MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014964	AGA	2	6	62276	62281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114925
1502	NC_014964	AT	3	6	62315	62320	50 %	50 %	0 %	0 %	320114925
1503	NC_014964	ATT	2	6	62340	62345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114925
1504	NC_014964	GT	3	6	62379	62384	0 %	50 %	50 %	0 %	320114925
1505	NC_014964	A	6	6	62397	62402	100 %	0 %	0 %	0 %	320114925
1506	NC_014964	GA	3	6	62409	62414	50 %	0 %	50 %	0 %	320114925
1507	NC_014964	TGC	2	6	62435	62440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114925
1508	NC_014964	TCT	2	6	62544	62549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114925
1509	NC_014964	TGC	2	6	62576	62581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114925
1510	NC_014964	GGA	2	6	62732	62737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114926
1511	NC_014964	T	9	9	62747	62755	0 %	100 %	0 %	0 %	320114926
1512	NC_014964	ATG	2	6	62763	62768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114926
1513	NC_014964	T	6	6	62778	62783	0 %	100 %	0 %	0 %	320114926
1514	NC_014964	AGT	2	6	62824	62829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114926
1515	NC_014964	ATT	2	6	62885	62890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114926
1516	NC_014964	A	6	6	62909	62914	100 %	0 %	0 %	0 %	320114926
1517	NC_014964	AGA	3	9	62947	62955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114926
1518	NC_014964	CTG	2	6	62961	62966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114926
1519	NC_014964	GAAT	2	8	63000	63007	50 %	25 %	25 %	0 %	320114926
1520	NC_014964	AG	3	6	63041	63046	50 %	0 %	50 %	0 %	320114926
1521	NC_014964	GGT	2	6	63049	63054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114926
1522	NC_014964	TTA	2	6	63062	63067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114926
1523	NC_014964	CACT	2	8	63114	63121	25 %	25 %	0 %	50 %	320114926
1524	NC_014964	ATT	2	6	63170	63175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114926
1525	NC_014964	AGA	2	6	63217	63222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114926
1526	NC_014964	AAAT	2	8	63243	63250	75 %	25 %	0 %	0 %	320114926
1527	NC_014964	ACA	2	6	63285	63290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114926
1528	NC_014964	TTC	2	6	63296	63301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114926
1529	NC_014964	TAA	2	6	63333	63338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114926
1530	NC_014964	T	6	6	63373	63378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014964	A	6	6	63389	63394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014964	AGG	2	6	63409	63414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014964	GAT	2	6	63516	63521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114927
1534	NC_014964	TTG	2	6	63542	63547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114927
1535	NC_014964	CTA	2	6	63557	63562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114927
1536	NC_014964	CTT	2	6	63615	63620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114927
1537	NC_014964	GAT	2	6	63661	63666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114928
1538	NC_014964	AAG	2	6	63667	63672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114928
1539	NC_014964	ACA	2	6	63684	63689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114928
1540	NC_014964	TCC	2	6	63732	63737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114928
1541	NC_014964	TGT	2	6	63769	63774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114928
1542	NC_014964	AGC	2	6	63802	63807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114928
1543	NC_014964	TGGA	2	8	63895	63902	25 %	25 %	50 %	0 %	320114928
1544	NC_014964	A	6	6	63937	63942	100 %	0 %	0 %	0 %	320114928
1545	NC_014964	AGG	2	6	63985	63990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114928
1546	NC_014964	GCA	2	6	63991	63996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114928
1547	NC_014964	GAA	2	6	64011	64016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114928
1548	NC_014964	T	6	6	64060	64065	0 %	100 %	0 %	0 %	320114929
1549	NC_014964	CTT	2	6	64090	64095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114929
1550	NC_014964	T	7	7	64094	64100	0 %	100 %	0 %	0 %	320114929
1551	NC_014964	CTT	2	6	64123	64128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114929
1552	NC_014964	CTA	2	6	64143	64148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114929
1553	NC_014964	TGA	2	6	64194	64199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114929
1554	NC_014964	AGT	2	6	64257	64262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114929
1555	NC_014964	TAA	2	6	64281	64286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114929
1556	NC_014964	AGA	2	6	64293	64298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114929
1557	NC_014964	A	6	6	64326	64331	100 %	0 %	0 %	0 %	320114929
1558	NC_014964	A	6	6	64347	64352	100 %	0 %	0 %	0 %	320114929
1559	NC_014964	TTG	2	6	64373	64378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114929
1560	NC_014964	AT	3	6	64442	64447	50 %	50 %	0 %	0 %	320114929
1561	NC_014964	ATTA	2	8	64457	64464	50 %	50 %	0 %	0 %	320114930
1562	NC_014964	AT	3	6	64481	64486	50 %	50 %	0 %	0 %	320114930
1563	NC_014964	A	9	9	64496	64504	100 %	0 %	0 %	0 %	320114930
1564	NC_014964	AG	3	6	64535	64540	50 %	0 %	50 %	0 %	320114930
1565	NC_014964	ATT	2	6	64548	64553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114930
1566	NC_014964	A	6	6	64559	64564	100 %	0 %	0 %	0 %	320114930
1567	NC_014964	GTAA	2	8	64581	64588	50 %	25 %	25 %	0 %	320114930
