MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014974	GTG	2	6	359696	359701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449506
8502	NC_014974	GTG	2	6	359771	359776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449506
8503	NC_014974	GCCTG	2	10	359785	359794	0 %	20 %	40 %	40 %	320449506
8504	NC_014974	CGGC	2	8	359806	359813	0 %	0 %	50 %	50 %	320449506
8505	NC_014974	CT	3	6	359873	359878	0 %	50 %	0 %	50 %	320449506
8506	NC_014974	GGC	2	6	359887	359892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449506
8507	NC_014974	GCC	2	6	359909	359914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449506
8508	NC_014974	CGG	2	6	359921	359926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449506
8509	NC_014974	CGC	2	6	360008	360013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449506
8510	NC_014974	CAC	2	6	360050	360055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449506
8511	NC_014974	TGG	2	6	360093	360098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449506
8512	NC_014974	GCC	2	6	360101	360106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449506
8513	NC_014974	CCG	2	6	360117	360122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449506
8514	NC_014974	CCCGG	2	10	360123	360132	0 %	0 %	40 %	60 %	320449506
8515	NC_014974	GGA	2	6	360151	360156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449506
8516	NC_014974	TTCC	2	8	360196	360203	0 %	50 %	0 %	50 %	320449506
8517	NC_014974	GAGG	2	8	360238	360245	25 %	0 %	75 %	0 %	320449506
8518	NC_014974	CAGGTG	2	12	360347	360358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449506
8519	NC_014974	GTG	2	6	360362	360367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449506
8520	NC_014974	G	7	7	360443	360449	0 %	0 %	100 %	0 %	320449507
8521	NC_014974	CTC	2	6	360498	360503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449507
8522	NC_014974	GGA	2	6	360554	360559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449507
8523	NC_014974	CGC	2	6	360581	360586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449507
8524	NC_014974	GA	3	6	360604	360609	50 %	0 %	50 %	0 %	320449507
8525	NC_014974	GTG	3	9	360623	360631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449508
8526	NC_014974	TG	3	6	360634	360639	0 %	50 %	50 %	0 %	320449508
8527	NC_014974	GAA	2	6	360670	360675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449508
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8529	NC_014974	GCC	2	6	360791	360796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449508
8530	NC_014974	T	6	6	360801	360806	0 %	100 %	0 %	0 %	320449508
8531	NC_014974	GTG	2	6	360830	360835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449508
8532	NC_014974	CTC	2	6	360836	360841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449508
8533	NC_014974	GGA	2	6	360904	360909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449508
8534	NC_014974	AGG	2	6	360918	360923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449508
8535	NC_014974	G	6	6	360922	360927	0 %	0 %	100 %	0 %	320449508
8536	NC_014974	GGT	2	6	360934	360939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449508
8537	NC_014974	TTC	2	6	360966	360971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449508
8538	NC_014974	GGGAA	2	10	361055	361064	40 %	0 %	60 %	0 %	320449509
8539	NC_014974	GTG	2	6	361094	361099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449509
8540	NC_014974	CTC	3	9	361232	361240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449509
8541	NC_014974	CTT	2	6	361273	361278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449509
8542	NC_014974	TGG	2	6	361293	361298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449509
8543	NC_014974	GCG	2	6	361327	361332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449509
8544	NC_014974	GGT	2	6	361336	361341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449509
8545	NC_014974	GGC	3	9	361393	361401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449509
8546	NC_014974	CGGGG	2	10	361405	361414	0 %	0 %	80 %	20 %	320449509
8547	NC_014974	TGG	3	9	361443	361451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449509
8548	NC_014974	CAT	2	6	361549	361554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449509
8549	NC_014974	CCT	2	6	361579	361584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449509
8550	NC_014974	CCG	2	6	361599	361604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449509
8551	NC_014974	GGGC	2	8	361625	361632	0 %	0 %	75 %	25 %	320449509
8552	NC_014974	GAG	2	6	361649	361654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449509
8553	NC_014974	AGG	2	6	361656	361661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449509
8554	NC_014974	TCA	2	6	361686	361691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449509
8555	NC_014974	CGG	2	6	361707	361712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449509
8556	NC_014974	CCG	2	6	361719	361724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449509
8557	NC_014974	C	6	6	361799	361804	0 %	0 %	0 %	100 %	320449509
8558	NC_014974	TTC	2	6	361836	361841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449509
8559	NC_014974	GCG	2	6	361848	361853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449509
8560	NC_014974	AGG	2	6	361887	361892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449509
8561	NC_014974	GTG	3	9	361907	361915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449509
8562	NC_014974	GGA	2	6	361981	361986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449509
