MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014974	CCT	2	6	276688	276693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449412
6502	NC_014974	ACCTCT	2	12	276714	276725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	320449412
6503	NC_014974	AGG	2	6	276780	276785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449412
6504	NC_014974	AGG	2	6	276788	276793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449412
6505	NC_014974	GGA	2	6	276841	276846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449412
6506	NC_014974	AAG	2	6	276860	276865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449412
6507	NC_014974	GAG	2	6	276872	276877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449412
6508	NC_014974	AAG	2	6	276881	276886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449412
6509	NC_014974	CCG	3	9	276901	276909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449412
6510	NC_014974	G	6	6	276964	276969	0 %	0 %	100 %	0 %	320449412
6511	NC_014974	TCC	2	6	276983	276988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449412
6512	NC_014974	GAG	2	6	276989	276994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449412
6513	NC_014974	AGG	2	6	277053	277058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449412
6514	NC_014974	CCT	2	6	277140	277145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449412
6515	NC_014974	ACG	2	6	277191	277196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449412
6516	NC_014974	GTG	2	6	277250	277255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449412
6517	NC_014974	TCC	2	6	277293	277298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449412
6518	NC_014974	C	6	6	277458	277463	0 %	0 %	0 %	100 %	320449412
6519	NC_014974	AGGC	2	8	277530	277537	25 %	0 %	50 %	25 %	320449413
6520	NC_014974	ACCT	2	8	277548	277555	25 %	25 %	0 %	50 %	320449413
6521	NC_014974	TGG	2	6	277735	277740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449413
6522	NC_014974	AGG	2	6	277873	277878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449413
6523	NC_014974	GAA	2	6	277908	277913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449414
6524	NC_014974	G	6	6	277925	277930	0 %	0 %	100 %	0 %	320449414
6525	NC_014974	AAG	2	6	277988	277993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449414
6526	NC_014974	CCA	3	9	278032	278040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449414
6527	NC_014974	AGG	2	6	278175	278180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449414
6528	NC_014974	G	6	6	278206	278211	0 %	0 %	100 %	0 %	320449414
6529	NC_014974	CGG	2	6	278224	278229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449414
6530	NC_014974	GTG	2	6	278288	278293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449414
6531	NC_014974	GAG	2	6	278297	278302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449414
6532	NC_014974	G	6	6	278310	278315	0 %	0 %	100 %	0 %	320449414
6533	NC_014974	GGC	2	6	278323	278328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449414
6534	NC_014974	GGGCC	2	10	278335	278344	0 %	0 %	60 %	40 %	320449414
6535	NC_014974	GGC	2	6	278356	278361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449414
6536	NC_014974	CGGG	2	8	278364	278371	0 %	0 %	75 %	25 %	320449414
6537	NC_014974	AGG	2	6	278382	278387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449414
6538	NC_014974	TGA	2	6	278421	278426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449414
6539	NC_014974	CAC	2	6	278482	278487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449414
6540	NC_014974	G	7	7	278489	278495	0 %	0 %	100 %	0 %	320449414
6541	NC_014974	CGC	2	6	278509	278514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449414
6542	NC_014974	TGG	2	6	278646	278651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449414
6543	NC_014974	ACCG	2	8	278660	278667	25 %	0 %	25 %	50 %	320449414
6544	NC_014974	CAC	2	6	278798	278803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449415
6545	NC_014974	GGA	2	6	278837	278842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449415
6546	NC_014974	AGG	3	9	278860	278868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449415
6547	NC_014974	GCC	2	6	278920	278925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449415
6548	NC_014974	CCA	2	6	278926	278931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449415
6549	NC_014974	CGA	2	6	278996	279001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449415
6550	NC_014974	G	7	7	279014	279020	0 %	0 %	100 %	0 %	320449415
6551	NC_014974	GGT	4	12	279044	279055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449415
6552	NC_014974	CCA	2	6	279059	279064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449415
6553	NC_014974	GGA	2	6	279224	279229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449415
6554	NC_014974	GCC	2	6	279274	279279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449415
6555	NC_014974	G	6	6	279314	279319	0 %	0 %	100 %	0 %	320449415
6556	NC_014974	G	7	7	279324	279330	0 %	0 %	100 %	0 %	320449415
6557	NC_014974	TCA	2	6	279361	279366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449415
6558	NC_014974	GCC	2	6	279408	279413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449415
6559	NC_014974	AGG	2	6	279433	279438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449415
6560	NC_014974	GCC	2	6	279447	279452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449415
6561	NC_014974	CCT	2	6	279479	279484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449415
6562	NC_014974	GGT	2	6	279494	279499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449415
6563	NC_014974	CCCGAG	2	12	279513	279524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449415
6564	NC_014974	GAG	2	6	279591	279596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449415
