MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 53811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014974	AGC	2	6	191803	191808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449322
4502	NC_014974	GGA	3	9	191832	191840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449322
4503	NC_014974	GGC	2	6	191868	191873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449322
4504	NC_014974	AAG	2	6	192067	192072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449322
4505	NC_014974	TCT	2	6	192139	192144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449323
4506	NC_014974	CTT	2	6	192182	192187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449323
4507	NC_014974	G	6	6	192211	192216	0 %	0 %	100 %	0 %	320449323
4508	NC_014974	CCT	3	9	192304	192312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449323
4509	NC_014974	TGGGG	2	10	192376	192385	0 %	20 %	80 %	0 %	320449323
4510	NC_014974	TCC	3	9	192429	192437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449323
4511	NC_014974	GGCC	2	8	192532	192539	0 %	0 %	50 %	50 %	320449324
4512	NC_014974	AGG	2	6	192603	192608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449324
4513	NC_014974	CCTG	2	8	192666	192673	0 %	25 %	25 %	50 %	320449324
4514	NC_014974	CAC	2	6	192676	192681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449324
4515	NC_014974	AGG	2	6	192684	192689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449324
4516	NC_014974	CCA	2	6	192750	192755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449324
4517	NC_014974	TGA	2	6	192873	192878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449324
4518	NC_014974	G	7	7	192880	192886	0 %	0 %	100 %	0 %	320449324
4519	NC_014974	GAG	2	6	192890	192895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449324
4520	NC_014974	CGC	2	6	192928	192933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449324
4521	NC_014974	GGT	2	6	192937	192942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449324
4522	NC_014974	GGGGC	2	10	192959	192968	0 %	0 %	80 %	20 %	320449324
4523	NC_014974	CAA	2	6	192985	192990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449324
4524	NC_014974	GCG	2	6	193016	193021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449324
4525	NC_014974	TCA	2	6	193080	193085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449324
4526	NC_014974	GGT	2	6	193135	193140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449324
4527	NC_014974	CCT	2	6	193174	193179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449324
4528	NC_014974	AGGA	2	8	193397	193404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_014974	CTC	2	6	193406	193411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_014974	CTG	2	6	193421	193426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_014974	GGC	2	6	193436	193441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_014974	CCG	2	6	193556	193561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449325
4533	NC_014974	GGC	2	6	193598	193603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449325
4534	NC_014974	CTT	2	6	193626	193631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449325
4535	NC_014974	CCT	2	6	193817	193822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4536	NC_014974	GAG	2	6	193938	193943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4537	NC_014974	CCT	2	6	193997	194002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4538	NC_014974	C	6	6	194018	194023	0 %	0 %	0 %	100 %	320449325
4539	NC_014974	CCTT	2	8	194192	194199	0 %	50 %	0 %	50 %	320449325
4540	NC_014974	G	6	6	194219	194224	0 %	0 %	100 %	0 %	320449325
4541	NC_014974	CCT	2	6	194303	194308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4542	NC_014974	GGA	2	6	194405	194410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4543	NC_014974	CTC	2	6	194460	194465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4544	NC_014974	GGA	2	6	194525	194530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4545	NC_014974	CAT	2	6	194565	194570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449325
4546	NC_014974	CTC	2	6	194571	194576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4547	NC_014974	CGGTGG	2	12	194608	194619	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449325
4548	NC_014974	AGGC	2	8	194637	194644	25 %	0 %	50 %	25 %	320449325
4549	NC_014974	CTC	2	6	194655	194660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4550	NC_014974	GCCA	2	8	194739	194746	25 %	0 %	25 %	50 %	320449325
4551	NC_014974	TGGCGG	2	12	194809	194820	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449325
4552	NC_014974	CCA	2	6	194842	194847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449325
4553	NC_014974	GAG	2	6	194850	194855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4554	NC_014974	TCCCCT	2	12	194896	194907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449325
4555	NC_014974	GAA	2	6	194910	194915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449325
4556	NC_014974	TCT	2	6	194939	194944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449325
4557	NC_014974	AGG	2	6	194973	194978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4558	NC_014974	GAA	2	6	194985	194990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449325
4559	NC_014974	GGC	2	6	195026	195031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449325
4560	NC_014974	GGCTG	2	10	195062	195071	0 %	20 %	60 %	20 %	320449325
4561	NC_014974	T	6	6	195107	195112	0 %	100 %	0 %	0 %	320449325
4562	NC_014974	GGA	2	6	195143	195148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4563	NC_014974	CACC	2	8	195197	195204	25 %	0 %	0 %	75 %	320449325
4564	NC_014974	AGG	2	6	195216	195221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449325
4565	NC_014974	AGG	2	6	195231	195236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449326
4566	NC_014974	GCCA	2	8	195365	195372	25 %	0 %	25 %	50 %	320449326
4567	NC_014974	TGG	2	6	195381	195386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449326
4568	NC_014974	GCC	2	6	195406	195411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449326
