MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_014974	GAG	2	6	2270899	2270904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
52003	NC_014974	GGA	2	6	2270925	2270930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
52004	NC_014974	GCTGGA	2	12	2270931	2270942	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451472
52005	NC_014974	GGA	2	6	2271003	2271008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
52006	NC_014974	CAC	2	6	2271078	2271083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451472
52007	NC_014974	GCTCCT	2	12	2271091	2271102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320451472
52008	NC_014974	AGC	2	6	2271150	2271155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451472
52009	NC_014974	CTT	2	6	2271204	2271209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451472
52010	NC_014974	GGC	2	6	2271216	2271221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451472
52011	NC_014974	GGAGCT	2	12	2271237	2271248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451472
52012	NC_014974	CCT	2	6	2271261	2271266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451472
52013	NC_014974	CCA	2	6	2271330	2271335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451472
52014	NC_014974	AGG	2	6	2271338	2271343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
52015	NC_014974	AGGGG	2	10	2271351	2271360	20 %	0 %	80 %	0 %	320451472
52016	NC_014974	CTT	2	6	2271361	2271366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451472
52017	NC_014974	GAG	2	6	2271379	2271384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
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52053	NC_014974	CCA	3	9	2273048	2273056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451473
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52103	NC_014974	GGCG	2	8	2275860	2275867	0 %	0 %	75 %	25 %	320451474
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52107	NC_014974	CGG	2	6	2275932	2275937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451474
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52112	NC_014974	CTG	2	6	2276035	2276040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451474
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52116	NC_014974	GCC	2	6	2276135	2276140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451474
52117	NC_014974	CCT	2	6	2276154	2276159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451474
52118	NC_014974	CGG	2	6	2276172	2276177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451474
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52120	NC_014974	TCC	2	6	2276321	2276326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52121	NC_014974	AAGA	2	8	2276364	2276371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52122	NC_014974	CCG	2	6	2276454	2276459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52123	NC_014974	AGG	2	6	2276461	2276466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52129	NC_014974	TG	3	6	2276749	2276754	0 %	50 %	50 %	0 %	320451476
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52154	NC_014974	GAG	2	6	2277561	2277566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451476
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52220	NC_014974	GTGG	2	8	2280617	2280624	0 %	25 %	75 %	0 %	320451478
52221	NC_014974	GGA	2	6	2280709	2280714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451478
52222	NC_014974	ACC	2	6	2280789	2280794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451478
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52225	NC_014974	GCCAG	2	10	2281084	2281093	20 %	0 %	40 %	40 %	320451478
52226	NC_014974	TCC	2	6	2281098	2281103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451478
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52230	NC_014974	GGC	2	6	2281208	2281213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451478
52231	NC_014974	GTC	2	6	2281301	2281306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451478
52232	NC_014974	CAT	2	6	2281441	2281446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451479
52233	NC_014974	GCC	2	6	2281448	2281453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451479
52234	NC_014974	GCCC	2	8	2281459	2281466	0 %	0 %	25 %	75 %	320451479
52235	NC_014974	TGG	2	6	2281473	2281478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451479
52236	NC_014974	GCG	2	6	2281514	2281519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451479
52237	NC_014974	CCA	2	6	2281584	2281589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451479
52238	NC_014974	CCGT	2	8	2281640	2281647	0 %	25 %	25 %	50 %	320451479
52239	NC_014974	CTC	2	6	2281660	2281665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451479
52240	NC_014974	CTC	2	6	2281705	2281710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451479
52241	NC_014974	TTG	2	6	2281787	2281792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451479
52242	NC_014974	TCC	2	6	2281859	2281864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451479
52243	NC_014974	GCA	2	6	2281868	2281873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451479
52244	NC_014974	C	6	6	2281880	2281885	0 %	0 %	0 %	100 %	320451479
52245	NC_014974	ACC	4	12	2281886	2281897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451479
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52247	NC_014974	C	6	6	2281944	2281949	0 %	0 %	0 %	100 %	320451479
