MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 1664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014917	CAC	2	6	46690	46695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774909
1002	NC_014917	GAA	2	6	46796	46801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774909
1003	NC_014917	CT	3	6	46816	46821	0 %	50 %	0 %	50 %	319774909
1004	NC_014917	A	6	6	46897	46902	100 %	0 %	0 %	0 %	319774910
1005	NC_014917	AAGG	2	8	46917	46924	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
1006	NC_014917	TTTCC	2	10	47121	47130	0 %	60 %	0 %	40 %	319774910
1007	NC_014917	CAAGCT	2	12	47144	47155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319774910
1008	NC_014917	AGG	2	6	47167	47172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774910
1009	NC_014917	GAGG	2	8	47279	47286	25 %	0 %	75 %	0 %	319774910
1010	NC_014917	CGT	2	6	47321	47326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774910
1011	NC_014917	CTT	2	6	47333	47338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774910
1012	NC_014917	CTTCGT	2	12	47351	47362	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319774910
1013	NC_014917	AAC	2	6	47364	47369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774910
1014	NC_014917	AG	3	6	47432	47437	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
1015	NC_014917	AGA	2	6	47455	47460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774910
1016	NC_014917	AG	3	6	47535	47540	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
1017	NC_014917	CGC	2	6	47561	47566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774910
1018	NC_014917	GGA	2	6	47592	47597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774910
1019	NC_014917	CTA	2	6	47603	47608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774910
1020	NC_014917	AGGAAG	2	12	47620	47631	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
1021	NC_014917	GGC	2	6	47651	47656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774910
1022	NC_014917	CCGT	2	8	47666	47673	0 %	25 %	25 %	50 %	319774910
1023	NC_014917	CGT	2	6	47728	47733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774910
1024	NC_014917	TGA	2	6	47749	47754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774910
1025	NC_014917	CCG	2	6	47766	47771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774910
1026	NC_014917	G	6	6	47849	47854	0 %	0 %	100 %	0 %	319774910
1027	NC_014917	ACT	2	6	47869	47874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774910
1028	NC_014917	C	6	6	47937	47942	0 %	0 %	0 %	100 %	319774910
1029	NC_014917	GAAG	2	8	47960	47967	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
1030	NC_014917	AAAG	2	8	48002	48009	75 %	0 %	25 %	0 %	319774910
1031	NC_014917	ACA	2	6	48010	48015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774910
1032	NC_014917	AAGG	2	8	48053	48060	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
1033	NC_014917	GAG	2	6	48084	48089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774910
1034	NC_014917	GGC	3	9	48098	48106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774910
1035	NC_014917	GAG	2	6	48123	48128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774910
1036	NC_014917	GGA	2	6	48194	48199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774910
1037	NC_014917	AAGGT	2	10	48209	48218	40 %	20 %	40 %	0 %	319774910
1038	NC_014917	CTC	2	6	48275	48280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774911
1039	NC_014917	C	6	6	48406	48411	0 %	0 %	0 %	100 %	319774911
1040	NC_014917	GAG	2	6	48439	48444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774911
1041	NC_014917	GCTC	2	8	48519	48526	0 %	25 %	25 %	50 %	319774911
1042	NC_014917	AGCTGA	2	12	48533	48544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319774911
1043	NC_014917	CAGG	2	8	48567	48574	25 %	0 %	50 %	25 %	319774911
1044	NC_014917	CAC	2	6	48575	48580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774911
1045	NC_014917	CGG	2	6	48738	48743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774911
1046	NC_014917	GAAG	2	8	48770	48777	50 %	0 %	50 %	0 %	319774911
1047	NC_014917	ACG	2	6	48827	48832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774911
1048	NC_014917	ACG	2	6	48848	48853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774911
1049	NC_014917	AAG	2	6	48901	48906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774911
1050	NC_014917	GCC	2	6	48963	48968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774911
1051	NC_014917	CCG	2	6	48979	48984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774911
1052	NC_014917	CCG	2	6	48988	48993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774911
1053	NC_014917	AGG	3	9	49022	49030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774911
1054	NC_014917	CTG	2	6	49042	49047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774912
1055	NC_014917	GCC	2	6	49083	49088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774912
1056	NC_014917	CTA	3	9	49149	49157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774912
1057	NC_014917	TCA	2	6	49205	49210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774912
1058	NC_014917	CGG	2	6	49221	49226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774912
1059	NC_014917	GTC	2	6	49276	49281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774912
1060	NC_014917	CCG	2	6	49310	49315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774912
1061	NC_014917	CCA	2	6	49355	49360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774912
1062	NC_014917	CT	3	6	49429	49434	0 %	50 %	0 %	50 %	319774912
1063	NC_014917	AG	3	6	49480	49485	50 %	0 %	50 %	0 %	319774912
1064	NC_014917	GAA	2	6	49680	49685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774913
1065	NC_014917	GAA	2	6	49691	49696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774913
1066	NC_014917	CCGC	2	8	49770	49777	0 %	0 %	25 %	75 %	319774913
1067	NC_014917	CTG	2	6	49785	49790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774913
1068	NC_014917	CTC	2	6	49812	49817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774913
