MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 chromosome

Total Repeats: 32906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_014926	CTC	2	6	1435705	1435710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790437
28003	NC_014926	TCA	2	6	1435734	1435739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790437
28004	NC_014926	AAG	2	6	1435750	1435755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790437
28005	NC_014926	G	6	6	1435771	1435776	0 %	0 %	100 %	0 %	319790437
28006	NC_014926	GGC	2	6	1435794	1435799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790437
28007	NC_014926	CTC	2	6	1435804	1435809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790437
28008	NC_014926	CTC	2	6	1435843	1435848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790437
28009	NC_014926	CCT	2	6	1435854	1435859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790437
28010	NC_014926	CTT	2	6	1435882	1435887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790437
28011	NC_014926	TTG	2	6	1435922	1435927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790437
28012	NC_014926	GCC	2	6	1436060	1436065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28013	NC_014926	T	6	6	1436072	1436077	0 %	100 %	0 %	0 %	319790438
28014	NC_014926	AGCA	2	8	1436099	1436106	50 %	0 %	25 %	25 %	319790438
28015	NC_014926	GCA	2	6	1436118	1436123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790438
28016	NC_014926	ACT	2	6	1436202	1436207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790438
28017	NC_014926	GTC	2	6	1436228	1436233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790438
28018	NC_014926	AAG	2	6	1436249	1436254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790438
28019	NC_014926	TCG	2	6	1436265	1436270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790438
28020	NC_014926	TCG	2	6	1436280	1436285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790438
28021	NC_014926	TGA	2	6	1436293	1436298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790438
28022	NC_014926	GAT	2	6	1436324	1436329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790438
28023	NC_014926	CTC	2	6	1436384	1436389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790438
28024	NC_014926	GGT	2	6	1436428	1436433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790438
28025	NC_014926	GAA	2	6	1436440	1436445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790438
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28028	NC_014926	CACTT	2	10	1436562	1436571	20 %	40 %	0 %	40 %	319790438
28029	NC_014926	C	6	6	1436576	1436581	0 %	0 %	0 %	100 %	319790439
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28032	NC_014926	AAG	2	6	1436667	1436672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790439
28033	NC_014926	CGG	2	6	1436704	1436709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790439
28034	NC_014926	GA	3	6	1436769	1436774	50 %	0 %	50 %	0 %	319790439
28035	NC_014926	CCA	2	6	1436777	1436782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790439
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28039	NC_014926	TCCAC	2	10	1437028	1437037	20 %	20 %	0 %	60 %	319790439
28040	NC_014926	GA	3	6	1437058	1437063	50 %	0 %	50 %	0 %	319790439
28041	NC_014926	TGA	2	6	1437070	1437075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790439
28042	NC_014926	CAA	2	6	1437103	1437108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790439
28043	NC_014926	GAG	2	6	1437200	1437205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790439
28044	NC_014926	CCCT	2	8	1437272	1437279	0 %	25 %	0 %	75 %	319790439
28045	NC_014926	CAT	2	6	1437284	1437289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790439
28046	NC_014926	GAT	3	9	1437386	1437394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790439
28047	NC_014926	TGGG	2	8	1437397	1437404	0 %	25 %	75 %	0 %	319790439
28048	NC_014926	TCC	2	6	1437425	1437430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790439
28049	NC_014926	AGCTTC	2	12	1437477	1437488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319790439
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28051	NC_014926	GAA	2	6	1437641	1437646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790439
28052	NC_014926	TCA	2	6	1437676	1437681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790439
28053	NC_014926	TAA	2	6	1437739	1437744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790439
28054	NC_014926	GAGG	2	8	1437761	1437768	25 %	0 %	75 %	0 %	319790439
28055	NC_014926	ATC	2	6	1437816	1437821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790439
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28058	NC_014926	GCC	2	6	1437974	1437979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790440
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28065	NC_014926	GAG	2	6	1438264	1438269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790440
28066	NC_014926	CCG	2	6	1438295	1438300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790440
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28068	NC_014926	TCCC	2	8	1438367	1438374	0 %	25 %	0 %	75 %	319790440
28069	NC_014926	TCC	2	6	1438391	1438396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790440
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28072	NC_014926	CTT	2	6	1438483	1438488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790440
