MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 1664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014917	TTC	2	6	23727	23732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774879
502	NC_014917	CTA	2	6	23745	23750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774879
503	NC_014917	CTT	2	6	23751	23756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774879
504	NC_014917	CTCC	2	8	23759	23766	0 %	25 %	0 %	75 %	319774879
505	NC_014917	GCC	2	6	23777	23782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774879
506	NC_014917	CT	3	6	23805	23810	0 %	50 %	0 %	50 %	319774879
507	NC_014917	GTC	2	6	23848	23853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774879
508	NC_014917	GCG	2	6	23881	23886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774879
509	NC_014917	AGGC	2	8	23908	23915	25 %	0 %	50 %	25 %	319774879
510	NC_014917	AG	3	6	24044	24049	50 %	0 %	50 %	0 %	319774879
511	NC_014917	TCT	2	6	24064	24069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774879
512	NC_014917	CTT	2	6	24077	24082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774879
513	NC_014917	AGC	2	6	24191	24196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774880
514	NC_014917	ACA	2	6	24224	24229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774880
515	NC_014917	ACT	2	6	24231	24236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774880
516	NC_014917	GGT	2	6	24274	24279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774880
517	NC_014917	CAA	2	6	24283	24288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774880
518	NC_014917	GCT	2	6	24308	24313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774880
519	NC_014917	AAG	2	6	24422	24427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774880
520	NC_014917	AAG	2	6	24432	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774880
521	NC_014917	TGT	2	6	24481	24486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774880
522	NC_014917	CCT	2	6	24654	24659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774880
523	NC_014917	ACT	2	6	24660	24665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774880
524	NC_014917	CTA	2	6	24712	24717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774880
525	NC_014917	AGA	2	6	24741	24746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774880
526	NC_014917	ACG	2	6	24750	24755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774880
527	NC_014917	CGA	2	6	24769	24774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774880
528	NC_014917	TAC	2	6	24776	24781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774880
529	NC_014917	GACG	2	8	24862	24869	25 %	0 %	50 %	25 %	319774880
530	NC_014917	CTT	2	6	24901	24906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774880
531	NC_014917	CCG	2	6	25002	25007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774880
532	NC_014917	GAG	2	6	25010	25015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774880
533	NC_014917	CTG	2	6	25073	25078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774880
534	NC_014917	CAG	2	6	25129	25134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774880
535	NC_014917	CAT	2	6	25141	25146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774880
536	NC_014917	GCC	2	6	25163	25168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774880
537	NC_014917	GA	3	6	25169	25174	50 %	0 %	50 %	0 %	319774880
538	NC_014917	GAAG	2	8	25218	25225	50 %	0 %	50 %	0 %	319774880
539	NC_014917	TAT	2	6	25237	25242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774880
540	NC_014917	CAG	2	6	25262	25267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
541	NC_014917	AAC	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774881
542	NC_014917	TGC	2	6	25304	25309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774881
543	NC_014917	CCG	2	6	25351	25356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
544	NC_014917	GCC	2	6	25367	25372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
545	NC_014917	GCA	2	6	25429	25434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
546	NC_014917	TAA	2	6	25459	25464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774881
547	NC_014917	CCG	2	6	25539	25544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
548	NC_014917	CTC	2	6	25548	25553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774881
549	NC_014917	A	6	6	25592	25597	100 %	0 %	0 %	0 %	319774881
550	NC_014917	TTC	2	6	25632	25637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774881
551	NC_014917	TTC	2	6	25693	25698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774881
552	NC_014917	CCT	2	6	25774	25779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774881
553	NC_014917	AACGG	2	10	25813	25822	40 %	0 %	40 %	20 %	319774881
554	NC_014917	CGC	2	6	25849	25854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
555	NC_014917	AGGC	2	8	25873	25880	25 %	0 %	50 %	25 %	319774881
556	NC_014917	CAC	2	6	25919	25924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774881
557	NC_014917	AGC	2	6	25962	25967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
558	NC_014917	TCA	2	6	25972	25977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774881
559	NC_014917	GCC	2	6	26051	26056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
560	NC_014917	GCA	2	6	26090	26095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
561	NC_014917	GCT	2	6	26324	26329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014917	CTC	2	6	26376	26381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774882