4569	NC_014974	GGC	2	6	195418	195423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449326
4570	NC_014974	CGGCC	2	10	195463	195472	0 %	0 %	40 %	60 %	320449326
4571	NC_014974	AGG	2	6	195490	195495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449326
4572	NC_014974	CGA	2	6	195520	195525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449326
4573	NC_014974	CCTGGG	2	12	195589	195600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320449326
4574	NC_014974	CTGGC	2	10	195665	195674	0 %	20 %	40 %	40 %	320449326
4575	NC_014974	TCC	2	6	195720	195725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449326
4576	NC_014974	GGCG	2	8	195763	195770	0 %	0 %	75 %	25 %	320449326
4577	NC_014974	CCT	2	6	195790	195795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449326
4578	NC_014974	GGT	2	6	195829	195834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449326
4579	NC_014974	GGA	2	6	195864	195869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449326
4580	NC_014974	CCTTCT	2	12	195885	195896	0 %	50 %	0 %	50 %	320449327
4581	NC_014974	TCC	2	6	195914	195919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449327
4582	NC_014974	G	6	6	195935	195940	0 %	0 %	100 %	0 %	320449327
4583	NC_014974	A	6	6	195941	195946	100 %	0 %	0 %	0 %	320449327
4584	NC_014974	CAGG	2	8	195961	195968	25 %	0 %	50 %	25 %	320449327
4585	NC_014974	TGG	3	9	195977	195985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449327
4586	NC_014974	CCT	2	6	196015	196020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449327
4587	NC_014974	GGC	2	6	196038	196043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449327
4588	NC_014974	CTT	2	6	196051	196056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449327
4589	NC_014974	CCG	2	6	196245	196250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449328
4590	NC_014974	GGGTG	2	10	196272	196281	0 %	20 %	80 %	0 %	320449328
4591	NC_014974	CAC	2	6	196372	196377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449328
4592	NC_014974	GAG	3	9	196387	196395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449328
4593	NC_014974	CAC	2	6	196414	196419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449328
4594	NC_014974	TGA	2	6	196422	196427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449328
4595	NC_014974	CCTT	2	8	196506	196513	0 %	50 %	0 %	50 %	320449328
4596	NC_014974	TCC	3	9	196517	196525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449328
4597	NC_014974	CGG	2	6	196602	196607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449328
4598	NC_014974	CCA	2	6	196620	196625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449328
4599	NC_014974	CCT	2	6	196629	196634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449328
4600	NC_014974	AGG	2	6	196652	196657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449328
4601	NC_014974	G	7	7	196656	196662	0 %	0 %	100 %	0 %	320449328
4602	NC_014974	CCA	2	6	196803	196808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449328
4603	NC_014974	CCA	2	6	196818	196823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449328
4604	NC_014974	TCC	2	6	196829	196834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449328
4605	NC_014974	GGC	2	6	196849	196854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449328
4606	NC_014974	GAG	2	6	196858	196863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449328
4607	NC_014974	CTT	2	6	196882	196887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449328
4608	NC_014974	CTT	2	6	196929	196934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449328
4609	NC_014974	AGG	2	6	196952	196957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449328
4610	NC_014974	GCG	2	6	196958	196963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449328
4611	NC_014974	GGA	2	6	196983	196988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449328
4612	NC_014974	GGT	2	6	197031	197036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449328
4613	NC_014974	CCGCC	2	10	197061	197070	0 %	0 %	20 %	80 %	320449328
4614	NC_014974	CTC	2	6	197101	197106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449328
4615	NC_014974	TCC	2	6	197138	197143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449328
4616	NC_014974	GAT	2	6	197188	197193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449328
4617	NC_014974	TTG	2	6	197279	197284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449328
4618	NC_014974	CTT	2	6	197317	197322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449328
4619	NC_014974	CAC	2	6	197323	197328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449328
4620	NC_014974	T	6	6	197350	197355	0 %	100 %	0 %	0 %	320449328
4621	NC_014974	GGT	2	6	197406	197411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449328
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4623	NC_014974	C	6	6	197474	197479	0 %	0 %	0 %	100 %	320449328
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4746	NC_014974	CTA	2	6	202290	202295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4748	NC_014974	GGA	2	6	202335	202340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_014974	CTC	2	6	202357	202362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4874	NC_014974	GGGC	2	8	207490	207497	0 %	0 %	75 %	25 %	320449341
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4992	NC_014974	C	6	6	211604	211609	0 %	0 %	0 %	100 %	320449343
4993	NC_014974	GAA	2	6	211632	211637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449343
4994	NC_014974	GTC	2	6	211641	211646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449343
4995	NC_014974	GCCAG	2	10	211709	211718	20 %	0 %	40 %	40 %	320449343
4996	NC_014974	AGG	2	6	211720	211725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449343
4997	NC_014974	CCA	2	6	211745	211750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449343
4998	NC_014974	TGG	2	6	211751	211756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449343
4999	NC_014974	CCG	2	6	211846	211851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449344
5000	NC_014974	GCC	2	6	211862	211867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449344

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