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28080	NC_014926	CT	3	6	1438733	1438738	0 %	50 %	0 %	50 %	319790440
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28083	NC_014926	CT	3	6	1438784	1438789	0 %	50 %	0 %	50 %	319790440
28084	NC_014926	GA	3	6	1438826	1438831	50 %	0 %	50 %	0 %	319790440
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28088	NC_014926	CTCCCT	2	12	1439017	1439028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790440
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28100	NC_014926	GAG	2	6	1439537	1439542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790441
28101	NC_014926	TCCCT	2	10	1439547	1439556	0 %	40 %	0 %	60 %	319790441
28102	NC_014926	CT	3	6	1439555	1439560	0 %	50 %	0 %	50 %	319790441
28103	NC_014926	CTT	2	6	1439609	1439614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790441
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28109	NC_014926	CTCC	2	8	1439810	1439817	0 %	25 %	0 %	75 %	319790441
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28112	NC_014926	GTT	2	6	1439954	1439959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790441
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28115	NC_014926	CGT	2	6	1440107	1440112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790442
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28117	NC_014926	CTC	2	6	1440150	1440155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790442
28118	NC_014926	GTA	2	6	1440180	1440185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790442
28119	NC_014926	TC	3	6	1440191	1440196	0 %	50 %	0 %	50 %	319790442
28120	NC_014926	CTT	2	6	1440198	1440203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790442
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28122	NC_014926	TCT	2	6	1440308	1440313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790442
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28126	NC_014926	AGGG	2	8	1440434	1440441	25 %	0 %	75 %	0 %	319790442
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28129	NC_014926	TGGG	2	8	1440565	1440572	0 %	25 %	75 %	0 %	319790442
28130	NC_014926	TCC	2	6	1440580	1440585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790442
28131	NC_014926	CTG	2	6	1440601	1440606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790442
28132	NC_014926	CCT	2	6	1440611	1440616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790442
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28137	NC_014926	GGC	2	6	1440716	1440721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790443
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28144	NC_014926	ACA	2	6	1440993	1440998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790443
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28147	NC_014926	CCT	2	6	1441126	1441131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790443
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28149	NC_014926	A	7	7	1441178	1441184	100 %	0 %	0 %	0 %	319790443
28150	NC_014926	TCT	2	6	1441408	1441413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790443
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28185	NC_014926	TCT	2	6	1442536	1442541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790446
28186	NC_014926	TA	3	6	1442692	1442697	50 %	50 %	0 %	0 %	319790446
28187	NC_014926	G	6	6	1442777	1442782	0 %	0 %	100 %	0 %	319790446
28188	NC_014926	TG	3	6	1442829	1442834	0 %	50 %	50 %	0 %	319790446
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28192	NC_014926	TGTT	2	8	1443068	1443075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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28221	NC_014926	CTA	2	6	1444779	1444784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790449
28222	NC_014926	CCTCTC	2	12	1444798	1444809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790449
28223	NC_014926	AAG	2	6	1444864	1444869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790449
28224	NC_014926	ATCT	2	8	1445029	1445036	25 %	50 %	0 %	25 %	319790449
28225	NC_014926	CCT	2	6	1445112	1445117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790450
28226	NC_014926	TTG	2	6	1445195	1445200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790450
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28229	NC_014926	AGT	2	6	1445265	1445270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790450
28230	NC_014926	AG	3	6	1445289	1445294	50 %	0 %	50 %	0 %	319790450
28231	NC_014926	CTG	2	6	1445323	1445328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790450
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28233	NC_014926	GCT	2	6	1445346	1445351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790450
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28495	NC_014926	TAG	2	6	1458141	1458146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790463
28496	NC_014926	ATC	2	6	1458198	1458203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790463
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28498	NC_014926	CTC	2	6	1458269	1458274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28499	NC_014926	TTC	2	6	1458345	1458350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790464
28500	NC_014926	ATC	2	6	1458351	1458356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790464

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