449563
10045	NC_014974	AGA	2	6	428099	428104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449563
10046	NC_014974	AGG	2	6	428161	428166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449563
10047	NC_014974	GGC	2	6	428232	428237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449563
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10049	NC_014974	CCT	2	6	428398	428403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
10050	NC_014974	A	6	6	428424	428429	100 %	0 %	0 %	0 %	320449563
10051	NC_014974	GCG	2	6	428490	428495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449563
10052	NC_014974	CCT	2	6	428516	428521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
10053	NC_014974	TCC	2	6	428536	428541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
10054	NC_014974	GTT	2	6	428612	428617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449563
10055	NC_014974	GC	3	6	428715	428720	0 %	0 %	50 %	50 %	320449563
10056	NC_014974	CTC	2	6	428721	428726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
10057	NC_014974	GAG	2	6	428736	428741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449563
10058	NC_014974	CCA	2	6	428777	428782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449563
10059	NC_014974	TCTG	2	8	428803	428810	0 %	50 %	25 %	25 %	320449563
10060	NC_014974	GCG	2	6	428917	428922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449563
10061	NC_014974	CCA	2	6	428930	428935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449563
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10064	NC_014974	GCC	2	6	429000	429005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449563
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10070	NC_014974	CTC	2	6	429303	429308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449563
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10080	NC_014974	GAG	2	6	429885	429890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449563
10081	NC_014974	CCTCC	2	10	429953	429962	0 %	20 %	0 %	80 %	320449563
10082	NC_014974	AAG	2	6	429964	429969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449563
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10087	NC_014974	ATG	2	6	430276	430281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449563
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10090	NC_014974	GTC	2	6	430490	430495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449563
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10092	NC_014974	C	6	6	430693	430698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10093	NC_014974	AAGG	2	8	430737	430744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_014974	TCG	2	6	430816	430821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_014974	AGAGG	2	10	430839	430848	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_014974	TAA	2	6	430862	430867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_014974	TGAA	2	8	430970	430977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014974	TTG	2	6	430985	430990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_014974	GGT	2	6	431025	431030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_014974	CCA	2	6	431037	431042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10101	NC_014974	CAC	2	6	431048	431053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_014974	G	6	6	431078	431083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014974	TTG	2	6	431087	431092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_014974	G	6	6	431105	431110	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_014974	CTG	2	6	431112	431117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10109	NC_014974	GGA	2	6	431317	431322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449564
10110	NC_014974	TGGG	2	8	431352	431359	0 %	25 %	75 %	0 %	320449564
10111	NC_014974	CGG	2	6	431431	431436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449564
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10114	NC_014974	TCCC	2	8	431705	431712	0 %	25 %	0 %	75 %	320449564
10115	NC_014974	TGG	2	6	431731	431736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449564
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10124	NC_014974	GA	3	6	432138	432143	50 %	0 %	50 %	0 %	320449564
10125	NC_014974	CACC	2	8	432205	432212	25 %	0 %	0 %	75 %	320449564
10126	NC_014974	TGG	2	6	432265	432270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449564
10127	NC_014974	GCG	2	6	432276	432281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449564
10128	NC_014974	GAG	2	6	432403	432408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449565
10129	NC_014974	CGG	2	6	432455	432460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449565
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10133	NC_014974	CCG	2	6	432642	432647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449565
10134	NC_014974	G	6	6	432791	432796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_014974	GAC	2	6	432853	432858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449566
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10137	NC_014974	G	6	6	433012	433017	0 %	0 %	100 %	0 %	320449566
10138	NC_014974	GAT	2	6	433095	433100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449566
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10140	NC_014974	G	6	6	433174	433179	0 %	0 %	100 %	0 %	320449566
10141	NC_014974	GTG	2	6	433186	433191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449566
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10154	NC_014974	TGG	2	6	433529	433534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449566
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10157	NC_014974	G	6	6	433691	433696	0 %	0 %	100 %	0 %	320449566
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10174	NC_014974	C	6	6	434353	434358	0 %	0 %	0 %	100 %	320449567
10175	NC_014974	GGTA	2	8	434375	434382	25 %	25 %	50 %	0 %	320449567
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10234	NC_014974	TCC	2	6	436508	436513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449570
10235	NC_014974	CGGC	2	8	436531	436538	0 %	0 %	50 %	50 %	320449570
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10240	NC_014974	GTC	2	6	436729	436734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449570
10241	NC_014974	AAG	2	6	436747	436752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449570
10242	NC_014974	TCG	2	6	436805	436810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449570
10243	NC_014974	ACC	2	6	436871	436876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449570
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