MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014964	ATA	2	6	18	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014964	TAT	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014964	TAAA	2	8	40	47	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014964	AGG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014964	ATC	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114858
6	NC_014964	CCA	2	6	150	155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114858
7	NC_014964	ACA	2	6	159	164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114858
8	NC_014964	ATT	2	6	194	199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114858
9	NC_014964	GAT	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114858
10	NC_014964	A	6	6	238	243	100 %	0 %	0 %	0 %	320114858
11	NC_014964	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114858
12	NC_014964	AT	3	6	259	264	50 %	50 %	0 %	0 %	320114858
13	NC_014964	ACG	2	6	276	281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114858
14	NC_014964	AAAT	2	8	298	305	75 %	25 %	0 %	0 %	320114858
15	NC_014964	AGA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
16	NC_014964	GAA	3	9	335	343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
17	NC_014964	ACT	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114858
18	NC_014964	TTTA	2	8	514	521	25 %	75 %	0 %	0 %	320114858
19	NC_014964	GGA	2	6	527	532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114858
20	NC_014964	ATGC	2	8	557	564	25 %	25 %	25 %	25 %	320114858
21	NC_014964	TACGT	2	10	611	620	20 %	40 %	20 %	20 %	320114858
22	NC_014964	AGTT	2	8	639	646	25 %	50 %	25 %	0 %	320114858
23	NC_014964	GAC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114858
24	NC_014964	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
25	NC_014964	TTC	2	6	705	710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114858
26	NC_014964	GAT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114858
27	NC_014964	A	6	6	737	742	100 %	0 %	0 %	0 %	320114858
28	NC_014964	GAAC	2	8	743	750	50 %	0 %	25 %	25 %	320114858
29	NC_014964	AAG	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
30	NC_014964	CAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114858
31	NC_014964	ACC	2	6	823	828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114858
32	NC_014964	AGA	2	6	847	852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
33	NC_014964	CCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114858
34	NC_014964	CGA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114858
35	NC_014964	A	6	6	993	998	100 %	0 %	0 %	0 %	320114858
36	NC_014964	TCAA	2	8	1000	1007	50 %	25 %	0 %	25 %	320114858
37	NC_014964	AG	3	6	1013	1018	50 %	0 %	50 %	0 %	320114858
38	NC_014964	TAA	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114858
39	NC_014964	TAA	2	6	1117	1122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114858
40	NC_014964	GA	3	6	1126	1131	50 %	0 %	50 %	0 %	320114858
41	NC_014964	GAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
42	NC_014964	AGA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
43	NC_014964	A	6	6	1213	1218	100 %	0 %	0 %	0 %	320114858
44	NC_014964	GAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
45	NC_014964	TAC	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114858
46	NC_014964	A	6	6	1335	1340	100 %	0 %	0 %	0 %	320114858
47	NC_014964	TC	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	320114858
48	NC_014964	T	6	6	1456	1461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014964	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014964	ATT	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014964	TCT	2	6	1565	1570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014964	ACT	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014964	CTTAT	2	10	1591	1600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014964	TAT	2	6	1602	1607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014964	A	7	7	1620	1626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014964	A	7	7	1647	1653	100 %	0 %	0 %	0 %	320114859
57	NC_014964	TG	4	8	1661	1668	0 %	50 %	50 %	0 %	320114859
58	NC_014964	ATT	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114859
59	NC_014964	G	6	6	1708	1713	0 %	0 %	100 %	0 %	320114859
60	NC_014964	ACT	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114859
61	NC_014964	TTC	2	6	1738	1743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114859
62	NC_014964	GTCAA	2	10	1771	1780	40 %	20 %	20 %	20 %	320114859
63	NC_014964	AGA	3	9	1835	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114859
64	NC_014964	TAG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114859
65	NC_014964	TAA	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114859
66	NC_014964	TA	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	320114859
67	NC_014964	AGA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114859
68	NC_014964	AGAGAT	2	12	2300	2311	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	320114859
69	NC_014964	GAAG	2	8	2376	2383	50 %	0 %	50 %	0 %	320114859
70	NC_014964	AAT	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114859
71	NC_014964	TTA	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114859
72	NC_014964	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114859
73	NC_014964	GAT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114859
74	NC_014964	A	6	6	2572	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	320114859
75	NC_014964	TTA	2	6	2631	2636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114859
76	NC_014964	GAA	3	9	2658	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114859
77	NC_014964	TAA	3	9	2701	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114859
