MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Taylorella equigenitalis MCE9 chromosome

Total Repeats: 33666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014914	CAT	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014914	CTG	2	6	71	76	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014914	TCA	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014914	CCA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014914	CT	3	6	246	251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014914	TAC	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014914	CT	3	6	280	285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014914	T	6	6	486	491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014914	ATC	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014914	AGT	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014914	AT	3	6	619	624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014914	CAG	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014914	TG	3	6	700	705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014914	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014914	TCT	2	6	767	772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014914	CAAA	2	8	914	921	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014914	ACGAT	2	10	991	1000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014914	TGT	2	6	1034	1039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778190
19	NC_014914	CTGTT	2	10	1136	1145	0 %	60 %	20 %	20 %	319778190
20	NC_014914	TC	3	6	1165	1170	0 %	50 %	0 %	50 %	319778190
21	NC_014914	ATT	2	6	1241	1246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778190
22	NC_014914	T	6	6	1271	1276	0 %	100 %	0 %	0 %	319778190
23	NC_014914	CAA	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319778190
24	NC_014914	TCAT	2	8	1422	1429	25 %	50 %	0 %	25 %	319778190
25	NC_014914	TAC	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778190
26	NC_014914	AGA	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319778190
27	NC_014914	CTGT	2	8	1509	1516	0 %	50 %	25 %	25 %	319778190
28	NC_014914	TTTAGA	2	12	1565	1576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319778190
29	NC_014914	ACTT	2	8	1670	1677	25 %	50 %	0 %	25 %	319778190
30	NC_014914	AAGA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	319778190
31	NC_014914	TTAA	2	8	1797	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	319778190
32	NC_014914	TAC	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778190
33	NC_014914	AATCC	2	10	2044	2053	40 %	20 %	0 %	40 %	319778190
34	NC_014914	AAG	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319778190
35	NC_014914	CCCT	2	8	2117	2124	0 %	25 %	0 %	75 %	319778191
36	NC_014914	TAA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778191
37	NC_014914	A	6	6	2211	2216	100 %	0 %	0 %	0 %	319778191
38	NC_014914	GT	3	6	2223	2228	0 %	50 %	50 %	0 %	319778191
39	NC_014914	TGAG	2	8	2250	2257	25 %	25 %	50 %	0 %	319778191
40	NC_014914	TCA	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
41	NC_014914	AG	3	6	2321	2326	50 %	0 %	50 %	0 %	319778191
42	NC_014914	TGTCA	2	10	2346	2355	20 %	40 %	20 %	20 %	319778191
43	NC_014914	ATT	2	6	2403	2408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778191
44	NC_014914	T	6	6	2449	2454	0 %	100 %	0 %	0 %	319778191
45	NC_014914	AG	3	6	2505	2510	50 %	0 %	50 %	0 %	319778191
46	NC_014914	ATG	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778191
47	NC_014914	AAT	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778191
48	NC_014914	TTA	2	6	2587	2592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778191
49	NC_014914	ACT	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
50	NC_014914	TTGA	2	8	2732	2739	25 %	50 %	25 %	0 %	319778191
51	NC_014914	A	6	6	2784	2789	100 %	0 %	0 %	0 %	319778191
52	NC_014914	ATC	2	6	2886	2891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
53	NC_014914	GTT	2	6	2901	2906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778191
54	NC_014914	TAA	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778191
55	NC_014914	TTA	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778191
56	NC_014914	T	7	7	3167	3173	0 %	100 %	0 %	0 %	319778191
57	NC_014914	TTC	2	6	3204	3209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778191
58	NC_014914	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	319778191
59	NC_014914	TCA	2	6	3322	3327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
60	NC_014914	CAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
61	NC_014914	GTT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778191
62	NC_014914	CTT	2	6	3476	3481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778191
63	NC_014914	ATA	2	6	3489	3494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778191
64	NC_014914	T	7	7	3536	3542	0 %	100 %	0 %	0 %	319778191
65	NC_014914	CTG	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778191
66	NC_014914	GTA	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778191
67	NC_014914	CT	3	6	3681	3686	0 %	50 %	0 %	50 %	319778191
68	NC_014914	CTG	2	6	3713	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778191
