MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 chromosome

Total Repeats: 32906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_014926	CAA	2	6	1410666	1410671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790410
27502	NC_014926	AG	3	6	1410691	1410696	50 %	0 %	50 %	0 %	319790410
27503	NC_014926	CGC	3	9	1410740	1410748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790410
27504	NC_014926	CCG	2	6	1410786	1410791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790410
27505	NC_014926	ACA	2	6	1410855	1410860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790411
27506	NC_014926	AG	3	6	1410875	1410880	50 %	0 %	50 %	0 %	319790411
27507	NC_014926	AGGGCA	2	12	1410957	1410968	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319790411
27508	NC_014926	GGTT	2	8	1410970	1410977	0 %	50 %	50 %	0 %	319790411
27509	NC_014926	CAG	2	6	1410989	1410994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790411
27510	NC_014926	CCT	2	6	1411039	1411044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790411
27511	NC_014926	GAA	2	6	1411151	1411156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790411
27512	NC_014926	AAC	2	6	1411229	1411234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790411
27513	NC_014926	CGG	2	6	1411264	1411269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790411
27514	NC_014926	AGA	2	6	1411288	1411293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790411
27515	NC_014926	AAC	2	6	1411298	1411303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790411
27516	NC_014926	GAG	2	6	1411488	1411493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790411
27517	NC_014926	AAAC	2	8	1411504	1411511	75 %	0 %	0 %	25 %	319790411
27518	NC_014926	GAG	2	6	1411530	1411535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790411
27519	NC_014926	CTCA	2	8	1411550	1411557	25 %	25 %	0 %	50 %	319790411
27520	NC_014926	CCG	2	6	1411625	1411630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790412
27521	NC_014926	CAA	2	6	1411644	1411649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790412
27522	NC_014926	GGC	2	6	1411651	1411656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790412
27523	NC_014926	GGC	2	6	1411702	1411707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790412
27524	NC_014926	A	7	7	1411735	1411741	100 %	0 %	0 %	0 %	319790412
27525	NC_014926	CAAC	2	8	1411764	1411771	50 %	0 %	0 %	50 %	319790412
27526	NC_014926	CTGC	2	8	1411789	1411796	0 %	25 %	25 %	50 %	319790412
27527	NC_014926	TTA	2	6	1411847	1411852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319790413
27528	NC_014926	GCC	2	6	1411863	1411868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790413
27529	NC_014926	CAT	2	6	1411908	1411913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790413
27530	NC_014926	ATC	3	9	1411921	1411929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790413
27531	NC_014926	CAA	2	6	1411955	1411960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790413
27532	NC_014926	CCT	2	6	1412063	1412068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790413
27533	NC_014926	TCC	2	6	1412116	1412121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790413
27534	NC_014926	TCT	2	6	1412231	1412236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790413
27535	NC_014926	AAG	2	6	1412257	1412262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790413
27536	NC_014926	ACT	2	6	1412287	1412292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790413
27537	NC_014926	GGA	2	6	1412299	1412304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790413
27538	NC_014926	GCG	2	6	1412309	1412314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790413
27539	NC_014926	AAC	2	6	1412391	1412396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790413
27540	NC_014926	AAG	2	6	1412400	1412405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790413
27541	NC_014926	AG	3	6	1412498	1412503	50 %	0 %	50 %	0 %	319790413
27542	NC_014926	ACC	2	6	1412518	1412523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790413
27543	NC_014926	AGG	2	6	1412606	1412611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27544	NC_014926	CAG	2	6	1412704	1412709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27545	NC_014926	CTC	2	6	1412764	1412769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27546	NC_014926	CAAC	2	8	1412782	1412789	50 %	0 %	0 %	50 %	319790414
27547	NC_014926	GTC	2	6	1412867	1412872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790414
27548	NC_014926	CTT	2	6	1412876	1412881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790414
27549	NC_014926	CTTCAA	2	12	1412906	1412917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790414
27550	NC_014926	CAA	2	6	1412947	1412952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790414
27551	NC_014926	GAT	2	6	1413038	1413043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790415
27552	NC_014926	CGC	2	6	1413070	1413075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790415
27553	NC_014926	TCC	2	6	1413111	1413116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790415
27554	NC_014926	CTT	2	6	1413158	1413163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790415
27555	NC_014926	AGG	2	6	1413168	1413173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790415
27556	NC_014926	AGT	2	6	1413176	1413181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790415
27557	NC_014926	CCT	2	6	1413217	1413222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790415
27558	NC_014926	AAC	2	6	1413299	1413304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790415
27559	NC_014926	TAT	2	6	1413359	1413364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319790415
