MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014964	TAA	2	6	164130	164135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014964	AGA	2	6	164185	164190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014964	AGG	2	6	164203	164208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014964	AG	3	6	164268	164273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014964	AT	3	6	164309	164314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014964	AAATTA	2	12	164375	164386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014964	TAGA	2	8	164412	164419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014964	GAA	2	6	164427	164432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014964	TAAGAA	2	12	164472	164483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014964	AAC	2	6	164586	164591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_014964	GAA	2	6	164694	164699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014964	AGA	2	6	164739	164744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014964	AAAT	2	8	164826	164833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014964	CCG	2	6	164900	164905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_014964	GTAC	2	8	164917	164924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_014964	GGT	2	6	164925	164930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014964	AATAA	2	10	164945	164954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014964	ATA	2	6	164991	164996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014964	TA	3	6	164995	165000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014964	ATAA	2	8	165004	165011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014964	TGAA	2	8	165054	165061	50 %	25 %	25 %	0 %	320115008
4022	NC_014964	GAG	2	6	165090	165095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115008
4023	NC_014964	TAAG	2	8	165121	165128	50 %	25 %	25 %	0 %	320115008
4024	NC_014964	CAA	2	6	165181	165186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320115008
4025	NC_014964	AAG	2	6	165188	165193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
4026	NC_014964	GAA	2	6	165210	165215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
4027	NC_014964	T	6	6	165282	165287	0 %	100 %	0 %	0 %	320115008
4028	NC_014964	AGA	2	6	165293	165298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
4029	NC_014964	TGC	2	6	165335	165340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115008
4030	NC_014964	AGA	2	6	165350	165355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
4031	NC_014964	ACT	2	6	165387	165392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320115008
4032	NC_014964	TGT	2	6	165431	165436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320115008
4033	NC_014964	AGG	2	6	165500	165505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115008
4034	NC_014964	GGA	2	6	165517	165522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115008
4035	NC_014964	TAA	2	6	165556	165561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115008
4036	NC_014964	A	6	6	165653	165658	100 %	0 %	0 %	0 %	320115008
4037	NC_014964	TG	3	6	165664	165669	0 %	50 %	50 %	0 %	320115008
4038	NC_014964	TA	3	6	165687	165692	50 %	50 %	0 %	0 %	320115008
4039	NC_014964	AAG	2	6	165717	165722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115008
4040	NC_014964	AAT	2	6	165761	165766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115008
4041	NC_014964	GAT	2	6	165771	165776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115008
4042	NC_014964	ATATAG	2	12	165817	165828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	320115008
4043	NC_014964	AAT	2	6	165849	165854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115008
4044	NC_014964	ACG	2	6	165859	165864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115008
4045	NC_014964	AAT	2	6	165894	165899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115009
4046	NC_014964	GAT	2	6	166003	166008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115009
4047	NC_014964	AT	3	6	166044	166049	50 %	50 %	0 %	0 %	320115009
4048	NC_014964	AGA	2	6	166062	166067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4049	NC_014964	A	6	6	166098	166103	100 %	0 %	0 %	0 %	320115009
4050	NC_014964	TGAA	2	8	166160	166167	50 %	25 %	25 %	0 %	320115009
4051	NC_014964	GAA	3	9	166186	166194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4052	NC_014964	A	7	7	166207	166213	100 %	0 %	0 %	0 %	320115009
4053	NC_014964	GTGCTT	2	12	166243	166254	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	320115009
4054	NC_014964	AAT	2	6	166332	166337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115009
4055	NC_014964	AAG	2	6	166352	166357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4056	NC_014964	AGA	2	6	166374	166379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4057	NC_014964	AGA	2	6	166416	166421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4058	NC_014964	GTA	2	6	166423	166428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115009
4059	NC_014964	AGA	2	6	166449	166454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4060	NC_014964	GAA	2	6	166462	166467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4061	NC_014964	A	6	6	166470	166475	100 %	0 %	0 %	0 %	320115009
4062	NC_014964	AT	3	6	166552	166557	50 %	50 %	0 %	0 %	320115009
4063	NC_014964	TTG	2	6	166613	166618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320115009
4064	NC_014964	AT	3	6	166636	166641	50 %	50 %	0 %	0 %	320115009
4065	NC_014964	GAG	2	6	166657	166662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115009
4066	NC_014964	AGC	3	9	166674	166682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115009
4067	NC_014964	AAG	2	6	166706	166711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115009
4068	NC_014964	GAG	2	6	166732	166737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115009
4069	NC_014964	AT	3	6	166742	166747	50 %	50 %	0 %	0 %	320115009
4070	NC_014964	AG	3	6	166767	166772	50 %	0 %	50 %	0 %	320115009