69	NC_014914	AAT	2	6	3759	3764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778191
70	NC_014914	CAT	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
71	NC_014914	GATT	2	8	3792	3799	25 %	50 %	25 %	0 %	319778191
72	NC_014914	AT	3	6	3814	3819	50 %	50 %	0 %	0 %	319778191
73	NC_014914	TTTAAG	2	12	3849	3860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319778191
74	NC_014914	AGC	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319778191
75	NC_014914	TAT	2	6	3992	3997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778191
76	NC_014914	ATC	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
77	NC_014914	GAAA	2	8	4070	4077	75 %	0 %	25 %	0 %	319778191
78	NC_014914	TTC	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778191
79	NC_014914	CAA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319778191
80	NC_014914	GTA	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778191
81	NC_014914	TCA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778191
82	NC_014914	T	8	8	4258	4265	0 %	100 %	0 %	0 %	319778191
83	NC_014914	T	7	7	4364	4370	0 %	100 %	0 %	0 %	319778191
84	NC_014914	TA	3	6	4374	4379	50 %	50 %	0 %	0 %	319778191
85	NC_014914	TTCTG	2	10	4570	4579	0 %	60 %	20 %	20 %	319778191
86	NC_014914	TAT	2	6	4620	4625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778191
87	NC_014914	TCCTA	2	10	4632	4641	20 %	40 %	0 %	40 %	319778191
88	NC_014914	CTT	3	9	4737	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778192
89	NC_014914	TCT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778192
90	NC_014914	GTTT	2	8	4798	4805	0 %	75 %	25 %	0 %	319778192
91	NC_014914	TTA	2	6	4806	4811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778192
92	NC_014914	AAG	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319778192
93	NC_014914	TTG	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778192
94	NC_014914	TAA	2	6	4869	4874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778192
95	NC_014914	TAG	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778192
96	NC_014914	TAATTT	2	12	4938	4949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778192
97	NC_014914	T	6	6	4962	4967	0 %	100 %	0 %	0 %	319778192
98	NC_014914	ATT	2	6	4993	4998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778192
99	NC_014914	ATA	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778192
100	NC_014914	TCA	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778192
101	NC_014914	TAA	2	6	5059	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778192
102	NC_014914	TTG	2	6	5122	5127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778192
103	NC_014914	CCAC	2	8	5162	5169	25 %	0 %	0 %	75 %	319778192
104	NC_014914	GTT	3	9	5312	5320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778192
105	NC_014914	T	6	6	5346	5351	0 %	100 %	0 %	0 %	319778192
106	NC_014914	T	6	6	5437	5442	0 %	100 %	0 %	0 %	319778192
107	NC_014914	ACC	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778192
108	NC_014914	GT	3	6	5468	5473	0 %	50 %	50 %	0 %	319778192
109	NC_014914	GTA	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778192
110	NC_014914	GCC	2	6	5706	5711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319778192
111	NC_014914	CAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319778192
112	NC_014914	ACC	3	9	5797	5805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778192
113	NC_014914	ACA	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319778192
114	NC_014914	TTG	2	6	6054	6059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778192
115	NC_014914	T	6	6	6193	6198	0 %	100 %	0 %	0 %	319778192
116	NC_014914	ATT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778192
117	NC_014914	TACA	2	8	6331	6338	50 %	25 %	0 %	25 %	319778192
118	NC_014914	TAG	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778192
119	NC_014914	TCA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778192
120	NC_014914	TCT	2	6	6647	6652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778192
121	NC_014914	TTC	2	6	6679	6684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778192
122	NC_014914	TTC	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778192
123	NC_014914	AAAAT	2	10	6785	6794	80 %	20 %	0 %	0 %	319778192
124	NC_014914	GTT	3	9	6803	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778192
125	NC_014914	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778192
126	NC_014914	ACC	2	6	7138	7143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778193
127	NC_014914	CTA	2	6	7208	7213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778193
128	NC_014914	AC	3	6	7305	7310	50 %	0 %	0 %	50 %	319778193
129	NC_014914	GACC	2	8	7428	7435	25 %	0 %	25 %	50 %	319778193
130	NC_014914	TAG	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778193
131	NC_014914	AAT	2	6	7494	7499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778194
132	NC_014914	CGC	2	6	7517	7522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319778194
133	NC_014914	T	6	6	7527	7532	0 %	100 %	0 %	0 %	319778194
134	NC_014914	T	6	6	7539	7544	0 %	100 %	0 %	0 %	319778194
135	NC_014914	TTTA	2	8	7632	7639	25 %	75 %	0 %	0 %	319778194
136	NC_014914	ATT	2	6	7686	7691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778194
