MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 56560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_014964	CAAAA	2	10	2239447	2239456	80 %	0 %	0 %	20 %	320116957
54002	NC_014964	A	6	6	2239485	2239490	100 %	0 %	0 %	0 %	320116957
54003	NC_014964	AATTT	2	10	2239498	2239507	40 %	60 %	0 %	0 %	320116957
54004	NC_014964	TA	3	6	2239534	2239539	50 %	50 %	0 %	0 %	320116957
54005	NC_014964	TC	3	6	2239549	2239554	0 %	50 %	0 %	50 %	320116957
54006	NC_014964	A	7	7	2239593	2239599	100 %	0 %	0 %	0 %	320116957
54007	NC_014964	TAA	2	6	2239637	2239642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116957
54008	NC_014964	TCC	2	6	2239699	2239704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116957
54009	NC_014964	A	6	6	2239706	2239711	100 %	0 %	0 %	0 %	320116957
54010	NC_014964	CATTA	2	10	2239722	2239731	40 %	40 %	0 %	20 %	320116957
54011	NC_014964	TCA	2	6	2239771	2239776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116957
54012	NC_014964	AAT	2	6	2239820	2239825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116957
54013	NC_014964	TAT	2	6	2239833	2239838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116957
54014	NC_014964	CGT	2	6	2239874	2239879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54015	NC_014964	T	6	6	2239884	2239889	0 %	100 %	0 %	0 %	320116958
54016	NC_014964	AAT	2	6	2239912	2239917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116958
54017	NC_014964	T	7	7	2239972	2239978	0 %	100 %	0 %	0 %	320116958
54018	NC_014964	A	7	7	2239980	2239986	100 %	0 %	0 %	0 %	320116958
54019	NC_014964	GAAA	2	8	2240023	2240030	75 %	0 %	25 %	0 %	320116958
54020	NC_014964	ATTT	2	8	2240039	2240046	25 %	75 %	0 %	0 %	320116958
54021	NC_014964	ACATG	2	10	2240076	2240085	40 %	20 %	20 %	20 %	320116959
54022	NC_014964	TAA	2	6	2240148	2240153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116959
54023	NC_014964	CATG	2	8	2240157	2240164	25 %	25 %	25 %	25 %	320116959
54024	NC_014964	CCA	2	6	2240227	2240232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116959
54025	NC_014964	TTA	2	6	2240275	2240280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116959
54026	NC_014964	CCTTTT	2	12	2240325	2240336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116959
54027	NC_014964	TGC	2	6	2240396	2240401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116959
54028	NC_014964	ATT	2	6	2240469	2240474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116959
54029	NC_014964	ATCA	2	8	2240492	2240499	50 %	25 %	0 %	25 %	320116959
54030	NC_014964	TCA	2	6	2240511	2240516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116959
54031	NC_014964	CGT	2	6	2240537	2240542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116959
54032	NC_014964	TTGCAA	2	12	2240551	2240562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	320116959
54033	NC_014964	TCC	3	9	2240573	2240581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116959
54034	NC_014964	GTG	2	6	2240588	2240593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320116959
54035	NC_014964	A	6	6	2240607	2240612	100 %	0 %	0 %	0 %	320116959
54036	NC_014964	T	6	6	2240683	2240688	0 %	100 %	0 %	0 %	320116959
54037	NC_014964	ATT	2	6	2240712	2240717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116959
54038	NC_014964	TGA	2	6	2240760	2240765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116959
54039	NC_014964	AT	3	6	2240766	2240771	50 %	50 %	0 %	0 %	320116959
54040	NC_014964	TAA	2	6	2240786	2240791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116959
54041	NC_014964	T	8	8	2240792	2240799	0 %	100 %	0 %	0 %	320116959
54042	NC_014964	T	7	7	2240823	2240829	0 %	100 %	0 %	0 %	320116959
54043	NC_014964	CAA	2	6	2240914	2240919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116959
54044	NC_014964	ATCT	2	8	2240926	2240933	25 %	50 %	0 %	25 %	320116959
54045	NC_014964	T	6	6	2240981	2240986	0 %	100 %	0 %	0 %	320116959
54046	NC_014964	A	6	6	2240987	2240992	100 %	0 %	0 %	0 %	320116959
54047	NC_014964	TTTCA	2	10	2241038	2241047	20 %	60 %	0 %	20 %	320116959
54048	NC_014964	TCC	2	6	2241051	2241056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116960
54049	NC_014964	AATT	2	8	2241102	2241109	50 %	50 %	0 %	0 %	320116960
54050	NC_014964	CTT	2	6	2241120	2241125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116960
54051	NC_014964	AGG	2	6	2241174	2241179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320116960
54052	NC_014964	ATA	2	6	2241244	2241249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116960
54053	NC_014964	CCA	2	6	2241328	2241333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116960
54054	NC_014964	GCT	2	6	2241364	2241369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116960
54055	NC_014964	AAT	2	6	2241438	2241443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116960
54056	NC_014964	TCC	2	6	2241546	2241551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116960
54057	NC_014964	ACC	2	6	2241580	2241585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116960
54058	NC_014964	T	6	6	2241624	2241629	0 %	100 %	0 %	0 %	320116960
54059	NC_014964	TTTC	2	8	2241746	2241753	0 %	75 %	0 %	25 %	320116960
54060	NC_014964	ATTTT	2	10	2241755	2241764	20 %	80 %	0 %	0 %	320116960
54061	NC_014964	TTC	2	6	2241830	2241835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116960
54062	NC_014964	CTG	2	6	2241947	2241952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116960
54063	NC_014964	TC	3	6	2241967	2241972	0 %	50 %	0 %	50 %	320116960
54064	NC_014964	TAT	2	6	2242005	2242010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116960
54065	NC_014964	ATTC	2	8	2242023	2242030	25 %	50 %	0 %	25 %	320116961
