MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014804	CTG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229766
2	NC_014804	A	6	6	246	251	100 %	0 %	0 %	0 %	315229766
3	NC_014804	AT	3	6	323	328	50 %	50 %	0 %	0 %	315229767
4	NC_014804	CTG	2	6	333	338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229767
5	NC_014804	CAGG	2	8	425	432	25 %	0 %	50 %	25 %	315229767
6	NC_014804	GAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229767
7	NC_014804	ATA	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229767
8	NC_014804	T	6	6	540	545	0 %	100 %	0 %	0 %	315229767
9	NC_014804	GCA	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229767
10	NC_014804	AACA	2	8	635	642	75 %	0 %	0 %	25 %	315229767
11	NC_014804	CTG	2	6	669	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229767
12	NC_014804	CGCTTC	2	12	685	696	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315229767
13	NC_014804	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229767
14	NC_014804	TGC	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014804	AAT	2	6	983	988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229768
16	NC_014804	TGA	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229768
17	NC_014804	GAAG	2	8	1073	1080	50 %	0 %	50 %	0 %	315229768
18	NC_014804	AGG	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229768
19	NC_014804	CAA	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229768
20	NC_014804	TTC	3	9	1182	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229768
21	NC_014804	GGT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229768
22	NC_014804	AGT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229768
23	NC_014804	GTC	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229768
24	NC_014804	GAA	2	6	1458	1463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229768
25	NC_014804	AGT	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229768
26	NC_014804	TTGT	2	8	1518	1525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014804	GAAA	2	8	1563	1570	75 %	0 %	25 %	0 %	315229769
28	NC_014804	CAA	2	6	1628	1633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229769
29	NC_014804	G	6	6	1652	1657	0 %	0 %	100 %	0 %	315229769
30	NC_014804	ACA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229769
31	NC_014804	AGA	2	6	1707	1712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229769
32	NC_014804	GAG	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229769
33	NC_014804	A	6	6	1740	1745	100 %	0 %	0 %	0 %	315229769
34	NC_014804	TCC	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229769
35	NC_014804	GAG	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229769
36	NC_014804	ATT	2	6	1877	1882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229769
37	NC_014804	GA	3	6	1884	1889	50 %	0 %	50 %	0 %	315229769
38	NC_014804	TGG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229769
39	NC_014804	AAT	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229769
40	NC_014804	GTT	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229769
41	NC_014804	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229769
42	NC_014804	GAAA	2	8	2085	2092	75 %	0 %	25 %	0 %	315229769
43	NC_014804	GAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229769
44	NC_014804	TA	3	6	2212	2217	50 %	50 %	0 %	0 %	315229769
45	NC_014804	AAT	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229769
46	NC_014804	TACA	2	8	2319	2326	50 %	25 %	0 %	25 %	315229769
47	NC_014804	TAAT	2	8	2435	2442	50 %	50 %	0 %	0 %	315229769
48	NC_014804	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229769
49	NC_014804	TGAA	2	8	2471	2478	50 %	25 %	25 %	0 %	315229769
50	NC_014804	AAT	2	6	2502	2507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229769
51	NC_014804	GAG	2	6	2515	2520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229769
52	NC_014804	GA	3	6	2526	2531	50 %	0 %	50 %	0 %	315229769
53	NC_014804	GATGC	2	10	2563	2572	20 %	20 %	40 %	20 %	315229769
54	NC_014804	CCT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229769
55	NC_014804	TTA	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229769
56	NC_014804	GCT	2	6	2692	2697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229769
57	NC_014804	TGAC	2	8	2840	2847	25 %	25 %	25 %	25 %	315229769
58	NC_014804	TA	3	6	2985	2990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014804	TAA	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014804	ATC	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014804	ATA	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229770
62	NC_014804	AT	4	8	3226	3233	50 %	50 %	0 %	0 %	315229770
63	NC_014804	GTT	3	9	3255	3263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229770
64	NC_014804	TGG	2	6	3289	3294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229770
65	NC_014804	CAT	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229770
66	NC_014804	CAGG	2	8	3374	3381	25 %	0 %	50 %	25 %	315229770
