MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 chromosome

Total Repeats: 32906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_014926	GTT	2	6	1283997	1284002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790279
25002	NC_014926	TTC	2	6	1284025	1284030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790279
25003	NC_014926	CCT	2	6	1284148	1284153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790280
25004	NC_014926	GA	3	6	1284223	1284228	50 %	0 %	50 %	0 %	319790280
25005	NC_014926	CAG	2	6	1284244	1284249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790280
25006	NC_014926	CTC	2	6	1284290	1284295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790280
25007	NC_014926	AG	4	8	1284318	1284325	50 %	0 %	50 %	0 %	319790280
25008	NC_014926	CTC	2	6	1284333	1284338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790280
25009	NC_014926	GA	3	6	1284346	1284351	50 %	0 %	50 %	0 %	319790280
25010	NC_014926	GCT	2	6	1284463	1284468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790280
25011	NC_014926	TC	3	6	1284478	1284483	0 %	50 %	0 %	50 %	319790280
25012	NC_014926	AAC	2	6	1284527	1284532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790280
25013	NC_014926	GCTC	2	8	1284563	1284570	0 %	25 %	25 %	50 %	319790280
25014	NC_014926	CTCAAC	2	12	1284593	1284604	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319790280
25015	NC_014926	GGA	2	6	1284646	1284651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790280
25016	NC_014926	ACA	3	9	1284765	1284773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790280
25017	NC_014926	CGT	2	6	1284775	1284780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790280
25018	NC_014926	CTTC	2	8	1284784	1284791	0 %	50 %	0 %	50 %	319790280
25019	NC_014926	CCT	2	6	1284794	1284799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790280
25020	NC_014926	GTAG	2	8	1284823	1284830	25 %	25 %	50 %	0 %	319790280
25021	NC_014926	GCC	2	6	1284888	1284893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790280
25022	NC_014926	AG	3	6	1284903	1284908	50 %	0 %	50 %	0 %	319790280
25023	NC_014926	CAA	2	6	1284936	1284941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790281
25024	NC_014926	AGT	2	6	1284990	1284995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790281
25025	NC_014926	ATA	2	6	1285013	1285018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790281
25026	NC_014926	AAAC	2	8	1285131	1285138	75 %	0 %	0 %	25 %	319790281
25027	NC_014926	AGG	2	6	1285160	1285165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790281
25028	NC_014926	AGT	2	6	1285167	1285172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790281
25029	NC_014926	AG	3	6	1285214	1285219	50 %	0 %	50 %	0 %	319790281
25030	NC_014926	GA	3	6	1285220	1285225	50 %	0 %	50 %	0 %	319790281
25031	NC_014926	CAA	2	6	1285249	1285254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790281
25032	NC_014926	AGA	3	9	1285281	1285289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790281
25033	NC_014926	CCGG	2	8	1285349	1285356	0 %	0 %	50 %	50 %	319790281
25034	NC_014926	TTA	2	6	1285449	1285454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319790281
25035	NC_014926	G	6	6	1285503	1285508	0 %	0 %	100 %	0 %	319790281
25036	NC_014926	CTG	2	6	1285519	1285524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790281
25037	NC_014926	TAG	2	6	1285613	1285618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790281
25038	NC_014926	AGG	2	6	1285692	1285697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790281
25039	NC_014926	CAG	2	6	1285705	1285710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790281
25040	NC_014926	ATC	2	6	1285721	1285726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790281
25041	NC_014926	TC	3	6	1285725	1285730	0 %	50 %	0 %	50 %	319790281
25042	NC_014926	TCT	2	6	1285766	1285771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790282
25043	NC_014926	CTC	2	6	1285815	1285820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790282
25044	NC_014926	CTC	2	6	1285842	1285847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790282
25045	NC_014926	AAG	2	6	1285878	1285883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790282
25046	NC_014926	CTT	2	6	1285884	1285889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790282
25047	NC_014926	A	6	6	1285947	1285952	100 %	0 %	0 %	0 %	319790282
25048	NC_014926	CAA	2	6	1286015	1286020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790282
25049	NC_014926	CCT	2	6	1286069	1286074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790283
25050	NC_014926	CTG	2	6	1286138	1286143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790283
25051	NC_014926	GAG	2	6	1286245	1286250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790283
