MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_014964	T	6	6	2322744	2322749	0 %	100 %	0 %	0 %	320117041
56002	NC_014964	T	8	8	2322786	2322793	0 %	100 %	0 %	0 %	320117041
56003	NC_014964	GAA	2	6	2322802	2322807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320117041
56004	NC_014964	ACC	2	6	2322808	2322813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320117041
56005	NC_014964	T	6	6	2322816	2322821	0 %	100 %	0 %	0 %	320117041
56006	NC_014964	TCT	2	6	2322826	2322831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117041
56007	NC_014964	CAT	2	6	2322837	2322842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117041
56008	NC_014964	CTT	2	6	2322845	2322850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117041
56009	NC_014964	ATT	2	6	2322862	2322867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117041
56010	NC_014964	ACC	2	6	2322877	2322882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320117041
56011	NC_014964	T	7	7	2322966	2322972	0 %	100 %	0 %	0 %	320117041
56012	NC_014964	T	8	8	2323033	2323040	0 %	100 %	0 %	0 %	320117041
56013	NC_014964	TTCATT	2	12	2323089	2323100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	320117041
56014	NC_014964	CGG	2	6	2323160	2323165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320117041
56015	NC_014964	AT	3	6	2323217	2323222	50 %	50 %	0 %	0 %	320117041
56016	NC_014964	TA	3	6	2323227	2323232	50 %	50 %	0 %	0 %	320117041
56017	NC_014964	TCTAAC	2	12	2323237	2323248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117041
56018	NC_014964	T	6	6	2323251	2323256	0 %	100 %	0 %	0 %	320117041
56019	NC_014964	GTA	2	6	2323266	2323271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320117041
56020	NC_014964	AAAG	2	8	2323289	2323296	75 %	0 %	25 %	0 %	320117041
56021	NC_014964	GTA	2	6	2323329	2323334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320117041
56022	NC_014964	AGA	2	6	2323386	2323391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320117041
56023	NC_014964	ATT	2	6	2323393	2323398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117041
56024	NC_014964	AGC	2	6	2323542	2323547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320117042
56025	NC_014964	ATA	2	6	2323578	2323583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117042
56026	NC_014964	TAC	2	6	2323587	2323592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117042
56027	NC_014964	CCT	2	6	2323600	2323605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320117042
56028	NC_014964	TAT	2	6	2323632	2323637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117042
56029	NC_014964	TAG	2	6	2323640	2323645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320117042
56030	NC_014964	GCT	2	6	2323658	2323663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320117042
56031	NC_014964	AAC	2	6	2323681	2323686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320117042
56032	NC_014964	ATCC	2	8	2323699	2323706	25 %	25 %	0 %	50 %	320117042
56033	NC_014964	TTC	2	6	2323728	2323733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117042
56034	NC_014964	TA	3	6	2323752	2323757	50 %	50 %	0 %	0 %	320117042
56035	NC_014964	TA	3	6	2323783	2323788	50 %	50 %	0 %	0 %	320117042
56036	NC_014964	TA	3	6	2323791	2323796	50 %	50 %	0 %	0 %	320117042
56037	NC_014964	ATTA	2	8	2323797	2323804	50 %	50 %	0 %	0 %	320117042
56038	NC_014964	ATC	2	6	2323846	2323851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117042
56039	NC_014964	TAA	2	6	2323872	2323877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117042
56040	NC_014964	ATA	2	6	2323922	2323927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117042
56041	NC_014964	CTT	2	6	2323928	2323933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117042
56042	NC_014964	A	6	6	2323956	2323961	100 %	0 %	0 %	0 %	320117042
56043	NC_014964	ATTT	2	8	2323974	2323981	25 %	75 %	0 %	0 %	320117042
56044	NC_014964	AAATA	2	10	2323999	2324008	80 %	20 %	0 %	0 %	320117042
56045	NC_014964	A	6	6	2324112	2324117	100 %	0 %	0 %	0 %	320117042
56046	NC_014964	AATA	2	8	2324163	2324170	75 %	25 %	0 %	0 %	320117042
56047	NC_014964	GAT	2	6	2324179	2324184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320117042
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56049	NC_014964	A	8	8	2324242	2324249	100 %	0 %	0 %	0 %	320117042
56050	NC_014964	TAC	2	6	2324292	2324297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117042
56051	NC_014964	TCA	2	6	2324309	2324314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117042
56052	NC_014964	AAT	2	6	2324422	2324427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117043
56053	NC_014964	T	8	8	2324440	2324447	0 %	100 %	0 %	0 %	320117043
56054	NC_014964	TTC	2	6	2324464	2324469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117043
56055	NC_014964	TC	3	6	2324487	2324492	0 %	50 %	0 %	50 %	320117043
56056	NC_014964	TAA	2	6	2324494	2324499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117043
56057	NC_014964	CATCTT	2	12	2324547	2324558	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	320117043
56058	NC_014964	AG	3	6	2324574	2324579	50 %	0 %	50 %	0 %	320117043
56059	NC_014964	ATA	2	6	2324624	2324629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117043
56060	NC_014964	ATT	2	6	2324647	2324652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117043
56061	NC_014964	ATT	2	6	2324738	2324743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117044
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56063	NC_014964	TTC	2	6	2324831	2324836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117044
