MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_014804	TGG	2	6	1577467	1577472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231550
31502	NC_014804	CAA	2	6	1577540	1577545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231550
31503	NC_014804	GAG	2	6	1577584	1577589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231550
31504	NC_014804	GTC	2	6	1577599	1577604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231550
31505	NC_014804	TGGC	2	8	1577699	1577706	0 %	25 %	50 %	25 %	315231550
31506	NC_014804	GGATA	2	10	1577709	1577718	40 %	20 %	40 %	0 %	315231550
31507	NC_014804	TG	3	6	1577788	1577793	0 %	50 %	50 %	0 %	315231550
31508	NC_014804	AGG	2	6	1577798	1577803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231550
31509	NC_014804	ATC	2	6	1577823	1577828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231551
31510	NC_014804	GAG	2	6	1577838	1577843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231551
31511	NC_014804	GTG	2	6	1577885	1577890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231551
31512	NC_014804	AGA	2	6	1577921	1577926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231551
31513	NC_014804	ATA	2	6	1578003	1578008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231551
31514	NC_014804	AAT	2	6	1578065	1578070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231551
31515	NC_014804	TGT	2	6	1578071	1578076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231551
31516	NC_014804	GGA	2	6	1578233	1578238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231551
31517	NC_014804	GAA	2	6	1578249	1578254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231551
31518	NC_014804	CGA	2	6	1578259	1578264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231551
31519	NC_014804	TGA	2	6	1578272	1578277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231551
31520	NC_014804	AGA	2	6	1578358	1578363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231551
31521	NC_014804	TGA	2	6	1578380	1578385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231551
31522	NC_014804	AGA	2	6	1578386	1578391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231551
31523	NC_014804	CGA	2	6	1578398	1578403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231551
31524	NC_014804	GAG	2	6	1578411	1578416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231551
31525	NC_014804	AG	4	8	1578430	1578437	50 %	0 %	50 %	0 %	315231551
31526	NC_014804	TTC	2	6	1578447	1578452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231552
31527	NC_014804	CT	3	6	1578468	1578473	0 %	50 %	0 %	50 %	315231552
31528	NC_014804	TCTT	2	8	1578498	1578505	0 %	75 %	0 %	25 %	315231552
31529	NC_014804	CAA	2	6	1578508	1578513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231552
31530	NC_014804	TCC	2	6	1578622	1578627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231552
31531	NC_014804	GAG	2	6	1578692	1578697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231552
31532	NC_014804	ATG	2	6	1578698	1578703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231552
31533	NC_014804	CTTT	2	8	1578722	1578729	0 %	75 %	0 %	25 %	315231552
31534	NC_014804	AGT	2	6	1578748	1578753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31535	NC_014804	TGG	2	6	1578819	1578824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31536	NC_014804	TAA	2	6	1578861	1578866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231553
31537	NC_014804	CAG	2	6	1578999	1579004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231553
31538	NC_014804	A	6	6	1579021	1579026	100 %	0 %	0 %	0 %	315231553
31539	NC_014804	GTT	2	6	1579109	1579114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231553
31540	NC_014804	TTCAA	2	10	1579178	1579187	40 %	40 %	0 %	20 %	315231553
31541	NC_014804	GCG	2	6	1579254	1579259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231553
31542	NC_014804	AAT	3	9	1579261	1579269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231553
31543	NC_014804	TCC	2	6	1579285	1579290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231553
31544	NC_014804	TAC	2	6	1579325	1579330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231553
31545	NC_014804	GAA	2	6	1579361	1579366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231553
31546	NC_014804	GAA	2	6	1579374	1579379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231553
31547	NC_014804	GAT	2	6	1579399	1579404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231553
31548	NC_014804	TAC	2	6	1579406	1579411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231553
31549	NC_014804	TC	3	6	1579483	1579488	0 %	50 %	0 %	50 %	315231553
31550	NC_014804	ATAG	2	8	1579490	1579497	50 %	25 %	25 %	0 %	315231553
31551	NC_014804	CAC	3	9	1579642	1579650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231553
