MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014804	CTCTT	2	10	173175	173184	0 %	60 %	0 %	40 %	315229980
3502	NC_014804	ATC	2	6	173212	173217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229980
3503	NC_014804	TGA	2	6	173300	173305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229980
3504	NC_014804	GGTCAT	2	12	173406	173417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315229980
3505	NC_014804	GAT	2	6	173475	173480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229980
3506	NC_014804	ATT	2	6	173492	173497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229980
3507	NC_014804	AAC	2	6	173557	173562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229980
3508	NC_014804	CTT	2	6	173571	173576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229980
3509	NC_014804	TCT	2	6	173595	173600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229980
3510	NC_014804	TCA	2	6	173630	173635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229980
3511	NC_014804	TTC	2	6	173677	173682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229980
3512	NC_014804	TTA	2	6	173718	173723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229980
3513	NC_014804	TAA	2	6	173741	173746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229980
3514	NC_014804	TCA	2	6	173777	173782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229980
3515	NC_014804	GTC	2	6	173863	173868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229980
3516	NC_014804	CAT	2	6	173889	173894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229980
3517	NC_014804	AT	3	6	173893	173898	50 %	50 %	0 %	0 %	315229980
3518	NC_014804	AGG	2	6	174010	174015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229980
3519	NC_014804	CTTT	2	8	174021	174028	0 %	75 %	0 %	25 %	315229980
3520	NC_014804	TCT	2	6	174041	174046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229980
3521	NC_014804	T	6	6	174046	174051	0 %	100 %	0 %	0 %	315229980
3522	NC_014804	TTG	2	6	174110	174115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229980
3523	NC_014804	CTT	2	6	174117	174122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229980
3524	NC_014804	TGA	2	6	174243	174248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229980
3525	NC_014804	AG	3	6	174290	174295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014804	GA	3	6	174304	174309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014804	TCT	2	6	174318	174323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014804	ATC	2	6	174327	174332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_014804	ACA	2	6	174469	174474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229981
3530	NC_014804	AGCC	2	8	174476	174483	25 %	0 %	25 %	50 %	315229981
3531	NC_014804	ATG	2	6	174569	174574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229981
3532	NC_014804	CAA	2	6	174581	174586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229981
3533	NC_014804	CTT	2	6	174643	174648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229981
3534	NC_014804	TAA	2	6	174684	174689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229981
3535	NC_014804	CTG	2	6	174746	174751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229981
3536	NC_014804	CCA	2	6	174766	174771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229981
3537	NC_014804	AT	3	6	174773	174778	50 %	50 %	0 %	0 %	315229981
3538	NC_014804	TTCC	2	8	174860	174867	0 %	50 %	0 %	50 %	315229981
3539	NC_014804	GAA	2	6	174981	174986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229981
3540	NC_014804	ATG	2	6	175049	175054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229981
3541	NC_014804	AT	3	6	175068	175073	50 %	50 %	0 %	0 %	315229981
3542	NC_014804	GAA	2	6	175165	175170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229981
3543	NC_014804	TAAG	2	8	175193	175200	50 %	25 %	25 %	0 %	315229981
3544	NC_014804	TC	3	6	175241	175246	0 %	50 %	0 %	50 %	315229982
3545	NC_014804	TCT	2	6	175264	175269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229982
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3547	NC_014804	GATT	2	8	175339	175346	25 %	50 %	25 %	0 %	315229982
3548	NC_014804	TTC	2	6	175376	175381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229982
3549	NC_014804	TCTT	2	8	175398	175405	0 %	75 %	0 %	25 %	315229982
3550	NC_014804	CTT	2	6	175427	175432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229982
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3552	NC_014804	TTA	2	6	175477	175482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229982
3553	NC_014804	AT	3	6	175504	175509	50 %	50 %	0 %	0 %	315229982
3554	NC_014804	TGG	2	6	175574	175579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229982
3555	NC_014804	TCT	2	6	175669	175674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229982
3556	NC_014804	GAT	2	6	175687	175692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229982
3557	NC_014804	ATCA	2	8	175724	175731	50 %	25 %	0 %	25 %	315229982
3558	NC_014804	CGT	2	6	175748	175753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229982
3559	NC_014804	CAG	2	6	175817	175822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229982
3560	NC_014804	CTTG	2	8	175859	175866	0 %	50 %	25 %	25 %	315229982
3561	NC_014804	T	6	6	175894	175899	0 %	100 %	0 %	0 %	315229982
3562	NC_014804	CCA	2	6	175916	175921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229982
3563	NC_014804	TTTG	2	8	175944	175951	0 %	75 %	25 %	0 %	315229982
3564	NC_014804	TC	4	8	176005	176012	0 %	50 %	0 %	50 %	315229982
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3582	NC_014804	TGC	2	6	177118	177123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229983
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3591	NC_014804	A	6	6	177471	177476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014804	AAAG	2	8	177481	177488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014804	ACTGC	2	10	177560	177569	20 %	20 %	20 %	40 %	315229984
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3599	NC_014804	TAC	2	6	177813	177818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229984
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3602	NC_014804	TTC	2	6	177929	177934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229984
3603	NC_014804	CAAG	2	8	177989	177996	50 %	0 %	25 %	25 %	315229984
3604	NC_014804	GAA	2	6	178047	178052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229984
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3608	NC_014804	CAT	2	6	178281	178286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229984
3609	NC_014804	AG	3	6	178328	178333	50 %	0 %	50 %	0 %	315229984
3610	NC_014804	TCC	2	6	178338	178343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229984
3611	NC_014804	TAT	2	6	178383	178388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229984
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3620	NC_014804	GAAT	2	8	178781	178788	50 %	25 %	25 %	0 %	315229984
3621	NC_014804	ATT	2	6	178816	178821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229984
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3623	NC_014804	CGG	2	6	178935	178940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315229985
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3861	NC_014804	TCCA	2	8	191888	191895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3863	NC_014804	GAT	2	6	191950	191955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3867	NC_014804	TCAG	2	8	192286	192293	25 %	25 %	25 %	25 %	315230002
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3994	NC_014804	GAG	2	6	198365	198370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230005
3995	NC_014804	AAG	2	6	198371	198376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230005
3996	NC_014804	GA	3	6	198438	198443	50 %	0 %	50 %	0 %	315230005
3997	NC_014804	TAC	2	6	198446	198451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230005
3998	NC_014804	TTG	2	6	198513	198518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230005
3999	NC_014804	CCG	2	6	198530	198535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230005
4000	NC_014804	AGAGC	2	10	198547	198556	40 %	0 %	40 %	20 %	315230005

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