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56065	NC_014964	T	7	7	2324957	2324963	0 %	100 %	0 %	0 %	320117044
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56067	NC_014964	TGT	2	6	2324997	2325002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320117044
56068	NC_014964	CCT	2	6	2325013	2325018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56069	NC_014964	ATC	2	6	2325033	2325038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117045
56070	NC_014964	CT	3	6	2325043	2325048	0 %	50 %	0 %	50 %	320117045
56071	NC_014964	TCA	2	6	2325106	2325111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117045
56072	NC_014964	TTC	2	6	2325123	2325128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117045
56073	NC_014964	CTG	2	6	2325139	2325144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320117045
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56077	NC_014964	TCA	2	6	2325422	2325427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117045
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56079	NC_014964	TTA	3	9	2325519	2325527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117046
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56083	NC_014964	TCA	2	6	2325668	2325673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117046
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56086	NC_014964	TTTC	2	8	2325734	2325741	0 %	75 %	0 %	25 %	320117046
56087	NC_014964	GA	4	8	2325759	2325766	50 %	0 %	50 %	0 %	320117046
56088	NC_014964	CCT	2	6	2325800	2325805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56089	NC_014964	GGC	2	6	2325835	2325840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56090	NC_014964	ATCCAT	2	12	2325842	2325853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56091	NC_014964	T	7	7	2325895	2325901	0 %	100 %	0 %	0 %	320117047
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56096	NC_014964	CA	3	6	2326128	2326133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56097	NC_014964	T	7	7	2326218	2326224	0 %	100 %	0 %	0 %	320117048
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56101	NC_014964	T	7	7	2326362	2326368	0 %	100 %	0 %	0 %	320117048
56102	NC_014964	TGAG	2	8	2326384	2326391	25 %	25 %	50 %	0 %	320117048
56103	NC_014964	TAT	2	6	2326398	2326403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117048
56104	NC_014964	TAT	2	6	2326500	2326505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117048
56105	NC_014964	CTT	2	6	2326553	2326558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320117048
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56108	NC_014964	TA	3	6	2326587	2326592	50 %	50 %	0 %	0 %	320117048
56109	NC_014964	AGC	2	6	2326746	2326751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320117048
56110	NC_014964	AAAT	2	8	2326759	2326766	75 %	25 %	0 %	0 %	320117048
56111	NC_014964	AT	3	6	2326778	2326783	50 %	50 %	0 %	0 %	320117048
56112	NC_014964	TCTT	2	8	2326811	2326818	0 %	75 %	0 %	25 %	320117048
56113	NC_014964	CAT	2	6	2326995	2327000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117048
56114	NC_014964	TA	3	6	2327028	2327033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56115	NC_014964	AAT	2	6	2327058	2327063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56116	NC_014964	AT	3	6	2327109	2327114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56117	NC_014964	TAA	2	6	2327157	2327162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320117049
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56238	NC_014964	TTCCC	2	10	2332566	2332575	0 %	40 %	0 %	60 %	320117052
56239	NC_014964	TCC	2	6	2332661	2332666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320117052
56240	NC_014964	T	6	6	2332715	2332720	0 %	100 %	0 %	0 %	320117053
56241	NC_014964	CTTTT	2	10	2332727	2332736	0 %	80 %	0 %	20 %	320117053
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56282	NC_014964	TAAAT	2	10	2334399	2334408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56283	NC_014964	TAT	2	6	2334416	2334421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56285	NC_014964	CCT	2	6	2334434	2334439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56293	NC_014964	TC	3	6	2334781	2334786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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56339	NC_014964	T	6	6	2336636	2336641	0 %	100 %	0 %	0 %	320117057
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56345	NC_014964	T	6	6	2336872	2336877	0 %	100 %	0 %	0 %	320117057
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56348	NC_014964	TCA	2	6	2336915	2336920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117057
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56352	NC_014964	ATT	2	6	2337268	2337273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320117057
56353	NC_014964	AC	3	6	2337443	2337448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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56355	NC_014964	AT	4	8	2337483	2337490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56356	NC_014964	AAT	2	6	2337497	2337502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56357	NC_014964	TCC	2	6	2337510	2337515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56358	NC_014964	AT	3	6	2337526	2337531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56479	NC_014964	TCA	2	6	2342321	2342326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320117061
56480	NC_014964	CCAA	2	8	2342327	2342334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56481	NC_014964	A	6	6	2342333	2342338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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