MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_014964	CTT	2	6	2342993	2342998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117062
56502	NC_014964	TC	4	8	2343060	2343067	0 %	50 %	0 %	50 %	320117063
56503	NC_014964	CTG	2	6	2343079	2343084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320117063
56504	NC_014964	AT	3	6	2343096	2343101	50 %	50 %	0 %	0 %	320117063
56505	NC_014964	AT	3	6	2343115	2343120	50 %	50 %	0 %	0 %	320117063
56506	NC_014964	ATCC	2	8	2343149	2343156	25 %	25 %	0 %	50 %	320117063
56507	NC_014964	CAT	2	6	2343169	2343174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117063
56508	NC_014964	AGA	2	6	2343217	2343222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320117063
56509	NC_014964	TA	3	6	2343223	2343228	50 %	50 %	0 %	0 %	320117063
56510	NC_014964	AGT	2	6	2343229	2343234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320117063
56511	NC_014964	CAG	2	6	2343237	2343242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320117063
56512	NC_014964	TA	3	6	2343256	2343261	50 %	50 %	0 %	0 %	320117063
56513	NC_014964	A	6	6	2343296	2343301	100 %	0 %	0 %	0 %	320117063
56514	NC_014964	CCA	2	6	2343386	2343391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320117063
56515	NC_014964	TCT	2	6	2343405	2343410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117063
56516	NC_014964	CTT	2	6	2343463	2343468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117063
56517	NC_014964	TTTC	2	8	2343495	2343502	0 %	75 %	0 %	25 %	320117063
56518	NC_014964	TA	3	6	2343529	2343534	50 %	50 %	0 %	0 %	320117063
56519	NC_014964	AAG	2	6	2343544	2343549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320117063
56520	NC_014964	TTA	2	6	2343555	2343560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117063
56521	NC_014964	AAT	2	6	2343571	2343576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117063
56522	NC_014964	ATG	2	6	2343604	2343609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320117063
56523	NC_014964	AAC	2	6	2343620	2343625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320117063
56524	NC_014964	TTG	2	6	2343645	2343650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320117063
56525	NC_014964	ATA	3	9	2343653	2343661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117063
56526	NC_014964	ATTT	2	8	2343671	2343678	25 %	75 %	0 %	0 %	320117064
56527	NC_014964	AT	3	6	2343836	2343841	50 %	50 %	0 %	0 %	320117064
56528	NC_014964	TTAA	2	8	2343854	2343861	50 %	50 %	0 %	0 %	320117064
56529	NC_014964	A	7	7	2343860	2343866	100 %	0 %	0 %	0 %	320117064
56530	NC_014964	AAC	2	6	2343868	2343873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320117064
56531	NC_014964	TAAT	2	8	2343914	2343921	50 %	50 %	0 %	0 %	320117065
56532	NC_014964	T	6	6	2343934	2343939	0 %	100 %	0 %	0 %	320117065
56533	NC_014964	T	7	7	2344079	2344085	0 %	100 %	0 %	0 %	320117065
56534	NC_014964	ATT	2	6	2344119	2344124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117065
56535	NC_014964	ATA	2	6	2344131	2344136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117065
56536	NC_014964	ACA	2	6	2344141	2344146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320117065
56537	NC_014964	T	7	7	2344199	2344205	0 %	100 %	0 %	0 %	320117065
56538	NC_014964	A	6	6	2344247	2344252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56539	NC_014964	TCT	3	9	2344296	2344304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117066
56540	NC_014964	T	7	7	2344359	2344365	0 %	100 %	0 %	0 %	320117066
56541	NC_014964	T	7	7	2344373	2344379	0 %	100 %	0 %	0 %	320117066
56542	NC_014964	CCT	2	6	2344408	2344413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56543	NC_014964	A	6	6	2344421	2344426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56544	NC_014964	TTAA	2	8	2344446	2344453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56545	NC_014964	GGA	2	6	2344454	2344459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56546	NC_014964	CAA	2	6	2344463	2344468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56547	NC_014964	CAA	2	6	2344493	2344498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56548	NC_014964	ATC	2	6	2344506	2344511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56549	NC_014964	AC	4	8	2344513	2344520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56550	NC_014964	ATT	2	6	2344532	2344537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56551	NC_014964	TAT	2	6	2344568	2344573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56552	NC_014964	AAC	2	6	2344619	2344624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56553	NC_014964	GTT	2	6	2344635	2344640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56554	NC_014964	GTT	2	6	2344658	2344663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56555	NC_014964	TCA	2	6	2344686	2344691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56556	NC_014964	T	7	7	2344715	2344721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56557	NC_014964	T	6	6	2344743	2344748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56558	NC_014964	CAA	2	6	2344751	2344756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56559	NC_014964	A	6	6	2344793	2344798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56560	NC_014964	TTA	2	6	2344819	2344824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.