6565	NC_014974	GGA	2	6	279614	279619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449415
6566	NC_014974	CCG	2	6	279638	279643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449415
6567	NC_014974	GCG	2	6	279782	279787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449416
6568	NC_014974	CAG	2	6	279794	279799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449416
6569	NC_014974	ACGTGA	2	12	279924	279935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320449416
6570	NC_014974	AAC	2	6	280016	280021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449416
6571	NC_014974	TCC	2	6	280023	280028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449416
6572	NC_014974	CGCTAC	2	12	280067	280078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320449416
6573	NC_014974	CGGCCA	2	12	280305	280316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449416
6574	NC_014974	TGG	3	9	280320	280328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449416
6575	NC_014974	CAGG	2	8	280519	280526	25 %	0 %	50 %	25 %	320449416
6576	NC_014974	GGAA	2	8	280573	280580	50 %	0 %	50 %	0 %	320449416
6577	NC_014974	ACC	2	6	280697	280702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449416
6578	NC_014974	TC	3	6	280728	280733	0 %	50 %	0 %	50 %	320449416
6579	NC_014974	CTT	2	6	280745	280750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449416
6580	NC_014974	GGA	2	6	280828	280833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449416
6581	NC_014974	AGGCC	2	10	280965	280974	20 %	0 %	40 %	40 %	320449416
6582	NC_014974	GCGG	2	8	281152	281159	0 %	0 %	75 %	25 %	320449416
6583	NC_014974	GAAG	2	8	281206	281213	50 %	0 %	50 %	0 %	320449416
6584	NC_014974	TGG	2	6	281277	281282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449416
6585	NC_014974	TGG	2	6	281301	281306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449416
6586	NC_014974	TGC	2	6	281334	281339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449416
6587	NC_014974	CCACC	2	10	281365	281374	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6588	NC_014974	GGC	2	6	281444	281449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449417
6589	NC_014974	GAG	2	6	281450	281455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449417
6590	NC_014974	AGG	2	6	281544	281549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449417
6591	NC_014974	GGC	2	6	281647	281652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449417
6592	NC_014974	TGG	2	6	281679	281684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449417
6593	NC_014974	CCG	2	6	281688	281693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449417
6594	NC_014974	AGG	2	6	281778	281783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449417
6595	NC_014974	CGCC	2	8	281821	281828	0 %	0 %	25 %	75 %	320449417
6596	NC_014974	G	6	6	281849	281854	0 %	0 %	100 %	0 %	320449417
6597	NC_014974	GGT	2	6	281911	281916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449417
6598	NC_014974	TGGCCC	2	12	281937	281948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449417
6599	NC_014974	TCC	2	6	281967	281972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449417
6600	NC_014974	TCCC	2	8	281996	282003	0 %	25 %	0 %	75 %	320449417
6601	NC_014974	AGG	2	6	282023	282028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449417
6602	NC_014974	TCA	2	6	282054	282059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449417
6603	NC_014974	GTGGAC	2	12	282080	282091	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449417
6604	NC_014974	GAG	2	6	282095	282100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449417
6605	NC_014974	TAAGC	2	10	282108	282117	40 %	20 %	20 %	20 %	320449417
6606	NC_014974	GCC	2	6	282168	282173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449418
6607	NC_014974	CTTCT	2	10	282186	282195	0 %	60 %	0 %	40 %	320449418
6608	NC_014974	CCT	2	6	282200	282205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449418
6609	NC_014974	CTCC	2	8	282209	282216	0 %	25 %	0 %	75 %	320449418
6610	NC_014974	CCT	2	6	282263	282268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449418
6611	NC_014974	CTT	2	6	282290	282295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449418
6612	NC_014974	AAG	2	6	282318	282323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449418
6613	NC_014974	CAC	2	6	282341	282346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449418
6614	NC_014974	CCG	2	6	282355	282360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449418
6615	NC_014974	CTC	2	6	282363	282368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449418
6616	NC_014974	CGC	2	6	282384	282389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449418
6617	NC_014974	CTG	2	6	282450	282455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449418
6618	NC_014974	GGC	2	6	282466	282471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449418
6619	NC_014974	GGA	2	6	282512	282517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449418
6620	NC_014974	GAGC	2	8	282548	282555	25 %	0 %	50 %	25 %	320449418
6621	NC_014974	C	6	6	282559	282564	0 %	0 %	0 %	100 %	320449418
6622	NC_014974	TGG	2	6	282589	282594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449418
6623	NC_014974	G	6	6	282598	282603	0 %	0 %	100 %	0 %	320449418
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6995	NC_014974	ACC	2	6	297614	297619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449437
6996	NC_014974	GCCT	2	8	297664	297671	0 %	25 %	25 %	50 %	320449437
6997	NC_014974	TCTTCC	2	12	297720	297731	0 %	50 %	0 %	50 %	320449437
6998	NC_014974	GCC	2	6	297758	297763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449437
6999	NC_014974	CTACG	2	10	297826	297835	20 %	20 %	20 %	40 %	320449437
7000	NC_014974	GGA	2	6	297895	297900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449437

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