137	NC_014914	T	6	6	7736	7741	0 %	100 %	0 %	0 %	319778194
138	NC_014914	TAA	2	6	7778	7783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778194
139	NC_014914	GTA	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778194
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141	NC_014914	CCA	2	6	7903	7908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778194
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174	NC_014914	T	6	6	10069	10074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_014914	TGTGG	2	10	21501	21510	0 %	40 %	60 %	0 %	319778204
404	NC_014914	GAA	2	6	21537	21542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319778204
405	NC_014914	AAG	2	6	21679	21684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319778204
406	NC_014914	CAT	2	6	21736	21741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778205
407	NC_014914	CAT	2	6	21854	21859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778205
408	NC_014914	GTT	2	6	21867	21872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319778205
409	NC_014914	ATA	2	6	21933	21938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778205
410	NC_014914	GACCA	2	10	21961	21970	40 %	0 %	20 %	40 %	319778205
411	NC_014914	T	6	6	22013	22018	0 %	100 %	0 %	0 %	319778205
412	NC_014914	AGA	2	6	22083	22088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319778205
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417	NC_014914	AT	3	6	22373	22378	50 %	50 %	0 %	0 %	319778205
418	NC_014914	AGC	2	6	22397	22402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319778205
419	NC_014914	T	7	7	22466	22472	0 %	100 %	0 %	0 %	319778205
420	NC_014914	CTA	2	6	22536	22541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778205
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422	NC_014914	ATT	2	6	22721	22726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319778205
423	NC_014914	CAC	2	6	22786	22791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778205
424	NC_014914	ATA	2	6	22797	22802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778205
425	NC_014914	AAC	2	6	22817	22822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319778205
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428	NC_014914	TCA	2	6	22902	22907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778205
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431	NC_014914	CTTT	2	8	23040	23047	0 %	75 %	0 %	25 %	319778206
432	NC_014914	AT	3	6	23060	23065	50 %	50 %	0 %	0 %	319778206
433	NC_014914	ACC	2	6	23171	23176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778206
434	NC_014914	T	7	7	23242	23248	0 %	100 %	0 %	0 %	319778206
435	NC_014914	TA	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	319778206
436	NC_014914	GTA	2	6	23290	23295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778206
437	NC_014914	AGT	2	6	23300	23305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778206
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439	NC_014914	T	7	7	23395	23401	0 %	100 %	0 %	0 %	319778206
440	NC_014914	GA	3	6	23505	23510	50 %	0 %	50 %	0 %	319778206
441	NC_014914	GGCA	2	8	23648	23655	25 %	0 %	50 %	25 %	319778206
442	NC_014914	CGA	2	6	23671	23676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319778206
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448	NC_014914	A	6	6	23934	23939	100 %	0 %	0 %	0 %	319778206
449	NC_014914	TGG	2	6	23972	23977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319778206
450	NC_014914	CAT	2	6	24002	24007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778206
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456	NC_014914	AAT	2	6	24179	24184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778206
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458	NC_014914	ATAA	2	8	24269	24276	75 %	25 %	0 %	0 %	319778206
459	NC_014914	ATAG	2	8	24288	24295	50 %	25 %	25 %	0 %	319778206
460	NC_014914	ATC	2	6	24348	24353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778206
461	NC_014914	TGA	2	6	24367	24372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778206
462	NC_014914	TAA	2	6	24389	24394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319778206
463	NC_014914	ACT	2	6	24404	24409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778206
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465	NC_014914	AAGAT	2	10	24503	24512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
466	NC_014914	CTA	2	6	24531	24536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778207
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471	NC_014914	AAAT	2	8	24740	24747	75 %	25 %	0 %	0 %	319778207
472	NC_014914	TACA	2	8	24849	24856	50 %	25 %	0 %	25 %	319778207
473	NC_014914	ACC	2	6	24883	24888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319778207
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498	NC_014914	CTT	2	6	25901	25906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319778207
499	NC_014914	GT	3	6	25910	25915	0 %	50 %	50 %	0 %	319778207
500	NC_014914	T	6	6	26004	26009	0 %	100 %	0 %	0 %	319778207

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