MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014964	A	6	6	1820641	1820646	100 %	0 %	0 %	0 %	320116591
44002	NC_014964	ATT	2	6	1820650	1820655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116591
44003	NC_014964	AAT	2	6	1820720	1820725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116591
44004	NC_014964	TCT	2	6	1820743	1820748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116591
44005	NC_014964	ATTTCC	2	12	1820827	1820838	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	320116591
44006	NC_014964	TGT	2	6	1820966	1820971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116592
44007	NC_014964	CGT	2	6	1820977	1820982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116592
44008	NC_014964	CAA	2	6	1821004	1821009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116592
44009	NC_014964	CT	3	6	1821057	1821062	0 %	50 %	0 %	50 %	320116592
44010	NC_014964	GTT	2	6	1821084	1821089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116592
44011	NC_014964	CTT	2	6	1821102	1821107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116592
44012	NC_014964	CTGA	2	8	1821163	1821170	25 %	25 %	25 %	25 %	320116592
44013	NC_014964	T	7	7	1821241	1821247	0 %	100 %	0 %	0 %	320116592
44014	NC_014964	A	7	7	1821272	1821278	100 %	0 %	0 %	0 %	320116592
44015	NC_014964	TC	4	8	1821288	1821295	0 %	50 %	0 %	50 %	320116592
44016	NC_014964	ACA	2	6	1821330	1821335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116592
44017	NC_014964	TAC	2	6	1821433	1821438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116592
44018	NC_014964	AAT	2	6	1821515	1821520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116592
44019	NC_014964	GTT	2	6	1821525	1821530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116592
44020	NC_014964	TGG	2	6	1821533	1821538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320116592
44021	NC_014964	A	7	7	1821552	1821558	100 %	0 %	0 %	0 %	320116592
44022	NC_014964	CTTTT	2	10	1821588	1821597	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44023	NC_014964	ATT	2	6	1821613	1821618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44024	NC_014964	AAATTA	2	12	1821619	1821630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44025	NC_014964	A	6	6	1821634	1821639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44026	NC_014964	TACA	2	8	1821695	1821702	50 %	25 %	0 %	25 %	320116593
44027	NC_014964	T	6	6	1821710	1821715	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44028	NC_014964	AAG	2	6	1821725	1821730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116593
44029	NC_014964	TTG	2	6	1821756	1821761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116593
44030	NC_014964	TTC	2	6	1821810	1821815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116593
44031	NC_014964	ACA	2	6	1821888	1821893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116593
44032	NC_014964	TTCA	2	8	1821947	1821954	25 %	50 %	0 %	25 %	320116593
44033	NC_014964	TCG	2	6	1821984	1821989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116593
44034	NC_014964	TTC	2	6	1822016	1822021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116593
44035	NC_014964	ATTG	2	8	1822026	1822033	25 %	50 %	25 %	0 %	320116593
44036	NC_014964	ATT	2	6	1822035	1822040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44037	NC_014964	CTCCTT	2	12	1822060	1822071	0 %	50 %	0 %	50 %	320116593
44038	NC_014964	T	6	6	1822082	1822087	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44039	NC_014964	T	6	6	1822107	1822112	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44040	NC_014964	ATT	2	6	1822155	1822160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44041	NC_014964	T	6	6	1822159	1822164	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44042	NC_014964	TAAATT	2	12	1822208	1822219	50 %	50 %	0 %	0 %	320116593
44043	NC_014964	AT	3	6	1822333	1822338	50 %	50 %	0 %	0 %	320116593
44044	NC_014964	A	6	6	1822361	1822366	100 %	0 %	0 %	0 %	320116593
44045	NC_014964	ATT	2	6	1822406	1822411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44046	NC_014964	TAC	2	6	1822427	1822432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116593
44047	NC_014964	TTTGCT	2	12	1822441	1822452	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	320116593
44048	NC_014964	TAT	2	6	1822499	1822504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44049	NC_014964	CTA	2	6	1822555	1822560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116593
44050	NC_014964	TAGG	2	8	1822579	1822586	25 %	25 %	50 %	0 %	320116593
44051	NC_014964	TAA	2	6	1822592	1822597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116593
44052	NC_014964	AT	3	6	1822612	1822617	50 %	50 %	0 %	0 %	320116593
44053	NC_014964	TAT	2	6	1822640	1822645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44054	NC_014964	CGT	2	6	1822648	1822653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116593
44055	NC_014964	CCCTT	2	10	1822686	1822695	0 %	40 %	0 %	60 %	320116593
44056	NC_014964	TCC	2	6	1822698	1822703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116593
44057	NC_014964	T	6	6	1822805	1822810	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44058	NC_014964	TAT	2	6	1822832	1822837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44059	NC_014964	TAT	2	6	1822844	1822849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44060	NC_014964	TCC	2	6	1822871	1822876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116593
