MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014974	GCG	2	6	297904	297909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449437
7002	NC_014974	CTT	2	6	297921	297926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449438
7003	NC_014974	CTT	2	6	297939	297944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449438
7004	NC_014974	GGAT	2	8	297954	297961	25 %	25 %	50 %	0 %	320449438
7005	NC_014974	TCCAGG	2	12	298003	298014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449438
7006	NC_014974	GAACCT	2	12	298043	298054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320449438
7007	NC_014974	G	7	7	298082	298088	0 %	0 %	100 %	0 %	320449438
7008	NC_014974	ACGG	2	8	298113	298120	25 %	0 %	50 %	25 %	320449438
7009	NC_014974	TCCT	2	8	298230	298237	0 %	50 %	0 %	50 %	320449438
7010	NC_014974	CGG	2	6	298243	298248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449438
7011	NC_014974	CTACTT	2	12	298268	298279	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	320449438
7012	NC_014974	CCA	2	6	298285	298290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449438
7013	NC_014974	AGG	3	9	298378	298386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449438
7014	NC_014974	TTCCTG	2	12	298441	298452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	320449439
7015	NC_014974	GCC	2	6	298495	298500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449439
7016	NC_014974	CTG	2	6	298555	298560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449439
7017	NC_014974	CCT	2	6	298623	298628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449439
7018	NC_014974	GCCCG	2	10	298690	298699	0 %	0 %	40 %	60 %	320449439
7019	NC_014974	CTT	2	6	298759	298764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449439
7020	NC_014974	TTC	2	6	298777	298782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449439
7021	NC_014974	TCC	2	6	298799	298804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449439
7022	NC_014974	GCC	3	9	298867	298875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449439
7023	NC_014974	CCT	2	6	298928	298933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449439
7024	NC_014974	TCC	2	6	298943	298948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449439
7025	NC_014974	TGGCCG	2	12	298973	298984	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320449439
7026	NC_014974	GGC	2	6	298992	298997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449439
7027	NC_014974	CGCC	2	8	299009	299016	0 %	0 %	25 %	75 %	320449439
7028	NC_014974	CCT	2	6	299046	299051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449439
7029	NC_014974	CAT	2	6	299064	299069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449439
7030	NC_014974	CCA	2	6	299087	299092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449439
7031	NC_014974	ATC	3	9	299098	299106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449439
7032	NC_014974	GGGGA	2	10	299108	299117	20 %	0 %	80 %	0 %	320449439
7033	NC_014974	GCC	2	6	299176	299181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449439
7034	NC_014974	G	7	7	299193	299199	0 %	0 %	100 %	0 %	320449439
7035	NC_014974	CCTT	2	8	299210	299217	0 %	50 %	0 %	50 %	320449439
7036	NC_014974	CCTGG	2	10	299301	299310	0 %	20 %	40 %	40 %	320449439
7037	NC_014974	G	6	6	299333	299338	0 %	0 %	100 %	0 %	320449439
7038	NC_014974	CTT	2	6	299379	299384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449439
7039	NC_014974	CCT	2	6	299405	299410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449439
7040	NC_014974	CGGG	2	8	299446	299453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_014974	ACCT	2	8	299462	299469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7042	NC_014974	CGA	2	6	299539	299544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449440
7043	NC_014974	GGC	2	6	299562	299567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449440
7044	NC_014974	TGG	2	6	299578	299583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449440
7045	NC_014974	CAA	2	6	299588	299593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449440
7046	NC_014974	GAGG	2	8	299612	299619	25 %	0 %	75 %	0 %	320449440
7047	NC_014974	TGG	2	6	299632	299637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449440
7048	NC_014974	ACCT	2	8	299748	299755	25 %	25 %	0 %	50 %	320449440
7049	NC_014974	CAA	2	6	299786	299791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449440
7050	NC_014974	G	6	6	299942	299947	0 %	0 %	100 %	0 %	320449440
7051	NC_014974	GTG	3	9	299952	299960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449440
7052	NC_014974	TCC	2	6	299967	299972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449440
7053	NC_014974	CTA	2	6	299975	299980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449440
7054	NC_014974	TCAAGG	2	12	300031	300042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320449440
7055	NC_014974	CCCCTG	2	12	300084	300095	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449440
7056	NC_014974	TCC	2	6	300136	300141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449440
7057	NC_014974	CGGG	2	8	300215	300222	0 %	0 %	75 %	25 %	320449440
7058	NC_014974	CCT	2	6	300236	300241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449440
7059	NC_014974	CCT	2	6	300252	300257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449440
7060	NC_014974	GTG	2	6	300273	300278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449440
7061	NC_014974	C	6	6	300286	300291	0 %	0 %	0 %	100 %	320449440
7062	NC_014974	TGC	2	6	300394	300399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449440
7063	NC_014974	GTG	2	6	300411	300416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449440
7064	NC_014974	CAT	2	6	300509	300514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449440
7065	NC_014974	GCG	2	6	300589	300594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449440
7066	NC_014974	AGG	2	6	300670	300675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449440
7067	NC_014974	GAA	2	6	300701	300706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449441
7068	NC_014974	AGG	2	6	300723	300728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449441
7069	NC_014974	CCT	2	6	300751	300756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449441
7070	NC_014974	CTG	2	6	300836	300841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449441
7071	NC_014974	GGCCTT	2	12	300913	300924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449441
7072	NC_014974	CT	3	6	300935	300940	0 %	50 %	0 %	50 %	320449441
