MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 chromosome

Total Repeats: 32906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014926	ATA	2	6	234599	234604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319789229
4502	NC_014926	TCT	2	6	234624	234629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789229
4503	NC_014926	AGAGG	2	10	234835	234844	40 %	0 %	60 %	0 %	319789229
4504	NC_014926	GCG	2	6	234882	234887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789229
4505	NC_014926	TTG	2	6	234888	234893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789229
4506	NC_014926	GCG	2	6	234963	234968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789229
4507	NC_014926	CGGG	2	8	234998	235005	0 %	0 %	75 %	25 %	319789229
4508	NC_014926	TCT	3	9	235026	235034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789229
4509	NC_014926	GTT	2	6	235049	235054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789229
4510	NC_014926	TTC	2	6	235082	235087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789229
4511	NC_014926	ACA	2	6	235117	235122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319789229
4512	NC_014926	CGG	2	6	235132	235137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789229
4513	NC_014926	CGG	2	6	235159	235164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789229
4514	NC_014926	TTG	2	6	235167	235172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789229
4515	NC_014926	TGC	2	6	235186	235191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319789229
4516	NC_014926	TCC	2	6	235282	235287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789230
4517	NC_014926	CAA	2	6	235309	235314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319789230
4518	NC_014926	CT	3	6	235405	235410	0 %	50 %	0 %	50 %	319789230
4519	NC_014926	AGG	2	6	235455	235460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789230
4520	NC_014926	AG	3	6	235538	235543	50 %	0 %	50 %	0 %	319789230
4521	NC_014926	TTG	2	6	235546	235551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789230
4522	NC_014926	GTC	2	6	235607	235612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319789230
4523	NC_014926	CGT	2	6	235624	235629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319789230
4524	NC_014926	CCT	2	6	235660	235665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789230
4525	NC_014926	TC	3	6	235704	235709	0 %	50 %	0 %	50 %	319789230
4526	NC_014926	AGG	2	6	235734	235739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789230
4527	NC_014926	CT	3	6	235794	235799	0 %	50 %	0 %	50 %	319789230
4528	NC_014926	GAG	2	6	235803	235808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789230
4529	NC_014926	AAG	2	6	235809	235814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789230
4530	NC_014926	AGA	2	6	235846	235851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789230
4531	NC_014926	GCT	2	6	235904	235909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319789230
4532	NC_014926	T	6	6	235984	235989	0 %	100 %	0 %	0 %	319789230
4533	NC_014926	AGG	2	6	236019	236024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789230
4534	NC_014926	AAG	2	6	236114	236119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789230
4535	NC_014926	TCC	2	6	236178	236183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789230
4536	NC_014926	T	6	6	236211	236216	0 %	100 %	0 %	0 %	319789230
4537	NC_014926	CTT	3	9	236275	236283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789230
4538	NC_014926	TC	3	6	236396	236401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_014926	ACC	2	6	236481	236486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319789231
4540	NC_014926	AGC	2	6	236551	236556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789231
4541	NC_014926	CCG	2	6	236608	236613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319789231
4542	NC_014926	AGG	2	6	236719	236724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789231
4543	NC_014926	AGGGC	2	10	236854	236863	20 %	0 %	60 %	20 %	319789231
4544	NC_014926	CGA	2	6	236993	236998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789231
4545	NC_014926	ATAG	2	8	237042	237049	50 %	25 %	25 %	0 %	319789231
4546	NC_014926	GTT	2	6	237192	237197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789231
4547	NC_014926	CAG	2	6	237281	237286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789231
4548	NC_014926	CCT	2	6	237296	237301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789231
4549	NC_014926	GCC	2	6	237460	237465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319789231
4550	NC_014926	C	6	6	237507	237512	0 %	0 %	0 %	100 %	319789231
4551	NC_014926	CGA	2	6	237521	237526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789231
4552	NC_014926	GAA	2	6	237560	237565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789231
4553	NC_014926	GA	3	6	237619	237624	50 %	0 %	50 %	0 %	319789231
4554	NC_014926	GCG	2	6	237658	237663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789231
4555	NC_014926	GAG	2	6	237789	237794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789231
4556	NC_014926	AG	3	6	237869	237874	50 %	0 %	50 %	0 %	319789231
4557	NC_014926	AGG	2	6	237969	237974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789231
4558	NC_014926	TTC	2	6	238023	238028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_014926	TAT	2	6	238074	238079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014926	ATT	2	6	238101	238106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014926	T	6	6	238116	238121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014926	AGG	2	6	238136	238141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_014926	GC	3	6	238151	238156	0 %	0 %	50 %	50 %	319789232
4564	NC_014926	CT	3	6	238243	238248	0 %	50 %	0 %	50 %	319789232
4565	NC_014926	CT	3	6	238261	238266	0 %	50 %	0 %	50 %	319789232
4566	NC_014926	AGC	2	6	238301	238306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789232
4567	NC_014926	CTT	2	6	238332	238337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789232
4568	NC_014926	CTT	2	6	238362	238367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789232
4569	NC_014926	GTT	2	6	238378	238383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789232
4570	NC_014926	TCC	2	6	238396	238401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789232
4571	NC_014926	AAG	2	6	238411	238416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789232
4572	NC_014926	TAG	2	6	238481	238486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319789232
4573	NC_014926	CTCC	2	8	238512	238519	0 %	25 %	0 %	75 %	319789232