44061	NC_014964	ACA	3	9	1822884	1822892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116593
44062	NC_014964	CTT	2	6	1822906	1822911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116593
44063	NC_014964	TC	3	6	1823030	1823035	0 %	50 %	0 %	50 %	320116593
44064	NC_014964	TG	3	6	1823039	1823044	0 %	50 %	50 %	0 %	320116593
44065	NC_014964	TA	3	6	1823054	1823059	50 %	50 %	0 %	0 %	320116593
44066	NC_014964	TA	3	6	1823066	1823071	50 %	50 %	0 %	0 %	320116593
44067	NC_014964	ATC	2	6	1823087	1823092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116593
44068	NC_014964	T	6	6	1823113	1823118	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44069	NC_014964	CTT	3	9	1823152	1823160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116593
44070	NC_014964	TGC	2	6	1823180	1823185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116593
44071	NC_014964	T	7	7	1823189	1823195	0 %	100 %	0 %	0 %	320116593
44072	NC_014964	AGA	2	6	1823261	1823266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116593
44073	NC_014964	CT	3	6	1823301	1823306	0 %	50 %	0 %	50 %	320116593
44074	NC_014964	AT	3	6	1823341	1823346	50 %	50 %	0 %	0 %	320116593
44075	NC_014964	TAA	2	6	1823374	1823379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116593
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44080	NC_014964	AGA	2	6	1823642	1823647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116593
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44084	NC_014964	ATT	2	6	1823862	1823867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116593
44085	NC_014964	TTCTT	2	10	1823917	1823926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44086	NC_014964	T	7	7	1823975	1823981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44087	NC_014964	A	6	6	1824043	1824048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44088	NC_014964	AT	3	6	1824050	1824055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44089	NC_014964	A	6	6	1824056	1824061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44090	NC_014964	T	6	6	1824112	1824117	0 %	100 %	0 %	0 %	320116594
44091	NC_014964	AT	3	6	1824119	1824124	50 %	50 %	0 %	0 %	320116594
44092	NC_014964	TCT	2	6	1824207	1824212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116594
44093	NC_014964	TAAATC	2	12	1824213	1824224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	320116594
44094	NC_014964	CTT	2	6	1824372	1824377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116594
44095	NC_014964	CTG	2	6	1824386	1824391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116594
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44099	NC_014964	TTC	2	6	1824518	1824523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116594
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44101	NC_014964	ATC	2	6	1824597	1824602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116594
44102	NC_014964	TTA	2	6	1824629	1824634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116594
44103	NC_014964	AAT	2	6	1824642	1824647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116594
44104	NC_014964	TAC	2	6	1824696	1824701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116594
44105	NC_014964	ATC	2	6	1824726	1824731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116594
44106	NC_014964	TTCT	2	8	1824790	1824797	0 %	75 %	0 %	25 %	320116594
44107	NC_014964	TCT	2	6	1824810	1824815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116594
44108	NC_014964	TAGGCA	2	12	1824839	1824850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320116594
44109	NC_014964	TTC	2	6	1824855	1824860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116594
44110	NC_014964	GCAA	2	8	1824870	1824877	50 %	0 %	25 %	25 %	320116594
44111	NC_014964	TCA	2	6	1824994	1824999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116594
44112	NC_014964	TCT	2	6	1825063	1825068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116594
44113	NC_014964	ACT	2	6	1825069	1825074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116594
44114	NC_014964	AGT	2	6	1825110	1825115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116594
44115	NC_014964	AAACC	2	10	1825133	1825142	60 %	0 %	0 %	40 %	320116594
44116	NC_014964	CAG	2	6	1825151	1825156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116594
44117	NC_014964	T	6	6	1825185	1825190	0 %	100 %	0 %	0 %	320116594
44118	NC_014964	T	6	6	1825283	1825288	0 %	100 %	0 %	0 %	320116594
44119	NC_014964	TCC	2	6	1825293	1825298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44221	NC_014964	TAC	2	6	1829265	1829270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44225	NC_014964	A	8	8	1829314	1829321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44239	NC_014964	TCA	2	6	1830064	1830069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116599
44240	NC_014964	TTG	2	6	1830119	1830124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116599
44241	NC_014964	AAG	2	6	1830158	1830163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116599
44242	NC_014964	TA	3	6	1830212	1830217	50 %	50 %	0 %	0 %	320116599
44243	NC_014964	TAT	2	6	1830249	1830254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116599
44244	NC_014964	AGA	3	9	1830264	1830272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116599
44245	NC_014964	CTA	2	6	1830287	1830292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116599