563	NC_014917	TA	3	6	26394	26399	50 %	50 %	0 %	0 %	319774882
564	NC_014917	CGG	2	6	26402	26407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774882
565	NC_014917	TTA	2	6	26441	26446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774882
566	NC_014917	CTC	2	6	26464	26469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774882
567	NC_014917	GCCT	2	8	26539	26546	0 %	25 %	25 %	50 %	319774882
568	NC_014917	GTA	2	6	26565	26570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774882
569	NC_014917	GAG	2	6	26575	26580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774882
570	NC_014917	CT	4	8	26654	26661	0 %	50 %	0 %	50 %	319774882
571	NC_014917	C	6	6	26665	26670	0 %	0 %	0 %	100 %	319774882
572	NC_014917	CCCT	2	8	26701	26708	0 %	25 %	0 %	75 %	319774882
573	NC_014917	CTCG	2	8	26739	26746	0 %	25 %	25 %	50 %	319774882
574	NC_014917	CAG	2	6	26769	26774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774882
575	NC_014917	GGC	2	6	26775	26780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774882
576	NC_014917	CTC	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774882
577	NC_014917	TGGGCT	2	12	26846	26857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319774882
578	NC_014917	CTTTGG	2	12	26865	26876	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319774882
579	NC_014917	TGGAA	2	10	26889	26898	40 %	20 %	40 %	0 %	319774882
580	NC_014917	AGC	2	6	26949	26954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774882
581	NC_014917	GCTCT	2	10	26958	26967	0 %	40 %	20 %	40 %	319774882
582	NC_014917	CTC	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774883
583	NC_014917	TCC	2	6	27209	27214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774883
584	NC_014917	GTA	2	6	27242	27247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774883
585	NC_014917	TCG	2	6	27291	27296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774883
586	NC_014917	TCT	2	6	27334	27339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774883
587	NC_014917	CTC	2	6	27347	27352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774883
588	NC_014917	AG	3	6	27398	27403	50 %	0 %	50 %	0 %	319774883
589	NC_014917	CCTT	2	8	27408	27415	0 %	50 %	0 %	50 %	319774883
590	NC_014917	GTA	2	6	27431	27436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774883
591	NC_014917	GAA	2	6	27446	27451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774883
592	NC_014917	TCTCT	2	10	27510	27519	0 %	60 %	0 %	40 %	319774884
593	NC_014917	TAA	2	6	27563	27568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774884
594	NC_014917	GTC	2	6	27702	27707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774884
595	NC_014917	AGA	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774884
596	NC_014917	ACC	2	6	27751	27756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774884
597	NC_014917	CGT	2	6	27762	27767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774884
598	NC_014917	GCAG	2	8	27781	27788	25 %	0 %	50 %	25 %	319774884
599	NC_014917	TTGAG	2	10	27955	27964	20 %	40 %	40 %	0 %	319774885
600	NC_014917	CGG	2	6	28024	28029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774885
601	NC_014917	CCG	2	6	28057	28062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774885
602	NC_014917	CGC	2	6	28070	28075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774885
603	NC_014917	TCAA	2	8	28080	28087	50 %	25 %	0 %	25 %	319774885
604	NC_014917	CAG	2	6	28118	28123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774885
605	NC_014917	CCT	2	6	28135	28140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774885
606	NC_014917	ACCTCT	2	12	28149	28160	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319774885
607	NC_014917	TC	3	6	28172	28177	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
608	NC_014917	A	6	6	28240	28245	100 %	0 %	0 %	0 %	319774886
609	NC_014917	GTCC	2	8	28264	28271	0 %	25 %	25 %	50 %	319774886
610	NC_014917	ACCC	2	8	28313	28320	25 %	0 %	0 %	75 %	319774886
611	NC_014917	CT	3	6	28333	28338	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
612	NC_014917	CT	3	6	28424	28429	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
613	NC_014917	G	6	6	28475	28480	0 %	0 %	100 %	0 %	319774886
614	NC_014917	TCCCT	2	10	28484	28493	0 %	40 %	0 %	60 %	319774886
615	NC_014917	TC	3	6	28564	28569	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
616	NC_014917	TGG	2	6	28839	28844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774886
617	NC_014917	T	6	6	28868	28873	0 %	100 %	0 %	0 %	319774887
618	NC_014917	A	7	7	28941	28947	100 %	0 %	0 %	0 %	319774887
619	NC_014917	CTC	2	6	29003	29008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774887
620	NC_014917	TTA	2	6	29020	29025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774887
621	NC_014917	AG	3	6	29037	29042	50 %	0 %	50 %	0 %	319774887
622	NC_014917	GAC	2	6	29140	29145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774887
623	NC_014917	CCAG	2	8	29194	29201	25 %	0 %	25 %	50 %	319774887
624	NC_014917	ACCTCT	2	12	29283	29294	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319774887
625	NC_014917	GAA	2	6	29383	29388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774887
626	NC_014917	A	6	6	29467	29472	100 %	0 %	0 %	0 %	319774887
627	NC_014917	ATC	2	6	29592	29597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774887
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629	NC_014917	AGA	2	6	29769	29774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774888
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