54066	NC_014964	CTT	2	6	2242053	2242058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116961
54067	NC_014964	CCG	2	6	2242082	2242087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320116961
54068	NC_014964	AATA	2	8	2242121	2242128	75 %	25 %	0 %	0 %	320116961
54069	NC_014964	CAA	2	6	2242455	2242460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320116961
54070	NC_014964	AGC	2	6	2242486	2242491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320116961
54071	NC_014964	ATA	3	9	2242535	2242543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116961
54072	NC_014964	A	7	7	2242618	2242624	100 %	0 %	0 %	0 %	320116961
54073	NC_014964	TAA	2	6	2242630	2242635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116961
54074	NC_014964	TTG	2	6	2242672	2242677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320116961
54075	NC_014964	AAG	2	6	2242722	2242727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116961
54076	NC_014964	TAC	2	6	2242771	2242776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116961
54077	NC_014964	AT	3	6	2242800	2242805	50 %	50 %	0 %	0 %	320116961
54078	NC_014964	T	6	6	2242837	2242842	0 %	100 %	0 %	0 %	320116961
54079	NC_014964	TAA	2	6	2242849	2242854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116961
54080	NC_014964	ATA	2	6	2242870	2242875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116961
54081	NC_014964	T	6	6	2242894	2242899	0 %	100 %	0 %	0 %	320116961
54082	NC_014964	ATTTCA	2	12	2242901	2242912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	320116961
54083	NC_014964	AAT	2	6	2242999	2243004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116962
54084	NC_014964	AAAAT	2	10	2243034	2243043	80 %	20 %	0 %	0 %	320116962
54085	NC_014964	CCA	2	6	2243072	2243077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116962
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54087	NC_014964	AT	3	6	2243095	2243100	50 %	50 %	0 %	0 %	320116962
54088	NC_014964	ATT	2	6	2243142	2243147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116962
54089	NC_014964	TGC	2	6	2243160	2243165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116962
54090	NC_014964	TCC	3	9	2243212	2243220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320116962
54091	NC_014964	ATT	2	6	2243221	2243226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116962
54092	NC_014964	AAG	2	6	2243258	2243263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116962
54093	NC_014964	ATTGCA	2	12	2243275	2243286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	320116962
54094	NC_014964	AAG	2	6	2243339	2243344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320116962
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54096	NC_014964	ACAA	2	8	2243404	2243411	75 %	0 %	0 %	25 %	320116962
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54098	NC_014964	TAT	2	6	2243448	2243453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116962
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54100	NC_014964	T	6	6	2243495	2243500	0 %	100 %	0 %	0 %	320116962
54101	NC_014964	TGC	2	6	2243502	2243507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320116962
54102	NC_014964	A	6	6	2243542	2243547	100 %	0 %	0 %	0 %	320116962
54103	NC_014964	ATT	2	6	2243593	2243598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116962
54104	NC_014964	CAT	2	6	2243706	2243711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116962
54105	NC_014964	TAA	2	6	2243850	2243855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116962
54106	NC_014964	TTTA	2	8	2243865	2243872	25 %	75 %	0 %	0 %	320116962
54107	NC_014964	AAT	2	6	2243876	2243881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116962
54108	NC_014964	TAT	2	6	2243899	2243904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116963
54109	NC_014964	GTA	2	6	2243926	2243931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320116963
54110	NC_014964	CAT	2	6	2243984	2243989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116963
54111	NC_014964	CAT	2	6	2244020	2244025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116963
54112	NC_014964	TAA	2	6	2244028	2244033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320116963
54113	NC_014964	ATT	2	6	2244103	2244108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320116963
54114	NC_014964	TTC	2	6	2244136	2244141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320116963
54115	NC_014964	CAT	2	6	2244236	2244241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116963
54116	NC_014964	CCA	2	6	2244279	2244284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320116963
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54118	NC_014964	ATTTC	2	10	2244359	2244368	20 %	60 %	0 %	20 %	320116963
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54120	NC_014964	ACT	2	6	2244400	2244405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320116963
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54131	NC_014964	GTAA	2	8	2245133	2245140	50 %	25 %	25 %	0 %	320116963
54132	NC_014964	GT	4	8	2245241	2245248	0 %	50 %	50 %	0 %	320116963
