MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014974	GGT	2	6	232657	232662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449365
5502	NC_014974	GA	3	6	232688	232693	50 %	0 %	50 %	0 %	320449365
5503	NC_014974	GCG	2	6	232709	232714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449365
5504	NC_014974	TGG	2	6	232767	232772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449365
5505	NC_014974	AGG	2	6	232821	232826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449365
5506	NC_014974	AGA	2	6	232855	232860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449365
5507	NC_014974	GTT	2	6	232942	232947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449365
5508	NC_014974	CAC	2	6	232948	232953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449365
5509	NC_014974	CGG	2	6	232968	232973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449365
5510	NC_014974	CCA	2	6	233009	233014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449365
5511	NC_014974	C	6	6	233123	233128	0 %	0 %	0 %	100 %	320449365
5512	NC_014974	GTC	3	9	233146	233154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449365
5513	NC_014974	GTTGGG	2	12	233194	233205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449365
5514	NC_014974	GGC	2	6	233221	233226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449365
5515	NC_014974	GGT	2	6	233235	233240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449365
5516	NC_014974	CCA	2	6	233259	233264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449365
5517	NC_014974	CCA	3	9	233268	233276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449365
5518	NC_014974	GCC	2	6	233381	233386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449365
5519	NC_014974	GGC	2	6	233399	233404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449365
5520	NC_014974	GGTC	2	8	233421	233428	0 %	25 %	50 %	25 %	320449365
5521	NC_014974	TGCG	2	8	233447	233454	0 %	25 %	50 %	25 %	320449365
5522	NC_014974	AGT	2	6	233520	233525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449365
5523	NC_014974	TCGGC	2	10	233526	233535	0 %	20 %	40 %	40 %	320449365
5524	NC_014974	CAGG	2	8	233621	233628	25 %	0 %	50 %	25 %	320449365
5525	NC_014974	TC	3	6	233712	233717	0 %	50 %	0 %	50 %	320449365
5526	NC_014974	GGC	2	6	233794	233799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449365
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5528	NC_014974	AAG	2	6	233818	233823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449365
5529	NC_014974	TCC	2	6	233847	233852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_014974	GTT	2	6	233946	233951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449366
5531	NC_014974	GTC	2	6	234099	234104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449366
5532	NC_014974	ACG	2	6	234154	234159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449366
5533	NC_014974	GCC	2	6	234198	234203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449366
5534	NC_014974	TCG	2	6	234205	234210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449366
5535	NC_014974	CGA	2	6	234404	234409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449366
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5537	NC_014974	GGT	2	6	234651	234656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449366
5538	NC_014974	CTG	2	6	234705	234710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449366
5539	NC_014974	AGT	2	6	234767	234772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449366
5540	NC_014974	GCCC	2	8	234819	234826	0 %	0 %	25 %	75 %	320449366
5541	NC_014974	GGC	2	6	234840	234845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449366
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5543	NC_014974	TGG	2	6	234896	234901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449366
5544	NC_014974	GCC	2	6	234915	234920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449366
5545	NC_014974	GGA	2	6	234952	234957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449366
5546	NC_014974	TACCG	2	10	235017	235026	20 %	20 %	20 %	40 %	320449366
5547	NC_014974	GTGC	2	8	235039	235046	0 %	25 %	50 %	25 %	320449366
5548	NC_014974	AGGA	2	8	235056	235063	50 %	0 %	50 %	0 %	320449366
5549	NC_014974	GAGG	2	8	235069	235076	25 %	0 %	75 %	0 %	320449366
5550	NC_014974	GGC	2	6	235104	235109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449366
5551	NC_014974	AG	3	6	235195	235200	50 %	0 %	50 %	0 %	320449366
5552	NC_014974	TGG	3	9	235250	235258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449366
5553	NC_014974	C	6	6	235314	235319	0 %	0 %	0 %	100 %	320449366
5554	NC_014974	AGG	2	6	235387	235392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449366
5555	NC_014974	T	7	7	235418	235424	0 %	100 %	0 %	0 %	320449366
5556	NC_014974	CCT	2	6	235432	235437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_014974	C	6	6	235527	235532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5558	NC_014974	CGG	2	6	235581	235586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449367
5559	NC_014974	CAT	2	6	235599	235604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449367
5560	NC_014974	GGA	2	6	235680	235685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449367
5561	NC_014974	TAC	2	6	235804	235809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449367
5562	NC_014974	CTC	2	6	235810	235815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449367
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5565	NC_014974	GGC	2	6	236003	236008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449367
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5568	NC_014974	C	6	6	236140	236145	0 %	0 %	0 %	100 %	320449367
5569	NC_014974	GAG	2	6	236176	236181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449367
5570	NC_014974	G	6	6	236222	236227	0 %	0 %	100 %	0 %	320449367
5571	NC_014974	GCC	2	6	236297	236302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449367
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5574	NC_014974	G	7	7	236376	236382	0 %	0 %	100 %	0 %	320449367
5575	NC_014974	CGG	2	6	236401	236406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449367
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5579	NC_014974	TCA	2	6	236693	236698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449367
5580	NC_014974	TTAGGG	2	12	236717	236728	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	320449367
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5590	NC_014974	GAG	2	6	237070	237075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449368
5591	NC_014974	G	6	6	237117	237122	0 %	0 %	100 %	0 %	320449368
5592	NC_014974	CTC	2	6	237143	237148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449368
5593	NC_014974	CTC	2	6	237248	237253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449368
5594	NC_014974	CTA	2	6	237271	237276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449368
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5596	NC_014974	AGG	2	6	237299	237304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449368
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5598	NC_014974	GGA	2	6	237517	237522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449368
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5602	NC_014974	TGG	2	6	237666	237671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449368
5603	NC_014974	CT	3	6	237674	237679	0 %	50 %	0 %	50 %	320449368
5604	NC_014974	GTG	2	6	237683	237688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449368
5605	NC_014974	ACA	2	6	237708	237713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449368
5606	NC_014974	AGG	2	6	237723	237728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449368
5607	NC_014974	CTC	2	6	237779	237784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449368
5608	NC_014974	CTT	2	6	237791	237796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449368
5609	NC_014974	GGC	2	6	237810	237815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449368
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5611	NC_014974	GGA	2	6	237838	237843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449368
5612	NC_014974	CTTCC	2	10	237893	237902	0 %	40 %	0 %	60 %	320449368
5613	NC_014974	CAC	2	6	237911	237916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449368
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5623	NC_014974	GCG	2	6	238178	238183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449369
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5870	NC_014974	CTG	2	6	248706	248711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449381
5871	NC_014974	CTG	2	6	248826	248831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449381
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5873	NC_014974	CTG	2	6	248859	248864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449381
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