78	NC_014964	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014964	AT	3	6	2812	2817	50 %	50 %	0 %	0 %	320114860
80	NC_014964	GGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114860
81	NC_014964	AAGCA	2	10	2868	2877	60 %	0 %	20 %	20 %	320114860
82	NC_014964	ATTT	2	8	2878	2885	25 %	75 %	0 %	0 %	320114860
83	NC_014964	A	6	6	2933	2938	100 %	0 %	0 %	0 %	320114860
84	NC_014964	A	6	6	3052	3057	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
85	NC_014964	AATA	2	8	3074	3081	75 %	25 %	0 %	0 %	320114861
86	NC_014964	TTA	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
87	NC_014964	TAA	2	6	3181	3186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114861
88	NC_014964	ATT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
89	NC_014964	AAT	2	6	3218	3223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114861
90	NC_014964	A	7	7	3243	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
91	NC_014964	AATAA	2	10	3300	3309	80 %	20 %	0 %	0 %	320114861
92	NC_014964	T	6	6	3349	3354	0 %	100 %	0 %	0 %	320114861
93	NC_014964	ATA	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114861
94	NC_014964	AAG	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114861
95	NC_014964	TGT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114861
96	NC_014964	AAAAGT	2	12	3516	3527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	320114861
97	NC_014964	TGA	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114861
98	NC_014964	TAG	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114861
99	NC_014964	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114861
100	NC_014964	ATT	2	6	3592	3597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
101	NC_014964	A	6	6	3599	3604	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
102	NC_014964	A	7	7	3620	3626	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
103	NC_014964	CAG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114861
104	NC_014964	GAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114861
105	NC_014964	A	7	7	3714	3720	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
106	NC_014964	ACA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114861
107	NC_014964	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
108	NC_014964	TTC	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114861
109	NC_014964	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
110	NC_014964	A	7	7	3971	3977	100 %	0 %	0 %	0 %	320114861
111	NC_014964	TAC	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114861
112	NC_014964	GTT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114861
113	NC_014964	A	6	6	4098	4103	100 %	0 %	0 %	0 %	320114862
114	NC_014964	GGC	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320114862
115	NC_014964	ACT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114862
116	NC_014964	GAA	3	9	4217	4225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114862
117	NC_014964	TAT	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114862
118	NC_014964	TTAT	3	12	4296	4307	25 %	75 %	0 %	0 %	320114862
119	NC_014964	AAG	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114862
120	NC_014964	A	6	6	4344	4349	100 %	0 %	0 %	0 %	320114862
121	NC_014964	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	320114863
122	NC_014964	TTG	2	6	4398	4403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114863
123	NC_014964	AAG	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
124	NC_014964	ATT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
125	NC_014964	A	6	6	4482	4487	100 %	0 %	0 %	0 %	320114863
126	NC_014964	GAAAG	2	10	4508	4517	60 %	0 %	40 %	0 %	320114863
127	NC_014964	AAGAA	2	10	4543	4552	80 %	0 %	20 %	0 %	320114863
128	NC_014964	ATAA	2	8	4595	4602	75 %	25 %	0 %	0 %	320114863
129	NC_014964	TAAT	2	8	4644	4651	50 %	50 %	0 %	0 %	320114863
130	NC_014964	GGA	2	6	4664	4669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114863
131	NC_014964	AGA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
132	NC_014964	A	6	6	4760	4765	100 %	0 %	0 %	0 %	320114863
133	NC_014964	T	6	6	4846	4851	0 %	100 %	0 %	0 %	320114863
134	NC_014964	T	7	7	4909	4915	0 %	100 %	0 %	0 %	320114863
135	NC_014964	TAT	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
136	NC_014964	ATT	2	6	4974	4979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
137	NC_014964	TTTA	2	8	4982	4989	25 %	75 %	0 %	0 %	320114863
138	NC_014964	CAG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114863
139	NC_014964	AG	4	8	5104	5111	50 %	0 %	50 %	0 %	320114863
140	NC_014964	AT	3	6	5162	5167	50 %	50 %	0 %	0 %	320114863
141	NC_014964	AGC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114863
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143	NC_014964	GAG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114863
144	NC_014964	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
145	NC_014964	AAG	3	9	5427	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
146	NC_014964	TGG	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114863
147	NC_014964	ATGA	2	8	5504	5511	50 %	25 %	25 %	0 %	320114863
148	NC_014964	CTA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114863
149	NC_014964	ATA	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114863
150	NC_014964	AAG	2	6	5592	5597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
151	NC_014964	TATGGC	2	12	5620	5631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320114863
152	NC_014964	GCT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114863
153	NC_014964	ACA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114863
154	NC_014964	CTT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114863
155	NC_014964	ATG	3	9	5765	5773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114863