1568	NC_014964	AGA	2	6	64631	64636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114930
1569	NC_014964	TAG	2	6	64768	64773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114930
1570	NC_014964	AGAA	2	8	64856	64863	75 %	0 %	25 %	0 %	320114930
1571	NC_014964	AG	3	6	64868	64873	50 %	0 %	50 %	0 %	320114930
1572	NC_014964	T	7	7	64874	64880	0 %	100 %	0 %	0 %	320114930
1573	NC_014964	CCT	2	6	64926	64931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114930
1574	NC_014964	AAG	2	6	64991	64996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114930
1575	NC_014964	TAT	2	6	65083	65088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114930
1576	NC_014964	ATT	2	6	65211	65216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114930
1577	NC_014964	ATA	2	6	65218	65223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114930
1578	NC_014964	A	6	6	65226	65231	100 %	0 %	0 %	0 %	320114930
1579	NC_014964	TAT	2	6	65257	65262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114930
1580	NC_014964	GTA	2	6	65264	65269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114930
1581	NC_014964	A	7	7	65279	65285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014964	T	6	6	65293	65298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014964	T	6	6	65309	65314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014964	CAAAA	2	10	65358	65367	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_014964	CAC	2	6	65384	65389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_014964	CGC	2	6	65403	65408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_014964	T	7	7	65420	65426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014964	TCC	2	6	65526	65531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_014964	GA	3	6	65668	65673	50 %	0 %	50 %	0 %	320114931
1590	NC_014964	TGA	2	6	65710	65715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114931
1591	NC_014964	AGA	2	6	65725	65730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114931
1592	NC_014964	AG	3	6	65768	65773	50 %	0 %	50 %	0 %	320114931
1593	NC_014964	T	7	7	65789	65795	0 %	100 %	0 %	0 %	320114931
1594	NC_014964	A	6	6	65804	65809	100 %	0 %	0 %	0 %	320114931
1595	NC_014964	ACT	2	6	65820	65825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114931
1596	NC_014964	AAT	2	6	65841	65846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114931
1597	NC_014964	A	6	6	65860	65865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014964	ATT	2	6	65886	65891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014964	TA	3	6	65923	65928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014964	A	6	6	65952	65957	100 %	0 %	0 %	0 %	320114932
1601	NC_014964	ATG	2	6	65965	65970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114932
1602	NC_014964	TGA	2	6	65980	65985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114932
1603	NC_014964	GAAA	2	8	66013	66020	75 %	0 %	25 %	0 %	320114932
1604	NC_014964	AAG	2	6	66037	66042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114932
1605	NC_014964	ATT	2	6	66072	66077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114932
1606	NC_014964	ATT	2	6	66097	66102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114932
1607	NC_014964	GT	3	6	66231	66236	0 %	50 %	50 %	0 %	320114932
1608	NC_014964	CTTT	2	8	66237	66244	0 %	75 %	0 %	25 %	320114932
1609	NC_014964	GAG	2	6	66283	66288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114932
1610	NC_014964	AGA	2	6	66354	66359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114933
1611	NC_014964	GT	4	8	66416	66423	0 %	50 %	50 %	0 %	320114933
1612	NC_014964	GAG	2	6	66427	66432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114933
1613	NC_014964	TGA	2	6	66438	66443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114933
1614	NC_014964	AGGA	2	8	66452	66459	50 %	0 %	50 %	0 %	320114933
1615	NC_014964	AG	3	6	66467	66472	50 %	0 %	50 %	0 %	320114933
1616	NC_014964	AT	3	6	66481	66486	50 %	50 %	0 %	0 %	320114933
1617	NC_014964	CAA	2	6	66509	66514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114933
1618	NC_014964	A	6	6	66666	66671	100 %	0 %	0 %	0 %	320114933
1619	NC_014964	CTT	2	6	66682	66687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114933
1620	NC_014964	AG	3	6	66713	66718	50 %	0 %	50 %	0 %	320114933
1621	NC_014964	GGA	2	6	66737	66742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114933
1622	NC_014964	AGA	2	6	66744	66749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114933
1623	NC_014964	AGA	2	6	66756	66761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114933
1624	NC_014964	GA	4	8	66760	66767	50 %	0 %	50 %	0 %	320114933
1625	NC_014964	TTG	2	6	66848	66853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114933
1626	NC_014964	TTAA	2	8	66862	66869	50 %	50 %	0 %	0 %	320114933
1627	NC_014964	AT	3	6	66906	66911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014964	GAT	2	6	66950	66955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014964	CAATAG	2	12	66978	66989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	320114934
1630	NC_014964	AGC	2	6	67024	67029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114934
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1744	NC_014964	TTCT	2	8	71078	71085	0 %	75 %	0 %	25 %	320114936
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1754	NC_014964	AAAG	2	8	71381	71388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1755	NC_014964	GGA	2	6	71402	71407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114937
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