1069	NC_014917	AGA	2	6	49841	49846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774913
1070	NC_014917	GAA	2	6	49862	49867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774913
1071	NC_014917	CGG	2	6	49892	49897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774913
1072	NC_014917	TGG	2	6	49924	49929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774913
1073	NC_014917	GAG	2	6	50022	50027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774913
1074	NC_014917	TAA	2	6	50051	50056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774914
1075	NC_014917	CT	3	6	50079	50084	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
1076	NC_014917	CCT	2	6	50090	50095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774914
1077	NC_014917	GGA	2	6	50101	50106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774914
1078	NC_014917	GGT	2	6	50110	50115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774914
1079	NC_014917	CCA	2	6	50123	50128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774914
1080	NC_014917	CCA	3	9	50138	50146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774914
1081	NC_014917	TG	4	8	50241	50248	0 %	50 %	50 %	0 %	319774914
1082	NC_014917	GTA	2	6	50260	50265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774914
1083	NC_014917	CCG	2	6	50387	50392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774914
1084	NC_014917	GGA	2	6	50404	50409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774914
1085	NC_014917	CT	3	6	50437	50442	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
1086	NC_014917	AGACGG	2	12	50484	50495	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319774914
1087	NC_014917	AG	3	6	50547	50552	50 %	0 %	50 %	0 %	319774914
1088	NC_014917	GTC	2	6	50581	50586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774914
1089	NC_014917	GAC	2	6	50596	50601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774914
1090	NC_014917	GGCA	2	8	50655	50662	25 %	0 %	50 %	25 %	319774914
1091	NC_014917	CAC	2	6	50781	50786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774914
1092	NC_014917	TC	3	6	50801	50806	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
1093	NC_014917	TC	3	6	50811	50816	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
1094	NC_014917	ACC	2	6	50888	50893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774914
1095	NC_014917	ATC	2	6	50950	50955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774914
1096	NC_014917	TCCCAC	2	12	50985	50996	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	319774914
1097	NC_014917	ACT	2	6	51046	51051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774914
1098	NC_014917	TAG	2	6	51194	51199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774914
1099	NC_014917	GAA	2	6	51243	51248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774914
1100	NC_014917	CTA	2	6	51312	51317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774914
1101	NC_014917	TAC	2	6	51325	51330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774914
1102	NC_014917	TCC	2	6	51336	51341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774914
1103	NC_014917	GGT	2	6	51366	51371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774914
1104	NC_014917	AAT	2	6	51511	51516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774914
1105	NC_014917	T	6	6	51539	51544	0 %	100 %	0 %	0 %	319774914
1106	NC_014917	TAC	2	6	51625	51630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774914
1107	NC_014917	TTG	2	6	51707	51712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774914
1108	NC_014917	GCTTA	2	10	51746	51755	20 %	40 %	20 %	20 %	319774914
1109	NC_014917	CCTT	2	8	51787	51794	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
1110	NC_014917	CT	4	8	51931	51938	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
1111	NC_014917	ACT	2	6	51995	52000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774914
1112	NC_014917	GGCA	2	8	52076	52083	25 %	0 %	50 %	25 %	319774914
1113	NC_014917	A	8	8	52206	52213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014917	ACA	2	6	52235	52240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774915
1115	NC_014917	TTC	2	6	52273	52278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774915
1116	NC_014917	GAG	2	6	52291	52296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774915
1117	NC_014917	AAG	2	6	52349	52354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774915
1118	NC_014917	A	6	6	52384	52389	100 %	0 %	0 %	0 %	319774915
1119	NC_014917	CTC	2	6	52397	52402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774915
1120	NC_014917	GAG	2	6	52420	52425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774915
1121	NC_014917	CTC	2	6	52480	52485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_014917	ACG	2	6	52575	52580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014917	ACG	2	6	52638	52643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014917	AGC	2	6	52726	52731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014917	GCT	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774916
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1127	NC_014917	ATC	2	6	52777	52782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774916
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1377	NC_014917	AG	3	6	64138	64143	50 %	0 %	50 %	0 %	319774931
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1493	NC_014917	CCT	2	6	69335	69340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1494	NC_014917	AGGGT	2	10	69415	69424	20 %	20 %	60 %	0 %	319774941
1495	NC_014917	CT	3	6	69441	69446	0 %	50 %	0 %	50 %	319774941
1496	NC_014917	TAA	2	6	69474	69479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774941
1497	NC_014917	CT	5	10	69514	69523	0 %	50 %	0 %	50 %	319774941
1498	NC_014917	CCT	3	9	69539	69547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_014917	TGG	2	6	69681	69686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774942
1500	NC_014917	CCT	2	6	69718	69723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774942

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