27560	NC_014926	CTT	2	6	1413395	1413400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790415
27561	NC_014926	GGC	2	6	1413422	1413427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790415
27562	NC_014926	CCG	2	6	1413429	1413434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790415
27563	NC_014926	AGG	2	6	1413447	1413452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790415
27564	NC_014926	AGA	2	6	1413453	1413458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790415
27565	NC_014926	ATG	2	6	1413468	1413473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790415
27566	NC_014926	CTT	3	9	1413476	1413484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790415
27567	NC_014926	CCT	2	6	1413486	1413491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790415
27568	NC_014926	CTT	2	6	1413494	1413499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790415
27569	NC_014926	CTC	2	6	1413500	1413505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790415
27570	NC_014926	GAA	2	6	1413576	1413581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790416
27571	NC_014926	GTC	2	6	1413586	1413591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790416
27572	NC_014926	GGT	2	6	1413592	1413597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790416
27573	NC_014926	ACGA	2	8	1413775	1413782	50 %	0 %	25 %	25 %	319790416
27574	NC_014926	GGCG	2	8	1413816	1413823	0 %	0 %	75 %	25 %	319790416
27575	NC_014926	GTAG	2	8	1413847	1413854	25 %	25 %	50 %	0 %	319790416
27576	NC_014926	TAA	2	6	1413858	1413863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790416
27577	NC_014926	CTG	2	6	1413916	1413921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790416
27578	NC_014926	AGA	2	6	1413927	1413932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790416
27579	NC_014926	AGA	2	6	1414090	1414095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790416
27580	NC_014926	TCA	2	6	1414169	1414174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790416
27581	NC_014926	GCCGTC	3	18	1414189	1414206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319790416
27582	NC_014926	TCG	2	6	1414211	1414216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790416
27583	NC_014926	CGG	2	6	1414270	1414275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790416
27584	NC_014926	ACA	2	6	1414358	1414363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790416
27585	NC_014926	GTA	2	6	1414399	1414404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790416
27586	NC_014926	GTTACC	2	12	1414405	1414416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319790416
27587	NC_014926	TATC	2	8	1414473	1414480	25 %	50 %	0 %	25 %	319790416
27588	NC_014926	AGT	2	6	1414488	1414493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790416
27589	NC_014926	CTC	2	6	1414621	1414626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790416
27590	NC_014926	TTC	2	6	1414637	1414642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790416
27591	NC_014926	ATC	2	6	1414708	1414713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790416
27592	NC_014926	GTA	2	6	1414795	1414800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790416
27593	NC_014926	GAA	2	6	1414828	1414833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790416
27594	NC_014926	TTG	2	6	1414865	1414870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790416
27595	NC_014926	CTC	2	6	1414923	1414928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790416
27596	NC_014926	GTG	2	6	1414967	1414972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790416
27597	NC_014926	TGT	2	6	1415043	1415048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790416
27598	NC_014926	CCT	2	6	1415125	1415130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790417
27599	NC_014926	GAT	2	6	1415136	1415141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790417
27600	NC_014926	TCA	2	6	1415143	1415148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790417
27601	NC_014926	CGG	2	6	1415165	1415170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790417
27602	NC_014926	CGT	2	6	1415189	1415194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790417
27603	NC_014926	AAC	2	6	1415202	1415207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790417
27604	NC_014926	CGTAA	2	10	1415271	1415280	40 %	20 %	20 %	20 %	319790417
27605	NC_014926	GTA	2	6	1415286	1415291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790417
27606	NC_014926	AG	3	6	1415340	1415345	50 %	0 %	50 %	0 %	319790417
27607	NC_014926	CAA	2	6	1415366	1415371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790417
27608	NC_014926	GGAA	2	8	1415418	1415425	50 %	0 %	50 %	0 %	319790417
27609	NC_014926	GTC	2	6	1415604	1415609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790417
27610	NC_014926	AGG	2	6	1415665	1415670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790417
27611	NC_014926	CTC	2	6	1415788	1415793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790418
27612	NC_014926	GCT	2	6	1415820	1415825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790418
27613	NC_014926	AGTA	2	8	1416007	1416014	50 %	25 %	25 %	0 %	319790418
27614	NC_014926	G	6	6	1416033	1416038	0 %	0 %	100 %	0 %	319790418
27615	NC_014926	CTG	2	6	1416044	1416049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790418
27616	NC_014926	CGG	2	6	1416135	1416140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790418
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27733	NC_014926	GTA	2	6	1422105	1422110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790424
27734	NC_014926	CTG	2	6	1422177	1422182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790424
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