31552	NC_014804	CCTT	2	8	1579713	1579720	0 %	50 %	0 %	50 %	315231553
31553	NC_014804	ACA	2	6	1579755	1579760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231553
31554	NC_014804	ACC	2	6	1579844	1579849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231553
31555	NC_014804	TAC	2	6	1579850	1579855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231553
31556	NC_014804	CCA	2	6	1579887	1579892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231553
31557	NC_014804	GTA	2	6	1579997	1580002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231553
31558	NC_014804	GGA	2	6	1580030	1580035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231553
31559	NC_014804	AAG	2	6	1580095	1580100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231553
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31562	NC_014804	CGC	2	6	1580192	1580197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231554
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31565	NC_014804	ATC	2	6	1580253	1580258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231554
31566	NC_014804	TCT	2	6	1580267	1580272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231554
31567	NC_014804	CTCA	2	8	1580280	1580287	25 %	25 %	0 %	50 %	315231554
31568	NC_014804	TGCC	2	8	1580416	1580423	0 %	25 %	25 %	50 %	315231554
31569	NC_014804	CAA	2	6	1580426	1580431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231554
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31572	NC_014804	TTC	2	6	1580586	1580591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231554
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31576	NC_014804	TCC	2	6	1580788	1580793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231554
31577	NC_014804	AGCC	2	8	1580829	1580836	25 %	0 %	25 %	50 %	315231554
31578	NC_014804	ACTCCC	2	12	1580837	1580848	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	315231554
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31582	NC_014804	G	6	6	1581009	1581014	0 %	0 %	100 %	0 %	315231554
31583	NC_014804	CT	3	6	1581032	1581037	0 %	50 %	0 %	50 %	315231554
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31588	NC_014804	AGA	2	6	1581289	1581294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231554
31589	NC_014804	T	6	6	1581315	1581320	0 %	100 %	0 %	0 %	315231554
31590	NC_014804	AG	3	6	1581340	1581345	50 %	0 %	50 %	0 %	315231554
31591	NC_014804	AAAG	2	8	1581390	1581397	75 %	0 %	25 %	0 %	315231554
31592	NC_014804	AG	3	6	1581506	1581511	50 %	0 %	50 %	0 %	315231554
31593	NC_014804	TGT	2	6	1581521	1581526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231554
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31598	NC_014804	TCT	2	6	1582067	1582072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231555
31599	NC_014804	CCT	2	6	1582109	1582114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231555
31600	NC_014804	CTGC	2	8	1582127	1582134	0 %	25 %	25 %	50 %	315231555
31601	NC_014804	ATC	2	6	1582147	1582152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231555
31602	NC_014804	CTG	2	6	1582164	1582169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231555
31603	NC_014804	CTT	2	6	1582210	1582215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231555
31604	NC_014804	CTT	2	6	1582218	1582223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231555
31605	NC_014804	T	6	6	1582236	1582241	0 %	100 %	0 %	0 %	315231555
31606	NC_014804	CTG	2	6	1582278	1582283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231555
31607	NC_014804	CAA	2	6	1582322	1582327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231555
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31609	NC_014804	TC	3	6	1582392	1582397	0 %	50 %	0 %	50 %	315231555
31610	NC_014804	TCTTT	2	10	1582403	1582412	0 %	80 %	0 %	20 %	315231555
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31612	NC_014804	GCT	2	6	1582589	1582594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231555
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31614	NC_014804	TC	3	6	1582615	1582620	0 %	50 %	0 %	50 %	315231555
31615	NC_014804	CTC	2	6	1582653	1582658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231555
31616	NC_014804	AGCTT	2	10	1582660	1582669	20 %	40 %	20 %	20 %	315231555
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31618	NC_014804	CTTCCC	2	12	1582757	1582768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231555
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31622	NC_014804	TAAA	2	8	1582856	1582863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31623	NC_014804	TGTT	2	8	1582904	1582911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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31975	NC_014804	TTC	2	6	1601470	1601475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231573
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