MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53502	NC_014974	GAG	2	6	2334824	2334829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451541
53503	NC_014974	GCCCCC	2	12	2334847	2334858	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	320451541
53504	NC_014974	GCC	2	6	2334893	2334898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451541
53505	NC_014974	CCT	2	6	2334922	2334927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53506	NC_014974	CTC	2	6	2334932	2334937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53507	NC_014974	CTC	2	6	2334974	2334979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53508	NC_014974	GAGG	2	8	2335021	2335028	25 %	0 %	75 %	0 %	320451541
53509	NC_014974	CCT	2	6	2335045	2335050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53510	NC_014974	CTC	2	6	2335103	2335108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53511	NC_014974	TCC	2	6	2335179	2335184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53512	NC_014974	GGA	2	6	2335219	2335224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451541
53513	NC_014974	GGT	3	9	2335375	2335383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451541
53514	NC_014974	CCT	2	6	2335417	2335422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53515	NC_014974	GAG	2	6	2335556	2335561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451541
53516	NC_014974	GGA	2	6	2335564	2335569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451541
53517	NC_014974	CCT	2	6	2335582	2335587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451541
53518	NC_014974	GAG	2	6	2335597	2335602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451541
53519	NC_014974	CCTGG	2	10	2335691	2335700	0 %	20 %	40 %	40 %	320451542
53520	NC_014974	GTG	2	6	2335743	2335748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451542
53521	NC_014974	CCT	3	9	2335754	2335762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451542
53522	NC_014974	TGG	2	6	2335788	2335793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451542
53523	NC_014974	TCCC	2	8	2335844	2335851	0 %	25 %	0 %	75 %	320451542
53524	NC_014974	TCC	2	6	2335870	2335875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451542
53525	NC_014974	A	6	6	2335945	2335950	100 %	0 %	0 %	0 %	320451542
53526	NC_014974	CCG	3	9	2335951	2335959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451542
53527	NC_014974	CCCT	2	8	2335974	2335981	0 %	25 %	0 %	75 %	320451542
53528	NC_014974	ACG	2	6	2336002	2336007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451542
53529	NC_014974	GCCTG	2	10	2336044	2336053	0 %	20 %	40 %	40 %	320451542
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53531	NC_014974	CCT	2	6	2336213	2336218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451543
53532	NC_014974	G	6	6	2336222	2336227	0 %	0 %	100 %	0 %	320451543
53533	NC_014974	CCA	2	6	2336255	2336260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451543
53534	NC_014974	C	6	6	2336274	2336279	0 %	0 %	0 %	100 %	320451543
53535	NC_014974	CCG	3	9	2336294	2336302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451543
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53538	NC_014974	GGC	2	6	2336409	2336414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451543
53539	NC_014974	CGC	2	6	2336424	2336429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451543
53540	NC_014974	C	7	7	2336429	2336435	0 %	0 %	0 %	100 %	320451543
53541	NC_014974	CCA	3	9	2336453	2336461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451543
53542	NC_014974	AGG	2	6	2336497	2336502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451543
53543	NC_014974	C	7	7	2336558	2336564	0 %	0 %	0 %	100 %	320451543
53544	NC_014974	AGCC	2	8	2336565	2336572	25 %	0 %	25 %	50 %	320451543
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53547	NC_014974	CTC	2	6	2336772	2336777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451543
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53549	NC_014974	CGC	2	6	2336841	2336846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451543
53550	NC_014974	CCG	2	6	2336858	2336863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451543
53551	NC_014974	GGCCC	2	10	2336868	2336877	0 %	0 %	40 %	60 %	320451543
53552	NC_014974	TCC	2	6	2336878	2336883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451543
53553	NC_014974	CTT	2	6	2336899	2336904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451543
53554	NC_014974	GAG	2	6	2336910	2336915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451543
53555	NC_014974	C	7	7	2336923	2336929	0 %	0 %	0 %	100 %	320451543
53556	NC_014974	CGG	2	6	2337001	2337006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451543
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53560	NC_014974	CTT	2	6	2337134	2337139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451544
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53563	NC_014974	CTC	2	6	2337245	2337250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451544
53564	NC_014974	CCT	2	6	2337280	2337285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451544
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53566	NC_014974	GCCACG	2	12	2337393	2337404	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320451544
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53571	NC_014974	GGTG	2	8	2337565	2337572	0 %	25 %	75 %	0 %	320451544
53572	NC_014974	CCA	2	6	2337586	2337591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451544
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53576	NC_014974	CCT	2	6	2337853	2337858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451544
53577	NC_014974	TCC	2	6	2337888	2337893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451544
53578	NC_014974	ACCAGG	2	12	2337915	2337926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451544
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53582	NC_014974	CTC	2	6	2338152	2338157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451545
53583	NC_014974	GGC	2	6	2338160	2338165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451545
53584	NC_014974	AGG	2	6	2338177	2338182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451545
53585	NC_014974	CCT	3	9	2338202	2338210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451545
53586	NC_014974	A	6	6	2338226	2338231	100 %	0 %	0 %	0 %	320451545
53587	NC_014974	CCT	2	6	2338241	2338246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451545
53588	NC_014974	TCC	2	6	2338288	2338293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451545
53589	NC_014974	G	8	8	2338296	2338303	0 %	0 %	100 %	0 %	320451545
53590	NC_014974	CCA	2	6	2338307	2338312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451545
53591	NC_014974	CTCCAG	2	12	2338392	2338403	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320451545
53592	NC_014974	CCT	2	6	2338434	2338439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53593	NC_014974	CCT	2	6	2338549	2338554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451546
53594	NC_014974	GCC	2	6	2338560	2338565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451546
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53596	NC_014974	AAG	2	6	2338635	2338640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451546
53597	NC_014974	TCC	2	6	2338707	2338712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451546
53598	NC_014974	CCA	2	6	2338714	2338719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451546
53599	NC_014974	TCC	2	6	2338752	2338757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451546
53600	NC_014974	CAC	2	6	2338772	2338777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451546
53601	NC_014974	CCA	3	9	2338786	2338794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451546
53602	NC_014974	GA	3	6	2338818	2338823	50 %	0 %	50 %	0 %	320451546
53603	NC_014974	TCGTAC	2	12	2338944	2338955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320451546
53604	NC_014974	TTG	2	6	2338956	2338961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451546
53605	NC_014974	CAC	2	6	2338994	2338999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451546
53606	NC_014974	C	7	7	2339047	2339053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53607	NC_014974	C	6	6	2339096	2339101	0 %	0 %	0 %	100 %	320451547
53608	NC_014974	GGC	2	6	2339103	2339108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451547
53609	NC_014974	GGC	2	6	2339126	2339131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451547
53610	NC_014974	CAGG	2	8	2339229	2339236	25 %	0 %	50 %	25 %	320451547
53611	NC_014974	GCCTCC	2	12	2339245	2339256	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320451547
53612	NC_014974	AAG	2	6	2339268	2339273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451547
53613	NC_014974	CCT	2	6	2339381	2339386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451547
53614	NC_014974	CCT	2	6	2339459	2339464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451547
53615	NC_014974	CAC	2	6	2339544	2339549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451547
53616	NC_014974	ATCC	2	8	2339588	2339595	25 %	25 %	0 %	50 %	320451547
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53618	NC_014974	GAG	2	6	2339765	2339770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451548
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