7073	NC_014974	CGC	2	6	301042	301047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449441
7074	NC_014974	ATG	2	6	301055	301060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449441
7075	NC_014974	TCC	2	6	301194	301199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449441
7076	NC_014974	GAT	2	6	301273	301278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449441
7077	NC_014974	AAG	2	6	301283	301288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449441
7078	NC_014974	GAG	2	6	301383	301388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7079	NC_014974	TCC	2	6	301414	301419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7080	NC_014974	C	7	7	301445	301451	0 %	0 %	0 %	100 %	320449442
7081	NC_014974	CGG	2	6	301460	301465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449442
7082	NC_014974	TGG	2	6	301501	301506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449442
7083	NC_014974	CCA	2	6	301529	301534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449442
7084	NC_014974	CCT	2	6	301535	301540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7085	NC_014974	AGAGGA	2	12	301565	301576	50 %	0 %	50 %	0 %	320449442
7086	NC_014974	CTC	2	6	301581	301586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7087	NC_014974	C	7	7	301586	301592	0 %	0 %	0 %	100 %	320449442
7088	NC_014974	GGA	2	6	301631	301636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7089	NC_014974	TCG	2	6	301660	301665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449442
7090	NC_014974	GGGCCA	2	12	301751	301762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449442
7091	NC_014974	CTTG	2	8	301859	301866	0 %	50 %	25 %	25 %	320449442
7092	NC_014974	AGG	2	6	301879	301884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7093	NC_014974	G	6	6	301896	301901	0 %	0 %	100 %	0 %	320449442
7094	NC_014974	TCC	2	6	301909	301914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7095	NC_014974	AGGTAG	2	12	301927	301938	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320449442
7096	NC_014974	G	6	6	301973	301978	0 %	0 %	100 %	0 %	320449442
7097	NC_014974	CCA	2	6	301988	301993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449442
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7099	NC_014974	G	6	6	302102	302107	0 %	0 %	100 %	0 %	320449442
7100	NC_014974	GGCG	2	8	302111	302118	0 %	0 %	75 %	25 %	320449442
7101	NC_014974	TCC	2	6	302155	302160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7102	NC_014974	GGT	2	6	302177	302182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449442
7103	NC_014974	C	6	6	302203	302208	0 %	0 %	0 %	100 %	320449442
7104	NC_014974	GAT	2	6	302229	302234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449442
7105	NC_014974	GGGGT	2	10	302248	302257	0 %	20 %	80 %	0 %	320449442
7106	NC_014974	CAGGGC	2	12	302295	302306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449442
7107	NC_014974	AGG	2	6	302318	302323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7108	NC_014974	TCC	2	6	302338	302343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7109	NC_014974	AGG	2	6	302359	302364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7110	NC_014974	AGG	2	6	302383	302388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7111	NC_014974	CCA	2	6	302450	302455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449442
7112	NC_014974	GCCCC	2	10	302484	302493	0 %	0 %	20 %	80 %	320449442
7113	NC_014974	C	7	7	302490	302496	0 %	0 %	0 %	100 %	320449442
7114	NC_014974	AGA	2	6	302533	302538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449442
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7117	NC_014974	AGG	3	9	302635	302643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449442
7118	NC_014974	GGC	2	6	302691	302696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449442
7119	NC_014974	CCA	2	6	302702	302707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449442
7120	NC_014974	TCC	2	6	302752	302757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449442
7121	NC_014974	CCAGG	2	10	302763	302772	20 %	0 %	40 %	40 %	320449442
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7123	NC_014974	C	7	7	302837	302843	0 %	0 %	0 %	100 %	320449442
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7243	NC_014974	GGAG	2	8	307940	307947	25 %	0 %	75 %	0 %	320449450
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7368	NC_014974	AGGGG	2	10	313410	313419	20 %	0 %	80 %	0 %	320449455
7369	NC_014974	TGG	2	6	313423	313428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449455
7370	NC_014974	G	6	6	313456	313461	0 %	0 %	100 %	0 %	320449455
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7373	NC_014974	TCT	2	6	313593	313598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449456
7374	NC_014974	GGC	2	6	313650	313655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449456
7375	NC_014974	GAG	2	6	313693	313698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449456
7376	NC_014974	GAG	2	6	313717	313722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449456
7377	NC_014974	GGAA	2	8	313803	313810	50 %	0 %	50 %	0 %	320449456
7378	NC_014974	GGT	4	12	313854	313865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449456
7379	NC_014974	TCCC	2	8	313915	313922	0 %	25 %	0 %	75 %	320449456
7380	NC_014974	CCT	2	6	313929	313934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449456
7381	NC_014974	GCG	2	6	313942	313947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449456
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7389	NC_014974	G	6	6	314434	314439	0 %	0 %	100 %	0 %	320449456
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7479	NC_014974	G	7	7	317953	317959	0 %	0 %	100 %	0 %	320449462
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7484	NC_014974	G	6	6	318140	318145	0 %	0 %	100 %	0 %	320449462
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7488	NC_014974	ACC	2	6	318256	318261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449462
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7497	NC_014974	GAT	2	6	318492	318497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449462
7498	NC_014974	GCG	2	6	318531	318536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449462
7499	NC_014974	CCT	2	6	318542	318547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449462
7500	NC_014974	GGC	2	6	318561	318566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449462

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