4574	NC_014926	CTC	2	6	238555	238560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789232
4575	NC_014926	CCTT	2	8	238581	238588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_014926	ACA	2	6	238628	238633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_014926	AGG	2	6	238636	238641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_014926	AGT	2	6	238642	238647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014926	AAG	2	6	238687	238692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789233
4580	NC_014926	AG	3	6	238736	238741	50 %	0 %	50 %	0 %	319789233
4581	NC_014926	AAG	2	6	238774	238779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789233
4582	NC_014926	CGC	2	6	238956	238961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319789233
4583	NC_014926	AGA	2	6	238975	238980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789233
4584	NC_014926	AAT	2	6	239024	239029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319789233
4585	NC_014926	CCA	2	6	239066	239071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319789234
4586	NC_014926	TCA	2	6	239121	239126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789234
4587	NC_014926	TGA	2	6	239133	239138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319789234
4588	NC_014926	AAG	2	6	239147	239152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789234
4589	NC_014926	CAT	2	6	239188	239193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789234
4590	NC_014926	GTCC	2	8	239267	239274	0 %	25 %	25 %	50 %	319789234
4591	NC_014926	GGT	2	6	239285	239290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319789234
4592	NC_014926	GAG	2	6	239323	239328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789234
4593	NC_014926	GCG	2	6	239439	239444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789234
4594	NC_014926	AAG	3	9	239450	239458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789234
4595	NC_014926	CAA	2	6	239485	239490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319789234
4596	NC_014926	GGT	2	6	239508	239513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319789234
4597	NC_014926	GGA	2	6	239528	239533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014926	AGCA	2	8	239542	239549	50 %	0 %	25 %	25 %	319789235
4599	NC_014926	ACC	2	6	239638	239643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319789235
4600	NC_014926	TAC	2	6	239656	239661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789235
4601	NC_014926	TGGA	2	8	239716	239723	25 %	25 %	50 %	0 %	319789235
4602	NC_014926	AGGAGA	2	12	239726	239737	50 %	0 %	50 %	0 %	319789235
4603	NC_014926	ATTACC	2	12	239743	239754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789235
4604	NC_014926	ACC	2	6	239764	239769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319789235
4605	NC_014926	GGC	2	6	239890	239895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319789235
4606	NC_014926	AAACCG	2	12	239906	239917	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319789235
4607	NC_014926	ATC	2	6	239953	239958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789235
4608	NC_014926	CTT	2	6	239991	239996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789235
4609	NC_014926	CCCGTT	2	12	240037	240048	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319789235
4610	NC_014926	GAG	3	9	240121	240129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789235
4611	NC_014926	GAC	2	6	240166	240171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319789235
4612	NC_014926	ATG	2	6	240241	240246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319789235
4613	NC_014926	GCC	2	6	240289	240294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319789235
4614	NC_014926	TTC	2	6	240322	240327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319789235
4615	NC_014926	CCG	2	6	240418	240423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319789235
4616	NC_014926	GAG	2	6	240451	240456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789235
4617	NC_014926	AG	3	6	240459	240464	50 %	0 %	50 %	0 %	319789235
4618	NC_014926	TCC	2	6	240626	240631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789235
4619	NC_014926	GAG	2	6	240652	240657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789235
4620	NC_014926	GCC	2	6	240688	240693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319789235
4621	NC_014926	CCT	2	6	240866	240871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789235
4622	NC_014926	ATC	2	6	240907	240912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789235
4623	NC_014926	ATC	2	6	240940	240945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789235
4624	NC_014926	TCA	2	6	241049	241054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319789235
4625	NC_014926	GGT	2	6	241063	241068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319789235
4626	NC_014926	GTT	2	6	241219	241224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319789235
4627	NC_014926	CTC	2	6	241287	241292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319789235
4628	NC_014926	GAAGTT	2	12	241378	241389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319789235
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4633	NC_014926	T	6	6	241665	241670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_014926	ATA	2	6	241704	241709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4662	NC_014926	GAA	2	6	243331	243336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789238
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4736	NC_014926	GGGTAA	3	18	247407	247424	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319789245
4737	NC_014926	GAA	2	6	247561	247566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789245
4738	NC_014926	AGTA	2	8	247583	247590	50 %	25 %	25 %	0 %	319789245
4739	NC_014926	GAA	2	6	247593	247598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789246
4740	NC_014926	CAGA	2	8	247614	247621	50 %	0 %	25 %	25 %	319789246
4741	NC_014926	GAG	2	6	247630	247635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789246
4742	NC_014926	AAG	2	6	247639	247644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319789246
4743	NC_014926	AG	3	6	247768	247773	50 %	0 %	50 %	0 %	319789246
4744	NC_014926	GGA	2	6	247793	247798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_014926	GTAAG	2	10	247828	247837	40 %	20 %	40 %	0 %	319789247
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4992	NC_014926	GAG	2	6	260579	260584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319789271
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