25052	NC_014926	CAA	2	6	1286265	1286270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790283
25053	NC_014926	TCA	2	6	1286288	1286293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790283
25054	NC_014926	CTT	2	6	1286353	1286358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790283
25055	NC_014926	GAG	2	6	1286404	1286409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790283
25056	NC_014926	C	6	6	1286426	1286431	0 %	0 %	0 %	100 %	319790283
25057	NC_014926	CTT	2	6	1286452	1286457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790283
25058	NC_014926	CGC	2	6	1286458	1286463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790283
25059	NC_014926	AGG	2	6	1286508	1286513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790283
25060	NC_014926	CTG	2	6	1286534	1286539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790283
25061	NC_014926	CTC	2	6	1286545	1286550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790283
25062	NC_014926	AAC	2	6	1286743	1286748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790283
25063	NC_014926	CGG	2	6	1286817	1286822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790283
25064	NC_014926	CCT	2	6	1286866	1286871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790283
25065	NC_014926	AG	3	6	1286905	1286910	50 %	0 %	50 %	0 %	319790283
25066	NC_014926	CCCG	2	8	1287003	1287010	0 %	0 %	25 %	75 %	319790283
25067	NC_014926	CCTC	2	8	1287012	1287019	0 %	25 %	0 %	75 %	319790283
25068	NC_014926	CGG	2	6	1287202	1287207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790284
25069	NC_014926	AAAG	2	8	1287215	1287222	75 %	0 %	25 %	0 %	319790284
25070	NC_014926	CCG	2	6	1287245	1287250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790284
25071	NC_014926	CCT	2	6	1287370	1287375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790284
25072	NC_014926	GCA	2	6	1287412	1287417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790284
25073	NC_014926	CAA	2	6	1287505	1287510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790284
25074	NC_014926	GGT	2	6	1287557	1287562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790284
25075	NC_014926	CAGCTC	2	12	1287668	1287679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319790284
25076	NC_014926	CTC	2	6	1287689	1287694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790284
25077	NC_014926	CCT	2	6	1287728	1287733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790284
25078	NC_014926	CCG	2	6	1287765	1287770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790284
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25080	NC_014926	CCGCT	2	10	1287897	1287906	0 %	20 %	20 %	60 %	319790284
25081	NC_014926	CAG	2	6	1287965	1287970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790284
25082	NC_014926	AAC	2	6	1287998	1288003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790284
25083	NC_014926	C	6	6	1288008	1288013	0 %	0 %	0 %	100 %	319790284
25084	NC_014926	CCG	2	6	1288017	1288022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790284
25085	NC_014926	GCC	2	6	1288037	1288042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790284
25086	NC_014926	CCT	2	6	1288061	1288066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790284
25087	NC_014926	AC	3	6	1288074	1288079	50 %	0 %	0 %	50 %	319790284
25088	NC_014926	CTAT	2	8	1288119	1288126	25 %	50 %	0 %	25 %	319790284
25089	NC_014926	TCC	2	6	1288143	1288148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25090	NC_014926	GAA	2	6	1288211	1288216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790285
25091	NC_014926	CTG	2	6	1288230	1288235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790285
25092	NC_014926	CTG	2	6	1288242	1288247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790285
25093	NC_014926	GCT	2	6	1288250	1288255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790285
25094	NC_014926	AG	3	6	1288427	1288432	50 %	0 %	50 %	0 %	319790285
25095	NC_014926	CCG	2	6	1288468	1288473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790285
25096	NC_014926	GAA	2	6	1288529	1288534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790285
25097	NC_014926	CAA	2	6	1288547	1288552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790285
25098	NC_014926	TAA	2	6	1288558	1288563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790285
25099	NC_014926	A	6	6	1288659	1288664	100 %	0 %	0 %	0 %	319790285
25100	NC_014926	GGA	2	6	1288712	1288717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25101	NC_014926	CTT	3	9	1288763	1288771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790286
25102	NC_014926	AGG	2	6	1288804	1288809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790286
25103	NC_014926	GGA	2	6	1288835	1288840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790286