67	NC_014804	TCA	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229770
68	NC_014804	TTG	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229770
69	NC_014804	TGC	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229770
70	NC_014804	GAGCGA	2	12	3662	3673	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315229770
71	NC_014804	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229770
72	NC_014804	AAT	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229770
73	NC_014804	TCT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229770
74	NC_014804	GGGA	2	8	3946	3953	25 %	0 %	75 %	0 %	315229770
75	NC_014804	GGA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229770
76	NC_014804	CGA	2	6	4078	4083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229770
77	NC_014804	GAA	2	6	4167	4172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229770
78	NC_014804	TGA	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229770
79	NC_014804	A	6	6	4218	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	315229770
80	NC_014804	GCTTG	2	10	4265	4274	0 %	40 %	40 %	20 %	315229770
81	NC_014804	GTG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014804	CAGAGG	2	12	4309	4320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014804	GTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014804	CTA	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229771
85	NC_014804	GAAG	2	8	4434	4441	50 %	0 %	50 %	0 %	315229771
86	NC_014804	AGGG	2	8	4505	4512	25 %	0 %	75 %	0 %	315229771
87	NC_014804	GCG	2	6	4555	4560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315229771
88	NC_014804	CCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229771
89	NC_014804	CTATTG	2	12	4955	4966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315229772
90	NC_014804	TCCAAT	2	12	5083	5094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229773
91	NC_014804	GTCT	2	8	5172	5179	0 %	50 %	25 %	25 %	315229773
92	NC_014804	TA	3	6	5212	5217	50 %	50 %	0 %	0 %	315229773
93	NC_014804	TA	3	6	5274	5279	50 %	50 %	0 %	0 %	315229773
94	NC_014804	GCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229773
95	NC_014804	TCT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229773
96	NC_014804	GTT	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229773
97	NC_014804	TTG	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229773
98	NC_014804	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229773
99	NC_014804	TTC	2	6	5647	5652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229773
100	NC_014804	TCT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229773
101	NC_014804	ATT	2	6	5762	5767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229773
102	NC_014804	CAA	2	6	5829	5834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229773
103	NC_014804	GT	3	6	5892	5897	0 %	50 %	50 %	0 %	315229773
104	NC_014804	ATGT	2	8	5959	5966	25 %	50 %	25 %	0 %	315229773
105	NC_014804	CTCC	2	8	6056	6063	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014804	TA	3	6	6082	6087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014804	A	6	6	6156	6161	100 %	0 %	0 %	0 %	315229774
108	NC_014804	T	6	6	6185	6190	0 %	100 %	0 %	0 %	315229774
109	NC_014804	GTT	2	6	6214	6219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229774
110	NC_014804	GAG	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229774
111	NC_014804	AG	3	6	6268	6273	50 %	0 %	50 %	0 %	315229774
112	NC_014804	ATA	2	6	6322	6327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229774
113	NC_014804	CATC	2	8	6358	6365	25 %	25 %	0 %	50 %	315229774
114	NC_014804	GGA	2	6	6366	6371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229774
115	NC_014804	GAA	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229774
116	NC_014804	TCA	2	6	6491	6496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229774
117	NC_014804	CATCC	2	10	6540	6549	20 %	20 %	0 %	60 %	315229774
118	NC_014804	TGCA	2	8	6557	6564	25 %	25 %	25 %	25 %	315229774
119	NC_014804	AAAGA	2	10	6678	6687	80 %	0 %	20 %	0 %	315229774
120	NC_014804	ATT	2	6	6805	6810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229774
121	NC_014804	A	6	6	6851	6856	100 %	0 %	0 %	0 %	315229774
122	NC_014804	ATA	2	6	6937	6942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229774
123	NC_014804	TTAT	2	8	7025	7032	25 %	75 %	0 %	0 %	315229775
124	NC_014804	TA	3	6	7120	7125	50 %	50 %	0 %	0 %	315229775
125	NC_014804	ACC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229775
126	NC_014804	TAT	2	6	7240	7245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229775
127	NC_014804	AG	3	6	7269	7274	50 %	0 %	50 %	0 %	315229775
128	NC_014804	CTTTTA	2	12	7308	7319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315229775
129	NC_014804	TCA	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229775
130	NC_014804	TGT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229775
131	NC_014804	T	6	6	7469	7474	0 %	100 %	0 %	0 %	315229775