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8564	NC_014974	CGA	2	6	362101	362106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449510
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8566	NC_014974	CAT	2	6	362179	362184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449510
8567	NC_014974	ATC	2	6	362198	362203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449510
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8569	NC_014974	GCA	2	6	362229	362234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449510
8570	NC_014974	TGG	2	6	362277	362282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449510
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8572	NC_014974	GTG	2	6	362312	362317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449510
8573	NC_014974	CTC	3	9	362348	362356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449510
8574	NC_014974	CCG	2	6	362359	362364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449510
8575	NC_014974	TGG	2	6	362394	362399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449510
8576	NC_014974	GAG	2	6	362405	362410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449510
8577	NC_014974	AGT	2	6	362454	362459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449510
8578	NC_014974	ATC	2	6	362466	362471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_014974	G	7	7	362513	362519	0 %	0 %	100 %	0 %	320449511
8580	NC_014974	GTG	2	6	362524	362529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449511
8581	NC_014974	GGA	2	6	362550	362555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449511
8582	NC_014974	GGA	2	6	362568	362573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449511
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8584	NC_014974	GAG	2	6	362631	362636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449511
8585	NC_014974	GGT	2	6	362688	362693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449511
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8587	NC_014974	AGG	2	6	362788	362793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449511
8588	NC_014974	GGA	2	6	362799	362804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449511
8589	NC_014974	CCA	2	6	362849	362854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449511
8590	NC_014974	TGG	2	6	362873	362878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449511
8591	NC_014974	CCTT	2	8	362881	362888	0 %	50 %	0 %	50 %	320449511
8592	NC_014974	AGG	2	6	362996	363001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449511
8593	NC_014974	AGGTGG	2	12	363098	363109	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449511
8594	NC_014974	AAG	2	6	363122	363127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_014974	TCCT	2	8	363160	363167	0 %	50 %	0 %	50 %	320449512
8596	NC_014974	CCCT	2	8	363170	363177	0 %	25 %	0 %	75 %	320449512
8597	NC_014974	CCA	2	6	363367	363372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449512
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8601	NC_014974	GCC	2	6	363489	363494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449512
8602	NC_014974	TCC	2	6	363495	363500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449512
8603	NC_014974	CCA	2	6	363530	363535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449512
8604	NC_014974	CGC	2	6	363543	363548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449512
8605	NC_014974	ACC	2	6	363570	363575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449512
8606	NC_014974	GCC	2	6	363583	363588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449512
8607	NC_014974	CTCCAC	2	12	363593	363604	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	320449512
8608	NC_014974	CTCC	2	8	363605	363612	0 %	25 %	0 %	75 %	320449512
8609	NC_014974	C	6	6	363644	363649	0 %	0 %	0 %	100 %	320449512
8610	NC_014974	CCT	2	6	363664	363669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449512
8611	NC_014974	GAA	2	6	363690	363695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449512
8612	NC_014974	C	6	6	363714	363719	0 %	0 %	0 %	100 %	320449512
8613	NC_014974	CAC	2	6	363749	363754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449512
8614	NC_014974	CTC	2	6	363758	363763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449512
8615	NC_014974	GTC	2	6	363797	363802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449512
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8617	NC_014974	C	6	6	363843	363848	0 %	0 %	0 %	100 %	320449512
8618	NC_014974	GCC	2	6	363861	363866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449512
8619	NC_014974	CTCC	2	8	363874	363881	0 %	25 %	0 %	75 %	320449512
8620	NC_014974	CCT	2	6	363883	363888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449512
8621	NC_014974	CCA	2	6	363922	363927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449512
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8989	NC_014974	ACC	2	6	379393	379398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449523
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8991	NC_014974	TGG	2	6	379460	379465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449523
8992	NC_014974	GAA	2	6	379509	379514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449523
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8997	NC_014974	GGGGAA	2	12	379927	379938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8998	NC_014974	GCC	2	6	379988	379993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449524
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