MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014974	G	6	6	255558	255563	0 %	0 %	100 %	0 %	320449386
6002	NC_014974	AAGC	2	8	255576	255583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_014974	TTTC	2	8	255599	255606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_014974	TCT	2	6	255660	255665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014974	T	8	8	255780	255787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014974	AGA	2	6	255889	255894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449387
6007	NC_014974	CTT	2	6	255901	255906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449387
6008	NC_014974	CCT	3	9	256017	256025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449387
6009	NC_014974	TGGG	2	8	256031	256038	0 %	25 %	75 %	0 %	320449387
6010	NC_014974	ATGAC	2	10	256077	256086	40 %	20 %	20 %	20 %	320449387
6011	NC_014974	GGGT	3	12	256089	256100	0 %	25 %	75 %	0 %	320449387
6012	NC_014974	GGT	2	6	256212	256217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449387
6013	NC_014974	GGCA	2	8	256223	256230	25 %	0 %	50 %	25 %	320449387
6014	NC_014974	TGG	2	6	256329	256334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449387
6015	NC_014974	T	7	7	256345	256351	0 %	100 %	0 %	0 %	320449387
6016	NC_014974	TC	3	6	256375	256380	0 %	50 %	0 %	50 %	320449387
6017	NC_014974	TA	3	6	256410	256415	50 %	50 %	0 %	0 %	320449387
6018	NC_014974	TCCTC	2	10	256416	256425	0 %	40 %	0 %	60 %	320449387
6019	NC_014974	T	7	7	256426	256432	0 %	100 %	0 %	0 %	320449387
6020	NC_014974	GGA	2	6	256433	256438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449387
6021	NC_014974	CGC	2	6	256455	256460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449387
6022	NC_014974	TCTTGG	2	12	256517	256528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	320449387
6023	NC_014974	TAC	2	6	256564	256569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449387
6024	NC_014974	TGG	2	6	256598	256603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449387
6025	NC_014974	CAC	2	6	256606	256611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449387
6026	NC_014974	CTC	2	6	256617	256622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449387
6027	NC_014974	ATT	2	6	256734	256739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320449387
6028	NC_014974	T	7	7	256836	256842	0 %	100 %	0 %	0 %	320449387
6029	NC_014974	TAT	2	6	256985	256990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320449387
6030	NC_014974	ACTGG	2	10	256997	257006	20 %	20 %	40 %	20 %	320449387
6031	NC_014974	TTGC	2	8	257009	257016	0 %	50 %	25 %	25 %	320449387
6032	NC_014974	GTT	2	6	257094	257099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449388
6033	NC_014974	AG	3	6	257130	257135	50 %	0 %	50 %	0 %	320449388
6034	NC_014974	CTG	2	6	257146	257151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449388
6035	NC_014974	GGT	2	6	257187	257192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449388
6036	NC_014974	C	6	6	257202	257207	0 %	0 %	0 %	100 %	320449388
6037	NC_014974	AAGCC	2	10	257281	257290	40 %	0 %	20 %	40 %	320449388
6038	NC_014974	GTG	2	6	257383	257388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449388
6039	NC_014974	T	6	6	257391	257396	0 %	100 %	0 %	0 %	320449388
6040	NC_014974	CAC	2	6	257514	257519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449388
6041	NC_014974	AAGGC	2	10	257555	257564	40 %	0 %	40 %	20 %	320449388
6042	NC_014974	GAG	2	6	257653	257658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449388
6043	NC_014974	GGA	2	6	257706	257711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449388
6044	NC_014974	TGG	2	6	257783	257788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449388
6045	NC_014974	TGG	2	6	257825	257830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449388
6046	NC_014974	TGA	2	6	257891	257896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449388
6047	NC_014974	TCC	2	6	257920	257925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449388
6048	NC_014974	GGGA	2	8	257930	257937	25 %	0 %	75 %	0 %	320449388
6049	NC_014974	CTC	2	6	257950	257955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449388
6050	NC_014974	GGGA	2	8	257997	258004	25 %	0 %	75 %	0 %	320449388
6051	NC_014974	GTG	2	6	258013	258018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449388
6052	NC_014974	AAT	2	6	258087	258092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320449388
6053	NC_014974	GAG	2	6	258148	258153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449388
6054	NC_014974	ACTGA	2	10	258199	258208	40 %	20 %	20 %	20 %	320449388
6055	NC_014974	GTT	2	6	258252	258257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449389
6056	NC_014974	TTTTA	2	10	258321	258330	20 %	80 %	0 %	0 %	320449389
6057	NC_014974	CCGG	2	8	258479	258486	0 %	0 %	50 %	50 %	320449389
6058	NC_014974	CAT	2	6	258527	258532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449389
6059	NC_014974	GCG	2	6	258534	258539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449389
6060	NC_014974	CCG	2	6	258557	258562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449389
6061	NC_014974	GGT	2	6	258569	258574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449389
6062	NC_014974	AAG	2	6	258618	258623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449389
6063	NC_014974	TCT	2	6	258688	258693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449389
6064	NC_014974	GAT	2	6	258702	258707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449389
6065	NC_014974	G	7	7	258761	258767	0 %	0 %	100 %	0 %	320449389
6066	NC_014974	GAG	2	6	258783	258788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449389
6067	NC_014974	CCACC	2	10	258801	258810	20 %	0 %	0 %	80 %	320449389
6068	NC_014974	GC	3	6	258912	258917	0 %	0 %	50 %	50 %	320449389
6069	NC_014974	AGCGAA	2	12	258960	258971	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	320449389
6070	NC_014974	GGA	2	6	258986	258991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449389
6071	NC_014974	GCA	2	6	259090	259095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449389
6072	NC_014974	AGG	2	6	259099	259104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449389
6073	NC_014974	CCATGG	2	12	259105	259116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320449389
6074	NC_014974	TCA	2	6	259126	259131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449389
6075	NC_014974	GGT	2	6	259160	259165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449389
6076	NC_014974	GGA	2	6	259289	259294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449389
6077	NC_014974	TCT	2	6	259363	259368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449390
