MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_014974	GTG	2	6	2162519	2162524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451357
49502	NC_014974	C	7	7	2162615	2162621	0 %	0 %	0 %	100 %	320451357
49503	NC_014974	CCT	2	6	2162637	2162642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451357
49504	NC_014974	CGC	2	6	2162674	2162679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451357
49505	NC_014974	GTG	2	6	2162747	2162752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451357
49506	NC_014974	CAC	2	6	2162811	2162816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451357
49507	NC_014974	C	6	6	2162864	2162869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49508	NC_014974	TTC	3	9	2162952	2162960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49509	NC_014974	CCA	2	6	2162963	2162968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49510	NC_014974	AGG	2	6	2163028	2163033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49511	NC_014974	CCT	2	6	2163064	2163069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
49512	NC_014974	CTT	2	6	2163083	2163088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451358
49513	NC_014974	CCG	2	6	2163166	2163171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451358
49514	NC_014974	AAGG	2	8	2163200	2163207	50 %	0 %	50 %	0 %	320451358
49515	NC_014974	CTC	2	6	2163215	2163220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
49516	NC_014974	G	6	6	2163230	2163235	0 %	0 %	100 %	0 %	320451358
49517	NC_014974	TGGG	2	8	2163238	2163245	0 %	25 %	75 %	0 %	320451358
49518	NC_014974	GCG	2	6	2163311	2163316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451358
49519	NC_014974	GGA	2	6	2163317	2163322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451358
49520	NC_014974	CCT	2	6	2163323	2163328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
49521	NC_014974	GAG	2	6	2163354	2163359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451358
49522	NC_014974	G	6	6	2163380	2163385	0 %	0 %	100 %	0 %	320451358
49523	NC_014974	GCAG	2	8	2163413	2163420	25 %	0 %	50 %	25 %	320451358
49524	NC_014974	CTT	2	6	2163443	2163448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451358
49525	NC_014974	AGG	2	6	2163466	2163471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451358
49526	NC_014974	AAGGA	2	10	2163498	2163507	60 %	0 %	40 %	0 %	320451358
49527	NC_014974	GTT	2	6	2163518	2163523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451358
49528	NC_014974	GTA	2	6	2163533	2163538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451358
49529	NC_014974	CGG	2	6	2163549	2163554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451358
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49532	NC_014974	TCT	2	6	2163850	2163855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451358
49533	NC_014974	ACC	2	6	2163903	2163908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
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49536	NC_014974	GCGG	2	8	2163959	2163966	0 %	0 %	75 %	25 %	320451358
49537	NC_014974	CCA	2	6	2163979	2163984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
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49539	NC_014974	GCA	2	6	2164039	2164044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451358
49540	NC_014974	CTC	2	6	2164130	2164135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
49541	NC_014974	CGGGG	2	10	2164167	2164176	0 %	0 %	80 %	20 %	320451358
49542	NC_014974	TGC	2	6	2164188	2164193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451358
49543	NC_014974	CCA	2	6	2164234	2164239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
49544	NC_014974	G	6	6	2164247	2164252	0 %	0 %	100 %	0 %	320451358
49545	NC_014974	C	7	7	2164294	2164300	0 %	0 %	0 %	100 %	320451358
49546	NC_014974	C	6	6	2164306	2164311	0 %	0 %	0 %	100 %	320451358
49547	NC_014974	CAC	2	6	2164403	2164408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
49548	NC_014974	CTGG	2	8	2164436	2164443	0 %	25 %	50 %	25 %	320451358
49549	NC_014974	GCC	2	6	2164453	2164458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451358
49550	NC_014974	CTC	2	6	2164481	2164486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
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49552	NC_014974	TGA	2	6	2164696	2164701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451358
49553	NC_014974	GCT	2	6	2164787	2164792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451358
49554	NC_014974	GCC	2	6	2164794	2164799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451358
49555	NC_014974	TGC	2	6	2164800	2164805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451358
49556	NC_014974	AGGTGG	2	12	2164807	2164818	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320451358
49557	NC_014974	AGG	2	6	2164823	2164828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451358
49558	NC_014974	G	7	7	2164830	2164836	0 %	0 %	100 %	0 %	320451358
49559	NC_014974	GCG	2	6	2164841	2164846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451358
49560	NC_014974	CCT	2	6	2164891	2164896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
49561	NC_014974	GGCCTG	2	12	2164904	2164915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320451358
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49563	NC_014974	GGCC	2	8	2164957	2164964	0 %	0 %	50 %	50 %	320451358
49564	NC_014974	CTC	2	6	2165051	2165056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
49565	NC_014974	TCC	3	9	2165076	2165084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451358
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49567	NC_014974	GA	3	6	2165167	2165172	50 %	0 %	50 %	0 %	320451358
49568	NC_014974	CCA	2	6	2165182	2165187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
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49570	NC_014974	CCA	2	6	2165221	2165226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
49571	NC_014974	CAC	2	6	2165267	2165272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
49572	NC_014974	CCTCCC	2	12	2165356	2165367	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320451358
49573	NC_014974	CCA	2	6	2165425	2165430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
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49576	NC_014974	CCA	4	12	2165593	2165604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451358
49577	NC_014974	TCCC	3	12	2165614	2165625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49578	NC_014974	CCCGG	2	10	2165633	2165642	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49579	NC_014974	CGA	2	6	2165660	2165665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49581	NC_014974	TC	3	6	2165701	2165706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49582	NC_014974	C	6	6	2165779	2165784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49583	NC_014974	AAC	2	6	2165809	2165814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49585	NC_014974	CGC	2	6	2165906	2165911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451359
49586	NC_014974	CTC	2	6	2165921	2165926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451359
49587	NC_014974	AGGGCC	2	12	2165955	2165966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320451359
49588	NC_014974	GTG	2	6	2166039	2166044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451359
49589	NC_014974	ACC	2	6	2166045	2166050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451359
49590	NC_014974	AGGGC	2	10	2166103	2166112	20 %	0 %	60 %	20 %	320451359
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49593	NC_014974	GCC	2	6	2166167	2166172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451359
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49596	NC_014974	CCA	2	6	2166274	2166279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451359
49597	NC_014974	ATC	2	6	2166456	2166461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451359
49598	NC_014974	TCC	2	6	2166583	2166588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451359
49599	NC_014974	GCC	2	6	2166732	2166737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451359
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49601	NC_014974	TGG	2	6	2166751	2166756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451359
49602	NC_014974	TCG	2	6	2166792	2166797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451359
49603	NC_014974	GGC	2	6	2166818	2166823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451359
49604	NC_014974	TGG	2	6	2166864	2166869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451359
49605	NC_014974	ATG	2	6	2166873	2166878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451359
49606	NC_014974	CGGCC	2	10	2166889	2166898	0 %	0 %	40 %	60 %	320451359
49607	NC_014974	CGG	2	6	2166919	2166924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451359
49608	NC_014974	GCG	2	6	2166941	2166946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451359
49609	NC_014974	TCC	2	6	2166984	2166989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451359
49610	NC_014974	GGA	2	6	2166997	2167002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451359
49611	NC_014974	GGC	2	6	2167073	2167078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451359
49612	NC_014974	CGGAT	2	10	2167105	2167114	20 %	20 %	40 %	20 %	320451359
49613	NC_014974	CTT	2	6	2167145	2167150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451359
49614	NC_014974	CCT	2	6	2167172	2167177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451360
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49616	NC_014974	TCC	3	9	2167232	2167240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451360
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49618	NC_014974	C	7	7	2167378	2167384	0 %	0 %	0 %	100 %	320451360
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