25104	NC_014926	CAA	2	6	1288898	1288903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790286
25105	NC_014926	ACT	3	9	1288942	1288950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790286
25106	NC_014926	CGA	2	6	1288952	1288957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790286
25107	NC_014926	TTCGG	2	10	1289096	1289105	0 %	40 %	40 %	20 %	319790287
25108	NC_014926	TCC	2	6	1289117	1289122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790287
25109	NC_014926	GCG	2	6	1289180	1289185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790287
25110	NC_014926	CTG	3	9	1289197	1289205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790287
25111	NC_014926	GGTA	2	8	1289229	1289236	25 %	25 %	50 %	0 %	319790287
25112	NC_014926	CTC	2	6	1289355	1289360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790287
25113	NC_014926	CCCT	2	8	1289382	1289389	0 %	25 %	0 %	75 %	319790287
25114	NC_014926	CTCAAC	2	12	1289409	1289420	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319790287
25115	NC_014926	GAG	2	6	1289421	1289426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790287
25116	NC_014926	GGA	2	6	1289469	1289474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790287
25117	NC_014926	GGC	2	6	1289484	1289489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790287
25118	NC_014926	TCC	3	9	1289522	1289530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790287
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25233	NC_014926	TAA	2	6	1294922	1294927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25352	NC_014926	TG	3	6	1301498	1301503	0 %	50 %	50 %	0 %	319790301
25353	NC_014926	GAG	2	6	1301545	1301550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790301
25354	NC_014926	CGA	2	6	1301598	1301603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790301
25355	NC_014926	GA	3	6	1301606	1301611	50 %	0 %	50 %	0 %	319790301
25356	NC_014926	CT	3	6	1301701	1301706	0 %	50 %	0 %	50 %	319790301
25357	NC_014926	CTG	2	6	1301743	1301748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790301
25358	NC_014926	GCC	2	6	1301763	1301768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790301
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25362	NC_014926	GCCC	2	8	1301981	1301988	0 %	0 %	25 %	75 %	319790301
25363	NC_014926	TGG	2	6	1302092	1302097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790301
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25371	NC_014926	TCT	2	6	1302467	1302472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790302
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25373	NC_014926	ATC	2	6	1302481	1302486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790302
25374	NC_014926	TTC	2	6	1302487	1302492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790302
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25387	NC_014926	CTG	2	6	1303313	1303318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790303
25388	NC_014926	CTA	2	6	1303413	1303418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790303
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25408	NC_014926	GTA	2	6	1304670	1304675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790304
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25416	NC_014926	AG	3	6	1305010	1305015	50 %	0 %	50 %	0 %	319790305
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25423	NC_014926	CGG	2	6	1305168	1305173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790305
25424	NC_014926	C	6	6	1305207	1305212	0 %	0 %	0 %	100 %	319790305
25425	NC_014926	GCT	3	9	1305259	1305267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790305
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25432	NC_014926	TCCC	2	8	1305606	1305613	0 %	25 %	0 %	75 %	319790306
25433	NC_014926	CTT	2	6	1305627	1305632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790306
25434	NC_014926	GAG	2	6	1305775	1305780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790306
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25439	NC_014926	GGA	2	6	1305960	1305965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790306
25440	NC_014926	GA	3	6	1305971	1305976	50 %	0 %	50 %	0 %	319790306
25441	NC_014926	CAA	2	6	1305992	1305997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790306
25442	NC_014926	CCTC	2	8	1306001	1306008	0 %	25 %	0 %	75 %	319790306
25443	NC_014926	A	6	6	1306102	1306107	100 %	0 %	0 %	0 %	319790306
25444	NC_014926	CCT	2	6	1306130	1306135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790306
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25446	NC_014926	AGC	2	6	1306185	1306190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790307
