MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014964	TAAGT	2	10	21458	21467	40 %	40 %	20 %	0 %	320114875
502	NC_014964	GA	3	6	21592	21597	50 %	0 %	50 %	0 %	320114875
503	NC_014964	ATG	2	6	21625	21630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114875
504	NC_014964	CAG	2	6	21656	21661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114875
505	NC_014964	TGT	2	6	21710	21715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114875
506	NC_014964	CTG	2	6	21724	21729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114875
507	NC_014964	GAA	2	6	21783	21788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114875
508	NC_014964	AT	3	6	21801	21806	50 %	50 %	0 %	0 %	320114875
509	NC_014964	GGA	2	6	21807	21812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114875
510	NC_014964	TAA	2	6	21838	21843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114875
511	NC_014964	GA	3	6	21875	21880	50 %	0 %	50 %	0 %	320114875
512	NC_014964	CAA	2	6	21964	21969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114875
513	NC_014964	ATT	2	6	22026	22031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114875
514	NC_014964	ATT	2	6	22044	22049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114875
515	NC_014964	TGA	2	6	22091	22096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114875
516	NC_014964	AAAG	2	8	22104	22111	75 %	0 %	25 %	0 %	320114875
517	NC_014964	G	6	6	22211	22216	0 %	0 %	100 %	0 %	320114875
518	NC_014964	AGG	2	6	22297	22302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114876
519	NC_014964	ATG	2	6	22320	22325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114876
520	NC_014964	GTTT	2	8	22424	22431	0 %	75 %	25 %	0 %	320114876
521	NC_014964	TGT	2	6	22501	22506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114876
522	NC_014964	ACAGG	2	10	22514	22523	40 %	0 %	40 %	20 %	320114876
523	NC_014964	AAG	2	6	22557	22562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114876
524	NC_014964	TAG	2	6	22689	22694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114876
525	NC_014964	A	6	6	22762	22767	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
526	NC_014964	AGT	2	6	22780	22785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114876
527	NC_014964	A	6	6	22832	22837	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
528	NC_014964	AGG	3	9	22852	22860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114876
529	NC_014964	CTT	2	6	22929	22934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114876
530	NC_014964	AGA	2	6	22957	22962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114876
531	NC_014964	AGG	2	6	23086	23091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114876
532	NC_014964	ATATTG	2	12	23118	23129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	320114876
533	NC_014964	GTAAA	2	10	23178	23187	60 %	20 %	20 %	0 %	320114876
534	NC_014964	TCAT	2	8	23219	23226	25 %	50 %	0 %	25 %	320114876
535	NC_014964	GAAA	2	8	23228	23235	75 %	0 %	25 %	0 %	320114876
536	NC_014964	TTTC	2	8	23253	23260	0 %	75 %	0 %	25 %	320114876
537	NC_014964	AAAAG	2	10	23263	23272	80 %	0 %	20 %	0 %	320114876
538	NC_014964	TAG	2	6	23319	23324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114876
539	NC_014964	A	6	6	23325	23330	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
540	NC_014964	AGG	2	6	23440	23445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114876
541	NC_014964	CTG	2	6	23472	23477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114876
542	NC_014964	GAAT	2	8	23544	23551	50 %	25 %	25 %	0 %	320114876
543	NC_014964	GCT	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114876
544	NC_014964	TAC	2	6	23601	23606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114876
545	NC_014964	CA	3	6	23672	23677	50 %	0 %	0 %	50 %	320114876
546	NC_014964	ACA	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114876
547	NC_014964	AGA	2	6	23752	23757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114876
548	NC_014964	A	6	6	23774	23779	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
549	NC_014964	A	6	6	23790	23795	100 %	0 %	0 %	0 %	320114876
550	NC_014964	TAT	2	6	23815	23820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114876
551	NC_014964	CGG	2	6	23917	23922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014964	GGAGAA	2	12	23987	23998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014964	AT	3	6	24013	24018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014964	T	6	6	24028	24033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014964	T	6	6	24059	24064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014964	AGG	2	6	24070	24075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014964	GAA	2	6	24086	24091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114877
558	NC_014964	ATA	2	6	24185	24190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
559	NC_014964	A	6	6	24244	24249	100 %	0 %	0 %	0 %	320114877