52248	NC_014974	TCC	2	6	2281964	2281969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451479
52249	NC_014974	CG	3	6	2282017	2282022	0 %	0 %	50 %	50 %	320451479
52250	NC_014974	CTGC	2	8	2282121	2282128	0 %	25 %	25 %	50 %	320451479
52251	NC_014974	TCG	2	6	2282195	2282200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451479
52252	NC_014974	CGC	2	6	2282298	2282303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451479
52253	NC_014974	GAT	2	6	2282305	2282310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451479
52254	NC_014974	CGT	2	6	2282316	2282321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451479
52255	NC_014974	CTC	2	6	2282326	2282331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451479
52256	NC_014974	CTC	2	6	2282380	2282385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451479
52257	NC_014974	C	6	6	2282402	2282407	0 %	0 %	0 %	100 %	320451479
52258	NC_014974	CG	4	8	2282582	2282589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52259	NC_014974	CGC	3	9	2282631	2282639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52260	NC_014974	CGG	2	6	2282715	2282720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52261	NC_014974	GAC	2	6	2282747	2282752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52262	NC_014974	C	6	6	2282886	2282891	0 %	0 %	0 %	100 %	320451480
52263	NC_014974	CTG	2	6	2282906	2282911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451480
52264	NC_014974	CCG	2	6	2282992	2282997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451480
52265	NC_014974	CCT	2	6	2282998	2283003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451480
52266	NC_014974	C	6	6	2283020	2283025	0 %	0 %	0 %	100 %	320451480
52267	NC_014974	GGAG	2	8	2283051	2283058	25 %	0 %	75 %	0 %	320451480
52268	NC_014974	CGC	2	6	2283061	2283066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451480
52269	NC_014974	GAA	2	6	2283104	2283109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451480
52270	NC_014974	GTG	3	9	2283200	2283208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451480
52271	NC_014974	AGG	2	6	2283225	2283230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451480
52272	NC_014974	T	6	6	2283234	2283239	0 %	100 %	0 %	0 %	320451480
52273	NC_014974	TCT	2	6	2283300	2283305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451480
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52277	NC_014974	C	6	6	2283497	2283502	0 %	0 %	0 %	100 %	320451481
52278	NC_014974	GGA	2	6	2283525	2283530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451481
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52280	NC_014974	GCC	2	6	2283574	2283579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451481
52281	NC_014974	C	6	6	2283625	2283630	0 %	0 %	0 %	100 %	320451481
52282	NC_014974	TTG	2	6	2283649	2283654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451481
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52284	NC_014974	CTG	2	6	2283733	2283738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451481
52285	NC_014974	TTC	2	6	2283760	2283765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451481
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52288	NC_014974	GGA	2	6	2284068	2284073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451481
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52300	NC_014974	CAGCTT	2	12	2284714	2284725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320451481
52301	NC_014974	TCC	2	6	2284727	2284732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451481
52302	NC_014974	TCC	2	6	2284757	2284762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451481
52303	NC_014974	CTT	2	6	2284779	2284784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451481
52304	NC_014974	CTT	2	6	2284857	2284862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451481
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52307	NC_014974	GGCC	2	8	2285028	2285035	0 %	0 %	50 %	50 %	320451481
52308	NC_014974	CGC	2	6	2285046	2285051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451481
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52315	NC_014974	CTCC	2	8	2285304	2285311	0 %	25 %	0 %	75 %	320451482
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52321	NC_014974	CTC	2	6	2285503	2285508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451482
52322	NC_014974	TGA	2	6	2285511	2285516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451482
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52330	NC_014974	GGGCC	2	10	2285763	2285772	0 %	0 %	60 %	40 %	320451482
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52333	NC_014974	G	6	6	2285818	2285823	0 %	0 %	100 %	0 %	320451482
52334	NC_014974	CCT	2	6	2285835	2285840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451482
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52337	NC_014974	ACC	2	6	2286041	2286046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451482
52338	NC_014974	TGG	3	9	2286047	2286055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451482
52339	NC_014974	GGCG	2	8	2286088	2286095	0 %	0 %	75 %	25 %	320451482
52340	NC_014974	GAA	2	6	2286100	2286105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451482
52341	NC_014974	CCT	2	6	2286149	2286154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451483
52342	NC_014974	TCC	2	6	2286184	2286189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451483
