MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_014974	GAA	2	6	2183054	2183059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451378
50003	NC_014974	CTG	2	6	2183060	2183065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451378
50004	NC_014974	GGT	2	6	2183093	2183098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451378
50005	NC_014974	CCAC	2	8	2183130	2183137	25 %	0 %	0 %	75 %	320451378
50006	NC_014974	TCC	2	6	2183167	2183172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451378
50007	NC_014974	CTT	2	6	2183201	2183206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451378
50008	NC_014974	AAG	2	6	2183295	2183300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451378
50009	NC_014974	GGA	2	6	2183332	2183337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451378
50010	NC_014974	CGT	2	6	2183356	2183361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451378
50011	NC_014974	TTG	2	6	2183400	2183405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451378
50012	NC_014974	GGC	2	6	2183479	2183484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451378
50013	NC_014974	CCA	2	6	2183548	2183553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451378
50014	NC_014974	GGAG	2	8	2183554	2183561	25 %	0 %	75 %	0 %	320451378
50015	NC_014974	ACC	2	6	2183586	2183591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451378
50016	NC_014974	GAA	2	6	2183750	2183755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451378
50017	NC_014974	GCC	2	6	2183811	2183816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451378
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50019	NC_014974	GCC	2	6	2183885	2183890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451378
50020	NC_014974	GTA	3	9	2183900	2183908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451378
50021	NC_014974	AGT	2	6	2183971	2183976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451378
50022	NC_014974	GTA	2	6	2184017	2184022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451378
50023	NC_014974	GGT	2	6	2184038	2184043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451378
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50028	NC_014974	TGT	2	6	2184322	2184327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451378
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50032	NC_014974	TCGTGG	2	12	2184409	2184420	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50033	NC_014974	TAT	2	6	2184443	2184448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50034	NC_014974	GGC	2	6	2184604	2184609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451379
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50040	NC_014974	AGGTG	2	10	2184960	2184969	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50041	NC_014974	AG	3	6	2185029	2185034	50 %	0 %	50 %	0 %	320451380
50042	NC_014974	CTC	3	9	2185048	2185056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451380
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50051	NC_014974	TGG	2	6	2185460	2185465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451380
50052	NC_014974	GGA	2	6	2185551	2185556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451380
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50054	NC_014974	C	7	7	2185578	2185584	0 %	0 %	0 %	100 %	320451380
50055	NC_014974	TGG	2	6	2185586	2185591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451380
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50101	NC_014974	G	6	6	2187417	2187422	0 %	0 %	100 %	0 %	320451382
50102	NC_014974	GGCCTT	2	12	2187480	2187491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451382
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50105	NC_014974	AGG	2	6	2187899	2187904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451383
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50107	NC_014974	TTCC	2	8	2187973	2187980	0 %	50 %	0 %	50 %	320451383
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50117	NC_014974	TTC	2	6	2188429	2188434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451384
50118	NC_014974	GCCCCT	2	12	2188536	2188547	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320451384
50119	NC_014974	TCA	2	6	2188793	2188798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451384
50120	NC_014974	CCA	2	6	2188799	2188804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451384
50121	NC_014974	GAC	3	9	2188816	2188824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451384
50122	NC_014974	GAA	2	6	2188848	2188853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451384
50123	NC_014974	TCA	2	6	2188871	2188876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451384
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50125	NC_014974	ATC	2	6	2189038	2189043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451384
50126	NC_014974	GAAG	2	8	2189061	2189068	50 %	0 %	50 %	0 %	320451384
50127	NC_014974	GGC	2	6	2189142	2189147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451384
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50129	NC_014974	AGG	2	6	2189321	2189326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451384
50130	NC_014974	TGG	2	6	2189327	2189332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451384
50131	NC_014974	CGGGC	2	10	2189372	2189381	0 %	0 %	60 %	40 %	320451384
50132	NC_014974	GGTCCT	2	12	2189400	2189411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451384
50133	NC_014974	C	7	7	2189432	2189438	0 %	0 %	0 %	100 %	320451384
50134	NC_014974	CCCG	2	8	2189460	2189467	0 %	0 %	25 %	75 %	320451384
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50144	NC_014974	TGG	2	6	2189969	2189974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451384
50145	NC_014974	GTG	3	9	2190037	2190045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451384
50146	NC_014974	GCC	2	6	2190167	2190172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451384
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50148	NC_014974	G	6	6	2190272	2190277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50149	NC_014974	CAGG	2	8	2190302	2190309	25 %	0 %	50 %	25 %	320451385
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50151	NC_014974	TGG	2	6	2190423	2190428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451385
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50175	NC_014974	GGGTG	2	10	2191399	2191408	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50176	NC_014974	CGGT	2	8	2191446	2191453	0 %	25 %	50 %	25 %	320451386
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50190	NC_014974	TGA	2	6	2191888	2191893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451386
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50200	NC_014974	TC	3	6	2192428	2192433	0 %	50 %	0 %	50 %	320451386
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50205	NC_014974	C	8	8	2192640	2192647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50206	NC_014974	ATG	2	6	2192662	2192667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50219	NC_014974	GGA	2	6	2193436	2193441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451387
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50225	NC_014974	GCG	2	6	2193671	2193676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451388
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50230	NC_014974	GGTCCT	2	12	2193897	2193908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451388
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50232	NC_014974	CCT	2	6	2194032	2194037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451388
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50234	NC_014974	CCA	2	6	2194114	2194119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451389
50235	NC_014974	AGG	2	6	2194147	2194152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451389
50236	NC_014974	CTC	2	6	2194159	2194164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451389
50237	NC_014974	CTT	2	6	2194176	2194181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451389
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50239	NC_014974	CTC	2	6	2194245	2194250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451389
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50300	NC_014974	AC	3	6	2197088	2197093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50301	NC_014974	C	6	6	2197123	2197128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50302	NC_014974	TTCCC	2	10	2197135	2197144	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
50303	NC_014974	G	6	6	2197149	2197154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50304	NC_014974	C	7	7	2197177	2197183	0 %	0 %	0 %	100 %	320451393
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50341	NC_014974	GATCCT	2	12	2198782	2198793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320451394
50342	NC_014974	CTA	2	6	2198800	2198805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451394
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50345	NC_014974	GCC	2	6	2198825	2198830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451394
50346	NC_014974	CAA	2	6	2198845	2198850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320451394
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50349	NC_014974	TGG	2	6	2198949	2198954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451394
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50352	NC_014974	G	6	6	2198999	2199004	0 %	0 %	100 %	0 %	320451394
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50469	NC_014974	CCT	2	6	2203943	2203948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451398
50470	NC_014974	AGGC	2	8	2203974	2203981	25 %	0 %	50 %	25 %	320451398
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50499	NC_014974	AAG	2	6	2205084	2205089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451400
50500	NC_014974	CCT	2	6	2205257	2205262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451400

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