6078	NC_014974	GTG	2	6	259400	259405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449390
6079	NC_014974	CCT	2	6	259420	259425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449390
6080	NC_014974	GAG	2	6	259559	259564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449390
6081	NC_014974	CGGA	2	8	259572	259579	25 %	0 %	50 %	25 %	320449390
6082	NC_014974	TGA	2	6	259591	259596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449390
6083	NC_014974	GA	3	6	259595	259600	50 %	0 %	50 %	0 %	320449390
6084	NC_014974	TCA	2	6	259659	259664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449390
6085	NC_014974	TGG	2	6	259689	259694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449390
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6087	NC_014974	CGG	2	6	259748	259753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449390
6088	NC_014974	GAG	2	6	259817	259822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449390
6089	NC_014974	TG	3	6	259837	259842	0 %	50 %	50 %	0 %	320449390
6090	NC_014974	CTG	2	6	259883	259888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449390
6091	NC_014974	CCA	2	6	259941	259946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449390
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6093	NC_014974	CGGGG	2	10	259992	260001	0 %	0 %	80 %	20 %	320449391
6094	NC_014974	G	7	7	259998	260004	0 %	0 %	100 %	0 %	320449391
6095	NC_014974	GTGGCC	2	12	260014	260025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320449391
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6098	NC_014974	AGGT	2	8	260435	260442	25 %	25 %	50 %	0 %	320449391
6099	NC_014974	GGAGCG	2	12	260458	260469	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320449391
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6102	NC_014974	GGT	2	6	260735	260740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449392
6103	NC_014974	GCCCTG	2	12	260754	260765	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449392
6104	NC_014974	CGG	2	6	260776	260781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449392
6105	NC_014974	CCAT	2	8	260782	260789	25 %	25 %	0 %	50 %	320449392
6106	NC_014974	GGT	3	9	260828	260836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449392
6107	NC_014974	GCCC	2	8	260886	260893	0 %	0 %	25 %	75 %	320449392
6108	NC_014974	ATAG	2	8	260901	260908	50 %	25 %	25 %	0 %	320449392
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6110	NC_014974	AAG	2	6	260958	260963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449392
6111	NC_014974	GGT	2	6	260993	260998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449392
6112	NC_014974	CAA	2	6	261164	261169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449392
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6114	NC_014974	G	6	6	261189	261194	0 %	0 %	100 %	0 %	320449392
6115	NC_014974	GAT	2	6	261207	261212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449392
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6120	NC_014974	AGG	2	6	261538	261543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449392
6121	NC_014974	TG	3	6	261560	261565	0 %	50 %	50 %	0 %	320449392
6122	NC_014974	G	6	6	261611	261616	0 %	0 %	100 %	0 %	320449392
6123	NC_014974	GGA	2	6	261626	261631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449392
6124	NC_014974	TTTG	2	8	261649	261656	0 %	75 %	25 %	0 %	320449392
6125	NC_014974	AGGACC	2	12	261682	261693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449392
6126	NC_014974	GGTTA	2	10	261726	261735	20 %	40 %	40 %	0 %	320449392
6127	NC_014974	GGC	2	6	261836	261841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449393
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6129	NC_014974	CGG	2	6	262012	262017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449393
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6139	NC_014974	TGG	2	6	262396	262401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449393
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6141	NC_014974	GGT	2	6	262436	262441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449393
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6231	NC_014974	TGCAG	2	10	266128	266137	20 %	20 %	40 %	20 %	320449396
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6244	NC_014974	CTTC	2	8	266820	266827	0 %	50 %	0 %	50 %	320449397
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6370	NC_014974	C	6	6	271274	271279	0 %	0 %	0 %	100 %	320449404
6371	NC_014974	GGA	3	9	271317	271325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449404
6372	NC_014974	GGT	2	6	271368	271373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449404
6373	NC_014974	GGT	3	9	271389	271397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449404
6374	NC_014974	TAC	2	6	271426	271431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449404
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6382	NC_014974	GTA	2	6	271794	271799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449405
6383	NC_014974	CCCGGG	2	12	271859	271870	0 %	0 %	50 %	50 %	320449405
6384	NC_014974	GCC	2	6	271879	271884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449405
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6423	NC_014974	TGGA	2	8	273330	273337	25 %	25 %	50 %	0 %	320449408
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6445	NC_014974	TGG	2	6	274209	274214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449408
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6471	NC_014974	G	6	6	275626	275631	0 %	0 %	100 %	0 %	320449411
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6487	NC_014974	GAG	2	6	276213	276218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449411
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6491	NC_014974	G	6	6	276296	276301	0 %	0 %	100 %	0 %	320449411
6492	NC_014974	GAA	2	6	276311	276316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449411
6493	NC_014974	CTG	2	6	276351	276356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449411
6494	NC_014974	G	6	6	276382	276387	0 %	0 %	100 %	0 %	320449411
6495	NC_014974	ACC	2	6	276406	276411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449411
6496	NC_014974	GGA	2	6	276425	276430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449411
6497	NC_014974	CCCCTG	2	12	276480	276491	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320449411
6498	NC_014974	GGGGT	2	10	276547	276556	0 %	20 %	80 %	0 %	320449412
6499	NC_014974	G	6	6	276635	276640	0 %	0 %	100 %	0 %	320449412
6500	NC_014974	CTT	3	9	276676	276684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449412

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