44246	NC_014964	T	6	6	1830298	1830303	0 %	100 %	0 %	0 %	320116599
44247	NC_014964	TTA	2	6	1830410	1830415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116599
44248	NC_014964	ATTT	2	8	1830492	1830499	25 %	75 %	0 %	0 %	320116599
44249	NC_014964	TCAA	2	8	1830526	1830533	50 %	25 %	0 %	25 %	320116599
44250	NC_014964	AAG	3	9	1830536	1830544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116599
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44252	NC_014964	CTT	2	6	1830625	1830630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116599
44253	NC_014964	ATT	2	6	1830673	1830678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116599
44254	NC_014964	ATT	2	6	1830682	1830687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116599
44255	NC_014964	AAAGA	2	10	1830694	1830703	80 %	0 %	20 %	0 %	320116599
44256	NC_014964	AT	3	6	1830770	1830775	50 %	50 %	0 %	0 %	320116600
44257	NC_014964	AAATC	2	10	1830854	1830863	60 %	20 %	0 %	20 %	320116600
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44260	NC_014964	TA	3	6	1831000	1831005	50 %	50 %	0 %	0 %	320116600
44261	NC_014964	CTT	2	6	1831016	1831021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116600
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44264	NC_014964	ATC	2	6	1831120	1831125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116600
44265	NC_014964	TC	3	6	1831212	1831217	0 %	50 %	0 %	50 %	320116600
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44268	NC_014964	GCG	2	6	1831319	1831324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320116600
44269	NC_014964	CTT	3	9	1831338	1831346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116600
44270	NC_014964	AAAG	2	8	1831349	1831356	75 %	0 %	25 %	0 %	320116600
44271	NC_014964	TCA	2	6	1831382	1831387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116600
44272	NC_014964	AT	3	6	1831409	1831414	50 %	50 %	0 %	0 %	320116600
44273	NC_014964	CCTC	2	8	1831416	1831423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44274	NC_014964	CAA	2	6	1831441	1831446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44275	NC_014964	A	8	8	1831452	1831459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44276	NC_014964	T	7	7	1831475	1831481	0 %	100 %	0 %	0 %	320116601
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44279	NC_014964	TGT	2	6	1831613	1831618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116601
44280	NC_014964	GTA	2	6	1831622	1831627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116601
44281	NC_014964	TCG	2	6	1831629	1831634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116601
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44303	NC_014964	T	7	7	1832564	1832570	0 %	100 %	0 %	0 %	320116602
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44306	NC_014964	GACT	2	8	1832594	1832601	25 %	25 %	25 %	25 %	320116602
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44313	NC_014964	TAAAA	2	10	1832733	1832742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44314	NC_014964	A	7	7	1832739	1832745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44315	NC_014964	AT	3	6	1832766	1832771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44316	NC_014964	TTTA	2	8	1832817	1832824	25 %	75 %	0 %	0 %	320116603
44317	NC_014964	TCA	2	6	1832860	1832865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116603
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44333	NC_014964	TAT	2	6	1833658	1833663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44334	NC_014964	T	6	6	1833740	1833745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44335	NC_014964	TAAATG	2	12	1833773	1833784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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44337	NC_014964	TA	3	6	1833812	1833817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44338	NC_014964	ACA	2	6	1833913	1833918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116604
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44342	NC_014964	AAGAGC	2	12	1834084	1834095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	320116604
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44350	NC_014964	AAG	2	6	1834452	1834457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116604
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44352	NC_014964	TAA	2	6	1834480	1834485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116604
44353	NC_014964	AAGG	2	8	1834505	1834512	50 %	0 %	50 %	0 %	320116604
44354	NC_014964	TGA	2	6	1834538	1834543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116605
44355	NC_014964	TAAA	2	8	1834616	1834623	75 %	25 %	0 %	0 %	320116605
44356	NC_014964	AAG	2	6	1834667	1834672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116605
44357	NC_014964	A	7	7	1834708	1834714	100 %	0 %	0 %	0 %	320116605
44358	NC_014964	AAG	2	6	1834720	1834725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116605
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44360	NC_014964	A	6	6	1834803	1834808	100 %	0 %	0 %	0 %	320116605
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44364	NC_014964	CAT	2	6	1835095	1835100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44365	NC_014964	AT	3	6	1835099	1835104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44366	NC_014964	A	6	6	1835129	1835134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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