25447	NC_014926	CCT	2	6	1306213	1306218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790307
25448	NC_014926	CTT	2	6	1306262	1306267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790307
25449	NC_014926	CTG	2	6	1306362	1306367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790307
25450	NC_014926	AGG	2	6	1306478	1306483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25451	NC_014926	GCG	2	6	1306488	1306493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25452	NC_014926	GGAG	2	8	1306498	1306505	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25453	NC_014926	A	7	7	1306512	1306518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25454	NC_014926	AAG	2	6	1306544	1306549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790308
25455	NC_014926	CTT	2	6	1306556	1306561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790308
25456	NC_014926	CTC	2	6	1306571	1306576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790308
25457	NC_014926	GTC	2	6	1306601	1306606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790308
25458	NC_014926	CCG	2	6	1306623	1306628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790308
25459	NC_014926	CCT	2	6	1306642	1306647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790308
25460	NC_014926	AAG	2	6	1306652	1306657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790308
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25464	NC_014926	ATA	2	6	1306839	1306844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790308
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25466	NC_014926	GGA	2	6	1306884	1306889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790308
25467	NC_014926	GGCC	2	8	1306960	1306967	0 %	0 %	50 %	50 %	319790308
25468	NC_014926	TAA	2	6	1307122	1307127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790308
25469	NC_014926	AGC	2	6	1307133	1307138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790308
25470	NC_014926	CCT	2	6	1307233	1307238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790308
25471	NC_014926	TAA	2	6	1307269	1307274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319790308
25472	NC_014926	AG	3	6	1307447	1307452	50 %	0 %	50 %	0 %	319790308
25473	NC_014926	CAT	2	6	1307519	1307524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790308
25474	NC_014926	CCTC	2	8	1307575	1307582	0 %	25 %	0 %	75 %	319790308
25475	NC_014926	CTG	2	6	1307588	1307593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790308
25476	NC_014926	GAGC	2	8	1307608	1307615	25 %	0 %	50 %	25 %	319790308
25477	NC_014926	TGG	2	6	1307706	1307711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790308
25478	NC_014926	AG	3	6	1307728	1307733	50 %	0 %	50 %	0 %	319790308
25479	NC_014926	ATC	2	6	1307742	1307747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790308
25480	NC_014926	CCT	2	6	1307908	1307913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790308
25481	NC_014926	GA	3	6	1307962	1307967	50 %	0 %	50 %	0 %	319790308
25482	NC_014926	CTT	2	6	1308002	1308007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790308
25483	NC_014926	AGC	2	6	1308119	1308124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790308
25484	NC_014926	GGC	2	6	1308146	1308151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790308
25485	NC_014926	TGA	2	6	1308169	1308174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790308
25486	NC_014926	CCTT	2	8	1308279	1308286	0 %	50 %	0 %	50 %	319790308
25487	NC_014926	CCT	2	6	1308349	1308354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790308
25488	NC_014926	TCC	2	6	1308447	1308452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790308
25489	NC_014926	CCT	2	6	1308496	1308501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25490	NC_014926	GAT	2	6	1308565	1308570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25491	NC_014926	AGT	2	6	1308600	1308605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25492	NC_014926	AGG	2	6	1308659	1308664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25493	NC_014926	TTA	2	6	1308720	1308725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319790309
25494	NC_014926	AGGGGA	2	12	1308818	1308829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790309
25495	NC_014926	GAG	3	9	1309025	1309033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790309
25496	NC_014926	GT	3	6	1309087	1309092	0 %	50 %	50 %	0 %	319790310
25497	NC_014926	CTC	2	6	1309111	1309116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790310
25498	NC_014926	GAG	2	6	1309135	1309140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790310
25499	NC_014926	A	7	7	1309237	1309243	100 %	0 %	0 %	0 %	319790310
25500	NC_014926	T	6	6	1309322	1309327	0 %	100 %	0 %	0 %	319790310

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