560	NC_014964	CTA	2	6	24273	24278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114877
561	NC_014964	CCT	2	6	24320	24325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114877
562	NC_014964	GAA	2	6	24332	24337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114877
563	NC_014964	AG	3	6	24357	24362	50 %	0 %	50 %	0 %	320114877
564	NC_014964	TA	3	6	24365	24370	50 %	50 %	0 %	0 %	320114877
565	NC_014964	A	6	6	24461	24466	100 %	0 %	0 %	0 %	320114877
566	NC_014964	AT	3	6	24496	24501	50 %	50 %	0 %	0 %	320114877
567	NC_014964	ACA	2	6	24689	24694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114877
568	NC_014964	ATT	2	6	24725	24730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114877
569	NC_014964	TAG	2	6	24736	24741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114877
570	NC_014964	TAA	2	6	24768	24773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
571	NC_014964	ACA	2	6	24803	24808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114877
572	NC_014964	AGAA	2	8	24830	24837	75 %	0 %	25 %	0 %	320114877
573	NC_014964	TTA	2	6	24861	24866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114877
574	NC_014964	GA	3	6	24921	24926	50 %	0 %	50 %	0 %	320114877
575	NC_014964	ATTG	2	8	24943	24950	25 %	50 %	25 %	0 %	320114877
576	NC_014964	TTG	2	6	24993	24998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114877
577	NC_014964	T	6	6	25010	25015	0 %	100 %	0 %	0 %	320114877
578	NC_014964	AAT	2	6	25027	25032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
579	NC_014964	AGG	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114877
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581	NC_014964	ATAGA	2	10	25119	25128	60 %	20 %	20 %	0 %	320114877
582	NC_014964	TGA	2	6	25129	25134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114877
583	NC_014964	TAA	2	6	25140	25145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114877
584	NC_014964	AGA	2	6	25193	25198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114878
585	NC_014964	GTA	2	6	25255	25260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114878
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587	NC_014964	TGGG	2	8	25450	25457	0 %	25 %	75 %	0 %	320114878
588	NC_014964	A	7	7	25513	25519	100 %	0 %	0 %	0 %	320114878
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592	NC_014964	TTA	2	6	25773	25778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114878
593	NC_014964	TA	3	6	25793	25798	50 %	50 %	0 %	0 %	320114878
594	NC_014964	TGA	2	6	25804	25809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014964	AGG	2	6	25823	25828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_014964	ATT	2	6	25888	25893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114879
599	NC_014964	GAT	2	6	25900	25905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114879
600	NC_014964	GCA	2	6	25939	25944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114879
601	NC_014964	GAA	2	6	26154	26159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114879
602	NC_014964	TAG	2	6	26162	26167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114879
603	NC_014964	AGA	2	6	26184	26189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114879
604	NC_014964	TGG	2	6	26232	26237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114879
605	NC_014964	A	7	7	26376	26382	100 %	0 %	0 %	0 %	320114879
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608	NC_014964	ATAA	2	8	26557	26564	75 %	25 %	0 %	0 %	320114879
609	NC_014964	AGGA	2	8	26675	26682	50 %	0 %	50 %	0 %	320114879
610	NC_014964	AGGA	2	8	26705	26712	50 %	0 %	50 %	0 %	320114879
611	NC_014964	ATC	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114879
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613	NC_014964	A	6	6	26891	26896	100 %	0 %	0 %	0 %	320114879
614	NC_014964	TGT	2	6	26925	26930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114879
615	NC_014964	CAAAA	2	10	26982	26991	80 %	0 %	0 %	20 %	320114879
616	NC_014964	A	6	6	26988	26993	100 %	0 %	0 %	0 %	320114879
617	NC_014964	A	7	7	27036	27042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014964	ATT	2	6	27056	27061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014964	TA	3	6	27065	27070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014964	TAA	2	6	27083	27088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014964	AT	3	6	27111	27116	50 %	50 %	0 %	0 %	320114880
622	NC_014964	GAAA	2	8	27139	27146	75 %	0 %	25 %	0 %	320114880
623	NC_014964	ATG	2	6	27319	27324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114880
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627	NC_014964	TTATT	2	10	27582	27591	20 %	80 %	0 %	0 %	320114881
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629	NC_014964	TAC	3	9	27632	27640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114881
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632	NC_014964	AT	3	6	27800	27805	50 %	50 %	0 %	0 %	320114881
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