4071	NC_014964	GGAAAT	2	12	166787	166798	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	320115010
4072	NC_014964	A	6	6	166816	166821	100 %	0 %	0 %	0 %	320115010
4073	NC_014964	GAT	2	6	166905	166910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115010
4074	NC_014964	GAA	2	6	166911	166916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115010
4075	NC_014964	GTG	2	6	166929	166934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115010
4076	NC_014964	AGA	2	6	166938	166943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115010
4077	NC_014964	GAA	2	6	166944	166949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115010
4078	NC_014964	ATGG	2	8	167064	167071	25 %	25 %	50 %	0 %	320115010
4079	NC_014964	ATTT	2	8	167083	167090	25 %	75 %	0 %	0 %	320115010
4080	NC_014964	TGA	2	6	167117	167122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115010
4081	NC_014964	AGG	2	6	167170	167175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115010
4082	NC_014964	GA	3	6	167177	167182	50 %	0 %	50 %	0 %	320115010
4083	NC_014964	TAA	2	6	167228	167233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115010
4084	NC_014964	AG	3	6	167245	167250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_014964	ATTA	2	8	167254	167261	50 %	50 %	0 %	0 %	320115011
4086	NC_014964	GGC	2	6	167317	167322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320115011
4087	NC_014964	GAA	2	6	167411	167416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115011
4088	NC_014964	GCT	2	6	167426	167431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115011
4089	NC_014964	ATA	2	6	167441	167446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115011
4090	NC_014964	AGA	2	6	167590	167595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115011
4091	NC_014964	AAAG	2	8	167603	167610	75 %	0 %	25 %	0 %	320115011
4092	NC_014964	GGT	2	6	167684	167689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115011
4093	NC_014964	TGA	2	6	167760	167765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115011
4094	NC_014964	GGT	2	6	167774	167779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115011
4095	NC_014964	TA	3	6	167816	167821	50 %	50 %	0 %	0 %	320115011
4096	NC_014964	TAA	2	6	167961	167966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115011
4097	NC_014964	TAT	2	6	168015	168020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115011
4098	NC_014964	TAG	2	6	168030	168035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115011
4099	NC_014964	AT	3	6	168047	168052	50 %	50 %	0 %	0 %	320115011
4100	NC_014964	TGAC	2	8	168090	168097	25 %	25 %	25 %	25 %	320115011
4101	NC_014964	ATG	2	6	168155	168160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115011
4102	NC_014964	GGT	2	6	168173	168178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320115011
4103	NC_014964	CTC	2	6	168270	168275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320115011
4104	NC_014964	ACTTGC	2	12	168283	168294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320115011
4105	NC_014964	GCA	3	9	168398	168406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320115011
4106	NC_014964	AAT	2	6	168430	168435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115011
4107	NC_014964	CTG	2	6	168444	168449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320115011
4108	NC_014964	CTC	2	6	168492	168497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320115011
4109	NC_014964	GGA	2	6	168500	168505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115011
4110	NC_014964	CTT	2	6	168539	168544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115011
4111	NC_014964	AGT	2	6	168571	168576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115011
4112	NC_014964	CTT	2	6	168596	168601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115011
4113	NC_014964	A	6	6	168605	168610	100 %	0 %	0 %	0 %	320115011
4114	NC_014964	A	6	6	168618	168623	100 %	0 %	0 %	0 %	320115011
4115	NC_014964	T	6	6	168644	168649	0 %	100 %	0 %	0 %	320115012
4116	NC_014964	TCT	2	6	168718	168723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115012
4117	NC_014964	AT	3	6	168773	168778	50 %	50 %	0 %	0 %	320115012
4118	NC_014964	TTTTC	2	10	168805	168814	0 %	80 %	0 %	20 %	320115012
4119	NC_014964	TCTA	2	8	168864	168871	25 %	50 %	0 %	25 %	320115012
4120	NC_014964	TAA	2	6	168894	168899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320115012
4121	NC_014964	ATT	2	6	168960	168965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320115013
4122	NC_014964	TTC	2	6	168978	168983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320115013
4123	NC_014964	AGT	2	6	169048	169053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320115013
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4125	NC_014964	TC	3	6	169115	169120	0 %	50 %	0 %	50 %	320115013
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4251	NC_014964	GGA	3	9	173946	173954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320115017
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4253	NC_014964	A	6	6	174011	174016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_014964	T	7	7	174017	174023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_014964	TTA	2	6	174082	174087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_014964	AG	3	6	174093	174098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_014964	GGT	2	6	174134	174139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4356	NC_014964	ATT	2	6	178794	178799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4357	NC_014964	TAT	2	6	178808	178813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4367	NC_014964	AG	3	6	179462	179467	50 %	0 %	50 %	0 %	320115022
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4373	NC_014964	AGA	2	6	179679	179684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320115023
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4499	NC_014964	TAAAT	2	10	185360	185369	60 %	40 %	0 %	0 %	320115027
4500	NC_014964	A	7	7	185411	185417	100 %	0 %	0 %	0 %	320115027

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