132	NC_014804	AG	3	6	7533	7538	50 %	0 %	50 %	0 %	315229775
133	NC_014804	CGG	2	6	7585	7590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315229775
134	NC_014804	ATC	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229775
135	NC_014804	TCA	2	6	7691	7696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229775
136	NC_014804	T	7	7	7699	7705	0 %	100 %	0 %	0 %	315229775
137	NC_014804	TTCT	2	8	7736	7743	0 %	75 %	0 %	25 %	315229775
138	NC_014804	CATT	2	8	7796	7803	25 %	50 %	0 %	25 %	315229775
139	NC_014804	TTC	2	6	7843	7848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229775
140	NC_014804	GGA	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229775
141	NC_014804	TGG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229775
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145	NC_014804	ATG	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014804	TAA	2	6	8190	8195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014804	AC	3	6	8206	8211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014804	G	6	6	8350	8355	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014804	GA	3	6	8374	8379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014804	TAA	2	6	8424	8429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014804	ATT	2	6	8456	8461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014804	AAT	2	6	8476	8481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014804	CTT	2	6	8501	8506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014804	TCA	2	6	8510	8515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014804	CT	3	6	8608	8613	0 %	50 %	0 %	50 %	315229776
156	NC_014804	CT	3	6	8676	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	315229776
157	NC_014804	ATCG	2	8	8691	8698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_014804	GAAA	2	8	8759	8766	75 %	0 %	25 %	0 %	315229777
159	NC_014804	ATTT	2	8	8772	8779	25 %	75 %	0 %	0 %	315229777
160	NC_014804	CA	4	8	8787	8794	50 %	0 %	0 %	50 %	315229777
161	NC_014804	ACT	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229777
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165	NC_014804	GGAT	2	8	9184	9191	25 %	25 %	50 %	0 %	315229777
166	NC_014804	GTG	2	6	9208	9213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229777
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213	NC_014804	TA	3	6	12369	12374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_014804	AG	3	6	14354	14359	50 %	0 %	50 %	0 %	315229781
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253	NC_014804	T	6	6	14762	14767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_014804	G	6	6	14780	14785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014804	TA	3	6	14873	14878	50 %	50 %	0 %	0 %	315229782
256	NC_014804	TTG	2	6	14880	14885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229782
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264	NC_014804	ATT	2	6	15313	15318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229782
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266	NC_014804	TGTAT	2	10	15427	15436	20 %	60 %	20 %	0 %	315229782
267	NC_014804	GAA	2	6	15440	15445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229782
268	NC_014804	AAGTA	2	10	15459	15468	60 %	20 %	20 %	0 %	315229782
269	NC_014804	AAGC	2	8	15504	15511	50 %	0 %	25 %	25 %	315229782
270	NC_014804	TGC	2	6	15514	15519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229782
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273	NC_014804	GA	3	6	15694	15699	50 %	0 %	50 %	0 %	315229782
274	NC_014804	AAAAC	2	10	15710	15719	80 %	0 %	0 %	20 %	315229782
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370	NC_014804	TTAT	2	8	20220	20227	25 %	75 %	0 %	0 %	315229787
371	NC_014804	A	6	6	20250	20255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_014804	ATT	2	6	21064	21069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229788
392	NC_014804	TA	3	6	21113	21118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_014804	TA	3	6	21180	21185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_014804	CCTTGA	2	12	21218	21229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315229789
395	NC_014804	GAT	2	6	21246	21251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229789
396	NC_014804	AAT	2	6	21275	21280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229789
397	NC_014804	AGA	2	6	21294	21299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229789
398	NC_014804	TCA	2	6	21321	21326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229789
399	NC_014804	AATTT	2	10	21436	21445	40 %	60 %	0 %	0 %	315229789
400	NC_014804	TCA	2	6	21469	21474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229789
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403	NC_014804	GA	3	6	21623	21628	50 %	0 %	50 %	0 %	315229789
404	NC_014804	GGA	2	6	21652	21657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229789
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