156	NC_014964	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
157	NC_014964	AT	3	6	5967	5972	50 %	50 %	0 %	0 %	320114863
158	NC_014964	CTTA	2	8	6009	6016	25 %	50 %	0 %	25 %	320114863
159	NC_014964	AAG	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
160	NC_014964	TA	3	6	6151	6156	50 %	50 %	0 %	0 %	320114863
161	NC_014964	A	6	6	6171	6176	100 %	0 %	0 %	0 %	320114863
162	NC_014964	ACTGG	2	10	6213	6222	20 %	20 %	40 %	20 %	320114863
163	NC_014964	TAT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
164	NC_014964	ATA	2	6	6272	6277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114863
165	NC_014964	AGG	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114863
166	NC_014964	ATT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
167	NC_014964	AGA	2	6	6334	6339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
168	NC_014964	ATA	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114863
169	NC_014964	GAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
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172	NC_014964	T	7	7	6652	6658	0 %	100 %	0 %	0 %	320114864
173	NC_014964	TTG	2	6	6688	6693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114864
174	NC_014964	TCT	2	6	6851	6856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114864
175	NC_014964	ATT	3	9	6875	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114864
176	NC_014964	CCA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114864
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178	NC_014964	ATC	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114864
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185	NC_014964	TATATC	2	12	7219	7230	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	320114864
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201	NC_014964	T	6	6	7780	7785	0 %	100 %	0 %	0 %	320114865
202	NC_014964	T	6	6	7793	7798	0 %	100 %	0 %	0 %	320114865
203	NC_014964	CTTC	2	8	7804	7811	0 %	50 %	0 %	50 %	320114865
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209	NC_014964	TAG	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114865
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211	NC_014964	AT	3	6	8070	8075	50 %	50 %	0 %	0 %	320114865
212	NC_014964	TCT	2	6	8076	8081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
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222	NC_014964	TCT	2	6	8362	8367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
223	NC_014964	TTA	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114865
224	NC_014964	A	6	6	8431	8436	100 %	0 %	0 %	0 %	320114865
225	NC_014964	T	6	6	8443	8448	0 %	100 %	0 %	0 %	320114865
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232	NC_014964	T	6	6	8611	8616	0 %	100 %	0 %	0 %	320114865
233	NC_014964	AT	3	6	8690	8695	50 %	50 %	0 %	0 %	320114865
234	NC_014964	ACC	2	6	8738	8743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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237	NC_014964	CAT	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_014964	T	6	6	8878	8883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_014964	A	6	6	8884	8889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_014964	TATAT	2	10	8927	8936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_014964	TATAT	2	10	8943	8952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_014964	AAT	2	6	9012	9017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_014964	ATTTT	2	10	9030	9039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_014964	ATAAA	2	10	9065	9074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_014964	CAAATA	2	12	9136	9147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	320114866
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257	NC_014964	AGA	2	6	9588	9593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114866
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259	NC_014964	ATG	2	6	9656	9661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114866
260	NC_014964	GA	3	6	9678	9683	50 %	0 %	50 %	0 %	320114866
261	NC_014964	TAAA	2	8	9695	9702	75 %	25 %	0 %	0 %	320114866
262	NC_014964	AGA	2	6	9741	9746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114866
263	NC_014964	TCC	2	6	9809	9814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114866
264	NC_014964	TGCA	2	8	9868	9875	25 %	25 %	25 %	25 %	320114866
265	NC_014964	TAA	2	6	9915	9920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114866
266	NC_014964	GGT	2	6	9937	9942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114866
267	NC_014964	TAG	2	6	9950	9955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114866
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270	NC_014964	GTA	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114866
271	NC_014964	T	6	6	10182	10187	0 %	100 %	0 %	0 %	320114866
272	NC_014964	AGA	2	6	10188	10193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114866
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280	NC_014964	AGT	2	6	10578	10583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114866
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282	NC_014964	TAT	2	6	10732	10737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114866
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403	NC_014964	TG	3	6	16221	16226	0 %	50 %	50 %	0 %	320114870
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405	NC_014964	ATA	2	6	16335	16340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114870
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498	NC_014964	CTT	2	6	21289	21294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114875
499	NC_014964	TTTAG	2	10	21327	21336	20 %	60 %	20 %	0 %	320114875
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