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54147	NC_014964	ATT	2	6	2245795	2245800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54218	NC_014964	A	6	6	2248723	2248728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54219	NC_014964	CTC	2	6	2248858	2248863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54222	NC_014964	T	6	6	2249256	2249261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54224	NC_014964	CTT	2	6	2249350	2249355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54225	NC_014964	CCTTT	2	10	2249375	2249384	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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54227	NC_014964	ATA	2	6	2249441	2249446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54229	NC_014964	AGTA	2	8	2249463	2249470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54230	NC_014964	ACG	2	6	2249680	2249685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54232	NC_014964	GCC	2	6	2249875	2249880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54233	NC_014964	TC	4	8	2249918	2249925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54234	NC_014964	CT	3	6	2249953	2249958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54235	NC_014964	CG	3	6	2249959	2249964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54236	NC_014964	AGG	2	6	2250012	2250017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54237	NC_014964	GGT	2	6	2250100	2250105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54238	NC_014964	TAC	2	6	2250255	2250260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54240	NC_014964	GCC	2	6	2250370	2250375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54241	NC_014964	TCCTC	2	10	2250599	2250608	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54242	NC_014964	GCT	2	6	2250670	2250675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54243	NC_014964	CCTG	2	8	2250712	2250719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54244	NC_014964	GGT	2	6	2250823	2250828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54245	NC_014964	CGG	2	6	2250930	2250935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54246	NC_014964	TC	3	6	2250975	2250980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54247	NC_014964	AGCTT	2	10	2250994	2251003	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54248	NC_014964	CTT	2	6	2251088	2251093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54249	NC_014964	ATC	2	6	2251095	2251100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54250	NC_014964	TTC	2	6	2251130	2251135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54251	NC_014964	TA	3	6	2251163	2251168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54252	NC_014964	TTCT	2	8	2251259	2251266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54253	NC_014964	TGC	2	6	2251304	2251309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54254	NC_014964	CTT	2	6	2251311	2251316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54255	NC_014964	TTG	2	6	2251397	2251402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54256	NC_014964	AT	3	6	2251403	2251408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54257	NC_014964	GCT	2	6	2251564	2251569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54258	NC_014964	TCC	2	6	2251706	2251711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54259	NC_014964	CCA	2	6	2251911	2251916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54261	NC_014964	TCGCTT	2	12	2251999	2252010	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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54263	NC_014964	CTCTT	2	10	2252106	2252115	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54264	NC_014964	ACT	2	6	2252117	2252122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54265	NC_014964	CTCCC	2	10	2252224	2252233	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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54268	NC_014964	CCA	2	6	2252355	2252360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54269	NC_014964	CTT	2	6	2252395	2252400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54270	NC_014964	CGGC	2	8	2252401	2252408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54271	NC_014964	ACTC	2	8	2252434	2252441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54272	NC_014964	TAT	2	6	2252485	2252490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54273	NC_014964	ATC	2	6	2252491	2252496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54274	NC_014964	T	6	6	2252497	2252502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54275	NC_014964	CTC	2	6	2252541	2252546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54276	NC_014964	TCGC	2	8	2252552	2252559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54277	NC_014964	CTTT	3	12	2252581	2252592	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54278	NC_014964	CG	3	6	2252620	2252625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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54281	NC_014964	CTT	2	6	2252756	2252761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54282	NC_014964	CCA	2	6	2252783	2252788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54290	NC_014964	CCTC	2	8	2253232	2253239	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54291	NC_014964	GT	3	6	2253260	2253265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54292	NC_014964	ATG	2	6	2253285	2253290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54295	NC_014964	CACGA	2	10	2253470	2253479	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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54318	NC_014964	TAAG	2	8	2254573	2254580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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54327	NC_014964	TTA	2	6	2254885	2254890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54332	NC_014964	T	6	6	2255037	2255042	0 %	100 %	0 %	0 %	320116967
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54358	NC_014964	GA	3	6	2255715	2255720	50 %	0 %	50 %	0 %	320116969
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