52343	NC_014974	GAA	2	6	2286225	2286230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451483
52344	NC_014974	CTCCAG	2	12	2286285	2286296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320451483
52345	NC_014974	CTC	2	6	2286312	2286317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451483
52346	NC_014974	TCCGC	2	10	2286338	2286347	0 %	20 %	20 %	60 %	320451483
52347	NC_014974	CCT	2	6	2286356	2286361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451483
52348	NC_014974	AGGG	2	8	2286375	2286382	25 %	0 %	75 %	0 %	320451483
52349	NC_014974	CCTCCC	2	12	2286407	2286418	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320451483
52350	NC_014974	GGTG	2	8	2286419	2286426	0 %	25 %	75 %	0 %	320451483
52351	NC_014974	GC	3	6	2286456	2286461	0 %	0 %	50 %	50 %	320451483
52352	NC_014974	CTC	2	6	2286480	2286485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451483
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52360	NC_014974	GCCTC	2	10	2286808	2286817	0 %	20 %	20 %	60 %	320451484
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52381	NC_014974	C	6	6	2287573	2287578	0 %	0 %	0 %	100 %	320451485
52382	NC_014974	CAC	2	6	2287611	2287616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451485
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52407	NC_014974	CTC	2	6	2288865	2288870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451486
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52421	NC_014974	CCT	2	6	2289718	2289723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451488
52422	NC_014974	CGT	2	6	2289799	2289804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451488
52423	NC_014974	CAG	2	6	2289857	2289862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451488
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52426	NC_014974	CGG	2	6	2289933	2289938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451488
52427	NC_014974	TCC	2	6	2289942	2289947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451488
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52430	NC_014974	GGT	2	6	2290130	2290135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451488
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52432	NC_014974	GTC	2	6	2290202	2290207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451488
52433	NC_014974	GGC	2	6	2290241	2290246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451488
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52453	NC_014974	CTC	2	6	2291161	2291166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451490
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52455	NC_014974	CCCT	2	8	2291192	2291199	0 %	25 %	0 %	75 %	320451490
52456	NC_014974	CCG	2	6	2291223	2291228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451490
52457	NC_014974	GGA	2	6	2291229	2291234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451490
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52459	NC_014974	TGG	2	6	2291337	2291342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52460	NC_014974	TGG	2	6	2291479	2291484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451491
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52465	NC_014974	CCT	2	6	2291799	2291804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451492
52466	NC_014974	CCG	2	6	2291843	2291848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451492
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52468	NC_014974	AGG	2	6	2291918	2291923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451492
52469	NC_014974	CTT	2	6	2291969	2291974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451493
52470	NC_014974	CGC	2	6	2291993	2291998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451493
52471	NC_014974	AGG	2	6	2292007	2292012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451493
52472	NC_014974	TCC	2	6	2292031	2292036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451493
52473	NC_014974	CCT	2	6	2292059	2292064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451493
52474	NC_014974	CCT	2	6	2292067	2292072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451493
52475	NC_014974	GGA	2	6	2292083	2292088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451493
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52480	NC_014974	GAAG	2	8	2292344	2292351	50 %	0 %	50 %	0 %	320451493
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52484	NC_014974	A	6	6	2292463	2292468	100 %	0 %	0 %	0 %	320451494
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52490	NC_014974	C	6	6	2292725	2292730	0 %	0 %	0 %	100 %	320451494
52491	NC_014974	TGG	2	6	2292809	2292814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451494
52492	NC_014974	AAGGG	2	10	2292843	2292852	40 %	0 %	60 %	0 %	320451494
52493	NC_014974	CTA	2	6	2292873	2292878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451494
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52495	NC_014974	GGC	2	6	2292927	2292932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451494
52496	NC_014974	G	6	6	2292977	2292982	0 %	0 %	100 %	0 %	320451494
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52498	NC_014974	C	6	6	2293079	2293084	0 %	0 %	0 %	100 %	320451494
52499	NC_014974	AGG	3	9	2293103	2293111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451494
52500	NC_014974	TCC	2	6	2293130	2293135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451494

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